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20例ABO血型抗原表达异常样本的血型基因分析

2021-10-14孙文杰何婷韩军任晓艳李萌

南方医科大学学报 2021年9期
关键词:内含子外显子亚型

孙文杰,何婷,韩军,任晓艳,李萌

南京医科大学附属儿童医院输血科,江苏 南京210008

ABO血型系统最初由Karl Landsteiner于1990年提出[1],至今仍然是输血医学和器官移植医学中最重要的血型系统,输注ABO不相容血液可能导致急性血管内溶血、肾衰竭甚至死亡。同样,移植ABO不相容器官可能导致急性体液性排斥反应[2]。因此,正确的血型鉴定是保障临床输血安全的重要保障。而在血清学方法进行ABO血型鉴定时,往往表现出正反定型不一致、抗原抗体反应性减弱或出现混合凝集视野等现象,ABO血型定型困难,疑为亚型。目前国内对于ABO亚型的研究报道多为个别案例[3,4],而且多为ABO血型1-7外显子的基因分析[5,6]。本研究对20例血清学检测异常的血型样本同时进行了ABO基因1-7外显子编码区及其上游调控区域基因扩增及测序,探讨其ABO血型抗原表达减弱的分子生物学机制。

1 资料和方法

1.1 研究对象

12例样本来自南京市儿童医院外科择期手术住院患儿;8例样本来自患儿家属。其中例1和例2(例1之母)、例4例5(例3之母)和例6(例4外婆)、例7和例8(例7之母)、例9和例10(例9之父)、例11和例12(例11之父)、例14和例15(例14之母)、例19和例20(例19之父)间存在家系关系。本研究已通过南京医科大学附属儿童医院医学伦理委员会审查,批件号:202101006-1。

1.2 材料

1.2.1 血清学检测 ABO-RhD血型鉴定卡、低离子抗人球蛋白卡(伯乐公司)、抗体筛选红细胞、抗A抗B血型定型试剂、抗D、抗H(上海血液生物医药有限公司)、专用离心机(伯乐公司,ID-Centrifuge 12 S Ⅱ)、专用孵育箱(伯乐公司,ID-Incubator 37 S Ⅰ)。

1.2.2 分子生物学检测 DNA提取试剂盒(天根生化科技有限公司)、2xGC Buffer、rTaq、dNTP Mixture(takara)、PCR扩增仪(GeneAmp9700PCR系统,ABI)、高速离心机(SIGMA1-14台式小型离心机)、涡旋混匀器(VDRTEX-5)、电泳仪(JY300C、北京君意东方电泳设备有限公司)、凝胶电泳槽(JY-SP3、北京君意东方电泳设备有限公司)、紫外分析仪(JYO2S、北京君意东方电泳设备有限公司)、水浴箱(天津泰斯特三用恒温/电热恒温水箱SHHW21.420AⅡ)。

1.3 方法

1.3.1 血清学检测 采用微柱凝集法及盐水试管法对18例样本进行ABO血型血清学鉴定。严格执行操作说明书。

1.3.2 分子生物学检测

1.3.2.1 DNA提取 取全血200 μL,按照试剂盒操作说明提取DNA。

1.3.2.2 PCR扩增及测序 委托天津吉诺泰普生物科技有限公司设计并合成针对ABO基因第1-7外显子及上游调控区域特异性引物,PCR扩增并直接测序,确定基因型。每个反应总体积50 μL:Taq DNA聚合酶(5 U/μL)0.4 μL,2×GC Buffer I 25 μL,2.5 mmol/L dNTP 4 μL,上、下游引物(20 μmol/L)各1 μL,DNA 模板5 μL、ddH2O 13.6 μL。反应过程为:96℃3 min,1 cycle;96 ℃25 s/68 ℃60 s 5 cycles;96 ℃25 s/65 ℃50 s/72 ℃45 s,10 cycles;96 ℃25 s/62 ℃50 s/72 ℃45 s,25 cycles;72 ℃3 min,1 cycle。PCR产物经2.5%琼脂糖凝胶鉴定后测序,与NCBI 在线比对数据库nucleotide blast(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/)确定其基因型。

2 结果

2.1 血清学检测结果

对20 例样本使用微柱凝集法及盐水试管法进行ABO血型鉴定,血清学检测结果显示,ABO血型抗原表达异常,正反定型结果不符合。其中A抗原表达异常3例,B抗原表达异常17例;10例样本红细胞与抗B试剂反应出现混合视野;样本红细胞与抗H试剂反应均有不同程度增强;20例样本均疑为ABO亚型(表1)。

2.2 分子生物学检测结果

ABO 血型基因第1-7 外显子及其上游调控区域PCR产物直接测序结果,根据ISBT 网站提供的Names for ABO(ISBT 001)blood group alleles v1.1 171023综合结果判定(以ABO*A1.01为参考序列)。结果显示,20例样本中,1例为A2B型,1例为A2型,2例为AB3型,3例为B3型,4例为Bw12型,4例B抗原表达减弱的样本发生启动子区域变异;1例A抗原表达减弱样本发生第7外显子1054delC;另外4例样本ABO血型1-7外显子及其调控区域未发现变异(表2,图1)。

表2 20例样本ABO血型PCR直接测序结果Tab.2 Results of direct PCR sequencing of ABO blood group in the 20 cases

3 讨论

ABO基因位于第9号染色体q34.2,由7个外显子组成,共编码354个氨基酸。如果在ABO等位基因编码区发生突变,则可引起ABO基因编码物质的改变,从而导致ABO血型亚型生成[7]。目前研究ABO亚型主要有血清学水平(免疫血液学实验)、基因水平(DNA、mRNA)、蛋白水平(氨基酸、糖基转移酶、蛋白构象)3种模式[8]。国外在蛋白质或氨基酸水平有相关研究[9]。然而因为ABO基因77%编码序列位于第6和第7外显子,这两个编码区是决定ABO基因产物糖基转移酶功能的主要部分[10],因此关于外显子区域,尤其第6、7外显子测序研究的文献报道较多[11-13],针对启动子区域研究较少。本次研究,对20例血清学检测ABO血型抗原表达减弱的样本1-7外显子编码区及其上游调控区域同时进行测序分析,以进一步揭示ABO血型亚型的分子生物学机制。

研究显示,上游调控区碱基变异导致的B抗原减弱样本4例;未见既往报道的碱基变异2例(1例为上游调控区-119位C>T变异,1例为第7外显子1054位点del C);另有4例样本血清学结果明显异常而其上游调控区及1-7外显子基因检测均未见异常,疑为内含子区域变异造成ABO血型抗原异常表达。20例样本中,例1及例2存在家系关系,确定其基因型分别为ABO*A2.01/ABO*B.01、ABO*A2.01/ABO*O01.01;例4、例5 及例6存在家系关系,确定其基因型分别为B3.04/A1.02、B3.04/O.01.01、B3.04/O.01.02;例7 及例8 存在家系关系,确定其基因型分别为B3.02/A1.02、B3.02/O.01.02;例9及例10存在家系关系,确定其基因型分别为Bw.12/O.01.01、Bw.12/O.01.01;例11及例12存在家系关系,确定其基因型分别为Bw.12/O.01.01、Bw.12/O.01.01;有4例样本发生启动子区域变异,其中例13、例14及例15发生ABO基因启动子区域-35_-18位点碱基缺失(例14及例15存在家系关系),导致B抗原表达减弱;例16发生启动子区域-119位C>T的异常变异,因对以往正常ABO血型基因分析并未发现此变异,故推测该变异导致了B抗原表达减弱;例3样本发生第7外显子1054位点缺失碱基C,因对以往正常ABO血型基因分析并未发现此变异,故推测该变异导致A抗原表达减弱;例17、例18、例19及例20样本红细胞与抗B试剂血清学反应均呈现混合视野现象,其中例19及例20为父子关系,且二者ABO血型血清学鉴定格局一致,但经ABO血型1-7外显子及其调控区域基因检测,该4例样本均未发现变异。

启动子在转录过程中起调控作用,通过活化RNA聚合酶,使之与DNA模板准确结合并具有转录起始的特异性。同时,ABO基因内含子1的变异可能也影响ABO血型基因的表达。国内关于这方面研究较少。国外文献报道[14],在红细胞生成过程中,miR-331-3p 和miR-1908-5p 的表达水平与血型抗原水平呈负相关。Sano等[15-17]研究发现,ABO基因内含子1中有基因表达的调控元件,位于ATG翻译起始位点3’方向、+5653和+6154核苷酸位点之间,可以增强ABO基因启动子的活性,而删除包含此调控序列的内含子1,会导致Bm亚型表型。Fenne等[18]研究发现,内含子1中GATA碱基突变,会引起ABO血型血清学试验正反定型不符。有文献报道[19-21],ABO基因内含子1中红细胞特异性调控元件(+5.8 kb)负责抗原差异表达,RUNX1基序单点突变可下调+5.8 kb位点的转录活性,导致A或B抗原表达减少。ABO基因内含子1中核昔酸的突变也可使红细胞表面A抗原表达减弱,导致AmB表型出现。

本次研究的20例样本中,7例变异发生在第6外显子;5例发生于第7外显子,其中1054位点del C未见报道,疑为新的变异位点;4例样本碱基变异位于启动子区域,其中-119位C>T未见报道,疑为新的变异位点;4例样本未发现其上游调控区域及外显子1-7明显变异,推测其是否与mRNA合成异常有关,是否由于RUNX1位点突变下调ABO基因内含子1的+5.8 kb位点的转录活性,从而导致B抗原减弱。目前国内对内含子1碱基变异导致ABO血型抗原表达异常的的研究较少,值得进一步关注。

另有资料认为A亚型比B亚型更常见[22],但是本次实验20例亚型中仅有2例A抗原表达异常,B亚型明显较A亚型更常见。分析其原因可能与中国人群血型分布不同于欧美有关,不同地域不同民族人群中血型分布,也是输血医学发展需要关注的方向之一。

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