解淀粉芽孢杆菌HAB-9的鉴定及对17株植物病原菌的拮抗作用①
2019-09-21李培征刘惠芳李秀芳刘文波秦春秀
陈 照 李培征 刘惠芳 李秀芳 刘文波③ 秦春秀③
(1海口市秀英区农林局 海南海口570100;2海南大学植物保护学院/热带农林生物灾害绿色防控教育部重点实验室 海南海口570228)
芽孢杆菌(Baci l lussp.)是人们熟知的一类重要的生防微生物,在自然界分布广泛,具有生长速度快、营养需求简单、较强的耐热性和抗逆性、在植物表面易于存活与繁殖等特性[1]。芽孢杆菌代谢产物较为丰富,如脂肽类、多糖、磷脂类、聚酮类、多烯类物质等[2],部分菌株还可以分解土壤中的不溶性磷酸盐;对人畜无害,不污染环境,作为生防菌,具有施用方便,能为农业可持续发展提供帮助[3];一些种类的芽孢杆菌不仅有防病作用,还能促进植物增产,也可以改善植物根际周围环境,刺激和调控植物生长,抑制植物的病害发生[4],包括根部病害、枝干病害、一些植物的立枯病菌、黄萎病菌、炭疽病菌等[5]。
解淀粉芽孢杆菌(B.amyloliquefaciens)与枯草芽孢杆菌(B.subt i l is)是两类重要的生防细菌,亲缘性很高[6],许多表型特征非常相似,仅通过形态、培养特征及其生理生化很难区分,只有通过进一步基因序列比较才能将两者区分开来[7]。解淀粉芽孢杆菌是一种好氧的革兰氏阳性杆状细菌;有大于菌体的次末端芽孢;芽孢卵圆型,孢囊膨大;最适生长温度为28~30℃,最适生长pH为6.5~7.0。它具有还原硝酸盐;水解淀粉;可利用D-葡萄糖,L-阿拉伯糖,甘露醇,D-木糖作为碳源;接触酶阳性;氧化酶阴性等生理生化性质[8]。
B.amyloliquefaciensHAB-9菌株是从海南省儋州市两院槟榔土中分离筛选得到,室内研究表明,其对槟榔炭疽病菌(Colletotrichum gloeosporioides)等17株植物病原真菌均具有拮抗活性。本文对它进行16S rDNA鉴定,并对其生化特征测定及抑菌谱进行研究,为实现该生防细菌的抑菌机理提供参考依据。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 供试细菌、真菌
供试细菌:HAB-9,从槟榔树根际土壤中分离保存。
供试真菌:所有菌株均由海南大学植物保护学院分子植物病理学实验室提供,并经单孢分离纯化后备用,见表1。
表1 供试植物病原真菌
1.1.2 培养基
LB固体培养基:酵母粉5 g,胰蛋白胨10 g,氯化钠10 g,琼脂16 g,蒸馏水定容至1 000mL,pH7,121℃蒸气灭菌20min。
PDA固体培养基:马铃薯200 g,葡萄糖20 g,琼脂粉16 g,蒸馏水定容至1 000mL,121℃蒸气灭菌20min。
M.R、V-P测定培养基:蛋白胨5 g,葡萄糖5 g,氯化钠5 g,蒸馏水定容至1 000mL,pH 7~7.2,每管分装4~5 mL,然后在115℃蒸气灭菌30min。
解淀粉培养基:在肉汁胨中加0.2%可溶性淀粉,蒸馏水定容至1 000mL,分装三角瓶,121℃蒸气灭菌20min,倒平板备用。
1.1.3 主要仪器
灭菌锅(HVE-50),电子天平(OHA),显微镜(OLYMPUS),恒温摇床 (Innova4230),移液枪(eppendor f),制冰机 (SANYO),恒温水浴锅(Polscience), HH-B11恒温培养箱,PCR仪(eppendor f),分光光度计(penk),凝胶成像系统(北京六一),电泳仪(北京君意),微波炉(格兰仕)等。
1.2 方法
1.2.1 生防细菌的分子生物学鉴定
从划线培养的平板上挑取HAB-9单菌落接种到100mLLB液体培养基中,28℃,200 r/min振荡培养 过 夜 。 27F: 5’ -AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’;1492R:5’-GGTTACCTTGTTACGACTT-3’引物进行PCR扩增,引物由深圳华大基因股份有限公司合成。反应体系:25µL体系中含有10×PCRbuf fer 2.5 µL,dNTPs 2.0 µL,27F 1.0 µL,1492R 1.0 µL,菌液1.0µL,Trans Taq酶 0.2µL,ddH2O 17.3 µL。反应条件:94℃ 5 min,94℃ 1 min,50℃ 30 s,72℃ 2min,30个循环;72℃ 10min[9];PCR产物,经1%琼脂糖凝胶电泳胶回收后,连接到pMDTM18-TVector载体,转化到感受态细胞DH5α。筛选阳性克隆送上海生工基因股份有限公司进行测序。
1.2.2 HAB-9菌株的生化特征测定
进行M.R测定、V-P测定、淀粉水解、氧化酶测定、接触酶测定等[10],并对其进行革兰氏染色[11]。
1.2.3 HAB-9菌株对植物病原真菌的拮抗作用
采用平板对峙培养法进行生防菌对多种病原真菌的拮抗作用测定。在PDA培养基中心接种直径4.0mm的病原真菌的菌饼,在距中心25.00mm的成正方形的4个点分别接种待测菌株,各处理4个重复,置于28℃黑暗培养,待对照组病原真菌长满整皿后,观察处理组有无抑菌圈及抑菌圈的大小,分别测定处理组及对照组的菌落直径,计算抑菌率。抑制率=
1.2.4 数据分析
所有试验均重复4次,数据采用Excel 2016、SPSS19.0和SAS9.2进行统计分析。
2 结果与分析
2.1 HAB-9菌株的分子生物学鉴定
2.1.1 PCR产物回收
PCR产物经过1%琼脂糖凝胶电泳检测,获得约为1 500 bp大小的片段PCR电泳产物及回收(图1)。
图1 HAB-9菌株PCR扩增产物电泳图
2.1.2 转化子的菌落PCR检测
随机挑取5个白色菌落培养菌液为模板进行PCR扩增,PCR产物经1.0%琼脂糖凝胶电泳检测。所挑选的转化子均扩增得到1 500 bp左右的条带,为阳性克隆(图2)。
2.1.3 序列分析
挑选阳性克隆,送往深圳华大基因公司测序,并对测序结果进行分析。经NCBI的Blast搜索16SrDNA进行比对,并通过DNAstar软件构建系统进化树(图3)。结果显示HAB-9为解淀粉芽孢杆菌,与其遗传距离最近的登录号为AB813716.1。
图2 HAB-9菌株ITS结果PCR
2.2 HAB-9菌株的生理生化测定
2.2.1 革兰氏染色
由图4可知,HAB-9菌株革兰氏染色为深紫色,呈阳性。
2.2.2 M.R测定及V-P测定
由图5可知,M.R测定,HAB-9菌株呈阴性;V-P测定,HAB-9菌株呈阳性。
2.2.3 氧化酶及接触酶测定
HAB-9菌株氧化酶测定均呈阴性,接触酶测定呈阳性。
2.2.4 淀粉水解
由图6可知,解淀粉测定,HAB-9中间均形成明显的透明圈,有解淀粉功能。
2.3 HAB-9菌株的抑菌作用测定
采用平板对峙法培养后,经后期统计处理,结果如下:HAB-9菌株对17种植物病原真菌的抑菌作用见图7,通过计算HAB-9菌株对各真菌的平均抑制率。进行比较(表2),表明HAB-9菌株对17种病原真菌的抑菌率存在差异,主要对炭疽病菌有很好的抑菌效果。
图3 HAB-9菌株16srDNA比对及进化树
3 讨论与结论
对解淀粉芽孢杆菌HAB-9菌株进行了16S rDNA鉴定、生化特征测定及对17种病原真菌的拮抗作用的研究。通过序列分析,HAB-9菌株与解淀粉芽孢 杆 菌 (B.amyloliquefaciens)(GenBank NO.GQ169782.1)的相似度为99%,初步推断为解淀粉芽孢杆菌;经革兰氏染色、M.R测定、V-P测定、淀粉水解、氧化酶测定、接触酶测定,都符合解淀粉芽孢杆菌的特性[10],可以认定为解淀粉芽孢杆菌。
图4 革兰氏染色
图5 M.R测定和V-P测定
图6 解淀粉测定
芽孢杆菌对植物病原真菌的拮抗作用很多人已经做过,常用的方法有抑菌圈法、对峙培养法、摇瓶菌丝生长抑制法等[8]。不同的方法存在着优缺点,本实验中采取了平板对峙培养法测定了HAB-9对17株植物病原真菌的拮抗作用。实验结果表明HAB-9对17种不同植物病原真菌均有不同程度的拮抗作用,发现HAB-9对槟榔炭疽病(C.gloeosporioides)有较好的拮抗作用,其抑菌率为70.59%;效果最差的为来自海南保亭橡胶树棒孢霉落叶病菌C.cassiicola),抑菌率为50.22%。
表2 HAB-9菌株对17种病原真菌抑菌率统计结果(%)
根据实验结果来看,解淀粉芽孢杆菌HAB-9在实验中对炭疽病菌及其他植物病原菌有抑制作用,抑制率都超过了50.00%,对不同种炭疽病菌抑制程度不一样,特别是对槟榔炭疽效果最好。解淀粉芽孢杆菌可以开发为生防菌,研究成生物农药,但是要将一种生防菌开发成一种商品就要考虑到生产成本问题,还有开发成商品之后在田间的使用效果等。据有关文献记载,虽然芽孢杆菌的研究已经取得了很大的进步,但仍存在着一些问题。解淀粉芽孢杆菌属于芽孢杆菌属,将其开发成生物农药一样要面临着这些问题,诸如:(1)生产成本:生防菌与化学农药相比分泌量比较低,生产周期比较长,这些因素都相应地增加了生产成本。(2)应用问题:将生物杀菌剂投入田间使用,生防菌的性能可能会受到田间微生物、温度、pH值等因素影响而发生变化作用,从而影响抑菌性能;生防菌与土壤本身存在的微生物的排斥;另外田间存在的农药不适宜生防菌的繁殖[12]。
然而,当今世界随着分子研究技术和科学技术的提高,解淀粉芽孢杆菌的基因功能更多的被了解,诸如上面所提到的一些问题势必也能一一解决,解淀粉芽孢杆菌开发成生物农药会被广泛地应用。将更多生防菌开发成生物农药也是历史发展的必然趋势。用不同的生防菌联用,以增强其生防效果[13],从而充分发挥生防菌的优势,为农业生产提供保障,造福人类。
图7 HAB-9菌株对17种病原菌抑菌作用