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牛乳中大肠杆菌O157∶H7 PCR检测方法的建立

2016-11-21佐兆杭侯婷婷

农产品加工 2016年2期
关键词:灵敏性牛乳特异性

刘 鑫,姚 笛,郭 瑜,张 微,佐兆杭,侯婷婷

(黑龙江八一农垦大学食品学院,黑龙江大庆 163319)

牛乳中大肠杆菌O157∶H7 PCR检测方法的建立

刘鑫,姚笛,郭瑜,张微,佐兆杭,侯婷婷

(黑龙江八一农垦大学食品学院,黑龙江大庆163319)

为了建立牛乳中大肠杆菌O157∶H7的PCR快速检测方法,试验对大肠杆菌O157∶H7的rfbE基因序列进行分析,设计1对特异性引物,对大肠杆菌O157∶H7的DNA进行PCR扩增,结合特异性和灵敏性试验,实现对致病性大肠杆菌O157∶H7的检测;然后将不同含量的大肠杆菌掺入到牛乳中进行实际样品的检测。结果表明,该方法的特异性和灵敏性较好,能够检测到0.1 ng/μL的DNA模板,当牛乳中含有超过100 CFU/mL的大肠杆菌时,可利用该方法进行检测。

大肠杆菌O157∶H7;PCR技术;检测

大肠杆菌O157∶H7是一种肠出血性大肠杆菌(Enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC) 的代表菌株,它是能够引起人的出血性腹泻和肠炎的一群大肠埃希氏菌[1]。大肠杆菌O157∶H7可产生大量毒素,从而引起出血性结肠炎等疾病[2]。自美国首次分离出该菌以后,O157∶H7的爆发和流行相继出现在全球五大洲的20多个国家[3]。目前,我国还未对由大肠杆菌O157∶H7引起的食物中毒进行比较系统的调查、分析和统计,但是从我国的饮食结构、食品加工、贮藏和运输条件等方面推测大肠杆菌O157∶H7的污染情况是比较严重的[4]。另外,大肠杆菌O157∶H7主要附着在人或动物的肠道内,可通过粪便等多种途径污染食品,为了保障食品的食用安全性,有必要对食品中的大肠杆菌O157∶H7进行快速检测。

目前,大肠杆菌O157∶H7的检测方法主要是常规的细菌学分离鉴定方法,该方法存在耗时长、过程复杂、灵敏性不强等缺点。酶联免疫法(ELSIA)等免疫学方法需要进行单克隆抗体的制备,建立该方法耗时、费力,且存在非特异性吸附等缺点[5]。PCR检测方法具有快速、准确的特点,可实现对致病菌的定性检测[6]。因此,本研究以大肠杆菌O157∶H7的rfbE基因为靶序列,拟建立一种牛乳中大肠杆菌O157∶H7的PCR检测方法,该技术与常规检测相比具有更强的特异性和灵敏性。建立的方法能够使牛乳中大肠杆菌O157∶H7的检测更为快速和准确,并为其他致病菌的快速检测提供参考。

1 材料与方法

1.1试验材料

1.1.1菌株

大肠杆菌O157∶H7、蜡样芽孢杆菌、志贺氏菌、沙门氏菌菌种,均由黑龙江八一农垦大学食品生物技术实验室保存。

1.1.2试剂

LB培养基,青岛海博公司产品;rTaq(5 U/μL)、TaKaRa ExTaqTM(5 U/μL)、MgCl2(25 mmol/L)、DL2000 DNAMarker、dNTPs(10 mmol/L)、6×Loading Buffer等,TaKaRa公司产品。

1.1.3培养基

LB液体培养基:胰蛋白胨10 g,酵母提取物5 g,氯化钠10 g,蒸馏水1 L,在121℃下灭菌20 min。

LB固体培养基:胰蛋白胨10 g,酵母提取物5 g,氯化钠10 g,琼脂粉15~20 g,蒸馏水1 L,在121℃下灭菌20 min。

1.1.4仪器设备

TGL-16B型台式离心机,上海安亭科学仪器制造厂产品;9700型PCR基因扩增仪,基因有限公司产品;JY04S-3B型电泳仪,北京君意东方电泳设备有限公司产品;YJ600+型凝胶成像系统,北京君意东方电泳有限公司产品。

1.2试验方法

1.2.1细菌的培养

将大肠杆菌O157∶H7接种于LB固体培养基中,37℃培养24 h,挑取单菌落接种于LB液体培养基中,37℃转速200 r/min,培养12 h。

1.2.2DNA模板的制备

取上述细菌培养液,以1%接种于5 mL LB液体培养基中,37℃转速200 r/min,培养过夜,取细菌培养液1.0 mL,置于EP管中,以转速12 000 r/min离心2 min,然后用ddH2O洗涤2次,最后加入300 μL ddH2O,隔水煮沸15 min,以转速8 000 r/min离心15 min,取上清液,即为DNA模板。置于-20℃下保存备用。

对于PCR特异性检测所用的蜡样芽孢杆菌、志贺氏菌、沙门氏菌的DNA模板制备均按照上述方法进行,DNA模板置于-20℃下保存。

1.2.3引物的合成

根据Genebank发表的大肠杆菌O157∶H7 rfbE基因序列,利用Primer 5软件设计特异性引物。上游引物:5'-CATCTTTACTTTCCTTGTGGACTT G-3';下游引物:5'-AAACTATTACTACAGGTGAAGGTGG-3'。扩增片段大小为261 bp,引物由上海生工生物技术有限公司合成。

1.2.4PCR扩增

以提取的基因组DNA为模版,使用设计的引物扩增rfbE基因片段,反应体系为 10×PCR buffer 2 μL,dNTP Mixture 1.5 μL,DNA模板1 μL,上下游引物各0.5 μL,Taq酶0.2 μL,加ddH2O至20 μL。PCR反应条件为95℃预变性3 min,95℃变性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸30 s,共30个循环,最后72℃延伸7 min;获得的PCR扩增产物进行2%琼脂糖凝胶电泳。

1.2.5特异性检测

以提取的大肠杆菌O157∶H7、蜡样芽孢杆菌、志贺氏菌和沙门氏菌的DNA为模板,利用大肠杆菌rfbE基因的特异性引物进行PCR检测,然后进行琼脂糖凝胶电泳,观察结果。

1.2.6灵敏性检测

测定大肠杆菌O157∶H7的DNA质量浓度,用ddH2O对已知质量浓度的DNA进行10倍梯度稀释,分别取100,10,1,0.1,0.01,0.001 ng/μL的DNA样品1 μL进行PCR扩增,检测该方法的灵敏性。

1.2.7PCR用于实际样品的检测

将大肠杆菌培养液用无菌生理盐水进行10倍梯度稀释,进行菌数的测定,然后用生理盐水进行菌体的洗涤,分别将含有1.0×105,1.0×104,1.0×103,1.0×102CFU/mL的大肠杆菌接入10 mL灭菌牛乳中,使牛乳中分别含有1.0×104,1.0×103,1.0×102,10 CFU/mL的大肠杆菌,然后提取牛乳样品的DNA,以其为模板进行PCR扩增。

2 结果与分析

2.1大肠杆菌O157∶H7的PCR扩增结果

蜡样芽孢杆菌PCR扩增结果见图1。

由图1可知,扩增片段的大小在250 bp左右,与预期结果相符。

2.2大肠杆菌O157∶H7的特异性检测结果

以大肠杆菌O157∶H7、蜡样芽孢杆菌、志贺氏菌和沙门氏菌的DNA为模板,利用大肠杆菌rfbE基因的特异性引物进行PCR扩增。

特异性检测结果见图2。

由图2可知,只有大肠杆菌O157∶H7出现目的片段的扩增,而其他能够引起食物中毒的致病菌未见扩增,说明该方法的特异性良好。

2.3大肠杆菌O157∶H7的灵敏性检测结果

灵敏性检测结果见图3。

由图3可知,当DNA质量浓度为0.1 ng/μL以上时可见特异性扩增,而DNA质量浓度为0.01 ng/μL时未见特异性扩增,说明该方法的灵敏度较高,可达到0.1 ng/μL。

图1 蜡样芽孢杆菌PCR扩增结果

图2 特异性检测结果

图3 灵敏性检测结果

2.4掺乳样品的检测结果

对大肠杆菌O157∶H7培养液进行菌落计数,测得的菌落总数为9.0×108CFU/mL。对菌体洗涤稀释后,分别提取不同掺乳样品的DNA,以其为模板进行PCR扩增。

掺乳样品的PCR扩增结果见图4。

由图4可知,当牛乳中分别含有1.0×104,1.0× 103,1.0×102CFU/mL的大肠杆菌时可见特异性扩增,目的条带为100~250bp。而牛乳中含有10 CFU/mL的大肠杆菌时未见特异性扩增,说明牛乳中含有超过100 CFU/mL的大肠杆菌时,可利用该PCR方法进行检测。

图4 掺乳样品的PCR扩增结果

3 结论

对大肠杆菌O157∶H7的rfbE基因进行PCR扩增,结合特异性和灵敏性试验,实现对致病性大肠

杆菌O157∶H7的检测;然后将不同CFU含量的大肠杆菌掺入到牛乳中进行实际样品的检测。结果表明,该方法的特异性和灵敏性较好,能够检测到0.1 ng/μL的DNA模板,当牛乳中含有超过100 CFU/mL的大肠杆菌时可利用该方法进行检测。因此,该PCR检测方法可以应用到实际样品中大肠杆菌的检测,检测时间3~4 h,检测速度快、灵敏度高。

[1]王培育.肠出血性大肠杆菌O157∶H7检测技术进展 [J].国际检验医学杂志,2013,34(19):23-28.

[2]Li Y,Frey E,Mackenzie A M,et al.Human response to Escherichia coli O157:H7 infection:antibodies to secreted virulence factors[J].Infect Immun,2013,68(9):211-219.

[3]徐兆炜.英国(苏格兰) O157大肠杆菌干扰爆发流行 [J].预防医学情报杂志,1997,13(1):65-69.

[4]林鹭芳,黄健利,钟凌.漳州市首次检出E.coli O157∶H7[J].海峡预防医学杂志,2002(4):43-47.

[5]陈玲霞,丁洪强.食品中大肠杆菌检测方法研究进展 [J].疾病监测与控制杂志,2010,4(6):325-326.

[6]宋宏新,李明亮.PCR检测乳品中大肠杆菌的研究 [J].食品科学,2009,30(4):260-263.◇

Establishment of PCR Method for Detection of Escherichia coli O157∶H7 in Milk

LIU Xin,YAO Di,GUO Yu,ZHANG Wei,ZUO Zhaohang,HOU Tingting
(College of Food Science,Heilongjiang Bayi Agricultural University,Daqing,Heilongjiang 163319,China)

In order to establish PCR rapid detection method on Escherichia coli(E.coli)O157∶H7 of milk.The rfbE gene sequence of E.coli O157∶H7 is analyzed in the experiment and a pair of specific primers are designed.E.coli DNA is amplified by PCR,combined with the specificity and sensitivity experiments,the detection of pathogenic E.coli O157∶H7 is implemented.Then different content of E.coli are added to milk to detect the actual samples.The results show that this method had good specificity and sensitivity,can detected 0.1 ng/μL DNA template,when milk contains more than 100 CFU/mL E.coli,this method can be used for testing.

Escherichia coli O157:H7;PCR technology;detection

TS252.7

A

10.16693/j.cnki.1671-9646(X).2016.01.043

2015-11-12

刘鑫(1993— ),男,本科,研究方向为微生物检测。

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