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常染色体和X染色体遗传标记分析同父异母半同胞关系1例

2021-06-17刘岩郝世诚张金佩刘革新袁丽

法医学杂志 2021年2期
关键词:等位基因分型同胞

刘岩,郝世诚,张金佩,刘革新,袁丽

1.中国政法大学 证据科学教育部重点实验室,北京 100088;2.司法文明协同创新中心,北京100088

1 案 例

1.1 简要案情

在一起遗产继承纠纷案件中,赵1(女)、赵2(女)、陈某(男)、赵3(男)为全同胞的兄弟姐妹,父母已故,在案件办理过程中查到邢某(女)可能为上述4 人同父异母的姐姐,故法院委托本中心对邢某与赵1、赵2、陈某、赵3 之间是否存在同父异母半同胞关系进行鉴定。

1.2 检验过程

采集5 人的血痕样本,按照《法庭科学DNA 实验室检验规范》(GA/T 383—2014)中的方法进行检验。采用GSTARTM25 试剂盒(北京金马晟和科技有限公司)直接扩增上述5 人的血样DNA。使用Chelex-100法提取邢某、赵1、赵2 的样本DNA,采用Goldeneye®DNA 身份鉴定系统17X[基点认知技术(北京)有限公司]和MicroreaderTM19X ID System(北京阅微基因技术股份有限公司)扩增模板DNA。扩增产物经3130基因分析仪(美国Applied Biosystems公司)检测、Gene-MapperTMID-Xv1.4 软件(美国Applied Biosystems 公司)分析,获得各基因座的基因型。

1.3 家系重建及统计学分析

1.3.1 常染色体STR的检验结果

使用GSTARTM25试剂盒检测赵1、赵2、陈某、赵3和邢某的基因分型,并根据赵1 等4 人的基因分型推导出其父母的常染色体STR 分型组合,结果见表1。根据孟德尔遗传定律,如果邢某与赵1 等系半同胞关系,在不发生遗传突变的情况下,邢某的每一个常染色体STR 基因座上至少有1 个等位基因可以在上述4 人推导出的其父母完整等位基因中找到来源。经比较,未发现可以排除邢某与赵1 等系同父异母半同胞关系的依据(表1)。采用ITO 法[1-2]计算邢某与赵1 等4 人之间的半同胞指数(half sibling index,HSI),邢某与赵1、赵2、陈某、赵3的HSI分别为5.7524、3 163.6、1 315.1、60.458,不排除邢某与赵1、赵2、陈某、赵3 之间存在半同胞关系。

表1 由赵1等4人推导出其父母常染色体STR分型组合以及与邢某的比较结果Tab.1 The parental autosomal STR typing combination deduced from Zhao 1 and others and compared with Xing

1.3.2 X染色体STR的检验结果

使用Goldeneye®DNA 身份鉴定系统17X、MicroreaderTM19X ID System 检测邢 某、赵1 和赵2 的X 染色体STR(X chromosome STR,X-STR)基因分型,并根据赵1 和赵2 的基因型推导出两人生物学父亲的X-STR 基因分型,结果见表2。在被检测的每个XSTR 基因座上,邢某的分型结果与由赵1、赵2 推导的生物学父亲的基因型表现为符合遗传规律。按照《法医物证鉴定X-STR 检验规范》(SF/Z JD0105006—2018)中同父异母半同胞姐妹关系指数的计算方法,计算上述X-STR 基因座的似然率(likelihood ratio,LR)。X-STR 有4 个连锁群,本例涉及的连锁群有连锁群1(DXS10135/DXS8378)、连锁群2(DXS7132/DXS10079)和连锁群4(DXS10134/DXS7423),在计算X-STR 的半同胞似然率时,连锁群需采用连锁基因座间的单倍型频率进行计算。结合赵1、赵2 和刑某的X-STR分型结果,按照DXS10135/DXS8378(19/10)、DXS7132/DXS10079(15/20)和DXS10134/DXS7423(38/14)的单倍型频率分别计算赵1、赵2 与邢某之间的半同胞姐妹似然率。对所有基因座进行综合分析,邢某与赵1、赵2 的同父异母半同胞姐妹似然率分别为1.264 0×106、1.580 0×105,不排除邢某与赵1、赵2 之间存在半同胞关系。

表2 由赵1和赵2推导出其父亲的X-STR等位基因分型以及与邢某的比较结果Tab.2 X-STR typing of the father deduced from Zhao 1 and Zhao 2 and compared with Xing

2 讨论

半同胞关系鉴定通常是在父母一方或双方缺失的情况下,由于认亲、移民及财产继承等需要而进行的复杂亲缘关系鉴定,如果仅采用ITO 法计算两个体之间的HSI,即使大量增加常染色体STR 基因座检测数,有时也不能提高HSI[3-4],从而无法给出明确意见。反之,如果详细了解亲属情况,增加更多亲属参与鉴定,在联合常染色体和X 染色体遗传标记分析的基础上,某些情况下还是有较大机会给出明确意见的。

分析本例的家庭情况,双方父母都已去世,不能参与鉴定,故要求赵1 等姐弟4 人参与鉴定,结合常染色体和X 染色体遗传标记利用家系重建法[5-7]、ITO 法和X-STR的半同胞姐妹似然率计算来完成委托任务。

通过分析赵1 等姐弟4 人的常染色体STR 分型结果,可以获得其父母的等位基因,如果邢某与赵1 等系半同胞关系,则在不发生遗传突变的情况下,邢某在每一个常染色体STR 基因座上至少有1 个等位基因可以在推导出的父母完整等位基因中找到来源,否则可以提供排除的依据。

X 染色体的遗传特征是,女儿的X 染色体中,一条来自其生物学父亲,一条来自其生物学母亲,如果遗传过程中不发生基因突变,则在每一个X-STR 基因座上,同父异母半同胞的姐妹之间会表现为至少有1 个相同的等位基因。根据赵1 和赵2 的X-STR 分型结果,推导出其生物学父亲的X-STR 分型,与邢某进行比较,未发现排除父女关系的依据。

X-STR 有4 个连锁群,本例检验涉及的连锁群有连锁群1(DXS10135/DXS8378)、连锁群2(DXS7132/DXS10079)和连锁群4(DXS10134/DXS7423),在计算X-STR 的半同胞似然率时,连锁群需采用连锁基因座间的单倍型频率进行计算。

综上所述,在半同胞关系鉴定中,应让尽量多的相关人员参与鉴定,采用多类型的遗传标记进行检验,通过家系重建的方法,提供有效的认定或排除信息,如果未发现排除信息,可结合常染色体和X-STR基因座检验结果,根据ITO 法和《法医物证鉴定XSTR 检验规范》(SF/Z JD0105006—2018)技术规范计算似然率,并出具鉴定意见。

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