新冠肺炎疫情后急性病毒性呼吸道感染多病原监测的预警研究及应用

徐刚，冉鑫，肖大瑾，熊英，龚甜

（江西省疾病预防控制中心，江西 南昌 330029）

2020 年初，新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19),简称"新冠肺炎"迅速蔓延，席卷全世界，对全球的经济、社会造成了巨大的冲击。截至12 月2 日，全球确诊病例超6 400 万例，死亡破147 万例，新冠肺炎疫情防控形式依然十分严峻。为了及时甄别新冠肺炎疫情，为不明原因发热等暴发疫情的早期发现及预警预测提供实验室关键数据，本实验室对新冠肺炎疫情后4 月份（2020 年第18 周）至10 月份哨点医院的流感样病例进行了6 种引起呼吸道传染病的重要病毒进行监测，并对期间进行2 起暴发疫情进行实验室检测，了解江西省新冠肺炎疫情后急性病毒性呼吸道传染病的病原谱，为暴发疫情预警预测和防控提供实验室证据，现将研究结果报告如下。

1 材料与方法

1.1 样本采集 每周采集江西省流感监测哨点医院 （南昌大学第一附属医院）出现发热 （体温≧38℃），伴咳嗽或咽痛等呼吸道感染的流感样病例咽拭子样本不少于20 份；及时采集呼吸道感染暴发疫情病例。

1.2 样本检测

1.2.1 病原核酸提取 使用核酸自动提取仪（QIAxtractor，Qiagen 公司）和Cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit（Cat No：54161，Qiagen 公司）对200μL 样本进行样本核酸提取，按试剂盒说明书进行操作。

1.2.2 病毒核酸检测 运用本实验室前期建立的Real-time RT-PCR 和Real-time PCR 方法[1]对样本进行6 种引起呼吸道传染病的重要病毒核酸快速检测, 其中包括新冠肺炎病毒、流感病毒（甲型和乙型）、鼻病毒、腺病毒、博卡病毒和偏肺病毒。

2 结果

2.1 多病原监测结果 2020 年4 月份至10 月份共采集样本670 份，5 月14 日开始检出阳性样本，共检出阳性样本91 份（13.58%），其中鼻病毒70 份（10.45%），流感病毒12 份（1.79%），腺病毒7 份(1.04%)，博卡病毒2 份(0.03%)。鼻病毒自5 月14日开始每周均检出阳性样本，在2020 年第27 周（6 月1 日至6 月7 日）出现高峰，见图1。

图1 流感样病例多病原检测结果

2.2 病毒性呼吸道传染病暴发疫情监测结果 共发生三起发热呼吸道感染暴发疫情，其中2020 年5 月27 日至2020 年6 月6 日两起发生于江西省两地，分别采集样本16 份和13 份，检出鼻病毒阳性样本分别为7 份和8 份，阳性率分别为43.75%和61.54%；2020 年8 月的一起疫情采集标本3份，均检出腺病毒阳性。

3 讨论

急性病毒性呼吸道传染病是一种由新冠肺炎病毒、流感病毒（甲型和乙型）、腺病毒、鼻病毒、博卡病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、冠状病毒、偏肺病毒和肠道病毒等病毒引起的，早期临床症状相似,为发热等流感样症状[2-10]。

本研究对2020 年4 月至10 月份流感哨点医院流感样病例标本进行新冠肺炎病毒、流感病毒等18 种引起呼吸道传染病的病原核酸快速检测，发现新冠肺炎疫情后2020 年第24 周 （5 月11 日至5 月17 日）开始出现急性病毒性呼吸道感染病例，发病率为13.58%，病毒类型主要为鼻病毒（10.45%）、流感病毒（1.79%）和腺病毒（1.04%）。鼻病毒感染率远高于其他病毒，鼻病毒主要引起普通感冒，本研究结果中，自2020 年第24 周（5 月11 日至5 月17 日）开始一直出现鼻病毒感染病例，在5 月底发生了两起由鼻病毒感染引起的急性病毒性呼吸道感染暴发疫情，也是我省首次发现首次由实验鼻病毒感染引起的暴发疫情。而腺病毒在第34 周（6 月29 日至7 月3 日）开始检出阳性样本，在8 月发生了一起由腺病毒感染引起的急性发热呼吸道感染暴发疫情。急性病毒性呼吸道感染暴发疫情前半个月至一个月均监测到相应病原开始流行，提示发热呼吸道感染多病原监测可以对疫情暴发起到预警预测作用。

目前，我国除流感病毒外,尚未建立腺病毒等其他呼吸道病毒的监测系统,其他呼吸道病毒的流行特征不清楚,不利于急性病毒性呼吸道传染病暴发疫情的早期发现及预警预测。根据本研究结果，建议依托全国省市两级流感实验室网络，进行每周一次新冠肺炎病毒、流感病毒（甲型和乙型）、腺病毒、鼻病毒、博卡病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、冠状病毒、偏肺病毒和肠道病毒等多病原监测，对急性病毒性呼吸道传染病疫情的防治、不明原因发热等暴发疫情的早期发现及预警预测和减少社会恐慌具有非常重要的意义。