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猪肺炎支原体PCR快速检测方法的建立和应用

2015-12-22李天芝于新友沈志强

猪业科学 2015年10期
关键词:病料支原体特异性

李天芝,于新友,沈志强,2

(1.山东绿都生物科技有限公司,山东 滨州 256600;2.山东省滨州畜牧兽医研究院,山东 滨州 256600)


猪肺炎支原体PCR快速检测方法的建立和应用

李天芝1,于新友1,沈志强1,2

(1.山东绿都生物科技有限公司,山东 滨州 256600;2.山东省滨州畜牧兽医研究院,山东 滨州 256600)

根据猪肺炎支原体P36基因序列,设计1对引物,建立了猪肺炎支原体PCR诊断方法,该方法对猪肺炎支原体的扩增结果为阳性,对照菌株扩增结果均为阴性,对猪肺炎支原体检测的灵敏性为1 pg总DNA量。并用建立的PCR诊断方法检测52份猪肺炎支原体疑似病料,检出阳性病例18份,以上结果表明该PCR方法特异性强敏感性高、简便、快速,可用于猪肺炎支原体疾病的诊断。

猪肺炎支原体;PCR;诊断

猪肺炎支原体(Mhp)可引起猪支原体肺炎(MPS),该病又叫猪霉形体肺炎或猪气喘病,是猪的一种高发性、慢性呼吸道传染病,主要临床表现为咳嗽和气喘,一年四季均可发病,但以冬、春寒冷季节较常见,各种日龄猪均可发病,但死亡率低,病猪生长缓慢,饲料利用率低,给世界各国养猪业造成了重大的经济损失[1-2]。猪肺炎支原体传统的检测方法主要有病原分离[3]、核酸探针[4]、间接血凝试验[5]和ELISA[6]等方法这些方法有的操作繁琐,诊断时间长,结果重复性不好,有的难以检测出微量病毒,不适宜疾病早期诊断,本研究设计了针对猪肺炎支原体P36基因的引物,优化PCR反应体系,建立检测了猪肺炎支原体的PCR检测方法,并用该方法对所采集的病料进行检测分析。

1 材料与方法

1.1 菌种和病料

猪肺炎支原体、猪鼻支原体、猪大肠杆菌、副猪嗜血杆菌、猪巴氏杆菌、猪链球菌2型、猪胸膜肺炎放线杆菌由本实验室分离、保存。病料采自山东省各地猪场临床诊断为猪支原体肺炎的猪肺脏。

1.2 主要试剂及仪器

pMD18-T载 体、Premix Taq、DL2000 Marker购自宝生物工程(大连)有限公司,多功能DNA纯化回收试剂盒、高纯质粒小量制备试剂盒、细菌基因组DNA提取试剂盒均购自北京百泰克生物技术有限公司,PCR仪购自BIO-RAD公司。

1.3 引物设计与合成

参照GenBank发表的Mhp P36(X67286) 基 因 序 列, 用Primer primer5.0软件设计1对引物,P1:5'-G ATTAGTGTCTCCCGTTAT-3',P2:5'- TCACCCATCACGTAGGCC -3'。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。

1.4 PCR模板制备

参照百泰克细菌基因组DNA提取试剂盒说明书,提取猪肺炎支原体基因组DNA,并提取其他几种细菌的DNA作为模板。

1.5 猪肺炎支原体P36基因的PCR扩增及条件优化

以基因组DNA为模板进行PCR扩增,反应体系为25 µL,对各扩增条件进行优化,包括退火温度(45~55 ℃梯度温度,每2 ℃为1个梯度)、引物浓度(0.1~1.1 µmol/L,每0.2 µmol/ L为1个梯度)等,最终确定的扩增程序为95 ℃预变性5 min,然后进入95 ℃30 s、51 ℃ 30 s、72 ℃30 min循环,共30个循环,最后72 ℃延伸10 min。取5 µL产物,1.5%琼脂糖凝胶电泳,EB染色,紫外成像。

1.6 PCR扩增产物的检测及鉴定

首先取扩增产物5 µL在1.5%的琼脂糖凝胶上电泳,利用凝胶成像系统扫描进行初步鉴定。然后用DNA凝胶回收试剂盒回收目的片段。将目的片段与pMD18-T克隆载体于4 ℃过夜连接,转化感受态菌株DH5α。挑取单个的转化菌落,加LB溶液培养18 h后用质粒提取试剂盒抽提质粒DNA用PCR方法进行鉴定,将阳性克隆送上海生工生物工程股份有限公司进行测序鉴定。将测序结果与参照的猪肺炎支原体P36基因序列同源性比较。

1.7 特异性试验

分别提取猪肺炎支原体、猪鼻支原体、猪大肠杆菌、副猪嗜血杆菌、猪巴氏杆菌、猪链球菌2型、猪胸膜肺炎放线杆菌的DNA,用已建立的方法进行扩增。

1.8 敏感性测定

猪肺炎支原体的基因组DNA后定量,然后10倍梯度稀释提取的细菌基因组DNA使其分别相当于含有100 ngDNA、10 ngDNA、1 ngDNA、100 pgDNA、10 pgDNA、1 pgDNA、0.1 pgDNA的含量,分别进行PCR检测,确定其敏感性。

1.9 重复性试验

用建立的PCR检测方法,对猪肺炎支原体、猪鼻支原体、猪大肠杆菌、副猪嗜血杆菌、猪巴氏杆菌、猪链球菌2型、猪胸膜肺炎放线杆菌DNA,重复检测3次,以验证本方法的重复性和稳定性。

1.10 临床样品的检测

对52份猪肺炎支原体疑似病料,用本试验优化建立的PCR反应体系进行检测,对扩增产物全部进行测序鉴定,并利用生物学软件BLAST进行序列分析。

2 结果与分析

2.1 扩增产物的检测

PCR扩增产物经过1.5%琼脂糖凝胶电泳,扩增产物在351 bp处可见特异性DNA扩增条带,与预期大小相符(图1)。测序结果显示扩增的序列与参照的猪肺炎支原体P36基因(X67286)的同源性为100%。

2.2 特异性试验

利用所设计的引物及所确定的最佳反应条件分别对猪肺炎支原体、猪鼻支原体、猪大肠杆菌、副猪嗜血杆菌、猪巴氏杆菌、猪链球菌2型、猪胸膜肺炎放线杆菌的DNA进行PCR检测。结果7菌株中只有猪肺炎支原体能扩增出相应的片段,大小分351 bp(预期的为351 bp),而其他均未扩增出相应的片段(图2)。说明本研究建立的方法特异性好。

图1 猪肺炎支原体扩增结果

图2 特异性试验

图3 敏感性试验

2.3 敏感性试验

取5µL PCR产物经1.5%琼脂糖凝胶电泳分析,分别在约351 bp附近出现特异性条带,与预期产物大小相符。从结果可以看出,该PCR检测灵敏度可以达到1 pgDNA(图3)。

2.4 重复性试验

经过3次重复操作,结果一致,说明建立的方法是稳定、可靠的。

2.5 检测方法的应用

用本试验优化建立的PCR方法对52份猪肺炎支原体疑似病料进行检测,4 h内可出结果,检出阳性病例18份,阳性率为34.6%。

3 讨论

本实验参照Genbank中猪肺炎支原体P36基因序列,在其高度保守区设计1对特异性引物,建立了猪肺炎支原体PCR诊断方法。通过对猪肺炎支原体、猪鼻支原体、猪大肠杆菌、副猪嗜血杆菌、猪巴氏杆菌、猪链球菌2型、猪胸膜肺炎放线杆菌的扩增表明,本试验所建立的PCR检测方法特异性高,敏感性试验结果表明,该PCR检测猪肺炎支原体灵敏度可以达到1 pgDNA。

国内外有关猪肺炎支原体临床病例方面的报道较多,而病原菌检测方法的报道却很少。由于该病传统的实验室检测方法(病原分离与生化鉴定等)繁杂费时,且检出率较低。本实验优化条件建立的猪肺炎支原体PCR检测方法,直接从病料提取细菌DNA,不需要进行病原菌的分离培养,进行PCR扩增,即可判断是否患有猪肺炎支原体感染,该方法具有检测速度快、特异性强、敏感性高等优点。对52份临床疑似病料进行检测,4 h内可出结果,检出阳性病例18份,检出率为34.6%;用传统的实验室检测方法耗时数天,说明PCR方法较传统方法有检测速度快,灵敏度高的优点,能对该病进行有效诊断。本试验建立的猪肺炎支原体PCR检测方法可用于该病的快速诊断与流行病学调查。

[1] 辛彩云,译.国际防制猪支原体肺炎会议报告简介[J].国外畜牧科技,2001,28(3):45.

[2] 沈青春,宁宜宝,覃青松.猪肺炎支原体的研究进展[J].中国兽药杂志,2003,37(6):26-30.

[3] 孔令增,刘艳芬,刘铀.广东猪肺炎支原体的分离与鉴定[J].中国兽医科学,2013,43(10):1016-1020.

[4] 李桂兰,张映,邵国青.猪肺炎支原体斑点杂交检测方法的建立及应用[J]山西农业大学学报(自然科学版),2012,32(6):536-539.

[5] 张顺凤.间接血凝试验及猪气喘病检测[J].甘肃畜牧兽医,1996,26(1):5-7.

[6] 刘茂军,靳岷,杜改梅,等.检测猪肺炎支原体抗体间接ELISA方法的建立[J].江苏农业学报,2007,23(5):437-441.

2015-08-07)

山东省现代农业产业技术体系生猪产业创新团队项目(SDAIT-06-011-14)

李天芝(1985-),女,汉族,助理研究员,硕士,主要从事动物传染病诊断技术研究。

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