全国种猪遗传评估中心2011年第二次遗传评估报告

为了更好地贯彻落实 《全国生猪遗传改良计划 （2009-2020年）》，按照农业部办公厅印发的 《全国生猪遗传改良计划 （2009-2020年）实施方案》的要求，推进全国种猪性能测定和遗传评估，加快遗传改良的进展，提高我国种猪的整体质量，全国种猪遗传评估中心根据24家国家生猪核心育种场上报到“全国种猪遗传评估信息网”的性能测定数据，进行了遗传评估。现对数据情况、评估结果予以公布和说明。

一、数据来源

本次分析数据来自24家国家生猪核心育种场于2011年8月12日前 （含8月12日）上报至 “全国种猪遗传评估信息网”的性能测定数据，数据范围2006-2011年，涉及杜洛克、大白和长白3个品种。

二、遗传评估模型

1.育种值估计

根据 《全国种猪遗传评估方案 （牧站 （种） [2000]60号）》， 采用多性状动物模型最佳线性无偏预测 （MTBLUP）方法估计达100kg体重日龄、背膘厚和总产仔数3个性状的育种值。具体如下：

（1）达100kg体重日龄和背膘厚

达100kg体重日龄或背膘厚观察值=总平均数+场年季性别固定效应+窝随机效应+个体随机遗传效应 +随机剩余效应

（2）总产仔数

总产仔数观察值 =总平均数+场年季固定效应+母猪出生的窝效应+个体随机遗传效应+母猪永久环境效应+随机剩余效应

2.父系指数和母系指数

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根据达100kg体重日龄、背膘厚和总产仔数三个性状的估计育种值，分别计算杜洛克、长白和大白三个品种的父系指数和母系指数，其中父系指数包括达100kg日龄和背膘厚2个性状，母系指数包括达100kg日龄、背膘厚和总产仔数3个性状。

(1）杜洛克

父系指数=100-4.21AGE-17.1BF，母系指数=100-3.16AGE-12.85BF+43.4NB

(2)长白

父系指数=100-3.62AGE-14.7BF，母系指数=100-2.5AGE-10.17BF+34.33NB

(3)大白

父系指数=100-3.79AGE-15.4BF，母系指数=100-2.54AGE-10.33BF+34.88NB

其中，AGE：达 100kg体重日龄的育种值，BF：背膘厚的育种值，NB：总产仔数的育种值。

3.分场计算育种值和选择指数

由于各猪场之间的场间遗传关联不大，不适合进行联合遗传评估，因此本次遗传评估分开计算各猪场的育种值和选择指数，各猪场之间的结果和排名没有可比性。

三、性能测定数据总体情况

根据2011年8月12日前各核心场上传至 “全国种猪遗传评估信息网”的数据，统计了24家国家生猪核心育种场从2006-2011年的测定数据总体情况（如表1所示），各核心场数据统计见附录。

四、育种值结果

根据父系指数或母系指数分别列出各猪场公猪前25名和母猪前50名的个体，其中杜洛克根据父系指数排序，大白和长白，根据母系指数排序。具体结果详见附表7。

五、场间关联率

用2006年到2011年8月，24家国家生猪核心育种场，杜洛克、长白和大白猪达100kg体重日龄的测定记录，根据场效应的相关系数来度量场间关联程度，即关联率 （connectednessrating，CR）的方法，进行长白猪和大白猪场间关联度的计算，评价种猪场间的遗传联系程度。三个品种各猪场间的关联率及各场的平均关联率见附表1到附表6。

总体而言，相互有关联的场比较少，有关联的场之间的关联率还比较低。