circRNA在糖尿病肾病中的研究进展
2022-12-06俞元植陈佳琦
俞元植,尹 敏,陈佳琦,刘 锋
(吉林大学中日联谊医院 肾病内科,吉林 长春130033)
肾脏在糖尿病作用下,易发生纤维化,影响肾脏正常功能,导致糖尿病肾病(DKD),并最终发展成终末期肾脏病(ESRD)。因此预防和延缓DKD进展对减少ESRD的发生至关重要。多项研究表明环状RNA(circRNA)参与DKD形成的多种机制,可能是DKD发病过程中的重要因子。因此本文将对circRNA与DKD的关系进行综述。
1 circRNA概述
1.1 circRNA的形成及分类
circRNA是一种新型的非编码RNA,近年来受到越来越多的关注[1]。circRNA主要来源于蛋白质编码的外显子。但也可以来自基因组的内含子、未翻译区域或基因间隔区[2]。根据形成方式和序列的不同,circRNA可分为外显子circRNA(ecircRNAs)、内含子circRNA(ciRNAs)以及外显子和内含子共同组成的circRNA(EIciRNAs)[3-5]。目前较为明确的成环机制是ecircRNAs的两种成环模型:一是直接反向剪接即内含子配对环化,二是外显子跳跃即套索驱动环化[3]。此外还有ciRNAs形成模型,以及RNA结合蛋白(RBPs)或反式因子(trans-factors)驱动的RNA环化模型[4,6]。
1.2 circRNA的特点
circRNA没有5’帽与3’多聚腺苷尾,可以在一定程度上抵抗RNA核酸外切酶或核糖核酸酶的降解,因此具有高度稳定性。同时,相对于circRNA相关的线性mRNA而言,circRNA半衰期稍长[7]。有研究显示,在某些类型的细胞中,circRNA的表达能力较弱。而另一些研究表明其与相对应的线性异构体的丰度相当或数倍[2-3]。关于circRNA表达丰度的研究差异可能由于细胞类型特定或组织特定的表达模式[8]。此外,circRNA在物种间的表达方式和序列均高度保守[6]。这些特性使得circRNA有望成为人类疾病的候选生物标记。
1.3 circRNA的功能
海绵吸附miRNA(mircoRNA):带有miRNA结合位点的circRNA可作为竞争性内源RNA(ceRNA),阻碍miRNA与mRNA的反应,影响miRNA的活性,提高miRNA靶标的表达能力[9-10]。
与蛋白质相互作用:circRNA与RNA结合蛋白(RBPs)结合,作为支架促进蛋白质复合体的形成和反应[11-12]。如circPABPN1和HuR的结合抑制了HuR和PABPN1mRNA的结合,降低PABPN1的转录水平[13]。circ-Foxo3与细胞周期蛋白依赖性激酶 2(CDK2)和CDKA1或细胞周期蛋白激酶抑制剂(p21)结合,形成三元复合体,使细胞周期停滞[14]。
调节转录:研究表明,一些源自反向剪接(具有保留的内含子)或加工过的内含子套索的circRNA保留在细胞核[4-5]。如通过与U1小核糖核蛋白(U1snRNR)相互作用或正向调节RNA聚合酶Ⅱ,EIciEIF3J和EIciPAIP2可以促进亲本基因的转录。而EIciEIF3J和EIciPAIP2的表达下调,EIF3J和PAIP2基因的转录水平也下调[5]。circRNA既可以增加线性RNA的转录,也可以抑制其转录。外显子形成的 circRNA 在RNA合成与经典剪接的互相竞争中有重要作用。
参与翻译:circRNA可通过帽子非依赖方式进行转录。包含无限阅读框的circRNA可模拟原核生物的RNA翻译模式,以实现DNA滚环扩增[15]。翻译可以通过含有细胞内核糖体插入部位(IRES)的circRNA来完成,或由N6-甲基腺苷化修饰(6mA or m6A)circRNA发生[16-17]。
2 circRNA在DKD肾纤维化发生中的机制
肾纤维化以肾小球硬化、肾小管间质纤维化为主要特征。本质上是细胞外基质(ECM)过度沉积。同时,上皮细胞-间充质转化(EMT)和外泌体(Exosome)也在肾纤维化过程中扮演着重要角色。
2.1 circRNA与肾小球系膜细胞
在高糖(HG)处理后的肾小球系膜细胞(GMC)中,circLRP6、circHIPK3、circ_0037128、circ-ACTR2、circ_0000064、circTLK1、circ-GNB4表达增加,通过GMC增殖、氧化应激、炎症、ECM积聚等不同方式,促进DKD进展。
circLRP6海绵吸附miR-205,上调HMGB1和激活TLR4/核因子-κB(NF-κB)通路来调节GMC增殖、氧化应激、ECM沉积和炎症[18]。circHIPK3通过海绵吸附miR-185,增加GMC中细胞周期蛋白D1(cyclin D1)、增殖细胞核抗原(PCNA)、促进转化生长因子-β1(TGF-β1)、Ⅰ型胶原蛋白(Collagen typeⅠ),纤连蛋白(FN)的mRNA 丰度,促进细胞增殖[19]。Wang等[20]发现circ_0037128通过miR-17-3p调节AKT3表达,刺激细胞增殖和纤维化。circ-ACTR2、circ_0000064、circ-GNB4分别通过miR-205-5p/高迁移率族蛋白A2(HMGA2)轴、miR-424-5p/WNT2B轴、circ-GNB4/miR-23c/EGR1轴促进细胞增殖、炎症和ECM沉积和氧化应激[21-23]。而circTLK1则可通过海绵吸附miR-126-5p/miR-204-5p阻断AKT/NF-κB通路以促进炎症、氧化应激和ECM沉积,加重肾脏纤维化[24]。
2.2 circRNA与足细胞
炎症诱导的足细胞(podocyte)损伤是肾小球纤维化、硬化和进行性肾功能丧失的主要原因[25]。
circ_0000285通过海绵吸附miR-654-3p 和激活MAPK6,释放白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-1β(IL-1β)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)等炎症因子,促进足细胞损伤[26]。Fang等[27]发现hsa_circ_0037128通过调节miR-31-5p/ Kruppel样转录因子9(KLF9)轴促进足细胞损伤。
2.3 circRNA与肾小管上皮细胞
在HG处理后的肾小管上皮细胞中,circRNA_010383表达减少,可抑制肾小管间质纤维化;circ_0037128、circEIF4G2、circ_0000064表达增加,则加重纤维化。
在体外,circRNA_010383过表达,通过海绵吸附miR-135a,抑制ECM蛋白沉积,并上调miR-135a的靶蛋白,瞬时受体电位阳离子通道亚家族C成员1(TRPC1)的表达,负性调节ECM沉积和肾纤维化。在体内,circRNA_010383过表达可抑制蛋白尿和肾脏纤维化,从而延缓DKD进展[28]。
circ_0037128/miR-497-5P/活化T-细胞核因子(NFAT5)轴、circ_0000064/miR-532-3p/ROCK轴均参与促进肾小管上皮细胞增殖、氧化应激、炎症和纤维化[29-30]。circEIF4G2通过miR-218/SERBP1轴,TGF-β1、ColⅠ和FN的表达增加,促使肾小管上皮细胞纤维化[31]。
2.4 circRNA与外泌体
外泌体是一种直径为40-100 nm,包含了DNA、RNA 和蛋白质的信息传递器。外泌体是circRNA的重要载体。在DKD进展中起重要作用,可以作为DKD肾纤维化治疗靶点[32-33]。
Li等[34]发现经HG 处理的肾小球上皮细胞(GEC)外泌体中circTAOK1(circ_0003928)表达上调。GEC-circTAOK1-Exo海绵吸附miR-520h并调节SMAD表达,促进GMC增殖、纤维化和EMT。外泌体circRNF169和circSTRN3可促进α-SMA表达,上调或下调circRNF169和circSTRN可分别有效抑制或促进细胞增殖、EMT,从而抑制或促进DKD进展[35]。HG处理后的GMC中分离的外泌体中,外泌体circ_DLGAP4、circ_0125310增加。且eco-circ_ DLGAP4、exo-circ_0125310能显著促进GMC增殖及纤维化。进而发现circ_DLGAP4通过海绵化miR-143和调节Erb-b2受体酪氨酸激酶3(ERBB3) /NF-κB/基质金属蛋白酶-2(MMP-2)轴促进GMC的增殖和纤维化。随后的体内测定证明circ_DLGAP4过表达后可调节miR-143/ERBB3/NF-κB/MMP-2,促进DKD进展[36]。circ_0125310海绵吸附miR-422a上调IGF1R/p38的表达水平,且体内测定显示circ_0125310表达过度可促进DKD进展。证明exo-ciec_0125310通过海绵吸附miR-422a,靶向IGF1R/P38轴,促进细胞增殖和纤维化[37]。
2.5 circRNA与上皮细胞-间充质转化
EMT是指通过特定的程序将上皮细胞转化为间质表型细胞的生物过程。主要特征有细胞黏附分子表达减少、细胞骨架以细胞角蛋白细胞骨架转化后的波形蛋白(Vimentin)为主。
在HG诱导的小鼠GMC中,circ_0000491水平升高。敲除circ_0000491则可减少vimentin、FN和α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)以及Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ型胶原蛋白(collagen typeⅠ、Ⅲ、Ⅳ,ColⅠ、Ⅲ、Ⅳ),同时增加GMC中E-钙黏蛋白(e-cadherin),起到抑制EMT的作用。circRNA_0000491/miR-101b/TGFβRI轴可通过调控EMT,促进DKD进展[38]。
因此可以尝试通过影响作用于GMC、足细胞、肾小管上皮细胞的circRNA,外泌体circRNA以及调控EMT的circRNA,改变DKD的肾脏损害程度。通过上述circRNA,可以进一步了解肾脏纤维化,并为延缓DKD进展提供新思路。
3 circRNA在DKD细胞程序性死亡中的机制
3.1 circRNA与凋亡
凋亡是由基因控制的细胞自主、有序死亡。在HG处理后的GMC中,circ_0000712、circ_0000491、circ-FBXW12过表达,而circ-AKT3、circ_LARP4、circSMAD4表达降低。
circ_0000712、circ_0000491分别通过miR-879-5p/SOX6轴、miR-455-3p/Hmgb1轴促进细胞凋亡、炎症、氧化应激和纤维化[39-40]。降低circ-FBXW12可通过miR-31-5p/LIN28B轴抑制HG诱导HMC中的细胞增殖、细胞周期停滞、ECM产生和氧化应激,从而延缓DKD进展[41]。
circ-AKT3、circ_LARP4过表达抑制纤维化相关蛋白的水平,如FN、ColⅠ和ColⅣ,且抑制GMC凋亡。circ-AKT3通过调节miR-296-3p/E-cadherin信号抑制ECM沉积,从而延缓DKD的发展[42]。circ_LARP4可促进BAX的表达,降低Bcl-2的表达。这说明circ_LARP4的过度表达对细胞增殖有抑制作用,使细胞凋亡率增高。在DKD细胞模型中circ_LARP4低于正常细胞,circ_LARP4 过表达导致细胞增殖和细胞纤维化减少,但通过海绵化miR-424在DKD细胞中增加细胞凋亡[43]。circSMAD4过表达可通过miR-377-3p/BMP7轴减轻细胞炎症、ECM沉积和细胞凋亡,延缓DKD进展[44]。
HG处理后的肾小管上皮细胞中,circ_0041795、hsa_circ_0003928、circ_0003928、circ_0060077、circ_000166、circ_WBSCR17表达上调,促进细胞凋亡;而circHIPK3表达下调,抑制细胞凋亡。
沉默circ_0041795通过靶向上调miR-361-3p可减弱肾小管上皮细胞凋亡和氧化应激损伤[45]。hsa_circ_0003928、circ_0003928分别通过miR-151-3p/膜联蛋白A2(Anxa2)轴、miR-506-3p/HDAC4轴促进炎症和细胞凋亡[46-47]。降低circ_0060077表达可通过miR-145-5p/VASN轴保护肾小管上皮细胞[48]。circ_000166、circ_WBSCR17分别通过miR-296/SGLT2轴、miR-185-5p/SOX6 轴促进肾纤维化和细胞凋亡[49-50]。
circHIPK3通过miR-326/miR-487a-3p/沉默信息调节因子2相关酶1(SIRT1)SIRT1轴可减轻HG对肾小管上皮细胞的毒性作用,抑制其增殖和凋亡,减少炎性细胞因子的分泌,延缓DKD进展[51]。
3.2 circRNA与焦亡
焦亡又称细胞炎性坏死,是程序性细胞死亡的一种,表现为细胞不断膨胀,直至细胞膜破裂,引起细胞内容物的释放,继而激活炎性反应。
circ_0004951、circACTR2在DKD患者的肾组织和HG处理后的肾小管上皮细胞中均显著上调。circ_0004951通过miR-93-5p/NLRP3通路,促进肾小管上皮细胞焦亡[52]。减少circACTR2 表达可降低细胞焦亡、IL-1β的释放以及ColⅣ和FN的产生,进而调节DKD的细胞焦亡、炎症及纤维化[53]。circ_0000181则通过调节 miR-667-5p/NLRC4轴,促进IL-1β和IL-18释放,也可引起细胞焦亡[54]。
因此,通过影响作用于细胞程序性死亡的circRNA,可以为延缓DKD进展提供新的方向。
4 小结
综上,circRNA可通过氧化应激、ECM沉积、炎症、EMT、细胞凋亡、焦亡等方式参与肾小球硬化和肾小管间质纤维化,加重或延缓肾脏纤维化,与DKD进展密不可分,为DKD的诊断与治疗提供了新靶点。同时circRNA具有高度保守性与稳定性,以及细胞和组织特异性,circRNA有望成为DKD诊断及治疗的生物标记物。虽然通过circRNA诊断与治疗DKD的前景广阔,但上述研究仅限于动物实验,案例数量相对较少,作用机制不够透彻,尚未形成明确的信号通路,仍需深入探索,寻求更完整的机制理论,提供更安全的诊断与治疗手段。所以circRNA在DKD中的作用还有待于进一步的研究。