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布鲁菌wzt基因的原核表达及生物信息学分析

2014-09-15王秀然康立恒郝芳芳许春晓卢天成周晓丽

关键词:布鲁菌菌液质粒

王秀然,康立恒,安 伟,郝芳芳,陈 思,许春晓,卢天成,周晓丽

(1.吉林农业大学生命科学学院,吉林 长春 130118;2.吉林大学白求恩医学部,吉林 长春 130021;3.吉林大学第一医院,吉林 长春 130021;4.军事医学科学院军事兽医研究所,吉林 长春 130122)

布鲁菌病是一种人畜共患疾病,该病不但严重影响养殖业的发展,对人类健康也构成了巨大威胁.人畜布鲁菌病难以防控的原因是多方面的,其中,其致病机理(包括胞内寄生机理)和免疫机理不清楚是主要原因.

引起布鲁菌病的布鲁菌是兼性细胞内寄生的革兰氏阴性球杆菌,不产生芽孢和荚膜.虽然布鲁菌不能自主运动,但其携带组装鞭毛的所有基因,也不含趋化系统[1].脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)是布鲁菌主要的毒力因子,也是引起哺乳动物免疫的主要抗原之一[2].目前布鲁菌脂多糖合成的途径并不完全清晰,已经发现的与布鲁菌脂多糖合成相关的关键基因有wbkA,gmd,wzm,wzt,wbkB,wbkC等,其中wzt基因为ABC转运系统(ABC transporter)的重要组成部分[3],布鲁菌LPS-O侧链的合成即是通过ABC转运途径.有研究显示[4],线性O多糖大多是通过这一途径完成的,这一过程中糖苷连接到UDP-PP-糖链上,在细胞膜内膜上完成聚合物的合成,然后借助ABC转运蛋白运到膜外,链接到核心寡糖和类脂A上;其中,wzt基因编码ABC型转运体(ATP酶结构域)O抗原输出系统ATP结合蛋白,其突变导致B.melitensis 16M形成粗糙型突变体,ELISA检测S-LPS的O侧链可确定O侧链缺失.O多糖合成前体由wzt形成的ABC转运系统通过十一异戊烯联聚合物转移到膜,在那里它被连接到脂质A核心和易位到外膜的周质面[5].ABC转运系统在细菌中是一个主要的细胞转运机器,由一系列同源基因编码的操纵子组成[6].该操纵子由ATP结合蛋白、膜蛋白、亚基结合蛋白3部分组成,通常情况下,形成由6个跨膜片段组成的2个完整的膜蛋白[7].ABC转运系统是膜外生物大分子合成的主要运输通道之一,参与胞外多糖的合成[8].此外,ABC转运系统在细菌营养成分的运输、独立分子的外排等过程中也起着重要的作用[9].研究发现,wzt基因缺失会造成布鲁菌O侧链缺失,同时降低布鲁菌的毒力[10];缺失wzt基因的布鲁菌突变株与亲本株相比,细胞免疫水平下降,体液免疫水平上升[11-12].

本研究对源于布鲁菌的wzt基因进行了克隆并对原核进行了表达,对其进行了生物信息学分析和结构预测,以为阐明布鲁菌wzt基因的功能提供理论依据.

1 材料与方法

1.1 菌株及载体

布鲁菌Brucella abortus S19DNA、感受态菌株Eschericholia.coli DH5α、E.coli BL21(DE3)由军事医学科学院军事兽医研究所五室赠送;Trans-T1感受态、原核表达载体pEASY-E1expression kit购自北京全式金生物技术有限公司.

1.2 方法

1.2.1 培养基

液体LB培养基:蛋白胨1g,酵母粉0.5g,NaCl 1g,蒸馏水100mL,pH=7.2.

固体培养基(Ampicillin,Ampr):蛋白胨1g,酵母粉0.5g,NaCl 1g,琼脂1.5g,蒸馏水100mL,pH=7.2.121℃灭菌20min.灭菌后加除菌的氨苄西林至100μg/mL.

1.2.2 引物的设计及合成

根据GenBank中B.abortus S19的序列信息设计引物.上游引物(Nde I酶切位点)F:catatgATGATCCAGCCATCGATTACCCTGT;下游引物R(Xho I 酶切位点):ctcgagTCATGCTATAGCTCCCATTCCCGAG.引物由长春华大中天生物技术有限公司合成.

1.2.3 wzt基因的扩增

以B.abortus S19总DNA为模板,反应体系50μL:模板DNA 2μL,上游引物1μL,下游引物1μL,Ex Taq酶0.5μL,10×Buffer 5μL,dNTP 4μL,水36.5μL.反应条件:94℃5min;94℃1min,58℃30s,72℃1min,30个循环;72℃延伸10min.

1.2.4 重组表达质粒的构建及鉴定

利用凝胶回收试剂盒纯化回收PCR产物,将回收产物与pEASY-E1载体连接并转化Trans-T1感受态细胞,转化后加入250μL经室温平衡的LB培养基,于37℃,180r/min恒温摇床中培养1h.取200μL菌液均匀地涂布于准备好的Ampr固体培养基平板上,37℃培养过夜.

挑取单菌落接种于LB(Amp)液体培养基中,180r/min,37℃恒温摇床中培养12h,采用载体正向引物(E Control Forward Primer:GGAATTGTGAGCGGATAACAATTCC)和下游引物R进行PCR鉴定.

提取阳性菌液质粒,进行Nde I和Xho I双酶切鉴定,37℃水浴锅酶切3h.酶切体系:质粒4μL,限制性内切酶Nde I 0.5μL,限制性内切酶Xho I 0.5μL,Buffer 1μL,无菌水4μL.将鉴定正确的质粒pEASY-wzt进行测序.

1.2.5 诱导表达

将pEASY-wzt转化到E.coli BL21(DE3).挑取阳性单克隆菌落,接种到5mL含有Amp的抗性LB液体培养基中,37℃,180r/min培养6h;至菌液D(600)为0.6时,加入终浓度为1mmol/L 的IPTG,37℃继续诱导4h.

1.2.6 聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE电泳)分析

收集1.5mL诱导的菌液,以未诱导菌液作为阴性对照,于室温12000r/min离心1min,弃上清,用1mL PBS悬浮;12000r/min离心1min,用50μL蒸馏水悬浮沉淀,加入50μL 2×SDS Buffer,在沸水中孵育5~10min.12000r/min离心5min,取上清液进行8%SDS-PAGE电泳分析.凝胶用考马斯亮蓝R-250染色.

1.2.7 表达蛋白质的纯化

收集100mL诱导表达的菌液,4℃,5000r/min离心5min;弃上清,加入100mL的PBS洗涤菌液,4℃,5000r/min离心5min;重复洗涤一次,弃上清,将菌体置于冰水中,用20mL的Binding Buffer结合液进行重悬.超声裂解细菌,超声10s,间歇10s,功率400W持续工作30min,直至上清液变清澈.4℃,13000r/min离心10min,取上清,经0.22μm的滤膜过滤后,用1mL HisTrapTMFF亲和层析柱纯化蛋白.

1.2.8 表达产物的Western Blotting鉴定

纯化产物经SDS-PAGE分析后,根据SDS-PAGE凝胶的大小,剪裁PVDF膜和滤纸.将滤纸放在转膜缓冲液中完全浸透;PVDF膜先在甲醇中敏化15s,随后放入蒸馏水中浸泡2min.组装转膜装置,从阳极到阴极依次为:8层滤纸-PVDF膜-凝胶-8层滤纸.PVDF膜要略大于凝胶,以保证所有蛋白能够转到膜上;并将滤纸、凝胶、PVDF膜对齐,赶走气泡.恒流110mA,电压控制在25V内,电转25min.用洗涤液清洗PVDF膜3次,每次5min.加入5%脱脂奶粉常温封闭,在摇床上轻轻摇动1~2h.倒掉封闭液,用洗涤液洗膜3次,每次5min.一抗孵育:加入1∶200(体积比)倍稀释的鼠抗His标签单克隆抗体,37℃孵育2h,倒掉一抗,洗涤液洗膜(方法同上);二抗孵育:加入1∶2000(体积比)倍稀释的辣根过氧化物酶标记的羊抗鼠IgG,37℃孵育2h.倒掉二抗,洗涤液洗膜(方法同上)[13].加入TMB显色液显色10min,加纯水终止,扫描保存图片.

1.3 wzt基因表达产物的生物信息学分析与结构预测

1.3.1 wzt蛋白结构预测

采用Discovery Studio 2.5软件以Swiss-Model模式对蛋白质结构进行预测[14].

1.3.2 wzt基因表达产物的生物信息学分析

在NCBI数据库中对与wzt基因功能相关的蛋白序列进行检索,并采用Clustalx1.83和MEGA5.0进行生物信息学分析.

2 结果与分析

2.1 wzt基因扩增产物的鉴定

以B.abortus S19总DNA为模板,PCR扩增wzt基因,成功获得目的基因,扩增产物经1%琼脂糖凝胶电泳检查,得到与目的基因大小相符的约756bp的条带(见图1).

2.2 重组表达质粒的酶切鉴定

将重组质粒pEASY-wzt经Xho I单酶切、Nde I和Xho I双酶切进行鉴定,得到的结果同理论值相符,表明重组表达质粒pEASY-wzt构建正确.经测序,与GenBank注册序列一致.

图1 目的基因wzt的PCR扩增产物凝胶电泳图

图2 表达产物的SDS-PAGE分析

2.3 表达产物的鉴定

将构建好的重组质粒pEASY-wzt转到大肠杆菌BL21中,加入IPTG使其终浓度为1.0mmol/L,37℃,诱导4h.通过8%SDS-PAGE分析鉴定,表明重组质粒能够成功表达目的蛋白,在相对分子质量约28000处可见差异蛋白条带,与理论值相符(见图2),表明wzt基因成功表达.

2.4 表达产物的分离纯化

SDS-PAGE结果表明,蛋白表达成功,经亲和层析纯化可获得纯化的重组蛋白,经Lowry法测定纯化蛋白的质量浓度为0.43mg/mL.

2.5 目的蛋白的鉴定

Western Blotting分析显示,在相对分子质量约28000处可见特异反应条带(见图3),表明纯化的重组蛋白能被His标签单克隆抗体所识别,表明所表达蛋白为wzt蛋白.

图3 纯化产物的Western blot分析

图4 ABC转运系统结构图

2.6 wzt编码蛋白的结构预测

由Discovery Studio 2.5生成、通过Swiss-Model构建的结构示意图见图4.模板选择1oxv,与来自Sulfolobus solfataricus的蔗糖ABC转运系统的ABC-ATP酶的序列一致性仅23.11%.三维构象显示,该蛋白可能由8个α螺旋、7个β片层构成.

图5 wzt基因及部分功能相同的基因编码的蛋白序列的系统进化分析

2.7 wzt编码蛋白的同源性分析

将wzt基因编码的蛋白序列与GenBank中功能相关的基因序列进行同源性比较,发现该基因编码的蛋白质序列在多数种属中具有较高的种属特异性.布鲁菌属不同种的该基因蛋白同源性接近100%(见图5),与其他种属相关蛋白的差异较大,但与耶尔森氏菌的O:9菌株的该蛋白序列同源性较高.

3 讨论

布鲁菌是一种重要的人畜共患病病原,其LPS既是其主要的毒力因子,同时也是引起免疫的重要抗原,wzt基因作为其合成的关键基因,在O多糖跨膜合成过程中起着重要的作用.

O多糖是在内膜上由糖基转移酶催化形成的脂质链接的O侧链重复单位,可通过某种机制将脂质链接的O多糖传递到细胞周质空间,并将O多糖链接到核心寡糖上形成LPS[5].在细菌中参与O多糖合成的基因往往形成RFB基因[15-16],RFB基因编码合成新型糖苷前体的糖基转移酶,作为运输过程所需要的酶,因此,RFB基因座位的多态性影响O多糖的结构多样性[17].

目前已知有3种途径参与O多糖的合成运输过程,分别为WZY依赖型途径、ABC转运型和合酶依赖型途径.在WZY依赖型途径中,由wzx蛋白同源类似物完成跨膜运输;而在ABC转运型途径中则由ABC转运子完成运输,其ATP结合域的序列高度保守,特别是核苷酸结合区[18].本研究的结果显示,ABC转运系统中的wzt蛋白、ATP结合域,在布鲁菌中具有高度保守的种属特异性,因此ATP结合域的保守性具有属的特异性.目前,有关O多糖合成的ABC转运子的确切组织形式和模式尚未见报道,没有结构数据可以参考,大部分信息是来自大肠杆菌等细菌的2型荚膜合成过程的研究和假说[18-19].本研究发现wzt蛋白具有8个α螺旋、7个β片层结构,为进一步研究ABC转运系统的组织形式及形成模式提供了依据.

本研究成功表达了wzt蛋白,并对其结构进行了初步的预测,研究结果为进一步揭示wzt基因在LPS合成过程中的作用机制,阐述其在细菌组成物质的合成和免疫调节中的作用具有重要的意义.

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