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人类白细胞抗原组织配型基因分型国家参考品的研制

2021-10-20胡泽斌高飞刘湘兰更欣李丽莉黄杰

中国生物制品学杂志 2021年10期
关键词:配型冻融分型

胡泽斌,高飞,刘湘,兰更欣,李丽莉,黄杰

1.中国食品药品检定研究院体外诊断试剂检定所非传染病诊断试剂室,北京100050 2.北京博奥晶典生物技术有限公司,北京101111

人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)基因位于6 号染色体短臂上6p21.3,全长约3 600 bp,由200 多个基因座位组成,是迄今已知基因中等位基因多态性最高的基因复合体[1-2]。HLA 在抗原识别、提呈、免疫应答及调控方面发挥重要作用,是导致移植排斥的主要抗原,也被称为移植抗原[3],因此,造血干细胞及器官移植均需在移植前进行HLA 配型[4]。

随着测序技术的发展,基于DNA 序列的分型方法基本取代了传统的血清学及细胞学分型方法[5-6],主要包括低中分辨序列特异性引物方法(PCR sequence specific primer,PCR-SSP)、中分辨序列特异性寡核苷酸探针方法(polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide probes,PCR-SSO)、高分辨基因测序分型方法(sequence-based typing,PCR-SBT)及近年迅速发展的二代高通量测序方法(next generation sequencing,NGS)[7-8],其中 PCR-SBT 法是 WHO 推荐的HLA 分型方法的金标准。目前,已有多家企业的HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DRB1、HLA-DQB1 基因分型检测试剂盒获批上市,同时还有许多企业正在申报此类试剂盒注册。我国目前尚无针对HLA 组织配型基因分型检测相关试剂盒的国家参考品,无法对该类试剂盒进行统一的质量评估,为确保其临床测定结果准确可靠,本实验研制一套涵盖中国人群常见HLA 位点型别信息的HLA 组织配型基因分型国家参考品,以期为临床细胞组织器官移植配型提供保障。

1 材料与方法

1.1 样本 采集45 名志愿者(均已签署知情同意书)5 ~ 10 mL 外周血,置无菌肝素锂抗凝采血管中,2 ~ 8 ℃保存。志愿者外周血基因组DNA 的HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DRB1、HLA-DQB1 等 5 个位点的高分辨基因分型信息预先采用金标准PCR-SBT 法获得。

1.2 病毒 EB 病毒液由深圳华大智造科技有限公司提供。

1.3 主要试剂及仪器 人外周血淋巴细胞分离液购自北京索莱宝科技有限公司;基因组DNA 提取试剂盒(磁珠法)及Qubit Fluorometer 3.0 购自深圳华大智造科技有限公司;HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLADRB1、HLA-DQB1 位点基因高分辨分型试剂盒(测序法)购自北京博奥晶典生物技术有限公司;Nano-Dorp 分光光度计购自美国安捷伦公司。

1.4 永生化淋巴细胞系的建立 45 份外周血样本中加入人淋巴细胞分离液,300×g离心30 min,获得单个核淋巴细胞;加入1.5 mL EB 病毒液,按文献[9-10]的方法进行细胞转化及细胞培养。显微镜下观察细胞由单个逐渐成团状聚集,生长旺盛,则表明永生化细胞系建立成功。

1.5 国家参考品的制备及验证 采用基因组DNA提取试剂盒(磁珠法)提取建立成功的永生化细胞系的基因组DNA,通过分光光度计测定A260/280。将基因组DNA 反复冻融3 次,取冻融前及冻融后的基因组DNA 样本,进行1%琼脂糖凝胶电泳分析。通过 Qubit Fluorometer 3.0 精确定量各样本的DNA 浓度,将各样本稀释至 20 ng / μL,经 HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DRB1、HLA-DQB1 位点基因高分辨分型试剂盒(测序法)对冻融前样品进行全外显子基因分型,并与预先采用金标准SBT 法获得的高分辨基因分型信息进行比较。将检测结果符合要求的样本组成一套国家参考品。

1.6 国家参考品的稳定性及均匀性验证 随机取3 套参考品在-20 ℃与室温(20 ~ 25 ℃)之间反复冻融3 次(每隔1 d 冻融1 次),将冻融前后的基因组DNA 样本按 1.4 项方法进行A260/280测定、DNA 定量和琼脂糖凝胶电泳分析,并采用PCR-SBT 法进行分型验证。

2 结 果

2.1 永生化淋巴细胞系的建立 45 份外周血样本分离的单个核淋巴细胞经EB 病毒转化后,培养5 ~7 d,镜下可见少量聚集的细胞团;培养10 ~14 d 可见细胞团变大变多,细胞生长旺盛,表明细胞已成功转化为淋巴母细胞样B 细胞。见图1。最终获得38株永生化HLA 细胞系,编号为1 ~38。

图1 细胞生长情况的镜下观察(× 100)Fig.1 Microscopy of cell growth(× 100)

2.2 国家参考品的制备及验证 经1%琼脂糖凝胶电泳分析,冻融前和冻融3 次后的DNA 样品均未见拖带或弥散带,条带完整清晰,符合实验室对基因组DNA 完整性的要求,见图2。DNA 样品的A260/280均在1.80 ~2.15 之间,表明DNA 的纯度较高,满足检测要求,且每份样本2 条染色体的分型结果均与建系前外周血基因组DNA 的分型信息一致,见表1。将 38 份样本按 30 μL 进行分装,浓度为 20 ng / μL,组成一套HLA-组织配型国家参考品盘。

图2 冻融前后DNA 样本的完整性检测Fig.2 Integrity of DNA samples before and after freeze-thawing

表1 基因组DNA 样本的纯度及分型结果Tab.1 Purity and typing of genomic DNA samples

2.3 国家参考品的稳定性及均匀性验证 3 套国家参考品的A260/280在 1.80 ~ 2.15 之间,表明 DNA 纯度不受影响;DNA 浓度为(20.0 ± 0.5)ng / μL,表明DNA 稳定未降解;经SBT 法验证,3 套国家参考品冻融前后样本的 HLA-A、B、C、DRB1、DQB1 基因的高分辨分型结果一致,且与2.2 项分型结果相符。表明本实验室研制的HLA 组织配型基因分型国家参考品稳定性和均匀性良好。

3 讨 论

HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DRB1、HLA-DQB1 基因与组织器官移植密切相关,移植的供受体双方HLA配型程度越高,移植成功率和受体长期存活率越高[11-12],因此HLA 基因分型试剂盒的质量关乎临床检测的准确性,直接影响移植配型成功率和受体存活率,标准物质是确保和提升试剂质量的重要手段之一[13-14]。

足量原料的持续供应是制约标准物质发展的瓶颈之一,尤其是大量多人份的临床血液样本。本研究采用永生化建系的手段解决该困难,充分确保了国家参考品的持续供应及换批连续性。永生化建系仅需抽取志愿者外周血3 ~5 mL,操作简便,永生化建立也是HLA 国际质控盘通常采用的技术手段。因此,HLA 组织配型基因分型国家参考品与国际质控盘(UCLA,IHWG)技术水平相当,本研究建立的HLA基因中国人群实物参考盘为国际间的交流合作提供了支撑。本研究结果表明,永生化淋巴细胞系基因组HLA 的检测结果与临床血液样本DNA 的HLA 分型结果一致,该永生化淋巴细胞系的遗传信息稳定,可作为国家参考品的遗传资源。

HLA 组织配型基因分型参考品为首批研制的定性基因分型参考品,参考品原料系人全血转化的永生化细胞系,参考品性质为DNA 样本,DNA 样本自身的均匀性和稳定性良好[15-16],常规在-20 ℃以下保存,且要求干冰或-20 ℃冷链运输,用户不宜反复冻融后使用。本研究将38 份DNA 样本反复冻融3 次后,DNA 样品的A260/280在 1.80 ~ 2.15 之间,分型结果均与PCR-SBT 法检测结果一致,表明建立HLA组织配型基因分型国家参考品的量值准确性、均一性和稳定性均符合要求,可用于HLA 组织配型类核酸检测试剂盒的质量控制和评价。

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