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山羊粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子基因克隆

2020-10-22王楠刘明国万双秀李金芮李翌姜勋昊姜莉莉

中国畜禽种业 2020年10期
关键词:山羊细胞因子氨基酸

王楠 刘明国 万双秀 李金芮 李翌 姜勋昊 姜莉莉*

(1,菏泽学院药学院 274015;2,山东省郓城诚信医院 274700)

粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF) 是机体重要的免疫调节因子,能促进造血前体细胞的存活和分化[1,2]。GCSF可刺激特定骨髓前体细胞增殖、分化成粒细胞,刺激多能干细胞的增殖和分化,诱导单核细胞和巨噬细胞的形成[3,4]。作为免疫刺激剂,GM-CSF 可直接作用于免疫细胞,具有较强的免疫增强效果[5,6]。GM-CSF 作为一种理想的免疫佐剂,能增强肿瘤疫苗的免疫效果。GM-CSF 对动物机体的抗感染免疫过程具有高效调节作用,能有效增强机体对疾病的免疫抵抗力,抑制肿瘤恶化、炎症、自身免疫性疾病的作用。GM-CSF 还参与了卵泡发育和排卵等生理过程[7],研究表明,GM-CSF 在PI3K/AKT通路中也发挥重要作用[8,9]。本研究克隆山羊GM-CSF 基因,并对其进行序列和生物信息学分析预测,为进一步研究GMCSF 的功能及抗病毒的分子机制提供有价值的参考。

1 材料与方法

1.1 试剂与仪器

RNAsimple 总RNA 提取试剂盒、FastKing cDNA 合成试剂盒、质粒小提试剂盒、DNA 聚合酶、D2000 DNA Marker、DNA回收试剂盒、DH5α 感受态、pGM-T 载体,T4 DNA 连接酶,均购自TIANGEN 公司;LB 培养基,购自Solarbio 公司;PCR仪、全自动数码凝胶成像仪、台式高速冷冻离心机。

1.2 引物设计

参考Genbank 中已发表的山羊CM-GSF 基因序列(登录号:X_53561.1),设计GM-CSF 基因RT-PCR 扩增引物F/R,F:5’-ATGTGGCTGCAGAACCTGCTTC-3’;R:5’-CACTTCTGGACTGGTTCCCAG-3’,引物由华大基因生物科技有限公司合成。

1.3 PCR 扩增CM-GSF 基因

Trizol 法提取山羊脾脏组织RNA 并反转录成cDNA。以提取的cDNA 为模板,用引物F/R 扩增CM-GSF 基因。PCR 反应体系50μl:2×Taq PCR MasterMix 25μl,cDNA 模板1μl,上下游引物各2μl,ddH2O 20μl。PCR 反应程序为:94℃预变性5min,94℃变性30s,50℃退火30s,72℃延伸30s,共3077 个循环;72℃延伸10min,PCR 产物经1.0%琼脂糖凝胶电泳检测,胶回收产物送华大基因公司进行序列测定。

1.4 CM-GSF 编码氨基酸序列理化特性分析

使用在线工具ProtParam 分析CM-GSF 编码氨基酸理化特性。

2 试验结果

2.1 GM-CSF 基因PCR 扩增

PCR 扩增产物经过琼脂糖凝胶电泳检测,如附图所示,扩增基因片段在500bp 左右,与预期结果一致。

2.2 GM-CSF 基因核苷酸序列分析

用DNA Star 软件分析印度黑羚GM-CSF 基因的核苷酸序列,结果表明,GM-CSF 基因的CDs 区全长435bp,其中胞嘧啶(C)在四种碱基中含量最高。A(23.3%)、C(31.1%)、G(24.2%)、T(21.4%),且(G+C)%为55.3%,高于(A+T)%,说明GM-CSF 编码区的DNA 双链较稳定。

2.3 GM-CSF 基因编码氨基酸序列理化特性分析

使用在线工具ProtParam 对GM-CSF 的编码氨基酸序列分析,结果表明印度黑羚的GM-CSF 蛋白分子化学式为C727H1141N187O217S10,理论等电点为5.76。在编码的144个氨基酸中含量最多氨基酸是Leu (L),占比11.8%,含量最低的是Tyr(Y),占比1.4%。编码蛋白的不稳定系数为47.27,推测,该蛋白为不稳定蛋白。在哺乳动物网织红细胞内的半衰期为30h,脂肪系数为81.87,蛋白质的疏水性预测为-0.160。

3 讨论

GM-CSF 是一种具有种属特异性且极具开发潜力的造血生长因子。近年来,因其对免疫系统具有多项调节功能,已被研发成为免疫佐剂或抗肿瘤治疗药广泛在临床实践中应用,多项临床实践反馈的结果也已证实其是一种低毒且高效的免疫佐剂,具有提高疫苗免疫原性的作用。因GM-CSF 可由多种免疫细胞(巨噬细胞、巨细胞、纤维细胞、T 细胞、内皮细胞等)分泌,故可通过诱导小细胞癌分化的途径来抑制肿瘤的恶化,有效降低免疫激活因子和炎性细胞因子活性,进而调节免疫反应,故又被称之为分化诱导器[10]。GM-CSF 基因也可通过刺激树突状细胞和B 细胞等来分泌细胞因子,并与所生成的细胞因子产生协同作用,以达到增强免疫效用的功能[11]。本研究成功扩增山羊GM-CSF 基因,研究成果对深入研究山羊GM-CSF 基因及其功能具有重要意义,为高效、安全免疫佐剂的研发奠定基础。

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