浅谈Delta变异株
2021-02-23郭育
郭育
【摘要】在新冠病毒(SARS-CoV-2)大流行的两年时间里,全球科研人员已对数以万计的新冠病毒流行株进行了基因测序。至少有五种变体被认为是对人类社会有害的 SARS-CoV-2 变体。其中Delta变异株因其广泛的传播性,引起了世界各国的高度关注。本文将从传染性、毒性、致病性、疫苗有效性、如何预防感染对该毒株进行描述。
【关键词】新冠病毒;Delta变异株;传染性;毒性;致病性;疫苗有效性;预防感染
中图分类号:R373 文献标识码:A
Delta 新冠病毒变异株于2020 年 10 月首次在印度被发现,Delta变异株在短短几个月内迅速波及至全球多个国家,甚至一度引起民众恐慌,因其快速的传播、强大的毒力及疫苗突破性,世界卫生组织将其列为“关注变异株”。本文将从该毒株的毒性及传染性、致病性、疫苗有效性、如何预防感染进行描述,希望在为相关感染防控提供可用数据的同时普及民众对该毒株的认识。
传染性
目前Delta毒株已蔓延至全球至少162个国家,并在许多国家引发了新一波的COVID-19疫情,据our world in data中上报的数据显示,现在疫情严重的欧美国家,delta毒株独占鳌头,成为全球的绝对优势流行毒株,其也是迄今为止传染性最强的 SARS-CoV-2 变种。与原始毒株相比, Delta 变体的繁殖数量要高得多,Delta变体平均 R0 为 5.08,远高于原始毒株的 R0 2.79。一篇在预印本网站 medRxiv 上发表的研究表明,Delta突变株从首次接触到PCR检测阳性平均是4天,而2020年感染原始菌株的时间则为6天,表明Delta毒株在人体内的复制速度更快,而且感染Delta突变株的人体内产生了更多的病毒,感染 Delta 变体的患者的病毒载量是对照组的 1260 倍。这也是Delta突变株如此“成功”、得以迅速传播的重要原因。科学家经过对该毒株的研究确定了之所以如此广泛快速传播的原因。谱系高度保守的P681R 突变,其促进了弗林蛋白酶(furin)介导的刺突蛋白(S蛋白)的切割,导致病毒更容易侵入人体细胞。这也使得Delta与野生毒株以及 Alpha 毒株相比,具有让病毒侵入人体的蛋白酶裂解变得更加容易的特性,从而使得传播更容易。此外,Delta 变体中的其他突变可以帮助它逃避免疫,国外的一项研究证实了这种免疫逃逸的存在。在病毒的 NTD 中的一个点确定为“超级位点”,亦是抗体的“超强”中和目标。但 Delta 独特的突变是删除了人类抗体直接结合的接触点。科学家认为,正是这一改变赋予了 Delta 更多的免疫逃避表型,这也使得该毒株更易传播。对于 Delta毒株强劲的传播态势,众多研究者认为,它最有可能是由增加的传染性和免疫逃避的组合来解释。
毒性
一般来讲病毒在进化和变异的过程中,会向低毒性和更强的传染性的方向发展,这是长期的必然的趋势。但是Delta 变体虽然传染性有所增强,但是其作为变异株在短期内其毒性并未减弱。加拿大安大略省的一项回顾性队列研究表明:新冠病毒Delta毒株的毒性远远强于原始毒株。研究团队统计显示,Delta毒株造成住院的风险是原始毒株的2.08倍,造成ICU的风险是原始毒株的3.35倍,造成死亡的风险是原始毒株的2.33倍。
对人的致病性
由于其较强的毒性及传染性,导致非疫苗接种群体感染率升高,且重症率较以往有所上升。我国临床研究表明,Delta 变异毒株引起的新冠肺炎潜伏期短,临床症状重,而且核酸转阴时间较长。而且在完成第一针接种或者完成2针接种完的人群中,仍有突破性感染。但是与未接种疫苗的患者相比,发生 Delta 变体突破性感染的完全接种疫苗的个体表现出的症状较轻。来自以色列的数据也显示,在完全接种疫苗的工人中,突破性感染症状轻微或无症状[1]。相比早期流行毒株,未接种疫苗的 Delta 株感染者病毒载量增加,住院率、重症率及死亡率具有大幅的上升。
疫苗有效性
Delta变异株不仅肆虐东南亚和非洲国家等疫苗覆盖率低的国家,同时也在疫苗覆盖率高的国家,引发新一轮疫情,值此现状下疫情的再次爆发对疫苗的保护性提出了挑战。当该毒株流行时,疫苗接种率高的国家或人群的重病率和死亡率较低,表明目前的疫苗仍具有一定的保护作用。我国民众目前接种的疫苗主要类型为灭活疫苗,一则国内研究显示国产疫苗预防密接接触者感染的效果为 69% ,预防发展为新冠肺炎的效果为73% ,预防重症效果达 95% 以上,国产灭活疫苗对 Delta 新冠病毒变异株具有较高的保护作用 。国外针对疫苗有效性的研究主要集中在mRNA疫苗及重组腺病毒载体疫苗。虽然疫苗对各类变体均有效,但是针对DELTA毒株来讲其疫苗有效性最低。有研究则表明辉瑞辉瑞mRNA疫苗比阿斯利康重组腺病毒载体更能防御Delta变体病毒。使用辉瑞mRNA疫苗,在Delta變体中疫苗有效性为88.0%。使用阿斯利康重组腺病毒载体疫苗,Delta变体的两剂疫苗的有效性67.0%。不管国内还是国外,各类型的疫苗均对delta毒株均有一定的预防能力,且能大大降低重症率。
预防感染
目前该毒株仍然作为主要毒株在全球迅速蔓延,各国都在紧急开展各项防控措施。为更好的对病毒进行防范,我们仍然要坚守现行的公共卫生和社会防控措施。目前疫苗接种仍是预防新冠肺炎最好的办法,通过接种疫苗,如果人群当中免疫力的达到了一定的阈值,就可以降低新冠的流行强度或者阻断它的流行,以达到降低感染率、降低重症率、降低病死率的目的。两次接种疫苗仍然是预防感染的最有效的办法。故需快速推动疫苗更广泛地覆盖。然而一项研究表明该毒株的最低再生数为 5 ,这意味着需要 80% 以上的疫苗覆盖率才能有效的防止该毒株的传播。但随着与 Delta 变体相关的疫苗有效性降低,需要达到 90% 以上的疫苗覆盖率才能控制 Delta 疫情。但是截止12月7日,相关数据显示:55% 的世界人口至少接种了一剂 COVID-19 疫苗。全球已给药 82.1 亿剂,现在每天给药 3387 万剂。在低收入国家,只有 6.2% 的人至少接受过一剂。目前新冠疫苗接种率离90% 以上的疫苗覆盖率仍有很大差距,故我们在做好当前的防护措施的同时需尽快完成疫苗的高覆盖。
结语
生物界所有的病毒都一样,会随着时间的推移发生新的突变,而且传染性也会逐渐增强,而传染性增强后又会引发新一轮的突变,这是病毒生存的模式,新冠病毒也不例外。故如何管控新冠病毒传播防止新突变形成,成为了控制疫情的重点。我们仍然要坚守戴口罩、保持社交距离、高发或持续传播地域封锁干预措施等基本措施,同时加快疫苗接种,尤其是向疫苗缺乏的国家提供疫苗,以保证全球疫苗高覆盖,再此基础上逐渐开发出以变异为重点的疫苗,从而实现靶向预防,最终达到消灭该病毒的目的。
参考文献
[1]Bian L, Gao Q, Gao F, et al. Impact of the Delta variant on vaccine efficacy and response strategies[J]. Expert Review of Vaccines, 2021, 20(10): 1201-1209. https://doi.org/10.1080/14760584.2021.1976153
[2]Liu Y, Rocklöv J. The reproductive number of the Delta variant of SARS-CoV-2 is far higher compared to the ancestral SARS-CoV-2 virus[J]. Journal of travel medicine, 2021. Journal of Travel Medicine, Volume 28, Issue 7, October 2021, taab124, https://doi.org/10.1093/jtm/taab124
[3]Li B, Deng A, Li K, et al. Viral infection and transmission in a large well-traced outbreak caused by the Delta SARS-CoV-2 variant[J]. MedRxiv, 2021. doi: https://doi.org/10.1101/2021.07.07.21260122
[4] Saito A, Nasser H, Uriu K, et al. SARS-CoV-2 spike P681R mutation enhances and accelerates viral fusion. bioRxiv[J]. Preprint, 2021, 10(2021.06): 17.448820.
[5] Mlcochova P, Kemp S, Dhar M S, et al. SARS-CoV-2 B. 1.617. 2 Delta variant emergence and vaccine breakthrough[J]. 2021. DOI:10.21203/rs.3.rs-637724/v1
[6]Fisman D N, Tuite A R. Evaluation of the relative virulence of novel SARS-CoV-2 variants: a retrospective cohort study in Ontario, Canada[J]. Cmaj, 2021, 193(42): E1619-E1625. DOI: https://doi.org/10.1503/cmaj.211248
[7]史庆丰 ,高晓东 ,胡必杰 .Delta 新冠病毒变异株的特性及流行现状与控研究进展[J].中华医院感染学杂志. 2021 年第 31 卷doi:kns.cnki.net/kcms/detail/11.3456.R.20210707.2126.070.html
[8] Kang M, Xin H, Yuan J, et al. Transmission dynamics and epidemiological characteristics of Delta variant infections in China[J]. Medrxiv, 2021. doi: https://doi.org/10.1101/2021.08.12.21261991
[9] Fisman D, Tuite A. Progressive Increase in Virulence of Novel SARS-CoV-2 Variants in Ontario, Canada, February to June, 2021[J]. medRxiv, 2021.
doi: https://doi.org/10.1101/2021.07.05.21260050
[10] 冯晔囡, 夏影, 陈操, 等. 新型冠状病毒全球主要流行株基因組变异变迁分析[J]. 疾病监测, 2021, 36(10): 1-7.
[11] Lopez Bernal J, Andrews N, Gower C, et al. Effectiveness of Covid-19 vaccines against the B. 1.617. 2 (Delta) variant[J]. N Engl J Med, 2021: 585-594.
[12]国务院联防联控机制.疫情防控和疫苗接种有关情况【EB/OL】. 【2021-6-11】.http://www.gov.cn/xinwen/gwylflkjz160/
[13] Griffin S. Covid-19: Fully vaccinated people can carry as much delta virus as unvaccinated people, data indicate[J]. 2021.doi: https://doi.org/10.1136/bmj.n2074
[14]数据来源:our world in data. Coronavirus (COVID-19) Vaccinations. http:ourworldindata.org/covid-vaccinations