婴幼儿人巨细胞病毒mRNA在不同感染时期表达的研究
2014-12-03刘风林张书红
李 娟 刘风林 张书红
我国是人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)感染的高发流行地区[1]。除先天性感染外,经产道传播、母乳传播、家庭内传播亦是婴幼儿感染HCMV的重要途径[2]。HCMV感染临床表现无特异性,且存在潜伏性感染,从轻微无症状感染直到严重缺陷或死亡。因而早期诊断、早期治疗对预后至关重要。但目前DNA-PCR检测HCMV只能证明病毒存在,并不能反映病毒复制。HCMV基因转录产物IE mRNA及pp67 mRNA的检测已应用于器官移植后患者是否存在HCMV活动性感染的早期诊断[3-4],并已作为HCMV宫内活动性感染的特异性指标[5],但尚少见针对婴幼儿HCMV感染者的研究。本研究拟通过对HCMV基因转录产物IE mRNA和pp67 mRNA的检测,探讨mRNA表达是否可以作为婴幼儿HCMV感染的诊断方法。
1 资料与方法
1.1 一般资料 选择2009年5月—2011年11月我院消化科收治的以黄疸、肝脾肿大、发热、咳喘、腹泻、抽搐为主要症状的1~6个月患儿。入院后行肝功能,血、尿、痰CMV-DNA,CMV-IgM,CMVpp67检测。选择结果满足血、尿、痰CMVDNA拷贝数增高、血CMV-IgM、CMVpp67检测呈阳性中任意一项同时除外其他病毒感染者入阳性组,共105例。并进一步行头CT、听力及眼底检查,综合临床症状体征及各项检查结果做出判断。而血、尿、痰CMV-DNA拷贝数增高,血CMV-IgM、CMVpp67检测均呈阴性,同时除外其他病毒感染者列入阴性组,共98例。2组间月龄、性别和体质量比较,差异无统计学意义,见表1。
Tab.1 General information of infants who were either positive or negative of CMV infection with current clinic diagnosis standards表1 阳性组与阴性组患儿一般情况比较
1.2 实验材料与试剂 RNA抽提试剂盒及实时荧光定量(real-time)PCR反应试剂盒(QIAGEN,Germany)。Real-time PCR仪及数据分析软件(ABI 7500,Life Technologies,US)。
1.3 方法
1.3.1 生化指标的检测 所有患儿抽取股静脉血1~2 mL,TBIL、DBIL、ALT及ALP指标均采用试剂盒进行检测,而HC⁃MV-DNA则采用裂解液破碎细胞,使得病毒颗粒游离,然后14 000×g离心10 min,取上清,利用荧光定量方法对病毒DNA拷贝数进行定量检测。
1.3.2 cDNA的合成 参照参考文献[4],采用Trizol方法抽提血清样本总RNA,并用紫外分光光度计检测RNA的浓度与纯度,检测光密度(OD)260/OD280数值在1.8~2.0之间时,证明提取的RNA纯度适合于进行下一步实验。4 μg总RNA于80µL反应体系,混匀后,1 000 r/min离心30 s,65℃水浴5 min后立即置于冰浴1 min。1 000 r/min离心30 s,冰浴中依次加入:5×First-strand buffer,0.1 mol/L MDTT,RNase抑制剂(40 U/µL)。混匀,25℃孵育10 min,37℃孵育2 min。各管中分别加入4µL M-MLV逆转录酶(200 μL),混匀后短暂离心,37℃水浴50 min。70℃水浴15 min灭活逆转录酶活性终止反应,–20℃保存样品cDNA。
1.3.3 Real-time PCR 试验流程参照参考文献[4]。IE及pp67基因的PCR引物设计见表2。PCR循环参数:95℃预变性60 s;95 ℃ 10 s、退火温度58 ℃ 10 s、72 ℃ 20 s,进行40个循环。温度变化速度为20℃/s,在每个循环的延伸末检测荧光信号。随后是一个缓慢升温的程序:65℃15 s,95℃10 s,温度变化速度为0.1℃/s,同时连续检测DNA逐渐变化过程中荧光信号的变化情况,绘制PCR产物的熔解曲线(melting curve),以了解样品扩增的特异性,保障测定结果的准确可靠。本研究中将各待测基因的PCR扩增CT值与相对应的βactin的PCR扩增CT值相减得到△CT来进行标准化,以2-△CT计算得出各待测基因产物的相对定量,每管样品重复测定3次。根据基因相对表达量,样本IE及pp67的相对表达数值高于对照组5倍以上被认为是高表达,5倍以下被认为是低表达。
Tab.2 Primers for real-time PCR表2 引物序列
1.4 统计学方法 采用SPSS 13.0软件进行统计学分析。计量资料以±s表示,比较采用t检验。计数资料以例(%)表示,行χ2检验。P<0.05为差异有统计学意义。
2 结果
2.1 患者基线资料 传统方法检测TBIL、DBIL、ALT、ALP和HCMV-DNA拷贝数阳性组均高于阴性组(P<0.01),见表1。
2.2 IE mRNA及pp67mRNA在常规诊断HCMV阳性和阴性患儿中的表达 常规诊断的阴性组中亦有IE mRNA阳性表达患者,但阳性率显著低于阳性组,差异有统计学意义,见表3。
Tab.3 IE and pp67 transcription in the infants who were CMV positive with current clinic standards表3 2组间IE及pp67 mRNA阳性表达结果例(%)
2.3 IE及pp67 mRNA表达在常规诊断HCMV阳性患儿中的分布规律 105例阳性患儿中,72例IE高表达,33例IE低表达。IE与pp67表达呈现交错进行的表达趋势,即IE表达升高,pp67表达呈现较低的状态,见表4。
2.4 IE及pp67 mRNA表达在常规诊断HCMV阴性患儿中的分布规律 HCMV阴性组患儿中尽管也检测到IE的表达(0.23±0.03),但是表达量显著低于IE低表达组(1.03±0.14),差异有统计学意义(t=4.215,P<0.05)。阴性组患儿未检测到pp67的表达。
Tab.4 Relative mRNA transcription profile of IE and pp67 genes in the HCMV-positive samples diagnosed by routine method表4 阳性组患儿中IE及pp67基因mRNA相对表达量比较
3 讨论
本研究主要对来我院就诊的常规诊断HCMV阳性或阴性患儿血液中的HCMV转录产物表达进行分析,结果表明,病毒转录早期和晚期的mRNA均在阳性患儿中表达,部分患儿就诊时体内已经出现pp67 mRNA表达,提示已经处于病毒感染晚期。在传统检测阴性的患儿中,笔者也检测到有IE mRNA的表达,说明现有诊断方法的灵敏度不足,提示这部分患儿也应该进行适当的治疗。
目前我国婴幼儿感染HCMV的传统诊断方法是基础病毒DNA扩增的检测手段,判断是否感染该病毒。但是传统的DNA扩增手段只能通过明确基因拷贝数的多少来判断感染情况,对于早期感染及病毒复制情况,并无法进行有效地判断,影响了疾病的治疗。因此,目前开发新的检测手段是国际该领域的研究热点[5-6]。
在既往研究中,IE mRNA和pp67 mRNA检测已经在肾脏移植后是否出现HCMV感染鉴定中被应用。研究发现,IE mRNA出现时间显著早于pp67 mRNA,提示IE mRNA是早期发现HCMV感染,并作出诊疗方案的重要依据[7]。同时,Pairoj等[8]发现,利用PCR方法检测pp67的表达,较传统的DNA-PCR方法更为敏感。Bergallo等[9]发现利用荧光定量PCR在HCMV-DNA拷贝数在100个时即可检测到。上述研究结果与笔者的结果是一致的,表明mRNA检测对于判断HCMV感染更加准确和灵敏。但不同的是,本研究利用了两种mRNA共表达的检测手段,通过分析每一种mRNA的相对表达量,达到更加准确地判断HCMV感染时期的目的。
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