中国农科院完成芝麻大规模全基因组关联分析
2016-08-15
生物学教学 2016年4期
据2015年10月22日《科技日报》报道,中国农科院油料所张秀荣研究团队与中科院国家基因研究中心等单位合作,在国际上率先完成芝麻高密度单倍型图谱构建和主要农艺性状大规模全基因组关联分析。研究成果在《自然·通讯》杂志在线发表。
研究团队在前期完成芝麻基因组测序基础上,筛选来自29个国家的705份芝麻资源进行全基因组测序,发掘500多万个SNP(单核苷酸多态性),构建了芝麻高密度单倍型图谱。
对世界芝麻资源遗传多样性和群体结构进行了分析,揭示芝麻资源分化为南、北方两个生态类型;对油脂、产量相关的56个重要农艺性状进行了全基因关联分析,发现关联位点549个、候选基因46个;对芝麻含油量的遗传进行了分析,揭示芝麻含油量不仅受油脂代谢酶类调控,还受其他基因调控,如种皮颜色控制基因SiPPO、木质素合成基因SiNST1;对芝麻种子脂肪酸成分进行了的关联分析,发现多个脂肪酸代谢关键基因,初步解析了芝麻油脂代谢调控网络。
研究还发现一系列与产量相关的基因,这些基因的积累是芝麻育成品种产量较地方品种高的重要因素。这些研究成果为芝麻遗传改良等奠定了基础,也为油菜、大豆等主要油料作物相关研究、分子育种提供了基础数据和参考借鉴。