长链非编码RNA 在结直肠癌发生发展中的研究现状
2021-03-27王金格黄晶晶霍晓燕孟庆辉梁德森潘华洋
汪 桐 王金格 贾 晨 黄晶晶 霍晓燕 孟庆辉 梁德森 潘华洋
1.哈尔滨医科大学附属第一医院普外科,黑龙江哈尔滨 150001;2.哈尔滨医科大学护理学院,黑龙江哈尔滨 150086;3.哈尔滨医科大学附属第二医院护理教研室,黑龙江哈尔滨 150086;4.哈尔滨医科大学附属第一医院儿科,黑龙江哈尔滨 150001
结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是一种常见的消化道恶性肿瘤,近年来我国CRC 的发病率大幅增加,2018 年在我国所有恶性肿瘤中,CRC 的发病率排第3 位,死亡率排第5 位[1]。CRC 已严重威胁人类健康,所以寻找新的CRC 诊断标志物和治疗靶点是至关重要的。大量研究发现,异常表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)与CRC 的发生发展密切相关[2]。本文针对lncRNA 在CRC 中的既往研究进行综述,旨在为寻找CRC 诊断标志物和治疗方案提供新的思路。
1 lncRNA 概述
lncRNA 是由RNA 聚合酶Ⅱ转录,长度>200 个核苷酸的RNA 分子,广泛存在于细胞核和细胞质中[3]。lncRNA 在广义上(相对于蛋白编码基因)可以分为5 类:正义lncRNA、反义lncRNA、基因间lncRNA、内含子lncRNA、双向lncRNA[4]。lncRNA 缺乏开放阅读框而不能编码蛋白质,所以对lncRNA 的研究在过去很长一段时间内进展缓慢。随着被发现的特征性lncRNA数量的增加,已经证实lncRNA 可以通过表观遗传调控、剪接调控、转录和转录后调控等多维度发挥抑癌或致癌的作用[5]。目前研究显示,lncRNA 主要通过以下方面调节靶基因的表达:①lncRNA 在不同的功能步骤上调控染色质结构,如组蛋白修饰、DNA甲基化和染色质重塑;②与信使RNA(mRNA)形成双链RNA 复合物,指导mRNA 选择性剪切;③Dicer 酶作用于lncRNA 和mRNA 形成的互补双链,产生内源小干扰RNA(siRNA);④与特定蛋白结合,改变蛋白质的细胞定位和活性;⑤直接与蛋白结合形成蛋白复合体,改变其功能;⑥与微RNA(miRNA)相互作用(海绵化)来调控靶基因表达;⑦编码蛋白基因上游启动子区转录,调节下游基因的表达[6-8]。
2 CRC 诊断相关的lncRNA
2.1 lncRNA CCAT
CCAT1 和CCAT2 是在人类染色体8q24 被转录的lncRNA。Nissan 等[9]首次发现CCAT1 在CRC 和癌前病变组织中明显高表达。Chen 等[10]在对27 对CRC的癌及癌旁组织RNA 进行RT-qPCR 检测证实了上述结果,且CCAT1 通过靶向miR-181b-5p 上调肿瘤抑制候选基因3 的表达,从而促进CRC 的发生。也有研究发现CCAT1 通过下调miR-185-3p、上调肌球蛋白轻链激酶的表达,促进炎症性肠病向CRC 转变[11]。Ling 等[12]首次研究发现,CCAT2 通过与转录因子TCF7L2 直接结合增强了对Wnt 信号通路的反应,此外CCAT2 与CCAT1 联合检测可以更有效地诊断早期CRC。
2.2 lncRNA 91H
91H 是H19 反义lncRNA,位于H19/IGF2 位点。91H在CRC 血清外泌体中过度表达,通过与异质性核糖核蛋白K(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K,HNRNPK)相互作用,调控大肠癌的发生[13]。Liu 等[14]在早期CRC 患者血浆外泌体中发现91H 表达明显上调,其敏感度和特异度分别是84.48%和80.36%。此外,91H 通过与IGFBP2 结合导致胰岛素样生长因子2高表达,从而激活PI3K/Akt 和mTOR 通路并促进肠癌发展。鉴于91H 具有较强的肠癌特异性,而且在早期CRC 血浆中阳性率高,因此其有望成为CRC 早期非侵入性诊断的生物标志物。
2.3 lncRNA APC1
APC1 是位于人类染色体19p12 上的一种肿瘤抑制因子,其低表达与肿瘤较高TNM 分期和预后不良有关。Wang 等[15]发现APC1 直接与Rab5b 直接结合,从而抑制了内皮细胞中MAPK 通路的过度激活,进而抑制血管生成。此外,APC1 可能通过非经典Wnt 通路的APC 信号转导参与CRC 的发生发展,颠覆了对经典Wnt 通路的认知,这为寻找潜在的CRC 诊断标志物和治疗靶点提供了新的思路。
3 CRC 治疗相关的lncRNA
3.1 lncRNA MEG3
MEG3 是在人类染色体14q32.3 上被转录的lncRNA,是研究最多的抑癌分子之一。Zhu 等[16]研究显示维生素D 通过调控VDR 与MEG3 启动子结合来激活MEG3 转录,进一步下调MEG3 与调控因子聚集素的结合来抑制CRC 增殖和侵袭。另有研究显示,通过外源性转染导入MEG3 可调控miR-141/PDCD4轴增强CRC 细胞对奥沙利铂(L-OHP)的敏感性来增强化疗效果,这揭示了MEG3 的表达干预有望成为CRC 治疗的新靶点[17]。
3.2 lncRNA H19 和lncRNA UCA1
H19 是第一个被发现的与恶性肿瘤发生发展密切相关的lncRNA。Ding 等[18]发现H19 海绵化miR-29b-3p,导致颗粒蛋白前体高表达,从而诱导上皮-间质转化过程。此外,Wang 等[19]发现H19 海绵化吸附miR-194-5p,逆转了miR-194-5p 对信息调节因子2 相关酶类1 的抑制,因此增加了对5-FU 的耐药性。UCA1 发挥促癌作用机制与H19 类似。UCA1/miR-143/MYO6 轴抑制CRC 细胞凋亡及G2/M 期阻滞,降低CRC 细胞对放疗的敏感性[20]。
3.3 lncRNA CRART16
Zhang 等[21]研究发现CRART16 在抗西妥昔单抗治疗的CRC 细胞中表达上调,过表达的CRART16 海绵化miR-371a-5p 进而增加下游靶点ERBB3 基因的表达,反过来抑制西妥昔单抗引起的G0/G1期阻滞,此外过表达的CRART16 也可以促进肿瘤细胞干性转化。因此CRART16 可作为西妥昔单抗耐药的CRC 患者的敏感治疗靶点。
3.4 lncRNA MIR17HG
MIR17HG 是一种与免疫调控相关的lncRNA,它在癌旁组织、腺癌组织和CRC 组织中的表达逐渐升高。Xu 等[22]研究发现,MIR17HG 可以与程序性死亡配体-1(programmed death-ligand 1,PD-L1)直接结合并上调PD-L1 的表达,通过特异性敲除MIR17HG,PD-L1 的表达下调,证实MIR17HG 可以在蛋白水平上调节PD-L1 的表达。众所周知PD-L1 是阻碍T 细胞活化的关键因素,因此干扰MIR17HG 表达可能对CRC 免疫治疗产生协同效应[23]。
4 CRC 转移及预后相关的lncRNA
4.1 lncRNA MALAT1
MALAT1 在多种肿瘤中具有促癌的作用。Sun 等[24]研究发现YAP1 蛋白通过增强MALAT1 海绵化miR-126-5p 来增促进CRC 细胞增殖、侵袭和血管生成。此外敲低MALAT1 可以降低维持肿瘤干细胞性的重要蛋白Oct4 的表达,从而抑制CRC 干细胞的自我更新和细胞代谢[25]。但是随着研究的逐渐深入,Chen 等[26]发现MALAT1 在CRC 和乳腺癌组织中的表达均下调,MALAT1 通过与转录因子TEAD 结合而起到抑癌的作用,这可能源于MALAT1 在不同肿瘤中作用的异质性。
4.2 lncRNA HOTAIR
近年来,研究表明HOTAIR 在多种癌症中明显过度表达,尤以CRC 合并肝转移的患者血液中表达量为高[27]。Pan 等[28]研究发现,HOTAIR 直接包含miR-326 结合位点并调控FUT6(一种特定的岩藻糖基转移酶)的表达,从而触发了PI3K/Akt/mTOR 信号转导通路,导致肠癌肝转移。因此HOTAIR 可以作为预测CRC 患者预后和监测复发情况的有效工具。
4.3 结直肠癌糖酵解相关的lncRNA
肠癌中有关糖酵解的研究尚在起步阶段,但已经引起了广大学者的关注。Tang 等[29]发现葡萄糖饥饿条件下,过表达的GLCC1 与HSP90 直接结合,从而抑制MYC 的泛素化降解,并进一步促进MYC 靶基因LDHA 的表达,激活糖酵解代谢的过程。Feng 等[30]发现高表达的LINC00504 也可以与MYC 直接结合形成复合物,在不改变MYC 稳定性的前提下,增加了MYC 的聚集,增强了MYC 的反式激活效力;此外,两者的过表达还可产生协同作用,进一步促进CRC 细胞的有氧糖酵解。而LINRIS 通过泛素化-自噬途径阻断IGF2BP2 的降解,最终下调MYC 介导的糖酵解代谢,抑制了体外和体内CRC 细胞的增殖。由此可见,与肿瘤细胞糖酵解代谢有关的lncRNA 可以作为预测肠癌预后的潜在生物学标志物[31]。
4.4 lncRNA XIST 和lncRNA CRNDE
几乎所有与CRC 相关的lncRNA 都在表观遗传学水平上受到影响,进而参与恶性肿瘤相关生物活性的调节。甲基转移酶样蛋白14 可以促进XIST 的m6A甲基化,最终被“阅读器”蛋白YTHDF2 识别和结合,才能完成整个表观遗传沉默过程[32]。CRNDE 通过结合EZH2 来抑制DUSP5,从而激活MAPK 信号通路并诱导CRC 细胞中H3K27 甲基化,并导致肿瘤抑制因子在表观遗传学层面被沉默[33]。这些研究成果加深了我们通过表观遗传学调控CRC 进展对lncRNA 的认识,为进一步探究CRC 发生发展的机制提供了方向。
5 小结
生物基因组学时代最令人欣喜的是lncRNA—这一重要非编码RNA 的发现,随着RNA 测序和生物信息学技术的发展,越来越多的lncRNA 逐渐被发现,失调的lncRNA 通过调节转录、翻译和翻译后水平的基因表达和功能来调控CRC 的发生发展。但lncRNA在结直肠癌中作用机制的研究仍处于初期阶段,只有少数的lncRNA 的具体作用机制被详细阐明。且某些lncRNA 如MALAT1 在结直肠癌中的功能仍存在争议,当前关于lncRNA 在CRC 微环境及代谢中的重要作用逐渐成为研究热点。因此进一步研究lncRNA 在CRC 发生发展过程中的确切功能及互相调控干扰机制至关重要,这将为突破CRC 现有的诊断和治疗方法提供新的思路和方向。