长针线虫Longidorus pinus的形态和分子鉴定
2019-01-15樊金玲徐玉梅赵增旗王建明
樊金玲,徐玉梅,赵增旗,2,王建明
(1.山西农业大学农学院,山西太谷030801;2.新西兰皇家研究院土地环境研究所,新西兰奥克兰1072)
长针线虫属(Longidorus Micoletzky,1922)寄生在植物根际,不仅会造成植物根部肿大、生长不良,而且还会传播植物病毒,引起果蔬病害,严重时会造成产量损失[1]。因其具有种类多样性以及分布广泛等特点被研究人员广泛关注[2]。目前,该属全世界已报道的有160多种,其中,我国报道的有20种[2-11]。
本研究采用传统形态学和分子生物学(包括18S和28S的分子序列)相结合的鉴定方法,对采自山西介休的枣树根际土壤中的线虫进行种类鉴定,以明确该线虫的分类地位。
1 材料和方法
1.1 样品的采集
试验材料采自山西省介休市(112°10′14″E,36°50′01″N),取枣树根际土壤样本 1 000 g,编号JX10,装入封口袋中,做好标记带回实验室。
1.2 方法
1.2.1 线虫标本的分离、制片和形态观察 采用浅盘法分离线虫[12],应用改进的SEINHORST[13]方法脱水,将固定脱水的线虫采用改进的HOOPER[14]方法制成永久玻片,并将制好的永久玻片置于Nikon 80i显微镜下进行观察,用尼康Ds-Fi2拍照,用NIS Elements version 4.10软件测量形态并利用de Man公式计算测量指标a,b,c,c'和V,具体方法参照文献[15-16]。
1.2.2 线虫的DNA提取、PCR扩增和系统发育树的构建 取单头线虫采用改进的蛋白酶K裂解法提取DNA[17]。18S采用2对引物扩增,第1对的上、下游引物分别为:1096F(5′-GGTAATTCTGGAGCTA ATAC-3′),1912R(5′-TTTACGGTCAGAACTAGG G-3′);第 2 对的上、下游引物分别为:1813F(5′-CT GCGTGAGGTGAAAT-3′),2646R(5′-GCTACCTTGT TACGACTTTT-3′)。28S的上、下游引物分别为:D2A(5′-ACAAGTACCGTGAGGGAAAGT-3′),D3B(5′-T GCGAAGGAACCAGCTACTA-3′)。PCR 扩增程序:95℃ 2.75 min;95℃ 1 min,53℃ 30 s,72 ℃ 1 min,40个循环;72℃7 min。采用XU等[18]的方法进行产物纯化,由生工生物工程(上海)股份有限公司进行双向测序。测序结果用Sequencher 5.1.2编辑拼接,并用Mrbays 3.1.2构建系统发育树。
2 结果与分析
2.1 形态学特征
其测量结果列于表1。
表1 供试线虫及其比较种群形态测量计值 μm
雌虫(图1-A~H):虫体热杀死后呈J型或C型,体长 3 480~4 366 μm,唇宽 10.5~11.3 μm,明显缢缩。齿尖针纤细,69.8~81.7 μm,齿托基部微肿胀,导环距头前端30.6~33.6 μm。神经环到头前端的距离195~248μm,食道球圆柱形((67~79)μm×(14~17)μm),阴门处体宽 27.3~36.1 μm,尾部圆锥形,尾长 32.3~41.5 μm(表 1)。
幼虫(图1-I~L):仅发现1龄幼虫1头,除个体大小和生殖器官外,与雌虫均相似。虫体热杀死后呈 J型或 C型,体长 1 176 μm,口针 43.8 μm,替代口针52.2 μm,替代口针前端插入齿托内部。尾短,圆锥形,尾长 17.6 μm(表 1)。
未发现雄虫。
2.2 分子生物学特征分析
本试验种群对18S和28S测序分别获得1 559,746 bp,将其与NCBI中已有的序列进行了比对,其结果表明,18S序列相似度最高的是Longidorus(MF674014和MF674015),与MF674014相似率为99%(1 559 bp有1 bp空白差异),与MF674015相似率为100%(图2)。28S序列相似度最高的是Longidorus(MF674016~MF674019),与 4 条序列的相似率均为99%(图3)。
2.3 系统发育树构建
以 Paralongidoruslitoralis和 Paralongidorus paramaximus为外群,用GTR+I模型构建的18S系统发育树如图2所示。本试验种群JX10与Longidorus pinus(MF674015 和 MF674014)在同一分枝上,置信度达100%。
以Paralongidorus maximus和Paralongidorus plesioepimikis为外群,用GTR+G模型构建的28S系统发育树如图3所示。本试验种群JX10与Longidorus pinus(MF674016~MF674019)在同一分枝上,置信度达96%。
2.4 鉴定结果
综合形态学特征和分子生物学分析结果,将JX10鉴定为松树长针线虫Longidorus pinus。依照CHEN等[19]和PENEVA等[20]的多歧检索表,确定其鉴定代码为A23-B1-C23-D4-E1-F2-G23-H23-I1-J2-K6。
3 结论与讨论
本试验在形态学鉴定的基础上,采用18S和28S区的分子序列及其系统发育分析相结合的方法,将山西介休枣树根际土壤中分离的长针属线虫鉴定为Longidorus pinus。与XU等[3]标本相比,本试验种群雌虫的齿托较短(30.3~49.5 μm),尾部较长(32.3~41.5 μm),XU等[3]标本的齿托和尾长分别为42.1~54.3,30.9~39.7 μm。可能是由于不同的地理种群造成的种内差异。
松树长针线虫Longidorus pinus首次于山西省汾阳市、太谷北洸村、大同市平旺花园、太原市阳曲县和山西农业大学校园等地发现,其寄主包括松树、白蜡树、玉米、槐树和杨树。枣树为该线虫的新寄主。