美国《Emerging Infectious Diseases》2018年第3期有关人兽共患病论文摘译

P443 使用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱法对流感嗜血杆菌进行荚膜分型//Viktor Mänsson, Janet R. Gilsdorf, Gunnar Kahlmeter,等

荚模型流感嗜血杆菌具有型特异性。采用PCR方法对菌株进行荚膜分型是可靠的，但一种更加有效的方法或许更有用。本研究对使用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱法(MALDI-TOF)对菌株荚膜分型进行评估。本调查涵盖所有荚膜型分离株(a-f 型和无法分型；n=258)和同基因荚膜转化株(a-d 型)。质谱的主成分分析与生物标志物分析结果显示呈聚集性，且峰值与荚膜型特异性基因谱系一一对应。我们使用31株选择株建立了一个荚膜分型数据模型，用余下的227株分离株对该模型进行验证，结果显示该模型对61株a-f型菌株的分型的灵敏度为100%，特异度为92.2%。为进一步提高特异度，我们建立了包含50株菌株的扩大数据模型，使用126株临床分离株对扩大模型进行盲法验证，结果显示扩大模型对28株b、e、f型荚膜菌株分型的灵敏度为100%，特异度为100%。可见，使用MALDI-TOF质谱法对流感嗜血杆菌进行荚膜分型是十分精确的。

P453 以色列在引入7价和13价肺炎疫苗后出现肺炎链球菌12F血清型//Assaf Rokney, Shalom Ben-Shimol, Zinaida Korenman,等

以色列分别于2009年和2010年开始实施7价和13价肺炎疫苗的接种工作。在疫苗引进后的七年来，我们对由肺炎链球菌12F血清型(Sp12F)引起的侵袭性肺炎(IPD)进行了前瞻性、人群为基础的、全国性的动态监测。结果显示，2009年7月至2016年6月期间共发生侵袭性肺炎 4 573次，其中434次(9.5%)由12F血清型引起。小于5岁年龄组由12F血清型引起的侵袭性肺炎发病率上升最显著，2009至2010年为1.44/10万，而2011至2012年高于3.9/10万；其它年龄组也均有不同程度的上升。在2011至2016年期间，12F血清型为引发侵袭性肺炎的主要血清型，多对青霉素不敏感(MIC>0.06 μg/mL；MIC50=0.12)，且主要为序列型3774，该型仅在以色列发现(在2000年至2009年间占90%)。实施疫苗接种以来，12F血清型作为优势株所引发的侵袭性肺炎持续、急剧上升，该单一血清型的扩张可能不仅仅是一个短暂的暴发。

P471 风险评估工具在流感大流行前准备工作中的应用// Stephen A. Burke, Susan C. Trock

2010年，美国疾病预防控制中心开发了一种流感风险评估工具(IRAT)，用于系统地捕获和评估当前未在人类中流行的甲型流感病毒相关信息。流感风险评估工具使用一个多属性相加模型生成每种病毒的总风险评分。虽然流感风险评估工具不是用来预测下一次甲流大流行，但它能为大流行前准备工作提供决策。

P478 印度应用死因推断量表来确定耐多药肺结核患者治疗期间死亡的根本原因//Poonam Ramesh Naik, Patrick K. Moonan, Abhay Subhashrao Nirgude,等

在耐多药肺结核患者(MDR TB)中，仅不足50%的患者完成治疗疗程，大多数耐多药肺结核患者因治疗过程中死亡而未完成治疗。为明确肺结核本身造成耐多药肺结核患者死亡的比例，在2016年1-12月，我们使用结构化的死因推断工具对死者家属进行调查。成立的委员会对死因推断、死亡证明以及可以从家庭成员获取的其它医学记录进行综合分析，以探明患者的根本死因。结果发现，肺结核是66%(47/71)死亡患者的根本死因。此外，经过综合分析，我们认为6名因自杀、2名因肺栓塞而死亡的患者的根本死因也是肺结核。治疗过程中死亡意味着治疗程序的失败，制定适当、及时的干预措施的首要环节是对死亡原因进行准确了解。

P492 2014-2015年加拿大安大略省多伦多市应用基因组测序方法定义机构暴发流感的研究// Derek R. MacFadden, Allison McGeer, Taryn Athey,等

目前对机构暴发流感的临床定义是否适合尚不清楚。我们对加拿大多伦多2014-2015年流感季节期间发生的机构暴发流感进行了回顾性的基因组测序和流行病学分析。通过对38个报告暴发流感的长期护理机构进行调查,我们对每个机构最早提交的2份A型(H3N2)流感阳性样本进行测序。基因组测序结果显示，同一暴发流感机构提交的病例样本在基因序列上大多高度相关。而包括监测样本在内的所有样本的检测结果表明，流感暴发的传染源很可能来自广泛传播的病毒谱系。通过多数基因组和血凝素特异性基因的两两距离分析能识别流感暴发时同一机构的样本和不同机构的样本之间的差别阈值；曲线下面积是0.93～0.95。在识别长期护理机构暴发流感时,常规基因组测序不太可能在目前临床定义的基础上提供额外的帮助；但在传染源调查中测序可能起到重要作用。

P506 2012-2015年南非肺炎支原体的流行病学和分子学鉴定及特征// Maimuna Carrim, Nicole Wolter, Alvaro J. Benitez,等

2012-2015年期间，我们用PCR方法对南非患有严重呼吸系统疾病(SRI)、流感样疾病患者(ILI)以及对照组的呼吸道样本进行肺炎支原体检测，随后对阳性样本进行培养和分子鉴定。严重呼吸系统疾病患者的肺炎支原体感染率为1.6%，流感样疾病患者为0.7%，对照组为0.2%(P<0.001)。肺炎支原体阳性者中年龄小于5岁(校正OR=7.1；95%CI=1.7～28.7)和艾滋病病毒感染(校正OR=23.8；95%CI=4.1～138.2)与疾病的严重性有关。严重呼吸系统疾病患者中肺炎支原体的归因危险度为93.9%(95%CI=74.4%～98.5%)，流感样疾病患者中为80.7%(95%CI=16.7%～95.6%)。支原体肺炎患者年平均住院率为28 /10万。我们观察到的所有样本均对大环内酯类药物敏感，基因型为P1-Ⅰ型、P1-Ⅱ型和一种具有多位点可变数目串联重复序列3/6/6/2，3/5/6/2和4/5/7/2的Ⅱ型变异株。

P558 2014-2015年法属波利尼西亚的登革热和基孔肯雅热病毒抗体的血清阳性率调查// Maite Aubry, Anita Teissier, Michael Huart，等

2014-2015年期间，我们调查研究了法属波利尼西亚的登革热和基孔肯雅热病毒抗体血清阳性率。学龄儿童登革热病毒抗体阳性率约为60%，一般人群的阳性率大于83%；2013年寨卡疫情发生之前，基孔肯雅热病毒抗体阳性率小于3%，而寨卡疫情发生后为76%。登革热病毒群体免疫可能影响寨卡病毒感染和发病机制。

P562 2011-2015年意大利再现肠道血清型那波利沙门氏菌的分子流行病学分析//Michela Sabbatucci, Anna Maria Dionisi, Patrizio Pezzotti等

在欧洲，人群感染肠道血清型那波利沙门氏菌(Salmonella enterica serovar Napoli)是罕见的。然而，2014-2015年，在意大利沙门氏菌病例中此类感染却占了5.9%，但其感染源尚属未知。我们通过分析监测数据以及比较菌株的遗传相似性，发现受污染的蔬菜和地表水可能是人群的感染源。

P579 俄罗斯结核性脊椎炎患者结核分枝杆菌的全基因组分析//Ekaterina Chernyaeva, Mikhail Rotkevich, Ksenia Krasheninnikova等

在俄罗斯，通过对71例结核性脊椎炎患者体内的结核分枝杆菌进行全基因组分析，详细描述了病原菌株的分布和耐药表型，并发现其与已知耐药突变显著关联。除了已知的基因因素，我们还发现了新的遗传因素也与细菌毒性、致病性和耐药性相关。