APP下载

棉花黄萎菌病毒VdCV1 OTU蛋白的表达及纯化

2015-11-23韩守兵竺锡武

浙江农业科学 2015年3期
关键词:洗涤液电泳分子筛

韩守兵,张 斯,竺锡武

(1.浙江理工大学生物工程研究所,浙江杭州 310018;2.湖南人文科技学院农业与生物技术研究所,湖南娄底 417000)

棉花黄萎菌病毒VdCV1 OTU蛋白的表达及纯化

韩守兵1,张 斯1,竺锡武2*

(1.浙江理工大学生物工程研究所,浙江杭州 310018;2.湖南人文科技学院农业与生物技术研究所,湖南娄底 417000)

采用Gateway技术将棉花黄萎菌病毒VdCV1的OTU蛋白基因克隆至原核表达载体PET42-DEST中,并在大肠杆菌Escherichia coli BL21中诱导表达,然后通过镍柱亲和层析和分子筛纯化得到纯化的目的蛋白,并进行Western Blot检测。结果表明,BL21表达的OTU蛋白以包涵体形式存在,大小为97 ku。W estern Blot检测表明,His标签抗体能与97 ku左右的OUT-His融合蛋白特异性结合。

OTU蛋白;棉花黄萎病;纯化

棉花黄萎病是棉花作物的主要病害之一,广泛分布于世界各产棉国,是由棉花黄萎菌(Verticillium dahliae Kleb)的侵染而引起的棉花黄萎现象,容易导致整棵植株枯死萎蔫。自20世纪90年代以来,我国棉花黄萎病发生区域面积逐年增加,难以防治,对棉花生产产生了重大影响。目前,仅发现一种棉花黄萎菌病毒Verticillium dahliae chrysovirus 1(VdCV1)[1],是以棉花黄萎菌为宿主的dsRNA病毒,全基因组包括4条dsRNA,其中一条dsRNA编码Ovarian Tumor Protease(OTU蛋白酶),功能不详。有关OTU蛋白酶基因的研究始于对果蝇等动物卵细胞发育方面的研究[2],此后经序列比对发现,真核生物、细菌、病毒来源的含有OTU结构域的蛋白形成了一个大的超级科,有4个保守区[3],有裂解泛素-蛋白结合物和去泛素化的功能[4-5]。研究dsRNA病毒的OTU蛋白是否具有去泛素化、降低真菌免疫力、增强病毒侵染能力的功能,对利用OTU基因及真菌病毒防治棉花黄萎病菌及其他病菌具有重要意义。

本研究表达、纯化了病毒VdCV1的OTU蛋白,为研究OTU蛋白功能提供了前提。

1 材料与方法

1.1 材料

大肠杆菌Escherichia coli(E.coli)DH5α菌株、E.coli BL21菌株由本实验室保存,BP反应载体PDoner221、LR反应载体PET42-DEST(含有H is标签序列)购自Invitrogen公司,新西兰大白兔购自杭州师范大学动物实验中心,rTaq、M lu I酶、Pst I酶、DNA Marker、蛋白Marker购自Fementas公司,IPTG、PMSF、Imidazole、弗氏完全佐剂、弗氏不完全佐剂购自生工生物工程(上海)股份有限公司,羊抗鼠IgG抗体购自武汉三鹰生物技术有限公司,Ni-NTA SweHarose、Ni柱亲和层析柱购自杭州艾路生物科技有限公司,引物由Invitrogen公司合成。

1.2 方法

1.2.1 表达载体的构建

以棉花黄萎菌病毒第4链VcR4的cDNA为模板,以P1∶5'-GGGGAC AAGTTTGTACAAAAAAGCA GGCTTCGAAGGAGATAGAACCATGTCGGCCTACAA GAGAGTGATG-3'和P2∶5'-GGGGACCACTTTGTAC AAGAAAGCTGGGTATGCCGGTCCTATCATCTGTTC-3'为引物,用LA Taq聚合酶,PCR扩增OTU基因的ORF框。利用GateWay技术[6],经过BP反应,将目的基因连入PDONR221(Kan+)载体;经过LR反应,将目的基因连至原核表达载体PET42-DEST(Amp+,含噬菌体T7启动子)上,酶切鉴定正确后送英潍捷基(上海)贸易有限公司测序。

1.2.2 OTU蛋白的诱导表达及可溶性分析

将测序正确的重组表达质粒PET42-VcR4电转至E.coli BL21之中,筛选阳性克隆,按1∶100(V/V)接种于200 m L LB液体培养基(Amp+)中,37℃,225 r·min-1振荡培养至D600为0.6,加入IPTG至终浓度1 mmol·L-1,37℃诱导表达4 h,4℃,6 000 r·min-1,10 min离心收集菌体。然后加入200 m L PBS振荡重悬菌体,加入1 mol·L-1PMSF至终浓度为1 mmol·L-1,超声破碎菌液,12 000 g,10 min,分别取上清液和沉淀,沉淀再用200 m L PBS振荡重悬;涡旋上清液和沉淀,取出100μL加入等体积的2×SDS上样缓冲液,混匀,100℃金属浴变性10 min;然后4℃超声破碎菌液,12 000 g,10 min,吸取上清液15 μL,SDS-PAGE电泳检测[7]。

1.2.3 包涵体的洗涤与溶解

取1 g包涵体,重悬于20 m L包涵体洗涤液Ⅰ(5 mmol·L-1EDTA,20 mmol·L-1Tris,1% Trion-X,PH 8.0),室温振荡10 m in,然后4℃,12 000 r·m in-1离心10 min,收集沉淀;加入10 m L包涵体洗涤液Ⅰ重悬,超声破碎,收集沉淀;加入20 m L包涵体洗涤液Ⅰ重悬。

收集沉淀,加入10 m L包涵体洗涤液Π(5 mmol·L-1EDTA,20 mmol·L-1Tris,4 mol·L-1尿素,0.3 mol·L-1NaCl,PH 8.0)室温振荡10 m in,然后4℃,12 000 r·min-1离心10 m in,收集沉淀;重复洗涤3次。

所得沉淀溶于10 m L溶解液(20 mmol·L-1Tris,8 mol·L-1尿素,0.3 mol·L-1NaCl,20 mmol·L-1β-巯基乙醇,PH 8.0),室温搅拌30 m in,至包涵体溶解,4℃,12 000 r·min-1离心10 min,收集变性蛋白上清液。

1.2.4 Ni柱亲和纯化重组蛋白

在玻璃层析柱中添加介质,确保填料均一无气泡无分层等现象,然后用5倍体积Lysis buffer平衡介质,取1倍柱床体积变性蛋白上清液低速上柱,孵育30 min。加入合适浓度的咪唑洗涤液洗涤,除去未结合及结合不牢固的杂蛋白,然后进行梯度浓度洗脱,分别收集洗脱液;SDS-PAGE电泳,确定最佳洗脱浓度;超滤浓缩,透析去离子,然后冷冻真空抽干,-20℃保存备用。

1.2.5 分子筛进一步纯化重组蛋白

将Ni柱亲和纯化的蛋白溶解于8 mol·L-1脲(20 mmol·L-1Tris,8 mol·L-1尿素,PH 8.0)中,利用AKTA Process系统匀速泵进分子筛平衡液(20 mmol·L-1Tris,8 mol·L-1尿素,PH 8.0)平衡,样品上样,匀速泵进分子筛洗脱液(0.3 mol·L-1NaCl,20 mmol·L-1Tris,8 mol· L-1尿素)洗脱,通过AKTA Process系统分析,分步收集不同峰段洗脱液;SDS-PAGE电泳,确定分离效果;超滤浓缩,透析去离子,冷冻真空抽干称重。采用Brad ford法定量检测纯化蛋白[8]。

1.2.6 Western blot鉴定

将经分子筛纯化的OTU蛋白进行SDS-PAGE电泳,电泳结束后电转至硝酸纤维膜上;室温封闭液(0.5 g脱脂奶粉溶于8 m L TBST洗涤液中,混匀定容至10 m L)封闭2 h后,按1∶1 000向封闭液加入His标签抗体,孵育2 h,TBST洗涤液(TBS洗涤液中加入Tween-20至终浓度为0.05%)洗膜3次,每次10 m in;然后按1∶5 000向封闭液中加入辣根过氧化物酶标记的羊抗兔二抗,孵育2 h,TBST洗涤液充分洗膜;显色液显色,鉴定杂交结果。

2 结果与分析

2.1 表达载体pET42-V cR4构建结果

利用LR反应将目的基因连入PET-DEST42载体,转化E.coli DH5α感受态细胞,摇菌提取质粒,经0.7%的琼脂糖凝胶电泳检测,在8 281 bP位置出现一条特异性条带,与理论结果相符,说明成功构建原核表达载体PET42-VcR4。

PCR鉴定结果如图1所示,与预期大小一致(2 550 bP);质粒经PstⅠ单酶切鉴定结果如图1所示,切出2个片段,与预期大小一致(4 936 bP和3 345 bP),其中1号泳道有3个条带,最大的片段为未酶切完全的质粒。

2.2 表达蛋白可溶性分析

重组菌BL21-PET42-VcR4、BL21-PET42-CmR(氯霉素蛋白)经4 h诱导表达,超声破碎后分别取上清液和沉淀进行SDS-PAGE电泳来鉴定蛋白的可溶性。结果表明,氯霉素蛋白与OTU蛋白均以包涵体形式存在,属于不可溶性蛋白(图2)。

2.3 W estern b lot鉴定

为了进一步检测目的蛋白在大肠杆菌中是否表达,用H is标签抗体作为一抗,羊抗鼠HRP标签作为二抗进行Western blot检测。SDS-PAGE、Western blot结果如图3所示。结果表明,BL21-PET42-VcR4超声裂解后的沉淀出现特异性条带,其他均未出现条带,说明OTU蛋白在E.coli BL21中能正确诱导表达,并且以包涵体形式存在。

图1 入门载体PDOVCR4质粒酶切和PCR鉴定电泳图

图2 OTU蛋白与氯霉素蛋白的可溶性分析

2.4 N i-NTA柱亲和层析纯化结果

对含His标签的融合蛋白进行纯化,SDSPAGE电泳检测结果如图4所示。结果表明,纯化得到了条带较为单一、大小在97 ku左右的蛋白,说明目的蛋白纯化效果良好,而且目的蛋白最佳洗脱咪唑浓度为100 mmol·L-1。

2.5 分子筛纯化

将纯化蛋白进一步过分子筛纯化,通过AKETA分析仪,收集不同波段的紫外检测峰波蛋白溶液,分别进行SDS-PAGE电泳检测。分析波峰和电泳检测结果分别见图5和图6。

图3 OTU蛋白SDS电泳(A)和Western blot检测(B)

图4 OTU蛋白的纯化结果

由图5和6可知,0~8 min收集的样品,可能混有微量气泡,电泳没有条带;8~17 m in收集的样品,电泳显示有一条带,大小与目的蛋白一致,紫外检测波峰较好,但条带不清晰,表明目的蛋白的纯化效果较好,但浓度较低。

图5 分子筛纯化的OTU蛋白AKETA波段分析

3 小结与讨论

图6 分子筛纯化的OTU蛋白的SDS-PAGE分析

本研究采用Gateway克隆技术,成功构建棉花黄萎菌病毒VdCV1的OTU蛋白原核表达载体PET42-VcR4;使其在大肠杆菌中稳定表达。采用亲和层析与分子筛层析相结合的方法[9-10],成功纯化OTU包涵体蛋白。病毒VdCV1的OTU蛋白的表达、纯化,是研究OTU蛋白的前期基础工作,对研究OTU蛋白酶的功能具有重要意义。

[1] Cao Y F,Zhu XW,LiD Q,et al.Genomic characterization of a novel dsRNA virus detected in the PhytoPathogenic fungus Verticillium dahliae K leb[J].Virus Research,2011,159(1):73-78.

[2] Steinhauer W R,Walsh R C,Kalfayan L J.Sequence and structure of the DrosoPhila melanogaster ovarian tumor gene and generation of an antibody sPecific for the ovarian tumor Protein[J].Molecular Cellular Biology,1989,9(12):5726-5732.

[3] Makarova K S,Aravind L,Koonin E V.A novel suPerfamily of Predicted cysteine Proteases from eukaryotes,viruses and Chlamyd ia Pneumoniae[J].Trends in Biochemical Sciences,2000,25(2):50-52.

[4] Frias-Staheli N,GiannakoPoulos N V,Kikkert M,et al. Ovarian tumor domain-containing viral Proteases evade ubiquitin-and ISG15-dePendent innate immune resPonses[J]. Cell Host&M icrobe,2007,2(6):404-416.

[5] Balakirev M Y,Tcherniuk SO,Jaquinod M,et al.Otubains: a new family of cysteine Proteases in the ubiquitin Pathway[J]. EMBO RePorts,2003,4(5):517-522.

[6] Landy A.Dynam ic,structure,and regulatory asPects of lambda site-sPecific recombination[J].Annual Review Biochemistry,1989,58(1):913-941.

[7] 萨姆布鲁克J,弗里奇E F,曼尼阿蒂斯T,等著.金冬雁,黎孟枫,侯云德,等译.分子克隆实验指南[M].2版.北京:科学出版社,1992:1713-1720.

[8] Bradford M M.A raPid and sensitive method for the quantification of m icrogram quantities of Protein utilizing the PrinciPle of Protein-dye binding[J].Analytical Biochem istry,1976,72(1):248-254.

[9] Yoshikawa K,Umetsu K,Shinzawa H,et al.Determ ination of carbohydrate-deficien t transferrin seParated by lectin affinity ch romatograPhy for detecting chronic alcohol abuse[J].FEBS Letters,1999,458(2):112-116.

[10] LoPatin SA,Varlamov V P.New trends in immobilized metal affinity chromatograPhy of Proteins[J].APPlied Biochem istry and M icrobilogy,1995,31(3):221-227.

(责任编辑:侯春晓)

表1 浙粳88秧苗多效唑调控后不同秧龄栽插经济性状及产量表现

3 小结

试验结果表明,浙粳88在秧苗1叶1心时喷施多效唑,能有效促进秧苗矮壮,延长栽插秧龄,栽插后对有效穗、结实率等产生积极影响,最终增加产量,其最佳栽插秧龄是24 d。

在实际生产中,为确保浙粳88的安全齐穗,可在计划的机插时间前24~27 d育秧,在秧苗1叶1心时,用150 mg·L-1多效唑细喷雾,能延长机插秧龄、增加秧龄弹性,又能增加产量。

参考文献:

[1] 应武,戈长水,俞祥群,等.连作晚稻秀水134秧苗喷施多效唑对机插产量的影响[J].中国种业,2012(12): 53-55.

[2] 叶胜海,石建尧,陆艳婷,等.晚粳稻新品种浙粳88的特征特性及栽培技术[J].中国稻米,2012,18(4):75-76.

[3] 朱化虹,叶胜海,陶才生,等.晚粳稻浙粳88作连作晚稻抛秧栽培试验[J].浙江农业科学,2014(1): 23-24.

(责任编辑:张才德)

S 435.621

A

0528-9017(2015)03-0365-04

10.16178/j.issn.0528-9017.20150325

2014-10-16

国家自然科学基金项目(31071729)

韩守兵(1984-),男,安徽六安人,硕士研究生,主要从事植物病毒与天然药物生物反应器研究。E-mail:hanbingxiong @163.com。

竺锡武,研究员,硕士生导师。E-mail:zhuxw9999@yahoo.com.cn。

文献著录格式:韩守兵,张斯,竺锡武.棉花黄萎菌病毒VdCV1 OTU蛋白的表达及纯化[J].浙江农业科学,2015,56(3):365-368.

猜你喜欢

洗涤液电泳分子筛
长链醇类和油类物质洗涤液在磁珠法DNA和RNA共提取中的应用
电子接插件选择性电镀电泳连线制程优化及应用
5种沸石分子筛的吸附脱碳对比实验
分子筛结构设计研究现状及展望
血红蛋白电泳在地中海贫血筛查中的应用及临床意义分析
13X/SBA-15复合分子筛的制备及其处理造纸废水的研究
辅助阳极在轻微型厢式车身电泳涂装中的应用
文丘里吸收器在焦化废气收集中的应用
超声萃取-毛细管电泳测定土壤中磺酰脲类除草剂
SAPO-56分子筛的形貌和粒径控制