大肠杆菌对大鼠肠上皮细胞IEC-6LncRNA 表达的调控
2020-06-19张明昱宋婉莹赵鹏伟李存保通讯作者
张明昱 宋婉莹 赵鹏伟 李存保(通讯作者)
(1 内蒙古医科大学研究生学院 内蒙古 呼和浩特 010010)
(2 内蒙古医科大学基础医学院 内蒙古 呼和浩特 010010)
大肠杆菌引起的肠道炎症,在临床中最为常见[1-2]。LncRNA(长链非编码RNA,Long non-coding RNA)对细胞的生长,分化等诸多生理活动有调控作用[3-4]。本研究就大肠感染感染大鼠肠上皮细胞后LncRNA 发生的变化进行研究,旨在为进一步研究LncRNA在大肠杆菌感染大鼠肠上皮细胞后的调节机制奠定基础,为深入的临床应用提取条件。
1.实验材料
大鼠肠上皮细胞IEC-6 购自中科院上海细胞库,大肠杆菌ATCC8739 购自贝纳生物。
2.实验方法
2.1 MTT 检测最佳的细菌浓度
用0,101,102和103个/ml 的大肠杆菌作用于大鼠肠上皮细胞IEC-6 中并于第0,24,48 和72h 检测。在酶标仪490nm 波长处测定吸光度(OD)值,依照公式计算细胞增殖率,细胞生长率(%)=(OD 药物/OD 对照)×100%
2.2 大肠杆菌对大鼠肠上皮细胞LncRNA 表达影响的分析
用最佳浓度的细菌作用IEC-6 细胞后提取RNA,送测序公司进行分析。并对所得结果进行生物信息学的分析。
3.结果
3.1 最佳的大肠杆菌作用细胞的浓度
通过MTT 检测得到了如下结果。大肠杆菌能够抑制MFC 细胞的增殖,且呈剂量和时间依赖性。作用细胞时间72 小时,随细菌浓度的增加,对细胞增殖的抑制率也逐渐增加,但当细菌作用时间达到48 小时时细胞几乎全部死亡。在12h 时细胞的生长已经受到抑制,而且103个/ml 和104个/ml 的大肠杆菌对细胞抑制作用显著高于10 个/ml 和102个/ml 组,见表。
表 不同作用时间不同浓度大肠杆菌对MFC 细胞增殖的抑制率
3.2 大肠杆菌对大鼠肠上皮细胞LncRNA 表达影响的分析
提取大肠杆菌作用后的大鼠肠上皮细胞的RNA 后送测序公司进行分析。得到了6 个有可能参与此过程的RNA,见图1。
图1 大肠杆菌对大鼠肠上皮细胞LncRNA 表达影响的分析
4.讨论
肠炎主要是由细菌,病毒,寄生虫等相关病原微升物引起的,临床主要表现为腹痛,腹泻,便希并常带血。该病在夏季最为常见,上吐下泻是其主要症状[5-6]。LncRNA 其长度均大于200,且为非编码RNA,研究发现,LncRNA 对细胞周期,细胞分化等诸多的生命活动均有很好的调控作用[4]。本研究通过对大肠杆菌作用后的大鼠肠上皮细胞的RNA 后送测序公司进行分析。得到了6 个有可能参与此过程的RNA。为进一步的深入研究奠定基础。