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科研人员创建蝙蝠与多种动物的异种嵌合体

近期，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所国家家养动物种质资源库联合国内高校，利用无外源基因残留的蝙蝠诱导性多能干细胞（iPSCs）成功创建了蝙蝠与鸡、蝙蝠与小鼠、蝙蝠与猪的异种嵌合体，为以蝙蝠为实验材料的长寿、抗病毒和回声定位等机制研究提供了优质细胞资源。相关成果发表在《细胞发现（Cell Discovery）》上。

蝙蝠是第二大哺乳动物类群，也是惟一进化出真正自主飞行能力的哺乳动物，具有长寿、抗病毒、冬眠和回声定位等生物学特性，受到科研人员广泛关注。然而，由于缺少蝙蝠生物学研究的可靠细胞模型，很多关于蝙蝠的重复性试验无法开展。诱导性多能干细胞可以在体外进行自我更新，高质量的诱导性多能干细胞在适当的条件下还可以分化成不同类型的细胞及类器官，是细胞生物学研究的良好模型。

该研究构建了一种无外源基因整合的蝙蝠诱导性多能干细胞，这些蝙蝠诱导性多能干细胞在小鼠、猪和鸡三种模式动物中均表现出较好的体内嵌合能力。其中，在蝙蝠-鸡异种嵌合体中获得了高比例嵌合，表明鸡胚可以作为外源干细胞嵌合能力检测的有效受体。无外源基因整合的蝙蝠诱导性多能干细胞不具有谱系分化偏好，避免了嵌合后代形成肿瘤和死亡的风险，为制备蝙蝠类器官提供了高质量的原材料。研究团队建立的蝙蝠诱导性多能干细胞资源将通过国家家养动物种质资源库与相关科研单位和企业共享。

新型转录组定量方法可准确定量序列高度相似的转录本的表达水平

近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所农业宏基因组学创新团队联合国内科研单位开创性地提出了一种快速且全局最优的转录组定量解决方案TQSLE。该方法可准确定量序列高度相似的转录本的表达水平。相关研究成果发表在《生物信息学简报（Briefings in Bioinformatics）》上。

由于存在着序列极其相似的不同参考转录本，一部分转录组测序读段存在映射不确定性，从而无法通过映射读段的计数来估计转录本表达量。为解决这一问题，研究人员开发了一种非基于最大期望算法且非序列比对的方法TQSLE，为估计转录本和基因表达定量提供了一个全局最优的解决方案。在模拟及真实的转录组测序数据集上进行了一系列测试，结果表明，该技术相比基于最大期望算法的非序列比对的转录组定量方法更为准确。