SNP-array芯片检测诊断自然流产的应用效果研究
2024-12-31刘安全赵艳芳
摘要:目的" 探讨SNP-array芯片检测诊断自然流产的应用效果。方法" 选取2018年10月~2023年11月于我院进行自然流产遗传学诊断的340例孕妇为研究对象,采用美国 Affymetrix Cyto Scan750K芯片平台对样本进行基因组拷贝数变异分析。结果" 检测异常174例,占比51.18%;在异常型中,染色体三体88例,占比25.88%,明显高于其他异常结果类型(P<0.05);在染色体三体中,16号染色体三体18例,占比20.45%,明显高于其他染色体三体(P<0.05);≥35岁孕妇三体发生率为44.19%,显著高于<35岁孕妇的23.23%(P<0.05)。结论" SNP-array芯片检测技术在自然流产遗传学诊断中的诊断效能良好,可有效检出异常染色。
关键词:自然流产;SNP-array芯片技术;诊断;效果
自然状态下发生的流产称为自然流产。在所有临床确认的妊娠中,自然流产的发生率约为15%,可影响母体的生命健康。相关研究显示[1~2],约50% ~ 60%的妊娠早期流产是由早期胚胎染色体异常所致。因此,实现对异常染色体高效、准确的诊断检查,对于明确病因十分重要。随着现代医学技术的不断发展,染色体检测技术越来越多地应用于临床中。其中,单核苷酸多态性微阵列(SNP-array)是含有大量SNP位点序列的高密度基因芯片,具有高效、便捷等优势[3~4]。本研究选取2018年10月~2023年11月于我院进行自然流产遗传学诊断的340例孕妇为研究对象,探讨探讨SNP-array芯片检测诊断自然流产的应用效果。
1资料与方法
1.1 一般资料
选取2018年10月~2023年11月于我院进行自然流产遗传学诊断的340例孕妇为研究对象。其中,流产物314例,外周血26例。
纳入标准:孕妇及家属同意参与研究;接受SNP-array芯片检测。排除标准:存在相关禁忌证。
1.2 方法
本研究使用美国Affymetrix Cyto Scan750K芯片平台对样本进行基因组拷贝数变异分析。实验操作严格遵循Affymetrix公司提供的操作流程,进行全基因组DNA的消化、连接、扩增、定量、杂交、染色等操作。采用Affymetrix扫描仪扫描芯片,扫描信号图经Affymetrix 的Chas软件分析、计算。
1.3 统计学方法
数据处理采用SPSS26.0统计学软件,计量资料以(±s)表示,采用t检验,计数资料用比率表示,采用χ2检验,P<0.05为差异具有统计学意义。
2结果
2.1 SNP-array芯片检测结果
检测异常174例,占比51.18%;在异常型中,染色体三体88例,占比25.88%,明显高于其他异常结果类型(P<0.05)。
2.2 三体中各染色体情况
在染色体三体中,16号染色体三体18例,占比20.45%,明显高于其他染色体三体(P<0.05)。
2.3 流产组织SNP-array芯片检测结果
≥35岁孕妇三体发生率为44.19%,显著高于<35岁孕妇的23.23%,两组比较差异具有统计学意义(P<0.05)。
3" 讨论
在孕早期实现对染色体的有效诊断检查,对于更好地预防及再次妊娠的科学指导均具有十分重要的意义[5]。SNP-array技术是自然流产组织异常染色体检出效能最高的方法之一,可以实现对异常染色体的高效检出,同时也可对杂合性缺失等检出,对于提高检出效能具有重要价值,也是目前自然流产遗传学诊断研究的重要内容及方向[6]。SNP-array技术可有效检测染色体拷贝数变异(Copy Number Variation,CNV),在三体、单体等异常的检测分析方面具有显著的应用价值[7~8]。
本研究结果显示,检测异常174例,占比51.18%;在异常型中,染色体三体88例,占比25.88%,明显高于其他异常结果类型(P<0.05);在染色体三体中,16号染色体三体18例,占比20.45%,明显高于其他染色体三体(P<0.05)。可见16号染色体三体的检出率最高。在临床异常结果中,以染色体三体等异常为主,具有较高的检出率。染色体三体的形成与遗传、环境、药物等影响相关,是目前最常见的染色体异常疾病[9~10]。其中,16号染色体三体是人类最常见的常染色体三体。相较于其他大染色体,胚胎对16号染色体的异常耐受性更强[11~12]。此外,16号染色体的结构比较特殊,它在基因组中是低拷贝重复序列最丰富的常染色体之一。因此,无论在产前还是产后,16号染色体微重复/微缺失的检出率均相对较高,并且主要集中在16号染色体短臂上[13~14]。
此外,本研究结果显示,≥35岁孕妇三体发生率为44.19%,显著高于<35岁孕妇的23.23%(P<0.05)。可见≥35岁产妇三体的发生风险较高。年龄是妊娠过程的危险因素,也是影响卵子质量的重要因子。这主要是因为随着母体年龄的增长,姐妹染色单体的内聚力减弱,甚至是丧失,进而导致非整倍的增加[15]。因此,在临床筛查诊断中,应强化对高龄产妇的SNP-array诊断检查,减少缺陷儿的出现,这也是SNP-array技术的应用价值体现。
综上所述,SNP-array芯片检测技术在自然流产遗传学诊断中的诊断效能良好,可有效检出异常染色。
参考文献
[1]陈佳燕,张剑,蔡美娇,等.单核苷酸多态性微阵列分析技术在孕早期颈项透明层增厚胎儿中的应用[J].中华医学遗传学杂志,2021,38(3):296-299.
[2]孙义锡,罗玉琴,钱叶青,等.单核苷酸多态性微阵列芯片在早期自然流产绒毛组织遗传学分析中的应用[J].浙江大学学报(医学版),2017,46(3):262-267.
[3]阳鑫妙,李雯雯,沈国松,等.42例自然流产组织的单核苷酸多态性微阵列芯片分析[J].中华医学遗传学杂志,2019,36(4):400-402.
[4]令狐克燕,卓召振,匡颖,等.染色体微阵列分析技术在自然流产病因学分析中的应用研究[J].贵州医药,2023,47(12):1854-1855,1858.
[5]郭依琳,王莉,薛淑文,等.SNP-array技术应用于超声检查异常胎儿产前诊断的研究[J].中华妇产科杂志,2018,53(7):464-470.
[6]孙媛媛,刘灵,职云晓,等.染色体微阵列分析和全外显子组测序技术在颈项透明层增厚胎儿中的应用[J].解放军医学杂志2023,48(3):311-317.
[7]余勤俭,孙素玉,沈旭娜,等.基因芯片技术在自然流产胚胎染色体分析中的应用[J].健康研究,2020,40(3):321-323,327.
[8]黄艳,王晓华,侯东霞,等.单核苷酸多态性微阵列 芯片与荧光原位杂交在流产绒毛组织遗传学分析中的比较研究[J].国际检验医学杂志,2021,42(1):87-90.
[9]胡艳平,袁静,李琴,等.染色体核型分析联合CNV-seq在NT增厚胎儿产前诊断中的应用[J].国际生殖健康/计划生育杂志,2022,41(5):360-364.
[10]熊卿圆,岑锦明,曾赤佳.应用单核苷酸多态性微阵列技术对不明原因智力低下/发育迟缓患儿的遗传学分析[J].广东医学,2020,41(20):2096-2101
[11]孙丹,王小艳,罗曼曼,等.应用单核苷酸多态性微阵列芯片及核型分析检测7例21q部分三体的产前遗传学诊断[J].生殖医学杂志,2022,31(6):834-837.
[12]彭小芳,林少宾,萧晓琴,等.16号染色体三体、嵌合体、单亲二体——更新的认识[J].中国产前诊断杂志(电子版),2021,13(1):12-16.
[13]项菁,赵伊冉,葛志红,等.CNV-seq技术对1953例自然流产物的染色体数目和拷贝数变异分析[J].中国产前诊断杂志(电子版),2021,13(4):46-51.
[14]梁红梅,张仿珍,余红秀,等.1 096例复发性自然流产夫妇外周血染色体异常率及异常核型分布特征分析[J].中外医学研究,2021,19(33):172-176.
[15]孙丹,贺晓,周娟,等.不同年龄段复发性流产患者染色体多态性检出情况分析[J].宁夏医科大学学报,2021,43(12):1299-1303.