小麦旗叶与幼苗性状的QTL分析
2021-09-23李兴茂王淑英倪胜利
李兴茂,王淑英, 倪胜利
(甘肃省农业科学院旱地农业研究所,甘肃兰州 730070)
相对于苗期活力低的品种,苗期活力高的品种其籽粒产量平均提高12%,有明显的节水增产效果[1-2]。高幼苗活力与高生物量的积累相关,在高温、高CO2浓度等胁迫条件下,籽粒产量也显著提高[3-4]。干旱环境下根系活力大的品种,在水分胁迫条件下产量的损失最小[5]。苗期活力与萌发期胚芽鞘长度、根系活力及茎叶活力密切相关。胚芽鞘长的品种有利于雨养环境下小麦深层水份的利用,具有耐深播的优点[6]。较高的根系活力,可增强对营养的吸收和生物量的积累,对提高小麦苗期抵抗水分胁迫[7]和后期抵抗干旱胁迫均有重要的影响。
前人在1A、6A、6D和7D染色体上定位到控制胚根长度的QTL,在2D和6D染色体上定位到控制根茎比率的QTL[8-10];在1A、2A、2B、4B、5A、5D、6A 和7B染色体上定位到控制根长的QTL,在5D染色体上定位到控制根、茎干重的QTL,在1D染色体上定位到控制茎秆长度的QTL[9,11-12],然而,很多QTL存在显著的上位性效应[10,13]。Manschadi等[14]研究发现,幼苗期根生长角度较窄的品种,其成株期同样具有较窄的根生长角度。Spielmeyer等[15]研究发现,在6A染色体上控制幼苗叶片宽度主效QTL紧密连锁的分子标记NW3106,也与胚芽鞘长度和株高QTL紧密连锁。Bennett等[16]研究发现,在3B染色体上控制苗期活力的QTL,也与籽粒产量、叶宽和冠层温度等性状有关。
小麦苗期性状相关的QTL定位报道较多,但苗期性状及旗叶性状的关系还不清楚。本研究利用京冬8号/矮抗58的207个RIL群体为材料,针对冬小麦幼苗期性状和开花期旗叶性状进行QTL研究,探讨小麦苗期性状与后期旗叶性状的关系,以期发掘出稳定调控小麦幼苗性状相关的QTL,为今后分子标记辅助选择育种提供 依据。
1 材料与方法
1.1 供试材料
试验材料为京冬8号/矮抗58的207个RIL群体及其亲本。其中,京冬8号携带矮秆基因Rht8,矮抗58携带矮秆基因Rht8和Rht2[17]。
1.2 试验设计
室内试验于2016年10月在实验室进行,将发芽纸在121℃下灭菌30 min,每个材料选取无损伤且大小均匀的种子200粒,用1.0%次氯酸钠消毒4 min,冲洗干净后,置于恒温光照培养箱(25 ℃)培养,重复3次,待发芽7 d后,测定发芽数、苗长、根长、苗鲜重、根鲜重、苗干重、根干重等指标。鲜重根冠比=根鲜重/苗鲜重;干重根冠比=根干重/苗干重。
田间试验于2015年在甘肃省庆阳市镇原试验站进行,种植RIL群体及其亲本,行长2 m,重复2次。于2016年5月14日小麦扬花期,测定旗叶长度和宽度,计算旗叶面积和旗叶长宽比。参照Li等[18]和李兴茂等[19]的方法测定产量、植被指数、植被覆盖度、叶片衰老速率、千粒重等 性状。
1.3 数据分析
用Excel进行数据整理,每个性状3次重复的平均值为表型值。从1 208对引物中进行双亲多态性筛选,筛选出391对差异引物。依据GrainGenes 2.0图谱提供的标记位置,利用Try命令进行调整、构建包含149对引物的遗传图谱。利用IciMapping 4.1软件中的双亲群体QTL定位功能,基于逐步回归的完备复合区间作图法,以 LOD>2.5作为阈值进行基因定位分析,分析方法参见文献[18-19]。
2 结果与分析
2.1 RILs群体及亲本的苗期与旗叶性状
从表1可以看出,幼苗期性状中,苗长、苗干重、根干重、鲜重根冠比和干重根冠比在亲本间差异较大,除鲜重根冠比和干重根冠比外,京冬8号的其他6个性状均小于矮抗58。旗叶性状中,京冬8号的旗叶长、宽、面积、长宽比4个性状的表型值均高于矮抗58。群体中苗长、根长、苗鲜重、根鲜重和苗干重的平均值都大于双亲,而旗叶长、宽和面积的群体平均值介于双亲之间。群体内所有研究性状均表现出超亲分离现象。表明这些性状是由多基因控制的数量性状,适合进行QTL定位。所有性状在群体内基因型间存在显著 差异。
表1 RIL群体及其亲本的苗期和旗叶性状Table 1 Phenotypic performance for the investigated traits of the RILs and their parents
2.2 旗叶相关性状的QTL定位结果
从表2可以看出,共检测到10个控制旗叶性状的QTL,其中4个QTL与旗叶面积有关,分布在1A和5D染色体上,表型贡献率为1.98%~7.69%;1个QTL与旗叶长有关,分布在1A染色体上,表型贡献率为9.24%;1个QTL与旗叶宽有关,分布在5D染色体上,表型贡献率为 6.54%;共检测到4个控制旗叶长宽比的QTL,均位于D染色体组上,分别分布在2D、3D、4D和5D染色体上,表型贡献率为2.73%~9.89%,其中,2D和5D染色体上的QTL加性效应来自矮抗58,3D和4D染色体上的QTL来自京冬8号。其中,1A染色体上与旗叶面积QTL紧密连锁的分子标记wmc550也与旗叶长QTL紧密连锁,遗传距离均为0.1 cM,加性效应均来自亲本矮抗58;5D染色体上与旗叶面积QTL紧密连锁的分子标记gwm182也与旗叶宽QTL连锁,但遗传距离不同,分别为0.4和2.4 cM,其加性效应均来自亲本京冬8号。有6个QTL的表型贡献率大于5%,为主效QTL,分别为1A染色体上控制旗叶面积和旗叶长的QTL、4D染色体上控制旗叶长宽比的QTL、5D染色体上控制旗叶面积、旗叶宽和旗叶长宽比的QTL。除5D染色体上控制旗叶面积和旗叶宽的QTL表现为部分显性效应外,与其他性状相关的QTL均表现为超显性效应。
表2 旗叶相关性状的QTLTable 2 QTLs for flag leaf traits
2.3 幼苗期相关性状的QTL定位结果
从表3可以看出,共检测到22个控制幼苗性状的QTL,其中7个QTL与根长有关,分布在1A、2D、3D、4D(2)、5A和7A染色体上,表型贡献率为2.53%~4.84%;1个QTL与幼苗根鲜重有关,分布在2D染色体上,表型贡献率为 1.31%;2个QTL与幼苗根干重有关,分布在4D和7A染色体上,表型贡献率分别为1.14%和 4.38%;3个QTL与幼苗苗长有关,分布在1A、4A和4D染色体上,表型贡献率为3.10%~ 10.52%;2个QTL与幼苗鲜重有关,分布在2D和5A染色体上,表型贡献率分别为4.91%和 1.23%;3个QTL与幼苗干重有关,分布在1A、2D和7A染色体上,表型贡献率为2.32%~ 3.32%;2个QTL与鲜重根冠比有关,分布在4D和7A染色体上,表型贡献率分别为1.88%和 1.90%;2个QTL与干重根冠比有关,分布在2D和7A染色体上,表型贡献率分别为2.78%和 2.74%。1A染色体上与根长QTL紧密连锁的分子标记wmc84也与苗长和苗干重QTL紧密连锁,但遗传距离不同,分别为4.9、3.0和4.0 cM,除根长QTL加性效应来自亲本京冬8号外,其他两个QTL均来自矮抗58。2D染色体上与根长QTL紧密连锁的分子标记wmc170也与根鲜重、苗鲜重、苗干重和干重根冠比QTL紧密连锁,遗传距离分别为5.8、0.9、6.0、0.9和3.0 cM,除干重根冠比QTL的加性效应来自亲本矮抗58外,其他性状均来自亲本京冬8号。4D染色体上与根长QTL紧密连锁的分子标记barc308与鲜重根冠比QTL紧密连锁,遗传距离分别为11.0和0.2 cM;与根干重QTL紧密连锁的分子标记barc98与苗长QTL紧密连锁。5A染色体上与根长QTL紧密连锁的分子标记gwm156也与苗鲜重QTL紧密连锁,遗传距离分别为3.0和5.0 cM。7A染色体上与根长QTL紧密连锁的分子标记barc1136也与根干重、苗干重、鲜重根冠比和干重根冠比QTL紧密连锁,遗传距离分别为6.0、2.0、7.0、2.0和1.0 cM。Rht2矮秆基因位于4D染色体上,但与4D染色体上控制根长、根干重、苗长和鲜重根冠比的QTL距离均较远。除1A和4D染色体上控制苗长的QTL表型贡献率大于5%外,其他与幼苗期相关性状的QTL表型贡献率均较低,且除3D染色体上控制根长的QTL表现为部分显性效应外,其他QTL均表现为超显性效应。
表3 幼苗期相关性状的QTLTable 3 QTLs for seedling traits
3 讨 论
本研究发现,2D染色体上与旗叶宽QTL紧密连锁的分子标记wmc170与幼苗根长、根鲜重、苗鲜重、苗干重和干重根冠比QTL紧密连锁;4D染色体上与旗叶长宽比QTL紧密连锁的分子标记barc308与幼苗根长、鲜重根冠比QTL紧密连锁,其他旗叶性状QTL紧密连锁的分子标记没有发现与幼苗期性状QTL紧密连锁的现象。袁倩倩等[9]在1A染色体侧翼标记wmc550附近检测到控制根长的QTL,而本研究在1A染色体侧翼标记wmc550附近检测到控制旗叶面积和旗叶长的QTL。Li等[20]在1A染色体侧翼标记wmc84附近检测到控制抽穗期、植被归一化指数和植株衰老速率的QTL,而本研究在1A染色体侧翼标记wmc84附近检测到控制根长、苗长和苗干重的QTL,遗传距离不同。Landjeva等[21]在5D染色体侧翼标记gwm182附近检测到控制苗长和根茎比率的QTL,而本研究在5D染色体侧翼标记gwm182附近检测到控制旗叶面积和旗叶宽的QTL,但遗传距离不同。因此,与幼苗期性状相关的QTL存在与苗期活力、后期生长发育性状和产量性状等QTL共同的连锁分子标记,这些标记可有效用于小麦分子标记辅助育种。尽管本研究检测到的QTL都是微效QTL,但验证了这些QTL位点与种子苗期活力性状有关,对苗期性状与小麦旗叶性状的深入研究有参考价值。
本研究在4D染色体上定位到矮秆基因Rht2,朱 浩等[22]研究表明,Rht2基因不仅影响根长,而且与产量和千粒重有关。但本研究检测到Rht2与控制根长的QTL距离较远。Tian等[23]在6A染色体上定位到矮秆基因Rht24,可增加春季苗期活力和千粒重,但与幼苗期活力性状无关。因此,Rht24基因弥补了大多数矮秆基因降低小麦初期生长活力的缺陷,对研究耐旱相关性状遗传检测及分子标记辅助选育奠定了基础。
本试验采用室内苗期性状研究方法,占用空间小,一次可以测试批量样品,有利于对遗传群体的多样本开展多重复研究。然而,统计分析的工作量大,不能及时完成所有品系的根系性状测量,可能造成品系间测量误差,因此,本研究在测定时,每个重复间适当增加了试验间隔,尽可能减少误差。今后采用数码拍照后,利用适合于大群体表型研究的根系分析系统软件进行处理,可以分析更多的幼苗指标,还可进一步减少试验误差。