当归-川芎药对治疗原发性痛经的网络药理学研究
2021-07-29谷冬梅李正翔袁恒杰
张 科,谷冬梅,李 波,宋 崟,李正翔,袁恒杰
(天津医科大学总医院药剂科1,检验科2,天津 300052)
原发性痛经(primary dysmenorrhea,PD)是一种青春期女性在月经前后或经期常见疾病,轻者为下腹疼痛、坠胀,重者会出现恶心呕吐、冷汗淋漓甚至昏厥等症状,影响患者的正常生活。PD 的发病机制目前尚未完全阐明,临床很难根治[1]。PD 治疗以药物治疗为主,常用药物为非甾体抗炎药,但治疗效果不佳,且不良反应明显[2]。中医治疗PD 具有独特的优势,痛经在中医辨证上属于“经行腹痛”的范畴,是由于气滞血瘀、经血不畅引起的或者是由于着凉受寒所引起的[3],治则以活血化瘀、行气止痛为法[4]。当归-川芎是于补血活血、化瘀止痛的经典药对。当归性温味甘辛,归心、肝、脾经,善补血活血,调经止痛,润肠通便,并能散寒,凡血虚血瘀有寒症均宜,为妇科调经之要药。川芎性温味辛,归肝、胆、心包经,善活血行气,祛风止痛,治血瘀气滞诸痛,兼寒者最宜[5]。近年来,基于网络药理学探究中药多成分、多靶点作用机制成为研究热点,本文拟采用该方法探究当归-川芎药对治疗PD 的作用机制,以期为其临床应用提供参考。
1 资料与方法
1.1 活性成分及靶点的筛选 基于TCMSP 数据库,以“当归”“川芎”为关键词检索,收集药材的化学成分,然后以OB≥30%和DL≥0.18 为条件筛选有效成分[6,7]。收集数据库中成分对应的靶点,并使用Uniprot 数据库,将靶点转换标准基因名。
1.2 当归-川芎药对治疗PD 的靶点的筛选 基于Genecards 数据库,以“Primary Dysmenorrhea”为关键词检索,收集UC 疾病靶点,以Excel 格式导出,然后将1.1 中成分靶点的标准基因与疾病靶点基因取交集,作为当归-川芎药对治疗PD 的靶点。
1.3 活性成分-靶点网络的构建 将1.1 中成分和靶点信息处理后导入Cytoscape 软件中绘制活性成分-靶点网络图,然后对网络进行拓扑结构分析,其中不同类型节点分别代表有效成分和靶点,边代表两者之间的关系。再根据节点连接度(Degree)和介数中心性(BC)对网络图进行调整,节点的大小反映Degree 的大小。
1.4 蛋白质相互作用网络(PPI)的构建及其核心靶点的筛选 蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络是从生物化学、信号转导和遗传网络的角度研究成分和疾病相关蛋白之间的相关性[8]。使用在线韦恩图工具,获取药对成分靶点和疾病靶点的交集基因,将交集基因导入STRING 数据库进行分析,将分析数据以TSV 格式导出,导入Cytoscape 软件,绘制当归-川芎药对与PD 靶点的PPI 网络,并对网络进行拓扑结构分析,再使用“Generate style from statistics”工具对网络节点的大小和颜色进行设置。网络图中节点的大小、颜色深浅代表Degree 值的大小,边的粗细反映了Combine Score 的大小,从中筛选出Degree 值和接近中心度排名靠前的靶点作为核心靶点。
1.5 核心靶点的通路分析 DAVID 数据库能提供系统的生物功能注释信息,进行基因本体论(gene ontology,GO)富集分析和KEGG 通路分析,由此挖掘特定基因或蛋白的生物学意义[9]。将当归-川芎药对治疗PD 靶点导入DAVID 数据库,并限定物种为人,进行基因功能注释分析和功能富集分析,然后导出数据,对生物过程(P<0.01)和信号通路(P<0.05)进行筛选,并进行绘图。
2 结果
2.1 当归-川芎药对活性成分的确定 在TCMSP 数据库中检索到“当归”“川芎”得到化学成分314 个,其中125 个来自当归,189 个来自川芎。以OB≥30%和DL≥0.18 筛选出活性成分9 个,其中2 个来自当归,7 个来自川芎,包括β-谷甾醇、豆甾醇、谷甾醇、叶酸、亚油酸乙酯、杨梅酮、川芎哚、川芎萘呋内酯、洋川芎醌碱,具体信息见表1。检索得到9 个成分对应靶点111 个:β-谷甾醇对应靶点38 个,豆甾醇对应靶点31 个,谷甾醇对应靶点3 个,叶酸对应靶点3 个,亚油酸乙酯对应靶点3 个,杨梅酮对应靶点25 个,川芎哚对应靶点4 个,川芎萘呋内酯对应靶点4 个,洋川芎醌没有对应靶点。将所得靶点蛋白名称转换为标准基因名,删除重复和无效靶点,共获取当归-川芎药对成分作用靶点69 个。
表1 当归-川芎中9 个活性成分的基本信息
2.2 活性成分-靶点网络 活性成分-靶点网络共包括77 个节点(8 个活性成分节点,其中1 个成分没有对应靶点,69 个靶点节点)和111 条边,见图1。分析网络可知,1 个活性成分平均作用13.88 个靶点,1 个靶点平均作用1.61 个活性成分。从活性成分的角度,8 个活性成分中作用靶点数量最多的前3个成分为DG-1(β-谷甾醇)、DG-2(豆甾醇)、CX-4(杨梅黄酮),分别能与38、31、25 个靶点发生相互作用。从靶点的角度,度值排名前5 位的是PTGS2、NCOA2、PTGS1、PRKACA、SCN5A,分别能与6、5、4、3、3 个活性成分发生相互作用。
图1 当归-川芎活性成分-靶点网络图
2.3 成分靶点与疾病靶点的交集 通过数据库获得当归活性成分作用靶点69 个,川芎活性成分作用靶点42 个,PD352 个相关基因。通过在线韦恩图得出当归、川芎与PD 共有基因4 个,分别是PTGS1、PTGS2、PGR、ADRB2;当归与PD 的共有基因8 个,分别是BAX、BCL2、CASP3、CHRM2、CHRM3、OPRM1、TGFB1、PLAU;川芎与PD 的共有基因4 个,分别是ESR1、ESR2、PPARG、KDR。当归-川芎药对活性活性成分作用靶点与PD 共有16 个交集基因,见图2。
图2 交集基因的韦恩图
2.4 PPI 网络分析 将交集基因导入STRING 数据库进行分析显示,PPI 网络包含15 个节点(其中CHRM3 靶点与其他靶点没有连接关系),34 条边,平均节点Degree 值为4.25。网络中Degree 值排名前5 的靶点分别是CASP3、PTGS2、ESR1、TGFB1、KDR、PPARG。从STRING 数据库中将分析数据以TSV 格式导出,然后导入Cytoscape 软件中,绘制当归-川芎药对与UC 靶点的PPI 网络图,见图3。
图3 当归-川芎作用靶点与PD 蛋白互作网络图
2.5 功能注释分析和富集分析 当归-川芎药对与PD 的交集基因共在108 个(P<0.05)GO term 上富集,其中生物过程(BP)78 个,分子功能(CC)11 个,细胞组成(MF)19 个,见图4。主要涉及生物学功能与过程包括雌二醇调节、类固醇激素介导的信号通路、NO 生物合成过程的正向调节、糖皮质激素反应等;交集基因共在62 条(P<0.05)通路上富集,主要通过调控雌激素信号通路、NF-κB 信号通路、细胞凋亡等发挥作用,见图5。
图4 GO 富集分析图
图5 KEGG 富集分析的16 条通路图
3 讨论
原发性痛经的发病机制可能与前列腺素水平升高、白细胞介数水平升高、血管内皮细胞功能障碍和经期体内激素水平的变化密切相关[1]。前列腺素水平升高可使子宫平滑肌的血流量减少,出现收缩甚至痉挛,增加周围神经对疼痛的敏感性。研究表明[10],与生殖系统密切相关的前列腺素是PGE2和PGF2α,在月经周期的不同阶段子宫内膜中二者的含量呈周期性变化。黄体期及月经期子宫内膜产生的前列腺类产物增多,黄体期PGE2的含量比PGF2α 高,而月经期则相反。此外,原发性痛经与经期性激素变化也有关,雌二醇(E2)可使子宫肌细胞的钙离子内流,引起子宫收缩,同时还可以通过激活磷酸肌醇循环,促进PGF2α 的合成,降低疼痛阈值。本研究药对中当归为气中之血药,擅补血活血、调经止痛;川芎为血中之气药,可活血行气、祛瘀止痛,二药配伍,既可补血活血以调经,又能行气祛瘀以止痛[5]。
本研究活性成分-靶点网络中当归-川芎药对中8 个活性成分通过作用于69 个靶点发挥药理作用,同时网络中度值排名前2 个活性成分分别是β-谷甾醇和豆甾醇,二者均证实有明显的抗炎作用。β-谷甾醇通过提高抗炎因子IL-10 的活性,减小趋化因子和促炎因子活性等抑制核转录因子(NF-κB)的迁移[11]。豆甾醇可明显减少由脂多糖刺激增多的致炎因子环氧化酶-2 和诱生型一氧化氮合酶mRNA 的表达,进而减少PGE2 和NO 的释放发挥抗炎作用[12]。从活性成分-疾病交集靶点可知,当归-川芎药对治疗原发性痛经是多靶点协同作用的,如调节炎症细胞因子TGFB1 和PTGS2,作用于阿片样物质受体OPRM1 等;GO 富集分析显示,疾病靶点主要富集在BP 环节,如雌二醇调节、类固醇激素介导的信号通路、NO 生物合成过程的正向调节、糖皮质激素反应等;从DAVID 通路分析显示,疾病靶点涉及的通路与PD 相关包括雌激素信号通路、NF-κB 信号通路、细胞凋亡等,其中雌激素信号通路涉及的靶点有IL6、TNF、SLC2A4、PTPN1、INSR,NF-κB 信号通路涉及的靶点有TNF、SLC2A4、INSR,细胞凋亡涉及的靶点有SLC2A4、PTPN1、INSR。
综上所述,当归-川芎药对中多个成分作用于多个靶点和通路,可发挥治疗PD 的作用。