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精准查新对精准医学时代临床医学发展的推动

2016-03-22

中华医学图书情报杂志 2016年12期
关键词:查新检索医师

2011 年,著名基因组学家Maynard V.Olson博士起草的美国国家智库报告“走向精准医学”正式发表,提出通过遗传关联研究和与临床医学紧密接轨,来实现人类疾病精准治疗和有效预警。美国总统奥巴马于2015年1月宣布的精准医学计划,是通过分析尽可能多的志愿者的基因信息及其与疾病之间的联系,更好地理解疾病形成机理,从而研发相应药物,实现精准预防疾病。这一计划引起全世界医学界科研工作者对精准医学的高度关注[1-2]。在推行精准医学的过程中,医疗服务的思想和方法都将发生前所未有的变化,医院查新也将面临着新的机遇和挑战。

1 从精准医学到精准查新

随着我国科学技术的快速发展,医学研究越来越精深,对查新的要求越来越高。因此,查新工作需要精准查新的理念,并将这种理念灌输于整个查新过程中,即查新点精准、检索过程精准、查新结论精准[3]。

查新工作的核心目标是判定委托人提供的科学技术内容是否具有新颖性,查新点是体现查新项目新颖性的技术创新点。查新点精准取决于查新委托方对课题创新的理解,并能够提炼归纳出查新点,除了要求查新员具备较强的信息素养外,还要求其要有一定委托人课题相关的背景知识。为此,查新站应制定一系列的人才培养计划以提升查新人员的素质和能力。

在掌握课题精要的基础上,选择合适的数据库,制定精准的检索策略,包括检索途径的选择、检索词的考量、检索式的设计等,检索结果的全部或者是一部分内容将成为查新报告的参考文献,用来与委托人课题的查新点比较。对应一个查新点,参考文献以10-20篇为宜,称为理想参考文献数量。如果检索结果略多于理想状态,则须逐条比较,通过选择典型文献并去掉重复文献,选择不同时期的文献,最终完成查新报告撰写。

查新结论精准来源于查新员委托内容相关专业背景、分析能力、文笔等,以及审核员的经验、职业素养等。查新结论的精准直接影响整个委托项目是否有研究的意义。

2 精准查新助力临床医学发展

20世纪80年代初,美国、日本、欧洲分别建立了美国国家生物技术信息中心(NCBI)、日本DNA数据库(DDBJ)和欧洲生物信息研究所[4]。随着医学的快速发展,医学领域的数据呈现几何级数的增长。如何精确利用这些数据来服务医院临床人员成为当前摆在医院面前的难题。而医院查新站查新人员熟悉各数据库的编目规则,了解这些数据库主要收录期刊类型以及检索的方式和方法,通过数据精确的挖掘与分析,可以为临床医生提供疾病基因诊断、基因治疗和预防的基因信息支持。医院查新站可以通过基因检索,将实验室中测出的基因数据与临床症状之间的互相联系系统地推送给临床医师,推进医学的发展。

2.1 通过精准查新满足临床人员研究需要

Genebank是美国国家生物技术信息中心建立的DNA序列数据库,序列数据主要由科研人员直接提供或来源于大规模基因组测序计划。如某位医师需要了解发表于CELL上的一篇文章“Regulation of T Cell Receptor Signaling by DENND1B in TH2 Cells and Allergic Disease”中DENND1B基因的相关信息。查新人员首先制定精确检索策略,在Genebank数据库中检索出DENND1B相关基因全称、相关基因ID,得到对该基因的描述DENN domain containing 1B [Homo sapiens (human)]、该基因的位置Chromosome 1, NC_000001.11 (197504748..197782175, complement)、该基因的来源C1ORF18, C1orf218, FAM31B以及在PUBMED数据库里的文献ID 613292。DENND1B基因相关信息见图1。

图1 DENND1B基因相关信息

通过进一步查阅该基因相关综述文献获知目前国内外该基因的研究进展,撰写精确查新结论:DENN基因编码一段400个氨基酸大小不一的蛋白多肽,是在所有真核细胞中十分保守的一个蛋白结构域,它和Rab家庭成员(GTP酶)相互作用,作为这些GTP酶的鸟嘌呤转移因子,DENND1B突变和慢性空洞性肺曲菌病有关。最后解决了临床医师的问题,用户很满意。

2.2 通过精准查新帮助临床医师精确诊断

利用PubMed Clinical Queries中Medical Genetics检索“脑血管病(cerebrovascular disorders)”得到关于脑血管病诊断文献8 663篇,综述文献7 166篇,不同主题引用该基因的文献11 168篇。

通过精准检索与脑血管病有关基因之间的文献,帮助医生重新将疾病准确分类,并在此基础上开展循证医学研究。临床医师可以根据患者症状,通过实验室检测出志愿者携带的可疑致病基因,在PubMed中搜索到国内外学者引用该基因的相关文献,并在查新站分析数据的支持下,了解该基因相对应的症状,进而对这种基因的研究进展进行分析和解读,实现精准的疾病分类及诊断[5]。

例如,某医师想了解新生儿糖尿病患者致病基因的测序情况。我们通过检索发现,近期《柳叶刀》杂志发表过一篇针对新生儿糖尿病患者14年跟踪的研究[6]。研究表明,每种癌症都有其对应的遗传基因、肿瘤特异性标志物,各种类型肿瘤也有共同特点[7]。我们通过建立基因与症状的对应关系,可以帮助医师制定相应的临床诊疗方案。

2.3 通过精准查新实现临床与基础研究的循环

查新专家在生物数据中心的大数据保障下实现了一定程度的精准查新,通过基因检索技术精确检出单个基因,辅助临床科室在动物水平和临床水平多维度验证疾病的诊断、预防和治疗,实现了多学科、多领域间的协作,达到了临床与基础的双向循环。

3 精准查新需要注意的几个问题

3.1 加快跨学科查新人才队伍建设

美国科学院为基础研究和临床医学发展建立起一个共同的生物学信息数据库(网络)[8]。建立精准医学所需的疾病知识数据库数据是一项非常浩大的前期工程。因此,精准医学的实施要通过多部门甚至多学科之间的协作才能完成。但无论是建立生物数据库,还是搭建精准检索平台,都需要复合型查新人才,尤其需要符合精准医学发展要求的跨学科人才团队。因此要改进查新人才培养方式,培养出既精通医疗又懂情报的复合型人才。医院可以在各科精选业务能力强的医师,对其进行情报、检索知识培训,由各科培养的兼职专业查新人员提供相应情报服务和分析研究,充当“智库”的作用。

3.2 开展精准医学查新人员培训

精准查新对查新人员要求更高,而且医学发展很快,特别是精准医学发展,更需要查新人员专业能力的提升。如基因组序列信息中所用技术不同,不同查新人员对某一基因进行分析识别的结果会大相径庭 ,需要为其开展相关精准医学专业知识的培训,提高其精确查新水平和能力[9-10]。

3.3 精准查新更需要保护委托人隐私

随着精准医学的深入发展,保护委托人隐私问题成为首要的职业道德问题。对查新数据使用的权限、范围、方法应进行严格的规定,避免数据泄露给患者造成困扰,格守伦理精神,并保持良好的职业道德,保证精准查新的开展[11-12]。

4 结语

精准医学的发展使基因检测进入临床实践,对精准检索和个体化查新是巨大的促进,也是巨大的挑战。医院查新人员要充当好临床工作人员的“智库”角色,帮助临床医师根据检索出的基因信息,分析相关基因可致疾病的发展,对治疗进行精准预测,推动临床医学的发展。

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