外膜蛋白C作为蛋白呈递平台将抗原定位至细菌外膜囊泡表面的可行性
2023-01-30孙京京黄建东
孙京京,黄建东
中国科学院深圳先进技术研究院深圳合成生物学创新研究院,广东 深圳 518055
细菌外膜囊泡(outer membrane vesicle,OMV)是革兰阴性菌生长过程中分泌的球形颗粒,直径为20 ~ 250 nm,表面携带母体菌的外膜成分,如膜蛋白、脂多糖等,内部包裹细菌蛋白质、核酸等[1]。由于OMV 表面含有病原相关分子模式,可激活免疫系统,具有作为疫苗载体的潜力。目前,采用脑膜炎球菌OMV 生产的疫苗已应用于B 群流行性脑脊髓膜炎的预防[2]。近年,有研究将OMV 作为载体用于递送核酸、药物等[3],还将 OMV 作为抗原呈递平台,经外膜蛋白将异源蛋白呈递于OMV 表面,从而递送至机体内,并获得了较好的免疫效果[4]。目前的研究常用溶血素A(cytolysin A,ClyA)、外膜蛋白A(outer membrane protein A,OmpA)、外膜蛋白 W(outer membrane protein W,OmpW)等膜蛋白与抗原融合表达,将抗原定位至 OMV 表面[5⁃6]。质谱研究证实,OMV 表面还携带其他外膜蛋白,如外膜蛋白C(outer membrane protein C,OmpC)[7],以OmpC 作为蛋白呈递平台将抗原定位至细菌OMV 表面的相关研究较少。因此,本研究将金黄色葡萄球菌EsxA抗原基因(esxA基因)与ompC基因进行重组,并经原核细胞表达融合蛋白,高速离心法提取重组菌OMV,采用福流纳米流式仪检测OMV 表面的融合蛋白,探讨OmpC 作为蛋白呈递平台将抗原定位至OMV表面的可行性。
1 材料与方法
1.1 菌株、基因及载体 感受态E.coliDH5α和E.coliBL21(DE3)均购自北京全式金生物技术股份有限公司;ompC基因片段及esxA基因均由深圳合成生物学创新研究院制备,载体pET21a由该研究院保存。
1.2 主要试剂及仪器 内切酶SalⅠ、HindⅢ及T4 DNA连接酶均购自英国NEW ENGLAND BioLabs公司;PCR产物回收试剂盒、质粒抽提试剂盒及PrimeSTAR Max DNA Polymerase 均购自日本 TaKaRa 公司;One Step Cloning试剂盒购自南京诺维赞生物科技股份有限公司;小鼠抗His⁃Tag单克隆抗体及HRP标记的山羊抗小鼠IgG 均购自美国Proteintech Group 公司;Al⁃exa Fluor 488 偶联抗体购自美国 Abcam 公司;LB 培养基及IPTG 均购自上海阿拉丁生化科技股份有限公司;ECL 发光液、超滤管(100 KDa)、0.45 μm 滤膜及PVDF膜均购自美国Millipore公司;SDS⁃PAGE蛋白上样缓冲液(5 ×)购自上海碧云天生物技术有限公司;福流纳米流式仪购自厦门福流生物科技有限公司。
1.3 重组表达质粒的构建 将载体pET21a 经SalⅠ限制性内切酶线性化后,用One Step Cloning 试剂盒与ompC基因片段进行重组,于50 ℃孵育15 min,转化感受态E.coliDH5α,于42 ℃孵育1 min;挑选阳性菌株,送深圳华大基因股份有限公司测序。取鉴定正确菌株,用质粒抽提试剂盒提取含ompC基因的质粒,将其及esxA基因均经SalⅠ和HindⅢ双酶切后,回收载体片段及目的基因片段,以T4 DNA 连接酶于室温连接30 min;转化感受态E.coliDH5α,于42 ℃孵育1 min;挑选阳性菌株,送深圳华大基因股份有限公司测序。取鉴定正确的菌株,用质粒抽提试剂盒提取含ompC⁃esxA基因的重组表达质粒。将空载体pET21a、含ompC基因的表达质粒和含ompC⁃esxA基因的重组表达质粒分别转化感受态E.coliBL21(DE3),即为阴性对照菌、重组蛋白OmpC 重组菌和融合蛋白OmpC⁃EsxA重组菌,于42 ℃孵育1 min。
1.4 融合蛋白的表达 将3 个菌株于37 ℃振荡培养过夜;按1∶100 的比例转接至LB 培养基,继续培养3 h;加入 IPTG 至终浓度为1 mmol/L,于30 ℃诱导培养5 h;11 973 ×g离心5 min,取沉淀,进行12%SDS⁃PAGE分析。
1.5 OMV的分离 将阴性对照菌和融合蛋白OmpC⁃EsxA 重组菌按1∶100 的比例分别转接至LB 培养基,于37 ℃振荡培养过夜;加入IPTG 至终浓度1 mmol/L,于30 ℃诱导表达16 h;于4 ℃,10 775 ×g离心20 min;收集上清,经0.45 μm滤膜过滤,于4 ℃,50 000×g离心2 h;取沉淀,用PBS重悬,经100 kDa截留的超滤管浓缩,即获得OMV,取 5 μL OMV,用1 ×SDS⁃PAGE 蛋白样品缓冲液重悬,进行12% SDS⁃PAGE分析。
1.6 融合蛋白定位至OMV表面的鉴定
1.6.1 Western blot 检测 分别取阴性对照菌和融合蛋白OmpC⁃EsxA重组菌及1.5项提取的OMV各5 μL,用1 × SDS⁃PAGE 蛋白样品缓冲液重悬,经12%SDS⁃PAGE 分离后,转移至PVDF 膜,用5%脱脂奶粉室温封闭1 h;加入小鼠抗His⁃Tag 单克隆抗体(1∶5 000稀释),4 ℃孵育过夜;TBST 洗涤3 次,加入HRP 标记的羊抗鼠IgG(1∶10 000 稀释),室温孵育1 h;TBST洗涤3次,ECL显色。
1.6.2 纳米流式检测 将阴性对照菌OMV 和融合蛋白OmpC⁃EsxA重组菌OMV与小鼠抗His⁃Tag单克隆抗体按1∶100比例混合,于室温孵育30 min;50 000×g离心2 h,去除多余抗体,标记Alexa Fluor 488偶联抗体;标记的样品用PBS 进行1∶1 000 稀释,用福流纳米流式仪检测OMV表面融合蛋白的荧光强度。
2 结 果
2.1 重组表达质粒的鉴定 含ompC基因的重组质粒及含ompC⁃esxA基因的重组表达质粒经测序鉴定,与目标序列完全一致,见图1(含ompC基因的重组质粒测序图略)。
图1 含ompC⁃esxA基因的重组表达质粒的测序结果Fig. 1 Sequencing results of recombinant expression plas⁃mid containing ompC⁃esxA gene
2.2 融合蛋白的鉴定 分别于相对分子质量约54 000及39 000 处可见融合蛋白OmpC⁃EsxA 及重组蛋白OmpC 目的条带(目的蛋白条带上方可见1 条相对分子质量约43 000 的非目的条带,推测可能为重组蛋白OmpC 的前体蛋白),大小与预期相符;阴性对照未见该目的蛋白条带。见图2。
图2 融合蛋白的SDS⁃PAGE分析Fig.2 SDS⁃PAGE profile of fusion protein
2.3 OMV 的鉴定 融合蛋白OmpC⁃EsxA 重组菌和阴性对照菌提取的 OMV 经 12% SDS⁃PAGE 分析,均可见多条蛋白条带,且前者总蛋白量高于后者,见图3。
图3 OMV总蛋白的SDS⁃PAGE分析Fig.3 SDS⁃PAGE profile of total protein of OMV
2.4 融合蛋白定位至OMV表面的鉴定
2.4.1 Western blot 检测 融合蛋白OmpC⁃EsxA 重组菌及其OMV 中的融合蛋白可与小鼠抗His⁃Tag 抗体发生特异性结合,且于相对分子质量约54 000 处可见特异性结合条带,大小与预期相符;阴性对照未见该条带。见图4。表明融合蛋白OmpC⁃EsxA 成功定位于OMV。
图4 OMV中融合蛋白OmpC⁃EsxA的Western blot检测Fig.4 Western blotting of fusion protein OmpC⁃EsxA of OMV
2.4.2 纳米流式检测 融合蛋白OmpC⁃EsxA 重组菌OMV可被荧光抗体标记(877/17 522个颗粒),阴性对照OMV 未被荧光抗体标记(7/14 619个颗粒),见图5。表明融合蛋白OmpC⁃EsxA成功定位至OMV表面。
图5 OMV表面融合蛋白OmpC⁃EsxA的纳米流式分析Fig.5 Analysis of fusion protein OmpC⁃EsxA of OMV sur⁃face by Flow NanoAnalyzer
3 讨 论
OMV 具有多种生物学功能,如在生理条件下,OMV 可促进细菌对营养物质的摄取;在应激条件下,OMV 可促进有毒物质包括错误折叠的蛋白、重金属、抗生素等的排出;OMV 还可促进遗传物质(如耐药基因)在细菌间的水平传播。另外,对于致病菌,OMV 可介导毒力因子向宿主细胞的传输,从而破坏宿主的防御系统,增强对宿主细胞的感染。
近年,OMV 的研究热点逐渐从产生机制及生物学功能转移至 OMV 疫苗的研发[8⁃9]。许多研究对致病菌产生的OMV 进行了抗感染试验,包括假单铜绿胞菌、沙门菌、脑膜炎球菌等革兰阴性菌,均取得较好的抗感染效果[2,10⁃11];另外,革兰阳性菌,如金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、结核分枝杆菌等产生的OMV 也具有类似的抗感染效果[12⁃14]。目前,将 OMV改造为疫苗或药物呈递载体的研究也取得了较大进展,如有研究将金黄色葡萄球菌蛋白构建为重组脂蛋白后,经E.coliOMV包裹形成疫苗,该疫苗免疫小鼠后产生了较好的抗金葡菌感染作用[15];另有研究以E.coli外膜蛋白作为锚定蛋白将抗原定位至OMV上,常用的外膜蛋白有OmpA、ClyA、OmpW 等,均能有效呈递抗原[16⁃19]。
本研究采用E.coli表达系统表达了OmpC 与金黄色葡萄球菌EsxA 抗原的融合蛋白;提取重组菌的OMV,经Western blot 检测和福流纳米流式仪检测表明,重组的融合蛋白可以OmpC 为载体将其定位至OMV 表面。有研究证明,OmpC 及 OmpA 均是 OMV中的通道蛋白,OmpC 可替代OmpA 用于抗原呈递[20⁃21],本研究结果也证明了该结论的可行性。综上所述,OmpC 作为蛋白平台将抗原定位至OMV 表面具有可行性,有望用于抗原呈递疫苗的研发。