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木质素生物合成途径相关基因调控琯溪蜜柚汁胞粒化的研究

2023-09-10刘鹿宁赵秋月葛聪田志娇周晓俐阮翥龙庄木来李延王平

果树学报 2023年3期
关键词:酶活性

刘鹿宁 赵秋月 葛聪 田志娇 周晓俐 阮翥龙 庄木来 李延 王平

摘要:【目的】探究琯溪蜜柚果实汁胞粒化过程中木质素生物合成途径相关基因在果实发育过程中的表达特征,以揭示汁胞粒化过程中木质素合成的分子调控机制。【方法】选取2018 年花后135、165、195、215 d 4 个时期的琯溪蜜柚果实,测定汁胞粒化率及木质素含量以及分析转录组数据筛选到的木质素生物合成途径关键基因的差异表达和相关酶活性变化,并进行汁胞细胞壁木质素沉积的显微观察。【结果】在琯溪蜜柚花后195 至215 d 果实发育成熟期,木质素生物合成途径中CrPAL1、CrPAL3、CrC4H1、CrC4H2、Cr4CL、CrCCR3、CrCAD3、CrPOD2 和CrPOD7 等9 个基因的表达量都显著增强,qRT-PCR验证结果与转录组数据一致。这期间果实汁胞粒化明显加速,木质素合成相关酶苯丙氨酸解氨酶(PAL)、肉桂酸-4-羟基化酶(C4H)、4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL)、肉桂醇脱氢酶(CAD)、过氧化物酶(POD)的活性明显上升,木质素含量显著积累,番红染色显示木质素在蜜柚汁胞细胞壁中明显沉积。【结论】琯溪蜜柚木质素生物合成途径相关基因参与调控汁胞粒化过程中细胞壁木质素的合成。研究结果为今后琯溪蜜柚的品种改良和分子育种提供了理论基础。

关键词:琯溪蜜柚;汁胞粒化;基因调控;酶活性;木质素合成

中图分类号:S666.3 文献标志码:A 文章编号:1009-9980(2023)03-0432-10

琯溪蜜柚[Citrus grandis(L.)Osbeck. Guanxipomelo]为亚热带芸香科常绿果树,是福建省平和县乃至全国具有代表性的亚热带水果之一,已有500多年的栽培历史,是当地农民脱贫致富的主要经济来源[1]。然而,琯溪蜜柚的汁胞粒化严重影响到了果实的生产和销售,对琯溪蜜柚的口碑和相关产业造成了冲击,给当地农民带来一定的经济损失。

琯溪蜜柚成熟過程中的汁胞粒化是一种生理病害,将粒化汁胞与正常汁胞比较,发现粒化汁胞变干、变硬,呈现浑浊的絮状物。汁胞粒化对果实汁胞的外观、质地和风味都有不利影响[2]。Shomer 等[3]通过观察琯溪蜜柚汁胞细胞壁的超微结构,认为汁胞粒化是汁胞细胞次生壁木质化形成厚壁组织的结果。潘腾飞等[4]的研究发现琯溪蜜柚汁胞粒化指数与木质素含量呈显著正相关,表明琯溪蜜柚汁胞粒化和木质素合成关系密切。木质素是沉积在植物细胞壁中的酚类聚合物,主要有3 种类型[5],分别是由香豆醇合成的对羟基苯基木质素(H型)、由松伯醇合成的愈创木基木质素(G型)、由芥子醇合成的紫丁香基木质素(S 型)[6]。琯溪蜜柚粒化汁胞中发现的木质素主要为G型木质素[7]。研究发现肉桂酰辅A还原酶(CCR)、肉桂醇脱氢酶(CAD)和过氧化物酶(POD)等和木质素合成直接相关[8]。此外,苯丙氨酸解氨酶(PAL)、肉桂酸-4-羟基化酶(C4H)、4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL)、CAD、POD等酶活性的变化也与木质素含量相关[9]。目前,对琯溪蜜柚汁胞粒化与木质素代谢关系的报道多为对木质素代谢途径中个别基因家族的分析或木质素相关合成酶活性对木质素含量的影响,关于琯溪蜜柚汁胞粒化过程中木质素代谢途径的系列关键基因表达变化与汁胞粒化关系的相关研究尚未见报道,因此在基因、酶及其代谢物水平上对此展开系统研究是十分必要的。

琯溪蜜柚果实汁胞粒化现象通常发生在果实成熟和采后的贮藏过程中,有关采后贮藏汁胞粒化的研究较多,但对成熟果实的汁胞粒化研究较少。笔者在本研究中以不同生长发育时期的琯溪蜜柚汁胞为材料,通过转录组筛选差异表达的木质素合成关键基因分析相关酶活性和木质素含量、粒化率的变化,以期揭示琯溪蜜柚汁胞粒化过程的生理与分子调控机制。

1 材料和方法

1.1 试验材料

琯溪蜜柚果实样品由福建省漳州市平和县小溪镇旧楼村石角坛“平和琯溪蜜柚综合试验站科研基地”果园提供,果园海拔420 m,选取25 年以上树龄、树势一致的健壮树体,正常管理。于2018 年花后135、165、195 和215 d 4 个时期分别随机采集大小一致、健康、无明显机械外伤的果实各9 个立即运回实验室,并进行果实粒化率的测定和果实汁胞石蜡切片。每个时期每个果实各取汁胞10 g,混合后放入液氮中速冻,存于-80 ℃冰箱,用于后续木质素合成相关酶活性的测定和qRT-PCR验证试验。此外,每个果实各取约100 g 置于玻璃瓶内于烘箱60 ℃烘干,研钵研磨后装入15 mL离心管中,用于木质素含量测定。以上所有试验均设3 次生物学重复。

1.2 蜜柚果实粒化率、汁胞木质素含量测定

琯溪蜜柚果实粒化率测定参考代亚兰等[10]的方法,分别测定花后4个时期的粒化汁胞质量和汁胞总质量。果实粒化率/%=粒化汁胞质量/汁胞总质量×100。琯溪蜜柚果实汁胞木质素含量采用AB 法,即乙酰溴法测定[11]。

1.3 蜜柚汁胞木质素显微镜观察

参照秦永亭等[12]的方法,将琯溪蜜柚汁胞用石蜡包埋后,用石蜡切片机切成7 μm厚的切片,干燥后用番红染液染色2 h、中性树胶封片后,用LEICADMI 48倒置显微镜观察。木质化的细胞壁被番红染成红色。

1.4 蜜柚汁胞转录组木质素合成差异基因表达分析

转录组测序由深圳华大基因研究院完成,统计和评估转录组测序数据数量和质量以及组装效果。

通过转录组测序,得到基因的表达水平。将log2>2,并且Q-value ≤ 0.001 的基因定义为差异基因。根据4 个时期汁胞转录组测序中的差异基因KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)途径富集分析,木质素合成代谢途径属于苯丙烷次生代谢途径中的一部分,将所有木质素代谢途径关键基因进行表达量分析,利用TBtools 软件绘制热图,并从中挑选出差异表达基因。

1.5 蜜柚汁胞木质素生物合成差异基因引物设计

从转录组中筛选出13 个差异表达基因(CrPAL1、CrPAL3、CrC4H1、CrC4H2、Cr4CL、CrHCT1、CrCCR3、CrCAD3、CrCOMT4、CrPOD2、CrPOD6、CrPOD7、CrPOD8),利用NCBI 上的引物设计程序(https://www.ncbi.nlm.nih. gov/tools/ primer- blast/index.cgi)、按照荧光定量引物设计原则设计基因的qRT-PCR引物,以Actin 为内参基因(表1)。引物合成由擎科生物公司完成。

1.6 qRT-PCR验证分析

使用通用RNA提取试剂盒(东盛生物)提取汁胞RNA,参照HiScrip? Ⅱ Q RT SuperMix for qPCR试剂盒说明书,以琯溪蜜柚果实汁胞RNA为模板合成双链cDNA。使用ChamQ Universal SYBR qPCRMaster Mix 试剂盒在罗氏荧光定量PCR 仪上测定基因的表达量。

1.7 蜜柚汁胞木质素合成相关酶活性测定

分别参考PAL、C4H、4CL、CAD和POD检测试剂盒(上海优选)说明对琯溪蜜柚果实汁胞进行PAL、C4H、4CL、CAD和POD提取并测定其活性。

1.8 数据处理

采用2-△△Ct方法计算基因的相对表达量[13]。利用WPS 表格进行数据统计(2019),SPSS 19.0 进行差异显著性分析。

2 结果与分析

2.1 琯溪蜜柚果实粒化率及汁胞木质素含量的变化

在琯溪蜜柚果实不同生长发育期间,花后195 d之前的果实发育期未见汁胞粒化,但在花后195 d 之后的果实成熟期汁胞粒化率明显增加(图1);随着蜜柚果实的成熟,汁胞木质素含量也呈现增加的趋势,在花后195 和215 d 汁胞中发现木质素含量显著增加(图1),这些结果说明在蜜柚果实生长发育期间,随着木质素的积累,果实汁胞粒化率也随之增加,果实汁胞粒化可能是木质素含量过度累积引起的。

2.2 蜜柚汁胞木质素显微观察

对FAA固定处理后的花后135、165、195和215 d的琯溪蜜柚果实汁胞进行石蜡包埋、切片及番红染色,图片由下至上是汁胞内部细胞到汁胞外表皮层。用20倍显微镜观察发现,花后135 和165 d 蜜柚果实汁胞颜色相似,无明显红色、无明显颜色变化(图2-A、B),说明这两个时期汁胞木质素含量较低;花后195 d 汁胞内部细胞壁呈现红色(图2-C),汁胞外表皮层细胞壁颜色与花后135、165 d 汁胞相比无明显变化,但此时汁胞已出现木质化,木质素含量较花后135、165 d 相比略微增加。花后215 d 汁胞内部细胞和外表皮层的细胞壁均被染成红色(图2-D),且颜色较花后195 d 更深,说明在花后195 d 之后的果实成熟期汁胞细胞壁木质化程度增加,木质素含量显著上升。

2.3 蜜柚汁胞转录组木质素合成差异基因表达分析

对4 个生长发育时期琯溪蜜柚果实汁胞转录组17 个木质素生物合成途径中差异表达基因进行热图分析(图3),结果表明,其中1 个基因CrCCR1 和另外3 个基因CrPAL、Cr4CL2、Cr4CL7 分别在花后165 和195 d 的表达量与这2 个时期的木质素含量的增加趋势不相一致。但值得注意的是,CrPAL1、CrPAL3、CrC4H1、CrC4H2、Cr4CL、CrHCT1、CrCCR3、CrCAD3、CrCOMT4、CrPOD2、CrPOD6、CrPOD7、CrPOD8 等13 个基因的表达量随着果实的发育成熟进程,在花后165、195 和215 d 差异表达(log2>2,Q-value ≤ 0.001)这些基因的表达水平在蜜柚花后215 d 与195 d 相比上调了2 至9 倍,并且和木质素含量的变化趋势相一致。研究认为这13 个基因可能是蜜柚汁胞木质素合成的关键基因,因此筛选这13个基因用于后续的qRT-PCR验证分析。

2.4 蜜柚汁胞木质素合成差异基因qRT-PCR验证分析

对13 个木质素生物合成途径差异基因进行qRT- PCR 验证( 图4)。随着果实的生长发育CrPAL1、CrPAL3、CrC4H1、CrC4H2、Cr4CL、CrCCR3、CrCAD3、CrPOD2 和CrPOD7 等9 个基因qRTPCR相对表达量都上调表达,尤其在花后195 至215 d 的果实成熟期显著表达,且与转录组测序的结果一致,证明了这9 个基因转录组数据的可靠性。说明花后195 至215 d 是蜜柚果实汁胞粒化时期。另外4 个基因CrHCT1、CrCOMT4、CrPOD6 和CrPOD8 的qRT-PCR相对表达量变化与转录组数据不一致。

2.5 蜜柚汁胞木质素生物合成途径相关酶活性变化分析

分别对花后135 至215 d 琯溪蜜柚果实汁胞中木质素生物合成途径相关酶PAL、C4H、4CL、CAD和POD的活性进行测定,结果显示,酶活性随着果实的发育成熟呈现上升趋势,在花后215 d 达到峰值(图5),与木质素含量及粒化率的变化规律基本一致,表明这些酶可能在蜜柚果实发育成熟阶段的汁胞木质素生物合成途径中起关键作用。

3 讨论

木质素是植物细胞中的苯丙烷代谢途径的代谢产物。木质素在果实汁胞中过量积累可能会导致汁胞粒化,会影响果实的口感和风味,目前在收获的柑橘果实中普遍存在汁胞粒化这一现象[14]。前人有研究表明木质素生物合成与汁胞粒化之间有着密切关联,粒化的汁胞通常發生木质素过度积累的现象[15],但总体研究还不够完整和系统。因此,笔者在基因转录、翻译和产物生成3 个水平展开木质素代谢与琯溪蜜柚汁胞粒化机制的系统研究。

果實中木质素含量的变化与木质素生物合成途径相关基因的表达有关,其中PAL、C4H、4CL、CCR、CAD和POD等基因在木质素的合成过程中起着极为重要的调控作用,且木质素合成量与这些基因的表达量呈正相关[16-17]。笔者在本研究中通过琯溪蜜柚汁胞转录组测序筛选到17 个木质素生物合成途径的差异表达基因,其中13 个基因的表达量与汁胞粒化率及木质素含量变化趋势一致,且在花后195至215 d 显著表达。qRT- PCR 验证结果显示,CrPAL1、CrPAL3、CrC4H1、CrC4H2、CrCCR3、CrCAD3、Cr4CL、CrPOD2、CrPOD7 等9 个基因在蜜柚果实发育和成熟期的表达量与转录组测序结果变化趋势一致,均随着果实的成熟呈显著上调表达趋势,同时相关酶活性也随之增强,并与木质素生物合成的增加及蜜柚汁胞粒化趋势相一致。这一研究结果表明以上9 个基因是蜜柚汁胞木质素的合成调控的关键基因,它们可能参与了琯溪蜜柚汁胞粒化的过程。

PAL是苯丙烷代谢途径中木质素生物合成的第一个关键酶,它在木质素生物合成中非常重要[18],PAL催化苯丙氨酸脱氨为反式肉桂酸[19]。前人通过对5 种白梨PAL 基因家族比较分析,结果显示Pb-PAL1 和PbPAL2 的表达水平对梨果中石细胞和木质素的含量有影响,PbPAL1 和PbPAL2 的转录水平在木质化组织(根和茎)中高于在木质化程度较低的组织(叶、芽和花)[20]。笔者在本研究中发现CrPAL1、CrPAL3 在汁胞木质素含量及粒化率较高的成熟期果实中表达量也大幅度增加,PAL酶活性与汁胞木质素含量测定结果及PAL 基因表达量一致,与汁胞粒化率也大致相符。C4H被证明参与了木质素生物合成途径中G 木质素单体的产生[21],小麦中发现C4H1 基因的表达与木质素含量呈显著相关[22],竹笋贮藏期间C4H活性增加促进木质素的合成,导致竹笋组织木质化[23],在本研究中,蜜柚汁胞CrC4H1、CrC4H2 的表达量在成熟期显著上调表达。同时,C4H酶活性也随着果实的发育成熟逐渐增强,并与汁胞中木质素含量及粒化率变化相一致。4CL 是CCR 上游的一个酶,4CL 的产物是CCR 的底物,而CCR被认为是木质素合成的关键酶[24]。青稞研究中发现4CL是影响木质素合成的一个关键酶,4CL活性的提高可以增强茎秆的抗倒伏能力[25]。在本研究中转录组测序与qRT-PCR 结果显示随着木质素含量的增加及汁胞粒化率的上升,Cr4CL 在蜜柚成熟过程中也逐渐上调表达,4CL 的酶活性也与Cr4CL的表达相一致,这也与芹菜发育阶段的观察结果相似[26]。前人在梨果实中木质素合成的有关研究中发现,PbCCR1、PbCCR2 和PbCCR3 的表达趋势与果核细胞的积累和木质素含量相关[27],笔者在本研究中发现CrCCR3 在汁胞中的表达趋势也与木质素含量、粒化率变化趋势相一致。此外,催化肉桂醛转化为肉桂醇[28],参与单体木质素生物合成最后一步的另一个关键酶是CAD[29]。SbCAD2 和OsCAD2 基因已被证明参与了茎秆木质素的生物合成[30- 31],PpCAD2 过量表达促进了转基因番茄植株中木质素的沉积,木质素含量增加,CAD 酶活性更活跃[32]。

笔者在本研究中发现,蜜柚汁胞中CAD活性在蜜柚成熟后期相应上升,且与木质素含量、木质素合成酶基因CrCAD3 的表达以及粒化率相一致。POD则通过聚合单体木质素催化松柏醇发生脱氢聚合反应形成G 型木质素[33]。有报道对白桦POD 全基因组鉴定,发现BpPOD6、BpPOD21 和BpPOD37 在木质部中高度表达[34],AgPOD 在芹菜叶柄、叶片中表达水平与木质素积累模式一致,说明POD在木质素生物合成中起着重要作用[35]。贮藏水果蔬菜时,通常会通过抑制木质素合成相关酶POD 活性来减缓木质素积累[36],对贮藏菜薹进行乙烯处理,发现木质素含量下降的同时BcPOD 的表达也下降[37]。在本研究中CrPOD2 以及CrPOD7 基因表达与POD酶活性以及木质素含量和粒化率变化相符,表明CrPOD2 和CrPOD7 参与了蜜柚汁胞粒化过程木质素的调控作用。本研究表明,以上琯溪蜜柚汁胞9 个木质素合成基因的表达及相关酶活性的动态变化与汁胞木质素含量和粒化率变化相一致,因此认为琯溪蜜柚汁胞粒化是由木质素代谢途径中的系列关键基因共同调控的结果。

4 结论

在琯溪蜜柚果实发育成熟过程中,汁胞粒化率随着木质素含量的积累而提高,尤其在成熟后期提高迅速。蜜柚汁胞中CrPAL1、CrPAL3、CrC4H1、CrC4H2、Cr4CL、CrCCR3、CrCAD3、CrPOD2 和CrPOD7 是木质素合成的关键调控基因。这9 个基因的上调表达,调控木质素合成途径中重要酶PAL、C4H、4CL、CAD和POD活性的增强,从而促进汁胞木质素含量积累,引起汁胞粒化发生。笔者在分子和生理水平上系统地研究了琯溪蜜柚果实发育过程中汁胞木质素生物合成途径关键基因表达与汁胞粒化的关系,为今后琯溪蜜柚的品种改良和分子育种提供了理论基础。

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