人磷酸甘油酸变位酶1在大肠杆菌中的表达及纯化*
2022-09-15金科华
金科华
(1.湖北科技学院医学部医药研究院,湖北 咸宁 437100;2.湖北科技学院医学部基础医学院)
有氧糖酵解是很多肿瘤细胞的重要特征之一,抑制有氧糖酵解是富有前景的抗肿瘤策略[1]。磷酸甘油酸变位酶(phosphoglycerate mutase 1,PGAM1)是糖酵解途径的重要酶,催化3-磷酸甘油酸和2-磷酸甘油酸之间的互变,协调糖酵解、丝氨酸生成和磷酸戊糖途径[2],研究表明PGAM1高表达与多种肿瘤的发生发展密切相关[3-4],可抑制PGAM1的活性[5-9]或降低其表达水平[10],阻碍肿瘤细胞生长。本研究利用重组DNA技术,在大肠杆菌中表达和纯化PGAM1,为后续抑制剂的筛选和其他研究奠定基础。
1 材料与方法
1.1 宿主菌和主要试剂
大肠杆菌、HiFi DNA Polymerase、DNA marker购自北京全式金生物技术公司。PGAM1 cDNA由厦门大学韩家淮院士馈赠。卡那霉素、IPTG、质粒提取试剂盒、胶回收试剂盒购自生工生物工程(上海)股份有限公司。限制性核酸内切酶购自NEB公司。DNA连接试剂盒购自TaKaRa公司。His-Tag蛋白纯化试剂盒(可溶性)购自康为世纪生物科技有限公司。BCA蛋白质定量测定试剂盒购自Bio-sharp公司。截流分子量10kd超滤管(15mL)购自Millipore公司。
1.2 扩增PGAM1 cDNA
设计引物。利用SnapGene软件设计扩增PGAM1 cDNA的引物。正向引物PF序列为:CGACATATGATGGCCGCCTACAAACTGG;反向引物PR序列为:AGTCTCGAGTCACTTCTTGGCCTTGCCC。下划线标记的序列分别为Nde I和Xho I位点。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。
获取cDNA模板。将含PGAM1 cDNA的菌液按1∶100接种于含100μg/mL氨苄青霉素的LB,37℃,220r/min培养24h,按质粒抽提试剂盒提取含PGAM1 cDNA的未知质粒。
PCR扩增cDNA。PCR体系:cDNA模板1μL,引物PF(10μmol/L)和PR(10μmol/L)各1μL,10×HiFi Buffer Ⅱ 5μL,2.5mmol/L dNTPs 4μL,HiFi DNA Polymerase 0.5μL,H2O 37.5μL。PCR参数:95℃预变性3min;94℃变性30s,60℃退火30s,72℃延长1min,循环30次;72℃延长10min。扩增产物经琼脂糖凝胶电泳鉴定后,胶回收试剂盒纯化。
1.3 酶切、连接与转化
按表1酶切cDNA与pET-28a。酶切产物行琼脂糖凝胶电泳分离、胶回收纯化。取酶切纯化的cDNA、pET-28a 各2.5μL与DNA连接试剂I 5μL,混匀,于16℃连接1h。按DH5α感受态细胞说明书,将连接产物进行热激转化,并于含卡那霉素的LB平板(LBK平板)筛选抗性菌落。
表1 DNA的酶切
1.4 鉴定重组质粒
重组质粒pET-28a-PGAM1(记为28a-PAM)按表1酶切,产物于0.8%琼脂糖凝胶电泳分离鉴定。酶切鉴定与预期相符重组质粒送华大基因测序。
1.5 IPTG诱导PGAM1表达与纯化
按1.3的方法,将28a-PAM转化BL21(DE3)细胞,挑抗性单菌落接种于5mL LBK培养基,37℃ 220r/m培养过夜。取过夜培养的菌液1mL接种于100mL LBK培养基,37℃ 220r/m培养至OD600为0.86,加入终浓度0.1mmol/L IPTG,16℃诱导培养24h。12 000r/min,4℃离心收集菌体。加10mL细菌蛋白抽提缓冲液(含1mmol/L PMSF)重悬细胞,以260W超声10s停10s的程序,超声1h裂解细胞。细胞裂解液于12 000r/min,4℃离心10min。将上清与等体积的不含咪唑的Binding Buffer混匀,得混合液。取1.5mL Ni2+填料,装入重力纯化柱,按说明书洗涤与平衡。在4℃冰箱纯化PGAM1:将混合液加入纯化柱,纯化柱出口连接一次性输液器管,调节流速至0.5mL/min,流出未结合蛋白。分别用含20、40mmol/L咪唑的Binding Buffer各40mL洗涤填料上的非特异性结合蛋白,再用20mL Elution Buffer洗脱PGAM1。
将纯化的PGAM1装入截留分子量10KD的超滤管,4℃ 4 000×g离心浓缩至1mL,加入9mL不含咪唑的Binding Buffer稀释浓缩液,再次离心浓缩至1mL,重复稀释—浓缩6次,彻底降低PGAM1溶液中的咪唑浓度。
取10μL浓缩的PGAM1,用PBS稀释10倍,按BCA蛋白质浓度测定试剂盒测定PGAM1浓度。向剩余PGAM1中加入终浓度2mmol/L PMSF后与等体积的甘油混匀,分装后保存于-20℃,备用。
2 结 果
2.1 PGAM1 cDNA的PCR扩增
PCR产物电泳结果如图1,PCR扩增后有略大于750bp的条带,与PGAM1 cDNA分子量(765bp)相符(泳道1),阴性对照无扩增条带(泳道2)。
M:DL2000 DNA marker;1:PGAM1 cDNA PCR产物;2:阴性对照PCR产物
2.2 重组质粒的鉴定
2.2.1 酶切鉴定
重组质粒28a-PAM经NdeI+Xho I酶切后出现两种DNA片段。大片段与pET-28a经相同酶切的产物(图2泳道1)相符,小片段(图2泳道2)与PGAM1 cDNA分子量(765bp)吻合。可知PCR产物已插入pET-28a质粒中。
M1:1kb DNA marker;1:pET-28a Nde I+Xho I酶切产物;2:pET-28a-PGAM1 Nde I+Xho I酶切产物;M2:DL2000 DNA marker
2.2.2 测序鉴定
重组质粒DNA测序结果表明连入pET-28a中的序列与cDNA序列一致,读码正确,正向测序的部分信号峰如图3所示。蓝色下划线序列为pET-28a Nde I位点,红色箭头序列为PGAM1的起始密码子编码序列。
图3 pET-28a-PGAM1部分测序峰图
2.3 PGAM1的表达与纯化
PGAM1表达产物如图4所示。0.1mmol/L IPTG诱导的28a-PAM-BL21(DE3)裂解液上清中有一条介于25~35Ku粗带(泳道2),与PGAM分子量(29Ku)相符,未经IPTG诱导的菌体无此条带(泳道1),可见PGAM获得了可溶性表达,经Ni2+纯化的PGAM1杂带少,纯度高。PGAM1经超滤浓缩和缓冲液交换后,测定其浓度约为12mg/mL,可知PGAM的表达量约120mg/mL。
M:蛋白质Marker;1:28a-PAM-BL21(DE3)未经IPTG诱导的上清;2:28a-PAM-BL21(DE3)0.2mmol/L IPTG诱导的上清;3:纯化的PGAM1
3 讨 论
PGAM1在多种肿瘤细胞中高表达,宋宜鹏等[11]发现PGAM1在胃癌组织的表达水平明显高于癌旁组织,与胃癌临床病理特征相关。近年已有研究认为PGAM有望成为肿瘤治疗的靶点在[1]。Wang等[12]合成了一系列基于N-氧杂蒽酮酰胺基苯磺酰胺母核的PGAM1的抑制剂,其中编号为15h的化合物对PGAM1抑制活性最强,IC50约2.1μmol/L,细胞实验表明,15h能有效抑制人非小细胞肺癌H1299细胞的增值。Liang等[6]发现小分子化合物HBK99通过别构抑制PGAM1,能逆转非小细胞肺癌细胞对埃罗替尼的抗性。
本研究构建了PGAM1的原核表达载体pET28a-PGAM1,并在宿主菌BL21(DE3)中获得了可溶性PGAM,产量达120mg/mL。通过大体积低浓度咪唑溶液的反复洗涤,有效去除杂蛋白,保证PGAM1的高纯度。为避免咪唑对PGAM1浓度测定及酶活性的影响,本文采用反复超滤—缓冲液交换的策略,彻底降低PGAM1溶液中残存咪唑的浓度,为后续酶活性的测定、抑制剂的筛选、蛋白质结晶和其它功能的研究奠定了坚实的基础。
PGAM1在LKB培养基中,通过低浓度IPTG(0.1mmol/L),16℃诱导培养24h,产量已达到120mg/mL,足够后续研究对酶量的需求,无需进一步优化其它表达条件。