突变型人PRKAG2基因的克隆及其真核表达载体构建
2013-08-18张必利
陈 挺,张必利,何 平,程 平,郑 兴
家族性心室预激、传导系统病变及心肌肥厚在2002年首次被归结为分子遗传学疾病,并被统称为PRKAG2心脏综合征。这是一种少见的常染色体显性遗传性疾病,主要由于编码腺苷-磷酸激活的蛋白激酶γ2调节亚单位基因的PRKAG2发生错义突变,例如,有人认为该基因R302Q位点突变与预激有关[1-2]。患者会出现阵发性室上性心动过速,需安装永久起搏器,同时有可能伴有心肌肥厚、左室功能障碍等临床表型[3-4]。本研究拟通过构建含有突变位点R302Q的PRKAG2的真核表达载体,为进一步研究基因PRKAG2 R302Q突变的功能以及PRKAG2心脏综合征的发病机制奠定基础。
1 材料与方法
1.1 试剂
大肠杆菌感受态细胞Top10,由笔者所在实验室制备;真核表达载体 pIRES2-EGFP(Clontech公司);KOD高保真DNA聚合酶(TOYOBO公司);限制性内切酶Nhe I、BamH I(Fermantas公司);T4DNA连接酶(NEB公司);普通质粒小抽试剂盒、琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒和PCR清洁试剂盒(Axygen公司);Trizol试剂(Invitrogen公司);逆转录酶(Promega公司)。
1.2 方法
1.2.1 引物设计与合成 设计用于PCR扩增人野生型PRKAG2基因(NCBI基因ID号51422)CDS区的引物,ATG起始位点前增加Kozak序列GCCACC,引物名称及序列:F1,5'-GTCAGCTAGCGCCACCATGGGAAGCGCGGTTATGG-3';R1,5'-TGTAGGATCCTCACTCCGTTTCTGTCTCCTTTTGT-3';设计R302Q定点突变引物,突变位点位于引物中间位置,引物名称及序列:RQ1,5'-GCCAACGGTGTCCGAGCAGCGCCACTGT-3';RQ2,5'-ACAGTGGCGCTGCTCGGACACCGTTGGC-3',以上引物由上海生工生物工程有限公司合成。
1.2.2 人野生型基因 PRKAG2的克隆 用 Trizol法抽提健康人全血mRNA,逆转录合成cDNA第1条链,采用F1/R1特异引物PCR扩增目标序列,PCR 体系:cDNA 0.5 μl,F1 引物 0.5 μl,R1 引物0.5 μl,KOD DNA 聚合酶 0.5 μl,浓度 2 mmol/L 的dNTP 2 μl,浓度 25 mmol/L 的 MgSO41 μl,10 × KOD Buffer 2.5 μl,无菌双蒸水加至 25 μl。反应体系在冰上配制,混匀,瞬时离心后置于PCR仪,95℃预变性 5 min 后;95℃变性30 s,55℃退火30 s,68℃延伸90 s,进行35个循环;最后68℃延伸5 min。目标片段回收,经Nhe I、BamH I双酶切连接至pIRES2-EGFP载体中,筛选阳性克隆测序验证。
1.2.3 人突变型基因 PRKAG2 R302Q的克隆(1)PCR分段扩增引入突变序列。以人野生型PRKAG2基因为模板,分别采用F1/RQ2、RQ1/R2 2对引物进行PCR扩增,扩增产物分别命名为RSa、RSb。扩增结束后将PCR扩增产物全部上样,用1%琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下切割目的片段,胶回收试剂盒纯化。PCR体系及反应条件:模板pPRKAG2-IRES2-EGFP质粒 0.1 μl,F1/RQ1 0.5 μl,RQ22/R1 0.5 μl,KOD DNA 聚合酶 0.5 μl,浓度 2 mmol/L 的 dNTP 2 μl,浓度 25 mmol/L 的 MgSO41 μl,10 × KOD Buffer 2.5 μl,无菌双蒸水加至25 μl。反应体系在冰上配制,混匀,瞬时离心后置于PCR仪,95℃预变性5 min后;95℃变性30 s,56℃退火30 s,68℃延伸60 s,进行30 个循环;最后68℃延伸5 min。(2)PCR拼接获得PRKAG2 R302Q全长。将上述纯化得到的2个分段PCR产物RSa、RSb作为模板,采用F1/R1引物PCR扩增,得到PRKAG2 R302Q基因片段,PCR扩增产物全部上样,用1%琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下切割目的片段,胶回收试剂盒纯化。PCR体系及反应条件:模板RSa 0.5 μl,模板 RSb 0.5 μl,F1 0.5 μl,R1 0.5 μl,KOD DNA 聚合酶1 μl,浓度 2 mmol/L 的 dNTP 4 μl,浓度25 mmol/L 的 MgSO42 μl,10 × KOD Buffer 5 μl,无菌双蒸水加至50 μl。反应体系在冰上配制,混匀,瞬时离心后置于PCR仪,95℃预变性5 min后;95℃变性30 s,56℃退火30 s,68℃延伸2 min,进行30 个循环;最后68℃延伸5 min。
1.2.4 重组载体 pR302Q-IRES2-EGFP的构建(1)酶切、连接、转化。用Nhe I、BamH I双酶切回收产物R302Q片段和pIRES2-EGFP载体,37℃水浴酶切2 h。酶切体系:10 × TangoTMBuffer 5 μl,Nhe I 2 μl,BamH I 2 μl,R302Q/pIRES2-EGFP 25 μl,无菌双蒸水加至50 μl。PCR清洁试剂盒回收酶切基因及载体产物,T4DNA连接酶4℃连接过夜,得到的质粒为pR302Q-IRES2-EGFP。将重组质粒42℃热击转化Top10感受态细胞,37℃培养箱中培养过夜。(2)阳性克隆鉴定。挑取转化板的单克隆,置于20 μl无菌水中溶解,取1 μl菌液作模板,特异引物F1/R1进行PCR扩增,取5 μl扩增产物,1%琼脂糖凝胶电泳检测。反应体系:10×Taq Buffer 2 μl,F1 0.3 μl,R1 0.3 μl,菌液 0.5 μl,Taq 0.3 μl,浓度 2 mmol/L 的 dNTP 2 μl,无菌双蒸水加至 20 μl。反应体系在冰上配制,混匀,瞬时离心后置于PCR仪,94℃预变性5 min后;94℃变性30 s,61℃退火30 s,72℃延伸2 min,进行30个循环;最后72℃延伸10 min。挑取PCR鉴定正确的阳性克隆进一步采用Nhe I、BamH I双酶切验证后,挑取2个克隆送Invitrogen公司采用通用引物测序。Axygen质粒小抽试剂盒抽提测序正确的克隆质粒。
2 结果
2.1 人野生型PRKAG2基因的克隆
Trizol法提取人细胞mRNA,经RT-PCR合成cDNA第1条链,特异性引物PCR扩增得到PRKAG2基因片段,目的片段条带在1710 bp左右,酶切连接至pIRES2-EGFP载体中测序验证,与NCBI公布序列完全一致,表明正确扩增出PRKAG2基因片段见图1。
图1 人野生型PRKAG2的RT-PCR电泳图
2.2 人突变型基因PRKAG2R302Q的克隆
以人野生型基因PRKAG2为模板,通过PCR拼接的方法,分段扩增得到PRKAG2R302Q基因2段,大小分别为900 bp与800 bp左右,均与预期一致。见图2。胶回收纯化克隆得到的基因片段,再分别以以上2个片段为模板,通过PCR拼接得到了约1700 bp的目标片段,与预期一致。见图3。
图2 PRKAG2的RSa、RSb片段扩增结果
2.3 重组载体pR302Q-IRES2-EGFP的构建
以Nhe I、BamH I分别双酶切 pIRES2-EGFP和上述胶回收片段,1%琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下切割阳性片段,胶回收试剂盒回收酶切片段。经T4DNA连接酶连接双酶切产物,构建pR302Q-IRES2-EGFP重组载体。转化Top10感受态细胞,菌落PCR筛选阳性克隆。见图4。筛选得到的阳性克隆进一步采用酶切验证。见图5。挑取2个阳性克隆送Invitrogen公司测序,结果与设计完全一致。
图3 PRKAG2 R302Q的RSa、RSb片段拼接电泳图
图4 pR302Q-IRES2-EGFP重组载体菌落PCR鉴定结果
图5 pR302Q-IRES2-EGFP重组载体酶切鉴定结果
3 讨论
PRKAG2是AMPK γ2调节亚基的编码基因,在心肌和骨骼肌高度表达[5]。AMPK是一种丝氨酸/苏氨酸激酶,由α、β、γ亚基组成异质三联体,在细胞中作为代谢感受器,监测细胞内AMP/ATP比值,通过调节ATP的消耗和产生,在心肌代谢过程中发挥关键作用。在低氧、缺血、肌肉运动等应激情况下,细胞内AMP/ATP的比值升高,AMP与AMPK的γ亚基结合,使α亚基的苏氨酸暴露,通过上游激酶-AMP激活蛋白激酶激酶(AMP-activated protein kinase kinase,AMPKK)使苏氨酸磷酸化,AMPK 被激活[6]。AMPK激活后通过减少维持生命并非必要的ATP消耗,以及通过促进细胞内葡萄糖的摄取和加强氧化分解代谢刺激ATP的产生,调节体内代谢平衡[7]。
关于PRKAG2突变对AMPK功能的影响,在细胞水平的研究发现,转染突变型PPKAG2基因的人CCL13 细胞株的 AMPK 活性降低[8];而 Arad 等[9]的研究表明,AMPK基础活性反而增高。Hamilton[10]和Barnes[11]等的研究结果与Arad的研究结果一致,并且发现AMPK对AMP的敏感性降低。Burwinkel等[12]认为,由于不同实验所用的细胞株不一样,因此研究结果不同。CCL13细胞株中的肿瘤抑制蛋白LKB1是AMPK的主要上游底物,含量与其他细胞有显著差异,而突变的AMPK结构基因只有在足量LKB1存在的条件下才能增加AMPK的基础活性,并降低AMPK对AMP的敏感性。
研究表明,PRKAG2心脏综合征患者均有PRKAG2基因突变。所以,对该基因突变进行研究,进而阐述其发病机制尤为重要。为阐明这种缺陷机制,Sidhu等制备了表达人类突变PRKAG2基因的转基因小鼠[13],转基因小鼠出现的变化表型与人的家系性预激患者相似。
本研究克隆了突变型人PRKAG2 R302Q基因并构建了其真核表达载体pR302QvIRES-EGFP,后续可通过转染心肌细胞进行相关检测,为进一步研究PRKAG2 R302Q突变功能奠定了基础。
[1]Mac Rae CA,Ghaisas N,Kass S,et al.Familial hypertrophic cardiomyopathy with Wolf-Parkinson-White syndrome maps to a locus on chromosome 7q3[J].J Clin Invest,1995,96(3):1216-1220.
[2]Gollob MH,Green MS,Tang ASL,et al.Identification of a gene responsible for familial Wolf-Parkinson-White syndrome[J].N End J Med,2001,344(24):1823-1831.
[3]Gollob MH,Green MS,Tang ASL,et al.PRKAG2 cardiac syndrome:familial ventricular preexcitation,conduction system disease,and cardiac hypertrophy[J].Curr Opin Cardiol,2002,17(3):229-234.
[4]Gollob MH,Seger JJ,Gollob TN,et al.Novel PRKAG2 mutation responsible for the genetic syndrome of ventricular preexcitation and conduction system disease with childhood onset and absence of cardiac hypertrophy[J].Circulation,2001,104(25):3030-3033.
[5]Charron P,Genest M,Richard P,et al.A familial form of conduction defect related to a mutation in the PRKAG2 gene[J].Europace,2007,9(8):597-600.
[6]Morita H,Seidman J,Seidman CE.Genetic causes of human heart failure[J].J Clin Invest,2005,115(3):518-526.
[7]Kemp BE,Mitchell KI,Stapleton D,et al.Dealing with energy demand:the AMP-activated protein kinase[J].Trends Biochem Sci,1999,24(1):22-25.
[8]Daniel T,Carling D.Functional analysis of mutations in the γ2subunit of AMP-activated protein kinase associated with cardiac hypertrophy and Wolff-Parkinson-White syndrome[J].J Biol Chem,2002,277(52):51017-51024.
[9]Arad M,Benson DW,Perez-Atayde AR,et al.Constitutively active AMP kinase mutations cause glycogen storage disease mimicking hypertrophic cardiomyopathy[J].J Clin Invest,2002,109(3):357-362.
[10]Hamilton SR,Stapleton D,Donnell JB,et al.An activating mutation in the γ1 subunit of the AMP activated protein kinase[J].FEBS Lett,2001,500(3):163-168.
[11]Barnes BR ,Marklund S,Steiler TL,et al.The 5-AMP-activated protein kinase γ3 isoform has a key role in carbohydrate and lipid metabolism in glycolytic skeletal muscle[J].J Biol Chem,2004,279(37):38441-38447.
[12]Burwinkel B,Scott JW ,Buhrer C,et al.Fatal congenital heart glycogenosis caused by a recurrent activating R531Q mutation in the γ2-subunit of AMP-activated protein kinase(PRKAG2),not by phosphorylase kinase deficiency[J].Am J Hum Genet,2005,76(6):1034-1049.
[13]Sidhu JS,Raja YS,Rami TG,et al.Transgenic mouse model of ventricular preexcitation and atrioventricular reentrant tachycardia induced by an AMP-activated protein kinase loss-of-function mutation responsible for Wolf-Parkinson-White syndrome [J].Circulation,2005,111(1):21-29.