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汉族人群乙型肝炎病毒感染者外周血IL-28B基因多态性研究*

2018-07-17谈国蕾孙梅王建芳吴旭平

实用肝脏病杂志 2018年4期
关键词:等位基因多态性基因型

谈国蕾,孙梅,王建芳,吴旭平

HBV感染所致的肝硬化(liver cirrhosis,LC)、肝衰竭(liver failure,LF)和肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)较为常见[1]。白细胞介素 -28B(in terleukin 28B,IL-28B)基因作为一个重要的细胞因子基因,具有影响抗病毒和免疫调节等作用,在HBV感染进程中有着重要的作用[2,3]。本研究检测了HBV感染者外周血IL-28B基因rs8099917和rs12979860多态性,以探讨其与乙型肝炎病程进展的关系。

1 资料与方法

1.1 研究对象 本研究对象为2013年1月~2014年12月南京市第二医院门诊及住院的HBV感染者。按照2010年中华医学会肝病学分会和感染病学分会制定的《慢性乙型肝炎防治指南》[4]对疾病诊断并分组如下:无症状携带者(asymptotic HBV carriers,ASC)45例,慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)患者181例,LC患者69例,HCC患者79例,LF患者79例。另选同期在我院健康体检者145例作为对照。所有人群无重叠或混合其他病毒感染,入选对象均为江苏籍汉族人群。

1.2 外周血IL-28B基因多态性检测 取外周血,EDTA抗凝,采用QIAGEN公司的DNA Blood Kit提取DNA,直接用于PCR扩增或者保存于-20℃备用。根据NCBI上IL-28B基因序列设计引物。rs12979860位点上游引物rs860-F:CTTATCGCATACGGCTAGGC,下游引物 rs860-R:GGACCGCTACGTAAGTCACC。rs8099917位点上游引物rs917-F:TTCACCATCCTCCTCTCATCCCTCAT,下游引 物 rs917-R:TCCTAAATTGACGGGCCATCTGTTTC。引物由上海英骏生物技术有限公司(Invitrogen)合成。PCR反应条件:94℃预变性5 min,94℃30 s,55℃ 30 s,72℃ 30 s;共 35 个循环,最后,72℃延伸5 min。取PCR产物,经1.5%琼脂糖凝胶电泳确定扩增结果。PCR产物用QIAGEN公司QIA Quick PCR Purification kit进行产物纯化。将纯化后的PCR产物送南京金思瑞生物科技公司测序。分析和记录IL-28B rs8099917和rs12979860位点的基因型和等位基因。

1.3 统计学分析 采用Pearson x2检验对IL-28B rs8099917与rs12979860位点进行Hardy-Weinberg平衡检验,计量资料以(±s)表示,计数资料采用例数表示。应用SPSS 17.0软件进行方差分析、x2检验和Binary Logistic回归分析,P<0.05表示差异有统计学意义。

2 结果

2.1 入组人群的临床特点 453例HBV感染者年龄和性别比较见表1,ASC患者中男性比例显著少于健康人群(x2=10.991,P=0.001),LC 患者中男性比例显著高于健康人群(x2=7.684,P=0.006)。LC患者、HCC患者和LF患者的年龄显著大于健康人群(P<0.05)。

2.2 Hardy-Weinberg平衡检验 对健康人群IL-28B基因2个位点分别进行平衡检验,经拟合优度x2检验,各个基因型分布实际值近似于推算获得的期望值,提示这些rs8099917与rs12979860位点处于遗传平衡状态(P>0.05),表明用于本研究的对照样本具有群体代表性,对照组中多态性位点Hardy-Weinberg遗传平衡检验结果见表2。

表1 各组人群年龄和性别(n,±s)比较

表1 各组人群年龄和性别(n,±s)比较

与健康组比,①P<0.05

健康人(n=145) ASC(n=45) CHB(n=181) LC(n=69) HCC(n=79) LF(n=79)性别(男/女) 98/47 18/27① 135/46 59/10① 63/16 54/25年龄(岁) 35.3±14.2 35.7±8.6 36.6±12.5 47.8±11.3① 55.5±10.0① 45.8±12.8①

表2 对照人群多态性位点Hardy-Weinberg遗传平衡检验结果

2.3 rs12979860位点基因型和等位基因分布情况 在本地区人群中,IL-28B基因rs12979860位点有三种基因型,即CC、CT和TT,以CC和CT为主要基因型,TT型只在健康人群和CHB患者中存在。ASC患者、CHB患者、LC患者、HCC患者CC型频率与健康人群无显著性差异(P=0.797,P=0.422,P=0.428,P=0.997),只有LF人群中CC型频率显著高于健康人群(P=0.045),提示CC型与LF的患病风险有关(OR=0.257)。ASC患者、CHB患者、LC患者、HCC患者C等位基因频率与健康人群无显著性差异(P=0.685,P=0.406,P=0.352,P=0.907),只有 LF 患者显著高于健康人群(P=0.038),提示C等位基因与LF的患病风险有关(OR=0.255,表3)。

表3 IL-28B基因rs12979860基因型和等位基因频率(%)分布

2.4 rs8099917位点的基因型和等位基因分布情况 在本地区人群中,IL-28B基因rs8099917位点有三种基因型,即 TT、TG、GG,以 TT、TG 为主要基因型。GG型只在健康人群和CHB患者中存在。LC患者TT型频率显著高于健康人群(P=0.041),而ASC、CHB患者、HCC患者、LC患者与健康人群无显著性差异(P=0.414,P=0.245,P=0.179,P=0.323),提示TT型与肝硬化的患病风险有关(OR=0.288)。ASC、CHB患者、HCC患者、LF患者与健康人群差异均不具有统计学意义(P=0.540,P=0.245,P=0.166,P=0.264),只有LC患者T等位基因比例显著高于健康人群(P=0.036),提示T等位基因与LC的患病风险有关(OR=0.299,表 4)。

表4 IL-28B基因rs8099917基因型和等位基因频率(%)分布

3 讨论

本研究分析了IL-28B基因2个SNPs位点(即rs8099917和rs12979860)在健康人群与ASC患者、CHB患者、LC患者、HCC患者和LF患者中的分布。结果表明,在健康人群和CHB患者或HCC患者中这两个位点分布都无显著性差异,即rs8099917和rs12979860位点多态性与HBV感染引起的CHB或HCC无明显相关。本研究发现的这个结果与国外学者]在健康人群和CHB患者中的结果,rs8099917和rs12979860基因型和等位基因分布无显著性差异是一致的[5-9]。

但是,IL-28B rs12979860和rs8099917多态性与HCC是否相关有着不同的结论。其他相关研究[10-12]表明,IL-28B rs12979860位点T等位基因在HCC患者中更普遍存在,而本研究与Akkiz[13]发现的rs-12979860位点在健康人群和HCC患者无显著性差异的结果是一致的。尚有其他报道[8,14,15]发现该位点在HCC患者和LC患者中都无显著性差异。此外,国内哈明昊[16]报道,IL-28B rs12979860位点T等位基因在ASC人群、CHB患者和LC患者中无显著性差异,可能不是病情进展的影响因素,与本文研究结果是不一致的。本研究还发现IL-28B rs12979860位点在健康人群和LF患者中有显著性差异,C等位基因的HBV携带者罹患LF的风险增加。是否与LF相关的报道较少,本研究的下一步将进一步扩大LF患病人群,研究LF发生发展的机理及其与遗传基因的相关性问题。

本研究发现IL-28B基因rs8099917位点在LC患者与健康人群有显著性差异,即IL-28B rs8099917位点T等位基因的携带者罹患LC的风险增加。Kimkong et al报道[11]在台湾地区,相对于健康人群组,IL-28B T等位基因都是乙型肝炎病程进展的易感基因,T等位基因是CHB的易感基因,但不是LC和HCC的易感基因。Kim et al[17]报道,相对于正常人,携带T等位基因者罹患HCC的风险增加。哈明昊[16]报道,T等位基因在ASC人群、CHB患者和LC患者无显著性差异。也有与之不一致的报道,比如Hodo et al[18]发现T等位基因是肝癌的高风险基因,而Lee et al[14]报道该点在HCC患者和LC患者中都无显著性差异。国内王艳[19]报道IL-28B G是发生HCC的高风险基因,T则是保护性基因。这些在不同地区和不同人群研究结果的差异,提示IL-28B基因多态性导致乙型肝炎病情进展仍存在较多的争议。

综上所述,通过本研究发现了人外周血IL-28B rs8099917和rs12979860基因多态性与HBV感染后的病情进程有一定的关联,且可能受到不同地区不同种族人群遗传结构的影响,以及研究对象样本量的影响,其具体机制仍有待进一步研究。

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