河南省地方猪遗传资源保护状况评价及对策探讨

刘 贤，吴胜军，李志明，茹宝瑞，薛亚辉，李新建*

（1.河南省畜牧总站，河南郑州 450008；2.河南农业大学动物科技学院，河南郑州 450046）

畜禽遗传资源是生物多样性的重要组成部分，是提升种业国际竞争力、实现畜牧业可持续发展的基础，同时还可满足人们多样化消费需求，提高国民生活质量和水平[1]。近些年来，国家和各级政府对畜禽遗传资源保护工作重视程度不断提高，以政策和资金大力扶持，畜禽遗传资源保护体系初步形成[2]。河南省有淮南猪、南阳黑猪、确山黑猪、豫西黑猪4 个地方猪遗传资源，分别建设有淮南猪国家级保种场和南阳黑猪、确山黑猪2个省级保种场，保种场的建设使优良种质得以保存，但是改革开放以来，随着社会经济发展、畜牧业生产方式转变，以及国外高瘦肉率猪种的引进，地方猪遗传资源的生存环境发生了改变，使河南省大部分地方猪群体数量急剧下降，加之长期的无序杂交、保种方法不科学等因素，导致一些优秀基因在尚未研究其价值之前丢失，对地方猪的遗传多样性造成影响。本研究旨在通过对河南省淮南猪、南阳黑猪、确山黑猪及近期发现的豫西黑猪4 个地方猪品种生存状况的调查和评价，为河南省地方猪保种工作提供参考。

1 材料与方法

1.1 实地调查 2017 年6 月，在淮南猪、确山黑猪、南阳黑猪、豫西黑猪中心产区和分布区域，对各品种分布、数量、品种保护和开发利用等情况进行调查。

1.2 文献调研 查阅《中国畜禽遗传资源志.猪志》[3]、《河南省地方优良畜禽品种志》[4]等相关文献。

1.3 受威胁程度评价 按照Simon[5]以及马月辉等[6]提出的畜禽遗传资源受威胁程度评价方法进行评价。

1.3.1 受威胁程度 根据各品种保存100 年的近交系数，可将受威胁程度分为安全、潜在威胁、最低威胁、威胁、严重威胁5 类。根据马、牛、羊、猪、禽的世代间隔及保存100 年的近交系数，得出群体有效大小，见表1。

1.3.2 有效群体大小 有效群体大小按照公式Ne=4Nm Nf/（Nm+Nf）进行计算，其中，Nm为参加繁育的公猪数量，Nf为参加繁育的母猪数量。

1.3.3 群体动态变化趋势和外来种杂交因素影响 群体动态变化趋势和杂交程度是受威胁程度的影响因素，因此，当出现繁育母畜数下降且低于1 000，或群体数量下降幅度大于50%，或群体杂交比例大于20%的情况之一时，将分类等级划到威胁程度高一级类型。

1.4 群体遗传多样性分析 在地方猪保种场内采集南阳黑猪、确山黑猪、淮南猪及豫西黑猪的耳组织样品，提取DNA 并经电泳检测质量。进行PCR 扩增，上游引物为：5'-AGGAGACTAACTCCGCCAT-3'，下游引物为：5'-CGCGGATACTTGCATGTGT-3'。将产物电泳检测合格后进行Sanger 双向测序。使用DNAstar 将序列核对和拼接；利用DNAsp 统计单倍型数量、单倍型多样度、核苷酸多样度、Tajima's D、Fu's FS；使用Mega 以邻接法（NJ 法）构建进化树。

表1 各受威胁等级群体有效大小

2 结果与分析

2.1 分布区域及变化情况 由表2 可见，与2006 年相比，2017 年淮南猪、南阳黑猪、确山黑猪3 个地方猪遗传资源的分布范围基本无变化。豫西黑猪为新发现资源，分布范围变化情况未知。

表2 2006 年和2017 年河南省地方猪品种分布范围

2.2 存栏数量及变化趋势 河南省地方猪品种存栏数量见表3，2017 年淮南猪与南阳黑猪存栏数量比2006 年分别下降了56.7%、75.7%，确山黑猪存栏数量比2006年增加了207.7%，豫西黑猪由于发现时间较短，部分资料暂时缺失。

表3 1986—2017 年河南省地方猪品种存栏量 万头

2.3 受威胁程度评价结果 由表4 可知，淮南猪处于受严重威胁状态，南阳黑猪处于受威胁状态，确山黑猪存在潜在威胁。豫西黑猪为新发现畜禽遗传资源，无2006 年群体数量，无法开展评价。

2.4 河南地方猪遗传多样性分析 对4 个地方猪群体进行基于线粒体DNA D-loop 序列的遗传多样性分析，结果见表5，河南省地方猪的单倍型多样度（Hd）在0.788 2～0.854 5，核苷酸多样度（Pi）在0.003 6～0.004 6；中性检验的Tajima's D 值在-1.254 2～0.987 6，Fu'Fs 值在-11.043 4～3.403 6，且差异均不显著（P＞0.05），说明这4 个群体符合中性进化。

表4 河南省3 个地方猪遗传资源受威胁程度评价结果

表5 河南地方猪线粒体DNA D-loop 区遗传多样性指数

对4 个地方群体间的群体分化系数（Fst）和遗传距离进行分析，结果见表6。结果显示，Fst 范围在0.077 0～0.171 6，其中，遗传分化最小的是南阳黑猪和确山黑猪，遗传分化最大的是淮南猪和确山黑猪；基于Nei's 遗传距离数值范围在0.004 9～0.010 0，其中，遗传距离最小的是豫西黑猪和确山黑猪，遗传距离最大的是南阳黑猪和淮南猪。分析结果显示了4 个群体各自的品种特异性与地域性。

表6 河南地方猪群体的遗传距离和遗传分化指数

对河南省4 个地方猪种进行聚类分析，结果见图1，与其他猪种相比，南阳黑猪与确山黑猪亲缘关系较近，聚为同一分支；淮南猪与其他地方猪种亲缘关系则较远，这与其地域分布关系也较为相符。

图1 基于Nei's 遗传距离构建的河南4 个地方猪群体的NJ 系统发育树

3 讨 论

3.1 分布范围变化分析 淮猪分布于淮河流域，包括淮北猪、山猪、灶猪、定远猪、皖北猪和淮南猪6 个类群，淮南猪主产于河南省信阳市的固始、商城、光山、罗山、新县五县，据当地史料记载该品种在当地已有一千多年的历史[3,7]；南阳黑猪主产区淅川县地处伏牛山南麓，地形主要为浅山、丘陵和缓坡；确山黑猪主产区确山县东临黄淮平原，西为桐柏山、伏牛山的连接地带；豫西黑猪主产区为豫西山区的栾川、卢氏两县，该区域山势陡峭，道路崎岖，长期处于一种自然半封闭状态。经考证，在豫南、豫西南和豫西的山区群众都有食用黑猪肉和制作腊肉的传统习俗。地方猪分布范围未发生变化，说明淮南猪、南阳黑猪、确山黑猪和豫西黑猪的原产地具有一定的封闭性，传统的养殖习俗和饮食文化保留较好。

3.2 数量变化分析 20 世纪60 年代以来，为满足人民对瘦肉型猪肉的需求，我国大量从国外引进猪种，开展猪杂交改良工作，对我国地方猪种造成了极大地冲击，存栏数量下降，选育工作几乎停滞，保种几乎名存实亡[8-9]。近年来，由于畜牧业处于转型升级发展时期，地方品种虽然具有耐粗饲、抗逆性强等优点，但由于长期以来粗放饲养，尤其是在保种群不允许选择的情况下，地方品种的一致性较差[10]，不适合当前畜牧业的标准化集约化生产方式。另外，保种场人员结构老化、机制不灵活、地方猪保种目标不明确、技术开发和应用严重滞后等因素，也使得地方猪优质特色不能发挥，因而地方猪保种工作举步维艰[11]。最后，地方猪种质资源优异特性未被深入挖掘，其价值得不到体现[12]，导致在地方猪开发利用过程中，产品种类单一、附加值低，优质优价的市场机制尚未形成，市场综合竞争力较弱。综上所述，受以上因素影响，河南省地方猪存栏数量逐年下降。

3.3 受威胁程度分析 淮南猪、南阳黑猪纯种数量的下降，势必导致参与繁育的种猪数量下降，群体有效含量低，存在近交系数上升的风险。确山黑猪虽然群体数量上升，但是主要集中在保种场养殖，保种场内血统数量有限，近交风险仍较大，因此仍存在潜在威胁。豫西黑猪由于发现时间较短，“提纯复壮”仍然是近期的工作重点。

3.4 遗传多样性分析 本研究中的4 个河南地方猪群体中，单倍型多样度在0.788 2～0.854 5、核苷酸多样度在0.003 6～0.004 6。本研究中的群体单倍型多样度值低于二花脸猪（0.947）、桂中花猪（0.942）、合作猪（0.883），与保山猪（0.828）、五指山猪（0.838）处于同等水平；核酸多样度低于陆川猪（0.007 4）、滇南小耳猪（0.005 21）、合作猪（0.005 49），与二花脸猪（0.003 73）、保山猪（0.003 71）、五指山猪（0.003 34）处于同等水平[13-16]。这说明河南省地方猪群体的遗传多样性遭受威胁，急需种质资源保护。

在表示群体间的遗传分化程度时，若Fst 介于0～0.05，表示遗传分化极小；若Fst 介于0.05～0.15，表示遗传分化中等；若Fst 介于0.15～0.25，表示遗传分化较大[17]。本研究中的4 个群体之间属于遗传分化程度中等或较大，可能是由于地形与地势影响了群体之间的基因交流，进而形成了各自的群体特征。

4 结 论

本研究结果显示，河南地方猪遗传资源的分布范围虽然基本未发生变化，但淮南猪、南阳黑猪的群体数量出现大幅下降。淮南猪已处于受严重威胁状态，南阳黑猪处于受威胁状态，确山黑猪存在潜在威胁。豫西黑猪为新发现畜禽遗传资源，有一定群体数量，重点是开展保种和提纯复壮工作。对此提出以下建议：第一，完善河南省地方猪保种体系，采取分点保种、多场保种措施，防止依赖“一点一场”带来的资源流失风险；第二，建设省级地方畜禽品种基因库，开展精液、体细胞等遗传材料保存；第三，建立地方猪品种种质评价体系，加强对优良种质的认定、登记，确保地方品种优良特性不丢失；第四，加大地方猪遗传特性挖掘和利用，提高自主育种能力；第五，加快推进地方猪品种优异性状的开发利用，以优质猪肉开发、延伸产业链条等手段提高产品附加值，形成“以用促保”的良性机制。