7个箭筈豌豆品种生育期、产量与SSR遗传多样性比较
2019-09-18陈柳倩魏臻武赵文明陈国宏
陈柳倩,路 璐,罗 璇,江 舟,魏臻武,赵文明,陈国宏,徐 琪
(扬州大学动物科学与技术学院,扬州225009)
为更好地实施“藏粮于地、藏粮于技”战略,华东地区多处稻-麦田块采用轮作休耕制度,复种绿肥,以促进生态环境改善和资源永续利用。箭筈豌豆(Vicia sativa L.)是野豌豆属(Vicia)重要的绿肥之一,不仅能够显著提高耕地中有机质含量,还能增加土壤微生物含量和活性,改善各项理化性质,调节土壤养分库。根据中国数字植物标本馆(http://www.cvh.org.cn/cms/)和宋敏等[1]的统计结果,野豌豆属植物广布于我国各省,其中栽培种5种,野生种36种。不同品种的箭筈豌豆生育期和农艺性状差异明显,杨红燕[2]研究发现,不同品种箭筈豌豆(‘苏箭4号’‘西牧333’‘淮箭1号’)进入花期时间不同,‘苏箭4号’进入花期最早。
微卫星又称简单重复序列(SSRs),一般为短的重复序列(1—6 bp)组成的串联DNA序列,是继RFLP、RAPD等分子标记后出现的第二代分子标记技术[3]。随着分子生物学的发展,微卫星标记技术越来越广泛地应用于植物遗传多样性研究中。Liu等[4]通过转录组测序,获得了1 071条潜在的EST-SSR标记。国外也有学者利用SSR技术分析了窄叶野豌豆和苕子的多样性,发现这2种箭筈豌豆具有较高的遗传多样性,多态信息含量(PIC)达到了0.5以上[5-6]。
箭筈豌豆品种众多,遗传多样性也较丰富,不同品种间农艺性状差异较大,生产中普遍存在品种杂乱、利用价值难以得到充分发挥的问题。因此,加强箭筈豌豆品种资源研究、筛选优良品种,是发展绿肥生产的基础和当务之急。本研究以生产中常见的7个箭筈豌豆品种为试验材料,比较不同品种的生育期和鲜草产量,并利用微卫星标记评价鉴定这7个品种的遗传多样性以及亲缘关系,旨在筛选优质种质资源,为本地区发展冬季休耕绿肥生产提供依据。
1 材料与方法
1.1 试验材料
试验在扬州大学草业科学试验基地进行,地处江苏省中部,位于长江北岸、江淮平原南端,为亚热带季风性湿润气候向温带季风气候的过渡区。该地区年降水量864 mm,平均气温15.8℃,无霜期138 d。试验地土壤为轻壤土,容重1.48 g/cm3,土壤有机质14.58 g/kg,pH 8.46,全氮0.821 g/kg,速效钾57 mg/kg,有效磷5.36 mg/kg。本研究所用材料均为该地区使用较为广泛的箭筈豌豆品种(‘兰箭1号’‘兰箭2号’‘兰箭3号’‘青箭’‘贵苕’‘连苕’和‘镇江野豌豆’),均由扬州大学草业科学魏臻武教授实验室提供。
1.2 生育期和鲜草产量测定
供试7个箭筈豌豆品种于2018年9月20日播种,每个品种种植2个小区,共14个小区,记录生育进程(出苗期、分枝期、现蕾期、盛花期和结荚期)。盛花期后,采用样方取样,样方面积为1 m2(1 m×1 m),每个小区取3个样方,取样后称鲜草质量,并折算为公顷产量。
1.3 SSR分型分析
1.3.1 基因组DNA提取
每个品种随机选取混合种子20份,取种子约200 mg,加入液氮充分研磨后将粉末转移至裂解液中,于60℃水浴20—30 min,期间上下混匀3—5次,加入苯酚-氯仿(1∶1)抽提,去除种子中淀粉等大分子物质,离心吸取上层水相,具体方法按照试剂盒(TIANGEN,北京)说明书进行。NanoDrop ND-1000浓度测定仪测定DNA质量浓度并稀释至50 ng/μL,于4℃保存。
1.3.2 SSR引物设计及筛选
参照文献[4],选取10对具有代表性的引物(表1),由南京擎科生物科技有限公司合成。将7个箭筈豌豆品种的基因组DNA分别混合后进行PCR扩增,扩增结果通过琼脂糖凝胶电泳进行确认,选取扩增片段呈多态、片段长度在100—500 bp且条带清晰的引物加入FAM荧光标记修饰进行后续试验。
表1 SSR引物序列Table 1 The primers of SSR in the experiment
1.3.3 SSR片段扩增与分型
以7个箭筈豌豆品种的20个样本DNA为模板,分别与筛选出的引物进行PCR扩增,优化后的PCR程序为:94℃预变性3 min;94℃变性35 s,53—56℃退火35 s,72℃延伸13 s,35个循环;72℃延伸7 min,扩增产物以ABI 3730XL DNA全自动基因分析仪为平台,以GeneScan-500为标准,进行荧光-多重PCR检测。
1.4 统计分析
试验采用Excel 2003建立数据库,利用Microsatellite-Toolkit统计各微卫星位点的等位基因数(Na)、有效等位基因数(Exp Ne)、杂合度(Ho、He)和多态信息含量(PIC);并采用UPGMA聚类方法,以遗传距离为依据构建分析7个箭筈豌豆品种间的遗传关系。
2 结果与分析
2.1 不同品种箭筈豌豆生育期和鲜草产量的比较
由图1可以看出,除‘青箭’生育期长达229 d外,其他6个箭筈豌豆品种的生育期均为175 d左右,主要差异在现蕾期和盛花期。从鲜草产量来看(图2),‘兰箭1号’‘兰箭2号’‘兰箭3号’‘青箭’‘贵苕’均超过了250 t/hm2。
图1 不同品种箭筈豌豆生育期的比较Fig.1 Com parison of grow th period of different Vicia sativa L.varieties
图2 不同品种箭筈豌豆鲜草产量的比较Fig.2 Com parison of fresh grass yield of different Vicia sativa L.varieties
2.2 不同品种箭筈豌豆遗传多样性分析
不同箭筈豌豆品种荧光-多重PCR检测结果表明,选取的扩增片段具有多态性(图3)。由表2可知,7个箭筈豌豆品种等位基因数均较为丰富,其中‘连苕’多达30种;‘兰箭3号’‘镇江野豌豆’与‘连苕’的PIC分别为0.427、0.377和0.313,其余4个品种呈现低度多态(PIC<0.25);‘兰箭3号’群体杂合度也较高(He>0.5)。
图3 荧光-多重PCR检测结果Fig.3 Results of fluorescent-multip lex PCR
表2 7个箭筈豌豆品种遗传多样性参数Table 2 Genetic diversity parameters of 7 Vicia sativa L.varieties
2.3 不同箭筈豌豆品种聚类分析
采用UPGMA聚类方法,基于品种间的遗传距离,构建不同品种的系统发生树。如图4所示,7个品种分为两个类群,‘连苕’‘镇江野豌豆’和‘青箭’聚为一类;‘兰箭1号’‘兰箭2号’‘贵苕’和‘兰箭3号’聚为一类。
3 讨论
不同绿肥作物在相同生长条件下,其生长特性、最适宜翻压时期并不同。本试验研究了7个箭筈豌豆品种的生育进程和鲜草产量,结果表明:在本试验条件下,除‘青箭’生育期较长外,其他6个箭筈豌豆品种的生育期均为175 d左右。由于‘青箭’现蕾期和盛花期时间较长,势必延长种植‘青箭’适宜翻压时期,影响下一季水稻种植,因此‘青箭’不适宜本地区推广种植。绿肥生物量越多,翻埋后越有利于培肥地力[7]。从鲜草产量来看,‘兰箭1号’‘兰箭2号’‘兰箭3号’‘青箭’‘贵苕’均超过了250 t/hm2。前人研究表明,春箭筈豌豆5-1-5品系苗期生长缓慢,鲜草产量只有114.7 t/hm2[8],‘陇箭1号’两年平均产量只有96.6 t/hm2,可见‘兰箭3号’等几个品种具有较高的生物量,意味着翻耕后具有较好的培肥地力。
遗传多样性分析表明,7个箭筈豌豆品种均检测出较多的等位基因数。但从PIC来看,仅有‘兰箭3号’‘连苕’与‘镇江野豌豆’为中度多态的品种(0.25<PIC<1.00),其余4个品种呈现低度多态(PIC<0.25),表明野豌豆属不同品种的PIC存在一定差异,当然也不排除是由于检测引物不同所致。‘兰箭3号’群体He较高(>0.5),说明该品种具有丰富的遗传多样性。研究还发现,‘兰箭1号’‘兰箭2号’‘兰箭3号’和‘贵苕’聚为一类。
综上,‘兰箭3号’具有合适的生育期、较高的产量和遗传多样性,可作为本地区冬季休耕绿肥生产的理想品种。
图4 基于遗传距离构建的7个箭筈豌豆品种聚类图Fig.4 Clustering diagram of 7 Vicia sativa L.varieties based on genetic distance