APP下载

CAT、CYBA及NIK基因与慢性阻塞性肺疾病及相关肺动脉高压易感性的关系*

2020-08-04谢欣芸

中国病理生理杂志 2020年7期
关键词:等位基因基因型位点

谢欣芸, 耑 冰, 苑 群, 王 曦, 李 萍, 谢 骏, 杨 朝△

(1西北民族大学第一附属医院,宁夏回族自治区人民医院院本部呼吸内科,宁夏银川750011;2南京医科大学附属苏州科技城医院呼吸科,江苏苏州215153)

慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary diseases,COPD)是一种患病率和致死率均较高的呼吸道疾病,其中肺动脉高压(pulmonary hypertension,PH)是COPD 常见的并发症及主要的致死原因之一。随着环境的改变,COPD 患病率逐年增加,已逐渐成为全球性问题。世界卫生组织的研究表明,COPD 的死亡率居全球致死性疾病的第5位[1],PH 致死率也随之升高。

氧化应激机制在驱动COPD 及相关PH 中起着关键作用。p22phox又称细胞色素b-245 α 多肽(cytochrome B-245 alpha polypeptide,CYBA),是由CYBA基因编码的普遍存在的蛋白质,是产生超氧化物的NADPH 氧化酶(NADPH oxidases,NOXs)的关键成分[2]。p22phox表达增加可激活 NOXs 的生成,导致活性氧簇(reactive oxygen species,ROS)生成增多,继而激活核因子κB(nuclear factor-κB,NF-κB)等信号通路,引起氧化应激损伤。NF-κB 诱导激酶(NF-κB-inducing kinase,NIK)的积累是NF-κB信号通路中的关键事件,可导致NF-κB 增加。王萍等[3]观察到 NF-κB 蛋白与肺血管重塑程度呈正相关,因此可导致肺血管相关疾病。过多的ROS 可由过氧化氢酶(catalase,CAT)分解,以减少氧化应激损伤。目前已有研究表明,CYBA基因 rs1049255 和 rs9932581 位点、CAT基 因 rs1001179 和 rs7943316 位 点 及NIK基 因rs7222094 位点的点突变可导致氧化/抗氧化能力改变,从而介导心血管、呼吸等系统疾病的发生。因此,本研究通过病例-对照研究,探讨CYBA、CAT及NIK基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与COPD 及相关PH 发病易感性的关系,为进一步阐明遗传易感基因在COPD 及相关PH 发生发展中的作用机制提供依据。

材 料 和 方 法

1 研究对象纳入标准

连续选取2016年11月~2018年5月就诊于宁夏回族自治区人民医院院本部汉族稳定期COPD 患者250 例作为病例组,选取同期我院127 例汉族健康体检者为对照组。所纳入COPD 患者符合2013 年《慢性阻塞性肺疾病诊治指南》诊断标准[第1 秒用力呼气 容 积(forced expiratory volume in one second,FEV1)/用力肺活量(forced vital capacity,FVC)<70%][4]。根据超声心动图测得的肺动脉收缩压(pulmonary artery systolic pressure,PASP)将COPD组分为 COPD 相关 PH 组(PASP≥50 mmHg)和 COPD 非PH 组(PASP<50 mmHg)。PH 诊断根据2015 年国际超声心动图PH 的诊断标准(三尖瓣返流速度>3.4 m/s,PASP≥50 mmHg)[5]。排除标准:胸腔积液、肺间质疾病等引起的限制性通气障碍及支气管哮喘;恶性肿瘤;贫血等血液疾病;糖尿病等内分泌疾病;冠状动脉粥样硬化性心脏病、先天性心脏病等心血管系统疾病;自身免疫性疾病;严重的肝、肾功能损伤;静脉药物滥用、使用抑制食欲药物(如右芬氟拉明、阿米雷司及其衍生物等)引起的PH。所有受试者均遵循自愿原则,已签署知情同意书,并经过我院伦理委员会批准。

2 研究方法

2.1 DNA 提取 抽取受试者禁食后晨起静脉血4 mL,置于EDTA 抗凝管内抗凝,严格按照AxyPrep 血基因组DNA 小量试剂盒(Axygen)说明书操作,测定DNA浓度后置于-80℃保存备用。

2.2 引物制备 引物设计使用Genotyping Tools 及MassARRAY Assay Design 软件,并交由北京博奥晶典生物技术有限公司合成。rs1001179 位点的上游引物序列为5'-ACGTTGGATGCAGCAATTGGAGAGCCTCG-3',下游引物序列为5'-ACGTTGGATGCTGAAGGATGCTGATAACCG-3',延伸引物序列为5'-GCCCTGGGTTCGGCTAT-3';rs7943316 位点的上游引物序列为5'-ACGTTGGATGATTGGCTGAGCCTGAAGTCG-3',下游引物序列为5'-ACGTTGGATGTCCACCCTCAGCAGGCAAAT-3',延伸引物序列为5'-gaaagCTGCCTGTTGCCCCGAG-3';rs1049255 位点的上游引物序列为5'-ACGTTGGATGTCGTGTGACCTCGCCCCGGA-3',下游引物序列为5'-ACGTTGGATGCCCCAGGCAGAGGCTCACG-3',延伸引物序列为5'-GCAGGTGGGTGCACCTGG-3';rs9932581 位点的上游引物序列为5'-ACGTTGGATGGTCACTCAGAGCAGGAACC-3',下游引物序列为5'-ACGTTGGATGCGGTGGCCATGGGGAATAAA-3',延伸引物序列为5'-TGGCCATGGGGAATAAACCAGCATT-3';rs7222094位点的上游引物序列为5'-ACGTTGGATGTGCTCGTCTGTTACCTCTCT-3',下游引物序列为5'-ACGTTGGATGAAGTGCACAGATGGTGGATG-3',延伸引物序列为5'-CTGCTCCAGTCACGATGGGCACAG-3'。

2.3 测序验证 使用5 管经二代测序(南京金斯瑞生物科技有限公司)验证的CYBA基因rs1049255 和rs9932581 位点、CAT基因 rs1001179 和 rs7943316 位点 及NIK基因 rs7222094 位点 SNP 的人类 DNA 作为阳性对照,5 管鲑鱼精DNA 作为阴性对照,混杂在待测DNA 样本中进行SNP 分型,最后结果完全匹配率接近100%。

3 统计学处理

统计分析采用SPSS 19.0 软件。以Hardy-Weinberg 平衡定律评估样本的群体代表性。直接计数法统计各位点的基因型频率与等位基因频率(%)。基因型频率、等位基因频率的对比采用χ2检验。用logistic回归方法计算优势比(odds ratio,OR)及其95%置信区间(confidence interval,CI),评估各位点基因多态性是否会影响COPD及相关PH的发病率。

结 果

1 临床资料

本研究共纳入 COPD 患者 250 例,其中 COPD 非PH 组 147 例,COPD 相关 PH 组 103 例,健康对照组127 例。年龄、性别和吸烟指数在COPD 组与健康对照组、COPD 非 PH 组与 COPD 相关 PH 组间差异无统计学显著性,见表1。

表1 健康对照者及COPD组、COPD非PH组和COPD相关PH组患者的临床资料Table 1.Clinical characteristics of the healthy controls(control group),and the patients in COPD,COPD without PH and COPD with PH groups

2 Hardy-Weinberg平衡检验

CYBA基 因 rs1049255 和 rs9932581、CAT基 因rs1001179和rs7943316及NIK基因rs7222094位点的基因型在各组间分布均符合Hardy-Weinberg 平衡,具有群体代表性,见表2~4。

表2 CYBA基因rs1049255和rs9932581位点的基因型在各组间的Hardy-Weinberg平衡检验Table 2.Hardy-Weinberg equilibrium of CYBA gene rs1049255 and rs9932581 loci in the studied groups

表3 CAT基因rs1001179和rs7943316位点基因型在各组间的Hardy-Weinberg平衡检验Table 3.Hardy-Weinberg equilibrium of CATgene rs1001179 and rs7943316 loci in the studied groups

表4 NIK 基因rs7222094 位点基因型在各组间的Hardy-Weinberg平衡检验Table 4.Hardy-Weinberg equilibrium of NIK gene rs7222094 locus in the studied groups

3 在健康对照组与COPD 组之间对比CAT、CYBA和NIK基因所纳入SNP位点基因型及等位基因频率的分布情况

在健康对照组与COPD 组之间,rs1001179 位点基因型及等位基因频率分布的差异有统计学意义(P<0.05),而 rs1049255、rs9932581、rs7943316 和rs7222094 位点基因型及等位基因频率分布的差异无统计学显著性(P>0.05),见表5。

4 在 COPD 非 PH 组与 COPD 相关 PH 组之间对比CAT、CYBA 和 NIK 基因所纳入 SNP 位点基因型及等位基因频率的分布情况

在 COPD 非 PH 组 与 COPD 相 关 PH 组 之 间 ,rs1049255 位点基因型及等位基因频率分布的差异有统计学显著性(P<0.05),rs7222094 位点等位基因频率分布的差异有统计学显著性(P<0.05),而rs7222094 位点基因型,以及 rs1001179、rs9932581 和rs7943316 位点基因型及等位基因频率分布的差异无统计学显著性(P>0.05),见表6。

讨 论

CAT 主要通过降解过氧化氢生成氧气和水来抵抗氧化损伤,在人体中所有主要身体器官中都有表达。当短时间内ROS 产生过多时,主要由CAT 发挥抗氧化作用,以维持氧化/抗氧化平衡[6]。而CAT基因单个位点的核苷酸变异可影响其表达水平,使其活性降低,抗氧化能力减弱,导致氧化应激增强,可能参与如肺癌、前列腺癌等的发生。但这种多态性的效果似乎并非在所有研究中呈现一致的方向性。rs1001179 位点位于CAT基因启动子区域,Mc-Culloygh 等[7]证实,该位点 SNP 与女性乳腺癌发生相关,且CC 基因型可显著增加女性乳腺癌患病风险。Goulas 等[8]在对血脂异常患者的研究中观察到该位点TT 基因型与较高的糖化血红蛋白和血浆甘油三酯水平相关,是增加糖化血红蛋白和血浆甘油三酯的危险因素。Ershova 等[9]认为该位点 C 等位基因是氧化应激发展中的危险因素,可导致发生氧化应激的风险增加。而本研究检测到CAT基因rs1001179位点基因型及等位基因频率分布在健康对照组和COPD 组之间的差异有统计学显著性(P<0.05),风险评估显示,与C 等位基因相比,携带T等位基因的受试者COPD 发病风险较低,提示T等位基因可能为保护性因素。进一步对COPD 的常见并发症PH进行易感性分析,并未观察到该位点在COPD 非PH组和COPD 相关PH 组之间的差异有统计学显著性(P>0.05)。

CYBA基因位于第16号染色体的长臂上,长度为8.5 kb,包括6 个外显子[2],rs1049255 位点位于该基因的3'端非翻译区(3'-untranslated region,3'-UTR)。Xu 等[10]在对急性心肌梗死的风险以及冠状动脉狭窄程度的研究中阐明rs1049255 位点多态性可能对冠状动脉粥样硬化风险具有保护作用,其G 等位基因可能是该病的保护性因素。Zhou等[11]在对终末期肾脏病的基因多态性研究中阐明该位点与NOXs 活性降低和p22phox蛋白含量降低有关,其中GG 基因型和G 等位基因可能是抵抗终末期肾脏病风险的保护因素,这可能是由于GG基因型与ROS产生减少和氧化应激减弱有关。本研究观察到rs1049255 位点基因型及等位基因频率在中国宁夏地区汉族COPD 相关PH 及COPD 非PH 患者之间的差异有统计学显著性(P<0.05);风险评估显示,与GG基因型相比,携带AA基因型的 COPD 患者 PH 发病率较高,与 G 等位基因相比,携带A 等位基因的COPD 患者发生PH 风险较高,GG 基因型及G 等位基因可能为PH 的保护性因素。

表5 健康对照组与COPD组间CAT、CYBA和NIK基因SNP位点基因型及等位基因频率的对比Table 5.Distribution of genotypes and alleles of CAT,CYBA and NIK gene SNP loci in control and COPD groups

NF-κB 是一种核转录因子,通过 NF-κB 介导的信号通路,可以激活核调节的多种炎症因子的表达[12]。该信号通路的关键事件是NIK 的积累,可间接引起炎性因子增加,介导COPD 或COPD 相关PH的发生[13]。本研究检测到NIK基因 rs7222094 位点等位基因频率在COPD 非PH 组与COPD 相关PH 组之间的差异有统计学显著性(P<0.05),但该位点尚未被广泛研究。Thair等[14]观察到该位点的SNP与感染性休克患者死亡率显著相关,基因型为CC 纯合子的患者死亡率将显著增加。本研究的风险评估显示,与C 等位基因相比,携带T 等位基因的COPD 患者发生PH 的风险将减低,提示C 等位基因可能是风险等位基因,但本研究尚未检测到该位点基因型在组间的差异有统计学显著性(P>0.05)。此外,rs9932581 和rs7943316 位点在各组间的差异无统计学显著性(P>0.05),可能与种族、地域差异、检测方法、样本量大小等因素均有关。

综上所述,CAT基因rs1001179 位点T 等位基因可能为COPD 的保护因子,可降低COPD 发病风险;CYBA基因 rs1049255 位点 GG 基因型和 G 等位基因及NIK基因rs7222094 位点T 等位基因可能为COPD相关PH 的保护因子,可降低COPD 相关PH 发病风险。因此对于某些COPD 及其相关PH 高危患者,可进行基因检测,早期预防及干预,这为COPD 及其相关PH基因易感性的个体化预防提供了新线索。

表6 COPD非PH组与COPD相关PH组间CAT、CYBA和NIK基因SNP位点基因型及等位基因频率的对比Table 6.Distribution of genotypes and alleles of CAT,CYBA and NIK gene SNP loci in COPD without PH and COPD with PH groups

猜你喜欢

等位基因基因型位点
HBV基因型的研究现状与发展趋势探讨
Pd改性多活性位点催化剂NH3-SCR脱硝反应机理研究
HBsAg低反应性乙肝患者HBeAg表达与HBV基因型、DNA载量的关系
亲子鉴定中Penta E稀有等位基因28的确认1例
亲子鉴定中男性个体Amelogenin基因座异常1例
CLOCK基因rs4580704多态性位点与2型糖尿病和睡眠质量的相关性
基于网络公开测序数据的K326烟草线粒体基因组RNA编辑位点的鉴定与分析
广东汉族人群Penta D基因座off-ladder稀有等位基因分析
贵州汉族人群23个STR基因座的OL等位基因研究
一种改进的多聚腺苷酸化位点提取方法