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lncRNA SNHG11通过吸附miR-193a-5p 促进NSCLC 细胞A549 的恶性生物学行为

2022-04-07王羽曹佳丽陈哲聪高梦源陈文虎杭州医学院药学院临床医学院基础医学与法医学院生物化学与分子生物学教研室浙江杭州310059

中国肿瘤生物治疗杂志 2022年2期
关键词:孔板荧光素酶试剂盒

王羽,曹佳丽,陈哲聪,高梦源,陈文虎(杭州医学院.药学院;.临床医学院,.基础医学与法医学院 生物化学与分子生物学教研室,浙江 杭州 310059)

全球范围内,肺癌的发病率和病死率长期居恶性肿瘤首位。2018 年中国肺癌新发病例约82 万例、病死约71 万例[1];其中以非小细胞肺癌(NSCLC)最为常见,占发病总数的80%以上[2]。据统计,经手术治疗后约40%NSCLC患者会因癌细胞转移或复发而死亡,且术后并发症会导致患者生存质量下降[3]。由于NSCLC 前期的临床症状并不明显,大多患者发现时已经是晚期,然而晚期患者的5 年生存率仅约15%[4]。因此,积极探讨NSCLC细胞增殖和转移的分子机制,对于防治具有十分重要的意义。研究结果[5-7]表明,lncRNA能够调控细胞增殖、分化和凋亡等生命活动,且与多种肿瘤的发生发展密切相关。lncRNA小核仁RNA宿主基因11(small nucleolus RNA host gene 11,SNHG11)被发现在人类的多种癌症中均表达异常[8-9],但尚少见在NSCLC 中的报道。本研究探讨lncRNA SNHG11 对NSCLCA549 细胞增殖、侵袭和迁移的影响及其是否通过靶向调控miR-193a-5p发挥作用,以期为NSCLC治疗提供新靶点。

1 材料与方法

1.1 主要材料与试剂

人NSCLC 细胞A549、NCI-H1299、HCC827 和人正常胚肺细胞HEL-1均购自ATCC,均用含10%FBS、1%青/链霉素的DMEM培养基在37 ℃、5%CO2、97%湿度的培养箱内培养,每1~2 d 更换1 次培养基。FBS、DMEM 培养基、胰蛋白酶均购自Gibco 公司,BCA蛋白浓度测定试剂盒、一抗稀释液、超敏ECL化学发光剂均购自上海碧云天公司,小鼠抗人PCNA 单克隆抗体、兔抗人cyclin D1 多克隆抗体、兔抗人GAPDH 单克隆抗体均购自CST 公司,SNHG11、miR-193a-5p 的引物均购自北京擎科公司,转染试剂Lipo2000、TRIzol 试剂均购自Invitrogen 公司,Prime Script 逆转录试剂盒和TB Green PCR 实时荧光定量试剂盒均购自TaKaRa 公司,二甲基亚砜(DMSO)购自北京索莱宝公司,lncRNA SNHG11小干扰RNA(si-SNHG11)及其阴性对照(NC siRNA)、lncRNA SNHG11过表达载体及对照空白载体、miR-193a-5p模拟物(mimic)及阴性对照序列(NC mimic)、miR-193a-5p 抑制剂(miR-193a inhibitor)及抑制剂阴性对照序列(NC inhibitor)均购自上海吉玛公司,双荧素酶报告基因系统试剂盒购自美国Promega公司,CCK-8试剂盒购自日本同仁生物公司。

1.2 qPCR 实验检测细胞中SNHG11 和miR-193a-5p的表达水平

使用TRIzol 试剂从细胞中提取总RNA,并使用Prime Script RT 试剂盒将RNA 逆向转录成cDNA。qPCR 采用TB Green PCR 试剂盒进行检测,U6 作为miR-193a-5p的内参,β-actin作为lncRNA SNHG11的内参。采用2-ΔΔCt法计算目的基因的相对表达水平。

1.3 细胞转染与分组

将对数生长期的A549细胞调整为1×104个/mL,接种于6 孔板,当生长至60%汇合时,更换为不含FBS 的DMEM 培养基。根据转染试剂说明书将NC siRNA、si-SNHG11,NC mimic、miR-193a mimic,si-SNHG11 和NC inhibitor,si-SNHG11 和miR-193a inhibitor 分别转染至A549 细胞中,依次记为NC siRNA 组、si-SNHG11 组,NC mimic 组、miR-193a mimic 组,si-SNHG11+NC inhibitor 组和si-SNHG11+miR-193a inhibitor 组。qPCR 法验证沉默与过表达效果。

1.4 CCK-8 法检测SNHG11 与miR-193a-5p 表达变化对A549细胞增殖的影响

转染后的各 组 细胞调 整为1×104个/mL,按200µL/孔接种于96孔板,培养24、48和72 h后,每孔加入10 µL CCK-8 溶液,继续培养2 h,酶标仪测定450 nm处光密度(D)值。

1.5 WB 法检测SNHG11 与miR-193a-5p 表达变化对A549细胞中PCNA和cyclin D1表达的影响

转染后的各组细胞调整为1×106个/mL,接种于6 孔板,培养48 h 后胰蛋白酶消化,收集细胞,加入RIPA 细胞裂解液,冰上处理40 min,充分裂解后,4 ℃离心20 min,取蛋白上清液。BCA法测定蛋白含量,100 ℃煮沸5 min后冷却至室温,进行SDS-PAGE分离蛋白,再将蛋白条带电转至PVDF 膜,5%脱脂奶粉溶液室温封闭1 h,分别加入抗PCNA(1∶1 000)、抗cyclin D1(1∶1 000)和抗GAPDH(1∶5 000)一抗,4 ℃过夜,TBST 洗膜3 次,加入HRP 标记的二抗(1∶5 000),室温处理2 h,TBST洗膜3次,加入ECL化学发光试剂,避光显影后曝光、拍照。以GAPDH 为内参计算目的蛋白的相对表达量。

1.6 Transwell 实验检测SNHG11 与miR-193a-5p 表达变化对A549细胞侵袭的影响

人工基膜(matrigel)液化后用4 ℃的无血清培养基以1∶8 比例稀释,取50 µL 加入Transwell 小室上室,自然晾干;转染后的各组细胞用不含血清的DMEM 培养基调整至2×105个/mL,加入100µL 细胞悬液至上室,下室加入500µL含10%FBS的培养基。培养48 h后取出小室,弃培养基,棉签擦去基质胶和上层小室内侧细胞,用4%甲醛固定穿膜细胞30 min、0.4%结晶紫染色30 min,显微镜下观察,随机选取5个视野计数。

1.7 划痕愈合实验检测SNHG11 与miR-193a-5p 表达变化对A549细胞迁移的影响

用记号笔在6孔板背后均匀划4条直线,横穿过孔,调整各组细胞密度为1×104个/mL,接种于6孔板,当细胞生长至80%汇合时,弃培养基,用10µL 无菌移液器吸头尖端在各孔相同位置划线,PBS冲洗3次,去除划下的细胞,每孔加入无血清培养基培养24 h后镜下观察细胞迁移情况。

1.8 双荧光素酶报告基因实验验证SNHG11与miR-193a-5p间的靶向关系

生物信息学软件预测显示,SNHG11 与miR-193a-5p 的核苷酸序列存在结合位点。构建含SNHG11 野生型序列的重组载体(SNHG11 WT)与SNHG11 突变型载体(SNHG11 MUT)。分别将SNHG11 WT、SNHG11 MUT 与NC mimic 或miR-193a mimic共转染至A549细胞,6 h后更换新鲜培养基,继续培养48 h,收集细胞,裂解、离心、收集上清液,检测荧光素酶活性。以海肾荧光素酶活性为内参,计算相对萤火虫荧光素酶活性。

1.9 统计学处理

采用SPSS19.0 软件进行数据处理和分析,符合正态分布的计量数据采用±s表示,多组间比较采用单因素方差分析(ANOVA),以P<0.05或P<0.01表示差异有统计学意义。

2 结果

2.1 lncRNA SNHG11 和miR-193a-5p 在NSCLC 细胞中分别呈高、低表达

qPCR 检测结果(图1)表明,与HEL-1 细胞相比,在NSCLC 细胞中SNHG11 呈明显高表达(均P<0.05),其中A549细胞最为明显;而miR-193a-5p呈明显低表达(均P<0.05),其中A549 细胞最为明显。选择A549细胞进行后续实验。

2.2 沉默lncRNA SNHG11表达对NSCLCA549细胞增殖、侵袭和迁移的影响

qPCR 检 测结果(图2A)显示,si-SNHG11 组A549 细胞株中SNHG11 的表达显著低于NC siRNA组(P<0.05),说明转染si-SNHG11 成功沉默了A549细胞株中SNHG11 的表达。CCK-8 法检测结果(图2B)显示,si-SNHG11 组A549 细胞的增殖水平显著低于NC siRNA 组(P<0.05);WB 法检测结果(图2C 和2D)显示,si-SNHG11 组A549 细胞中PCNA、cyclin D1 蛋白的表达水平显著低于NC siRNA 组(P<0.05);划痕愈合实验(图2E)和Transwell实验(图2F)检测结果显示,si-SNHG11组A549细胞的迁移能力和侵袭细胞数均显著低于NC siRNA组(P<0.05)。

2.3 miR-193a-5p 过表达对NSCLCA549 细胞增殖、侵袭和迁移的影响

qPCR检测结果(图3A)显示,miR-193a mimic组A549细胞中miR-193a-5p的水平显著高于NC mimic组(P<0.01)。CCK-8法(图3B)、WB法(图3C)、划痕愈合实验(图3D)和Transwell 侵袭实验(图3E)检测结果显示,miR-193a mimic组A549细胞的增殖水平、PCNA和cyclin D1蛋白的表达、迁移能力与侵袭细胞数均显著低于NC mimic组(均P<0.05)。

2.4 lncRNA SNHG11靶向负调控miR-193a-5p表达

利用生物信息学数据库Starbase 3.0在线预测结果(图4A)显示,lncRNA SNHG11 的序列中含有与miR-193a-5p互补的核苷酸序列。双荧光素酶报告基因实验证实了两者的靶向关系(图4B)。qPCR 检测结果(图4C)显示,si-SNHG11 组A549 细胞中miR-193a-5p的表达水平显著高于NC siRNA组(P<0.01)。

2.5 抑制miR-193a-5p 表达逆转了沉默SNHG11 对A549细胞增殖、迁移和侵袭的抑制作用

将SNHG11 的干扰siRNA 和miR-193a-5p 的inhibitor 共转染至A549 后,CCK-8 和WB 实验的结果(图5A、B)表明,miR-193a inhibitor 逆转了沉默SNHG11 表达导致的细胞增殖能力的降低(P<0.05),也部分逆转了PCNA 和cyclin D1表达的降低(均P<0.05)。划痕愈合实验和Transwell实验结果(图5C、D)表明,miR-193a inhibitor 也逆转了干扰SNHG11表达引起的细胞迁移和侵袭能力的降低(均P<0.05)。

3 讨论

肺癌分为NSCLC和小细胞肺癌,其中NSCLC占85%。NSCLC 的发病受多基因调控,其发病机制并不明了[10]。研究[11-12]发现,许多lncRNA参与调控肿瘤细胞的增殖、凋亡、迁移和侵袭,在肿瘤中表现出异常的表达和调节活性,这些发现为指导疾病治疗和诊断提供新策略。

作为lncRNA 最主要的功能之一,其可以充当miRNA 海绵,与miRNA 目标位点竞争结合,以抑制miRNA 活性并参与miRNA 介导的转录后调控。例如,lncRNA PCAT6 在骨肉瘤组织中表达上调,通过靶向miR-139-3p 抑制骨肉瘤细胞增殖,诱导骨肉瘤细胞凋亡[13]。lncRNA DANCR 通过调控miR-214-5p促进宫颈癌细胞的增殖及侵袭,提示其在宫颈癌中是一个具有促癌作用的分子,并有可能作为诊断和治疗的靶点[14]。lncRNA LINC00460 在NSCLC 患 者的癌组织中表达上调,且影响NSCLC 患者预后,是NSCLC 预后的独立预测因子[15]。前期研究结果[16]证实,lncRNA SNHG17 可通过调节miR-338-3p/SOX4 轴促进食管癌细胞的增殖和迁移。SNHG11 是一种新发现的lncRNA,可通过调节miR-184/AGO2促进肝癌细胞的增殖、迁移和凋亡[17],通过调节miR339-3p/SHOX2 轴促进结直肠癌细胞进展[18]。因此,SNHG11被认为是潜在的促癌因子。本研究发现,SNHG11 在NSCLC 细胞中呈高表达。进一步探讨SNHG11 对NSCLC 细胞生物学功能的影响,结果显示,沉默SNHG11的表达可抑制NSCLC细胞的增殖和侵袭、迁移,提示SNHG11 可能具有作为NSCLC治疗生物标志物的潜力。

miR-193a-5p对肿瘤细胞增殖和侵袭迁移具有重要作用,如miR-193a-5p 通过下调HOXA7 抑制人卵巢癌细胞的增殖[19],通过影响SRSF6 介导的OGDHL和ECM1选择性剪接促进胰腺癌细胞转移[20]。此外,lncRNA TUG1 可通过海绵吸附miR-193a-5p 从而提高AML细胞的活力[21]。本研究证明,miR-193a-5p在NSCLC 细胞中呈低表达,而过表达miR-193a-5p 能够抑制A549 细胞的增殖、侵袭和迁移能力。生物信息学预测到SNHG11 与miR-193a-5p 存在结合位点,通过双荧光素酶报告基因实验证实了两者关系;沉默SNHG11 表达可上调NSCLC 细胞中miR-193a-5p的水平。而抑制miR-193a-5p 表达则能够逆转沉默SNHG11 表达对NSCLC 细胞增殖、迁移和侵袭的抑制作用。

综上所述,本研究发现SNHG11在NSCLC细胞中呈高表达,沉默SNHG11可通过调节与其直接结合的miR-193a-5p发挥调控肿瘤细胞的增殖、侵袭和迁移的作用。SNHG11 可能成为NSCLC 治疗潜在新靶点。

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