APP下载

双向凝胶电泳技术在中医证候研究中的应用

2010-04-13

世界中医药 2010年5期
关键词:双向电泳凝胶电泳组学

陈 冰

(中国中医科学院中医基础理论研究所,北京市东直门内南小街 16号,100700)

双向凝胶电泳技术自从问世以来便广泛应用于各种领域,现已成为蛋白质组学的核心技术,由于其整体性、实时性等特点,近年来大量应用于中医证候研究方面。本文拟对双向电泳技术在证候研究中的应用做一综述。

1 双向电泳技术原理及应用

双向电泳(two-dimensional gel electrophoresis,2-DE)是根据蛋白质等电点和分子量的不同,通过两次方向互相垂直的高分辨率等电聚焦电泳和十二烷基磺酸钠一聚丙烯酰胺凝胶电泳(sodium dodecyl sulphate polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE),将带不同净电荷和不同分子量的蛋白质二维平面上呈点状分开的技术。双向电泳技术 1975年由意大利生化学家O'Farrell发明[1],可以在一个平面上分离出数以千计的蛋白质,适用于整体水平生命活动规律的研究[2]。它以高分辨率、简单、快速等优点被广泛应用于蛋白质组学研究,是目前分离复杂蛋白质组分最常用的工具。通过双向电泳得到差异蛋白后,可结合其他蛋白质组学研究方法进一步分析,如结合质谱技术进行差异蛋白质的鉴定、相关数据库检索,将所获结果进行生物信息学分析等。因此说,双向电泳是蛋白质组学的核心技术。

双向电泳技术包括蛋白样品制备、等电聚焦、SDSPAGE、染色等步骤。样品制备非常关键,合理的样品制备可保证 2-DE的重复性。尽量减少蛋白提取过程中的降解和丢失,以提高分辨率。等点聚焦是在存在 p H梯度和电场的条件下,蛋白质分子向其净电荷为零的 p H处移动,当样本中的每一个蛋白质均达到其电荷为零的 pH位置时,样品蛋白质就根据其等电点得到分离。SDS-PAGE有垂直和水平 2种方式。垂直方式是目前常用的电泳方式,阴离子去垢剂十二烷基磺酸钠同蛋白质合后形成项链样结构,并以 114∶1的比例结合,从而使蛋白质带有净负电荷,使蛋白电泳时移动距离与其分子量呈正比。

双向电泳常用的染色方法有考染色、银染、荧光染色等方法。荧光差异双向凝胶电泳(DIGE)是目前蛋白质组学研究的热门技术[3-4]。它是通过荧光染料与蛋白质中的赖氨酸残基进行结合,把不同荧光素标记的样品在同一块凝胶上进行分离,用不同波长的激光激发后可以显示不同的颜色。DIGE技术的优点是采用几种不同的荧光染料(Cy3、Cy5、Cy2)分别标记不同的蛋白质样品,并设立内标,可以在同一块胶上同时分离 2种以上蛋白质样品,比较同一蛋白在不同样品中的丰度[5-6]。由于每块凝胶中加入了内标,降低了普通双向凝胶电泳中不同凝胶间的误差,减少了实验重复次数;且灵敏度高,可以对相对微量的蛋白质进行定量研究。DIGE实验中一般用 Cy2标记内标,用 Cy3、Cy5分别交叉标记不同胶间的样品,这就避免了不同染料对实验结果的影响。其分析软件能自动进行蛋白质点的识别和匹配,可消除人为因素,增加实验的准确性和重复性[7-8]。因此,DIGE技术具有较高的敏感性、特异性及较宽的动态范围等优点,非常适用于样本数较少,蛋白丰度范围大的实验研究。目前已有学者将该项技术应用于证候特征的研究方面,唐利华等发现了 17个差异蛋白质可能与肾阳虚疾病有关[9]。双向电泳技术还可以根据研究者的需要结合其他蛋白质组学相关技术,如蛋白质芯片、S质谱等,目前双向电泳加质谱已经成为蛋白质组学研究的基本方法。

2 双向电泳技术是研究中医证候的重要方法

中医证候是指在致病因素作用下,机体内外环境各系统之间相互关系发生紊乱所产生的综合反应,是反映疾病处于某一阶段病因、病性、病位、病势等病理因素的综合性诊断概念,是致病因素与机体反应两方面情况的综合。证,是指对疾病所处的一定阶段的病机概括,或非疾病机体的一定阶段的机体状态的概括;候,是指这种病机或状态的可被观察到的外在表现[10]。

蛋白质组的概念最早由澳大利亚学者 Wilkins和Williams提出[11],指由一个基因组、细胞、组织或生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组学是以细胞或组织不同时间、环境的所有蛋白质为研究对象,从整体上研究蛋白质的种类、相互作用以及功能结构的一门科学。而证候的整体性、时相性等特点与蛋白质组学时空性与整体性的特点十分贴近。因此,应用蛋白质组学方法对证候本质进行研究已经成为一种公认的方法,而作为蛋白质组学中最重要的技术——双向电泳,更是被广泛使用。将蛋白组学引入证实质研究,更有利于动态地揭示同一个研究对象不同时期的变动性,更符合证研究自身的特点。对不同中医证候产生前后蛋白质组学研究,探究中医证候产生的物质基础支配机制,可以揭示中医证候的科学内涵,能够为中医诊断的客观化提供依据和方法。寻找与证候相关的差异标志蛋白群,制定标准参照物,使得疾病的辨证分型及用药具有客观性、准确性及重复性[12]。

3 双向电泳技术在中医证候研究中的应用

以双向电泳技术为代表的蛋白质组学方法近些年来已经大量应用于中医证候的研究中。刘萍[13]等通过双向电泳技术,成功建立了脾肾虚型重症肌无力患者血清 2-DE图谱。其中在正常对照组双向电泳图谱上观察到了 1463±179个蛋白点,而重症肌无力组共观察到 1508±89个蛋白点。选取具有明显差异的21个蛋白点进行质谱鉴定,共鉴定出 8种差异蛋白。赵慧辉[14]等采用双向凝胶电泳结合基质辅助激光解析/电离 -飞行时间质谱对 8例心绞痛血瘀证患者血瘀证程度变化前后的血浆进行比较蛋白质组学研究,寻找心绞痛血瘀证相关蛋白。结果初步发现了 Clusterin、ApoA-I在血瘀证程度变轻后表达增加,而 Fibrinogenβchain、Vitamin D-Binding Protein、Haptoglobin βchain、Albumin isoform在血瘀证程度变轻后表达降低。谭秦湘等[15]以不同疾病组肝郁证患者和正常人的血清为样本,采用双向凝胶电泳分离蛋白质组分,通过分析比较正常组与肝郁证组血清蛋白质图谱,探询其物质基础,经分析后发现肝郁证差异蛋白质群。张娴[16]等在对自发性高血压大鼠组和高血压肝阳上亢模型组大鼠肝脏蛋白质组的双向电泳分析中发现,大部分蛋白集中分布在 PI 5~8的区域。研究人员认为应用蛋白质组分析技术能较全面地了解模型的蛋白表达情况,有利于筛选证候相关蛋白,是研究中医证候的可行途径之一。战丽彬[17]等应用双向电泳技术,通过2-DE图像分析软件 ImageMaster 5.0对大鼠脾阴虚组和空白对照组海马蛋白质组进行分析,可分辨 2组蛋白斑点数目分别为(2027±61)个和(1917±207)个。将图谱部分区域放大后显示出明显差异,初步筛选出脾阴虚大鼠海马蛋白质组的差异表达,研究人员推测与学习记忆相关。刘希成[18]利用双向电泳优化分离了除去高丰度蛋白(白蛋白和 IgG)的老年体虚肾阳虚患者(以健康组为参照)的血清样本,对比分析pH4~7范围的 2-DE图谱,发现肾阳虚患者和参照组的平均蛋白点分别为(393±32)和(455±19)个。其中肾阳虚证候表达量上调 2倍(P<0.05)以上的蛋白点有 26个,下调 2倍以上的有 33个。结合质谱获得上述差异蛋白的肽质量指纹图谱,并经数据库检索共鉴定出了 49种差异蛋白质,其中有 10种在肾阳虚血清中特异表达,有 6种在健康组血清中特异表达。蛋白功能分析发现,其中 33种蛋白质的差异表达与肾阳虚证密切相关。蛋白质 TCRβ及 transthyretin的蛋白印迹实验验证了 2-DE的结果。研究人员认为该研究结果为阐明中医肾阳虚证的机理提供了一条新途径。除此之外,还有学者利用双向电泳技术对血虚证[19]、慢性胃炎湿证[20]等证候类型进行了研究。

4 存在问题与展望

双向电泳的分辨率较高,近年来被广泛应用于农业、医学等研究领域。但仍存在诸多问题:1)重复性差,自动化程度低;2)低丰度蛋白质、极酸及极碱性蛋白质、分子量过大或过小的蛋白质及膜蛋白等分离困难。针对上述问题,可采用如二维色谱、二维毛细管电泳、液相色谱 -毛细管电泳等新型分离技术作为双向电泳的补充。而且随着高通量和高精度蛋白质新型检测技术的出现,双向电泳技术可以得到进一步完善。双向电泳技术结合蛋白质的生物质谱鉴定及其与生物信息学的结合一系列方法的建立,必将为中医证候的研究提供更完备的支持。

[1]O'Farrell PH.High resolution two-dimensional electrophoresis of proteins[M].J Biol Chem,1975,250:4007-4021.

[2]Dutt MJ,LeeKH.Proteomics analysis.Curr Opin Biotechnol,2000,11(2):176-179.

[3]Zhou G,Li H,DeCamps D,et al.2D differential in2gel electrophoresis for the identification of esophageal scans cell cancer specific protein markers.Mol Cell Proteomics,2002,1(2):117-124.

[4]Gharbi S,Gaffney P,Yang A,et al.Evaluation of two2dimensional differential gel electrophoresis for proteomic expression analysis of a model breast cancer cell system.Mol Cell Proteomics,2002,1(2):91-98.

[5]Unlu M,Morgan ME,Minden JS.Difference gel electrophoresis:a single gel method for detecting changes in protein extracts.Electrophoresis,1997,18(11):2071-2077.

[6]Tonge R,Shaw J,Middleton B,et al.Validation and development of fluorescence two2dimensional differential gel electrophoresis proteomics technology.Proteomics,2001,1(3):377-396.

[7]Karp NA,Kreil DP,Lilley KS.Determining a significant change in protein expressinon with DeCyder TM during a pair-wise comparison using two-dimensional difference gel electrophoresis.Proteomics,2004,69(4):1421-1432.

[8]Alban A,David SO,Bjordesten L.A novel experimental design for comparative two-dimensional gel analysis:Two-dimensional difference gel electrophoresis incorporating a pooled internal standard.Proteomics,2003,68(3):36-44.

[9]唐利华,卢德赵,沃兴德.肾上腺切除的肾阳虚大鼠肝组织蛋白质双向电泳图谱的建立与分析.浙江中医学院学报,2005,29(5):51-54.[10]郭蕾,王永炎,张志斌.关于证候概念的诠释.北京中医药大学学报,2003,26(02):5-8.

[11]Wasinger VC,Cordwell SJ,Cerpa-Poljak A,et al.Progress with geneproduct of mapping of the moliautos Mycoplasmit genitalium.Electrophoresis,1995,16(7):1090-1094.

[12]施孟如,沃兴德,卢德赵.蛋白质组学和中医药研究.浙江中医学院学报,2004,28(6):82-85.

[13]刘萍,章怡祎,乔健.脾肾虚型重症肌无力患者血清双向电泳图谱的建立及分析.中西医结合学报,2007,5(2):150-154.

[14]赵慧辉,王伟,李宏.双向电泳 -质谱技术筛选心绞痛血瘀证相关蛋白的研究.北京中医药大学学报,2008,27(2):96-99.

[15]谭秦湘,吕志平,钟小兰,等.肝郁证辨证与相关蛋白关系初步研究.辽宁中医杂志,2006,33(2):157-158.

[16]张娴,曾星,段小军,等.高血压肝阳上亢证大鼠模型建立和蛋白质表达分析.四川中医,2008,26(3):9-11.

[17]战丽彬,刘莉,路小光,等.脾阴虚证大鼠海马蛋白质组双向凝胶电泳的研究.中华中医药杂志,2009,24(2):149-152.

[18]刘希成,梁恒,田真,等.肾阳虚证候的人血清比较蛋白质组学分析.中国生物化学与分子生物学报,2007,23(7):592-599.

[19]马增春,高月,谭洪玲,等.四物汤对辐射致血虚证小鼠血清蛋白质表达的影响.中国中药杂志,2003,28(11):1050-1053.

[20]王忆勤,李福凤,王文静,等.慢性胃炎中医湿证血清蛋白组学研究.中西医结合学报,2007,5(5):514-516.

猜你喜欢

双向电泳凝胶电泳组学
口腔代谢组学研究
基于UHPLC-Q-TOF/MS的归身和归尾补血机制的代谢组学初步研究
挤压添加耐高温α—淀粉酶高粱辅料麦汁的蛋白质组分分析
基于DNA计算的最大权团问题设计
应用双向电泳分析2株不同毒力的副猪嗜血杆菌蛋白质表达的差异
4种核酸染料在实验教学中的应用研究
代谢组学在多囊卵巢综合征中的应用
蛋白质组学在结核杆菌研究中的应用
双向电泳技术分离燕窝水溶性蛋白
进出口食品中肠炎沙门氏菌的脉冲场凝胶电泳分子分型分析