中外两种“人兽共患病学”相关期刊的可视化分析
2019-07-16
人兽共患病(zoonosis)是指由同一种病原体引起,且能够在人类与动物之间进行自然传播的感染性疾病。目前已知发生于人和动物的传染病和寄生虫病约350种,其中约60%为人兽共患病,达193个病种[1]。人类与动物尤其是野生动物越来越频繁的接触增加了人类患人兽共患病的概率。而人兽共患病的暴发,不仅威胁着人类身体健康,重创养殖业发展,同时也会造成巨大经济损失和社会的恐慌,对人类生产生活产生极大影响。
大多数科学研究的数据和成果依赖于公开发行的科技期刊而被学术界认可。在此过程中,科技期刊有责任在科技成果的真实性审查和传播中发挥重要的作用,包括引导研究方向、规范研究流程、保证研究质量、服务社会需求[2]。我们通过分析国内外2种人兽共患病领域相关专业期刊的文献,探索近年来该领域的研究热点,追踪学术前沿。同时,通过对中外期刊的比较,寻找中文期刊与SCI期刊间的差距,为中文期刊寻找借鉴和发展方向。
1 材料与方法
1.1文献的检索 英文文献检索方法:基于Web of Science核心合集数据库,检索时间截至2019年1月20日。以“Zoonoses”为关键词搜索出版物名称,获得英文出版物ZoonosesandPublicHealth及其相关文献1 537篇。下载文献信息并保存为CiteSpace软件识别的文件类型。中文文献检索方法:中国知网(CNKI)学术期刊数据库期刊检索页面检索,设定检索条件为“中国人兽共患病学报”,时间限定为2007-2018(与英文期刊的文献时间保持一致,便于分析比较),获得3 569篇文献,剔除消息、译文等信息后得到3 323篇有效文献,下载文献信息并保存为CiteSpace软件识别的文献类型。所得文献信息全部经过滤和除重处理。
1.2数据的转换 Web of Science核心库导出的数据可直接用于数据分析,每一条文献包含的信息比较全面。中国知网得到的文献以Refworks的格式导出,重命名后,利用软件自带的数据格式转换功能转换为软件可识别的格式,每一条文献的信息包括作者、单位、关键词、摘要和发表时间,不包括参考文献,信息不全,部分分析功能无法实现。分别设置2个文件夹“date”和“project”用于储存查询结果和可视化分析的结果。
1.3引文分析 英文文献引文及被引分析数据来源于Web of Science核心合集数据库,中文期刊被引数据来源于中国知网引文数据库,检索时间2019年1月20日。
1.4数据分析和软件应用 采用科学知识图谱文献可视化分析工具CiteSpace分析操作,本文控制节点的数据抽取标准采用TOPN法,其他作图直接使用Excel2016软件。
2 结 果
2.1文献分布时间及类型统计 发文量在一定程度上可反映出学者对某领域的关注程度和该领域的发展状况[3],从图1A可以看出,2007-2018年间,两本期刊发文量的变化有相同趋势。ZoonosesandPublicHealth为2007年创刊,当年刊登了581篇论文。之后发文量平均80篇,直到2018年增至144篇。《中国人兽共患病学报》创刊于1985年,2007年刊载可被引文献量372篇,之后逐渐减少,近3年年均文献量为212篇。两本期刊刊登的文献类型也有所不同,ZoonosesandPublicHealth刊登的Articles占比为58%(890/1 537);《中国人兽共患病学报》刊登的栏目分为论著、实验研究、综述、疾病防治和调查防治等,其中研究型的论著和实验研究的文献占比为65.9%(2 189/3 323),见图1B和图1C。
2.2文献作者分布 核心作者是推动学术创新与学科发展的骨干力量,同时也是提升期刊学术影响力和竞争力的重要因素之一。把Node types设定为作者,运行程序得到两种期刊近 12年来的作者共现知识图谱,ZoonosesandPublicHealth共得到301个节点,519条连线,网络密度为0.011 5,该期刊作者团队之间的合作较少。《中国人兽共患病学报》检索结果得到1 038个节点,2 512条连线,网络密度为0.004 7,该期刊出现了几个较为明显的作者群体,如:严延生、万康林、焦新安、叶长芸、詹希美、陈家旭等作者团队,团队之间的连线则相对较少,且作者之间存在较高的共线性。较为突出的作者对于国内及国外人兽共患病学科的发展起了重要推动作用,高产作者的发文情况见表1。
1A: Zoonoses and Public Health和《中国人兽共患病学报》2007-2018年发文量分布;1B:Zoonoses and Public Health 2007-2018年刊登文献类型分布; 1C:《中国人兽共患病学报》2007-2018年刊登文献类型分布图1 Zoonoses and Public Health和《中国人兽共患病学报》年度发文量和刊登文献类型分布Fig.1 Types and distribution of publications of Zoonoses and Public Health and Chinese Journal of Zoonoses
表1 2007-2018年ZoonosesandPublicHealth和《中国人兽共患病学报》发文量居前10位的作者
Tab.1 Top 10 authors with publications ofZoonosesandPublicHealthandChineseJournalofZoonoses,2007-2018
排名Zoonoses and Public Health《中国人兽共患病学报》作者发文量作者发文量1WAGENAAR JA19严延生862SARGEANT JM18万康林673PEARL DL15焦新安464VAN VLIEF AHM11翁育伟445OWEN RJ10张拥军326MICHEL P10赵秀芹307HIEET KL10张龙现308WARD MP9刘 军259STERN NJ9谢剑锋2410MEARAUD F9李文桂21
2.3发文国家和机构分布 把Node types设定为国家,运行程序得到两种期刊近12年来的机构共现知识图谱,每一个点代表一个国家,节点大小代表国家发文量的多少,节点之间的连线表示国家的合作研究情况。从图2A中ZoonosesandPublicHealth发文的国家分布看,美国占总发文量超1/4,其次是英国和加拿大,中国发表论文7篇。从发文机构分布来看,则是University of Guelph排在第1位,紧随其后的是Centers for Disease Control and Prevention和Public Health Agency of Canada,发文量超过60篇,远超第4位的Ghent University,见图2B。《中国人兽共患病学报》发文量排在前3位的机构分别是中国疾病预防控制中心传染病预防控制所202篇、福建省疾病预防控制中心189篇,远远多于排在第3位的河南农业大学牧医工程学院49篇,见图2C。中英期刊的一个共性是疾病预防控制中心同时成为发文机构较多的机构,可见该机构在控制人兽共患病疫情及防治方面发挥着很大的作用。从图中节点及连线也可以说明该领域的研究得到学术团队的广泛关注,多为独立研究,机构间缺乏合作,发文量居前10的国家和机构详见表2。
表2ZoonosesandPublicHealth和《中国人兽共患病学报》发文量居前10的国家和机构
Tab.2 Top 10 countries and institutions with publications ofZoonosesandPublicHealthandChineseJournalofZoonoses
排名Zoonoses and Public HealthZoonoses and public health《中国人兽共患病学报》国家发文量(%)机构发文量机构发文量1USA418(27.20)UNIV GUELPH76中国疾病预防控制中心传染病预防控制所/传染病预防控制国家重点实验室2022ENGLAND184(11.97)CTR DIS CONTROL PREVENT61福建省疾病预防控制中心1893CANADA14(9.4347)PUBL HLTH AGCY CANADA60河南农业大学牧医工程学院494GERMANY102(6.64)UNIV GHENT35四川农业大学动物医学院375NETHERLANDS85(5.53)UNIV UTRECHT26浙江省疾病预防控制中心336ITALY76(4.95)OHIO STATE UNIV25中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所317AUSTRALIA67(4.36)IOWA STATE UNIV24河南省疾病预防控制中心288FRANCE65(4.23)UNIV BRISTOL24中国农业科学院兰州兽医研究所279SPAIN65(4.23)UNIV COPENHAGEN24中山大学中山医学院寄生虫学教研室2610DENMARK61(3.97)UNIV OXFORD21华南农业大学兽医学院24
2A: Zoonoses and Public Health国家共现知识图谱;2B: Zoonoses and Public Health机构共现知识图谱;2C:《中国人兽共患病学报》机构共现知识图谱图2 Zoonoses and Public Health和《中国人兽共患病学报》国家和机构共现知识图谱Fig.2 Knowledge map of country and institutional co-occurrence of Zoonoses and Public Health and Chinese Journal of Zoonoses
2.3关键词共现分析 一篇文献的关键词可以体现文献的主题,关键词的聚类分析可以研究该领域的热点问题,关键词的时区图分析可以发现前沿的研究热点。CiteSpace中关键词的重要程度以出现频次和中心性为依据,其中图谱圆圈的大小代表关键词的出现频次,圆圈越大,表示出现频次越高;关键词的中心性越强,越趋向于出现在图谱的中心位置。此网络可反映出某一领域当前及过去产生过哪些热点研究。ZoonosesandPublicHealth关键词共现分析结果显示,接近200次的关键词有2个:infection 238次和prevalence 198次,出现超过100次的关键词有9个,超过50次的有26个,Zoonoses出现124次,Public Health 出现77次,见图3A。《中国人兽共患病学报》中出现次数在100次以上的关键词有1个:结核分枝杆菌,出现超过50次的关键词有14个,关键词集中度明显弱于英文期刊,见图3B。两本期刊的关键词共现时区图如下:
图3 Zoonoses and Public Health(3A)和《中国人兽共患病学报》(3B)关键词共现时区图Fig.3 Timezone map of keywords co-occurrence of Zoonoses and Public Health and Chinese Journal of Zoonoses
2.4被引期刊分析 一本期刊被哪些刊物引用,引用频次多少直接决定了该期刊的影响因子。表3数据表明,ZoonosesandPublicHealth与《中国人兽共患病学报》相比,虽然前者在载文数量上明显偏少,被其他期刊引用的频次却显著高于后者,且在自引率方面更是低于后者。由于数据库缺少相关中文刊物被引相关数据,本文仅分析ZoonosesandPublicHealth被引期刊共现知识图谱,详见图4。
2.5高被引文献分析 文献的高被引往往意味着该篇文献是该专业的奠基性及有开拓意义的文献。《中国人兽共患病学报》被引50次以上的文献有13篇,被引频次居前10的文献中有4篇综述,其余为研究型论文。ZoonosesandPublicHealth被引100次以上的文献有3篇,被引50次以上的是20篇,被引频次居前10的文献中9篇综述,1篇为研究型论文,详见表4。
图4 Zoonoses and Public Health被引期刊共现知识图谱Fig.4 Knowledge map of cited journals co-occurrence of Zoonoses and Public Health
表3ZoonosesandPublicHealth和《中国人兽共患病学报》被引频次居前10的期刊
Tab.3 Top 10 highest cited journals byZoonosesandPublicHealthandChineseJournalofZoonoses
排名Zoonoses and public health中国人兽共患病学报期刊被引频次期刊被引频次1EMERG INFECT DIS577中国人兽共患病学报1 1922J CLIN MICROBIOL438中国病原生物学杂志4193VET MICROBIOL349中国卫生检验杂志2914ZOONOSES PUBLIC HLTH309中国寄生虫学与寄生虫病杂志2595CLIN INFECT DIS309动物医学进展2426EPIDEMIOL INFECT308中国媒介生物学及控制杂志2177APPL ENVIRON MICROB274中国血吸虫病防治杂志2068VET REC236现代预防医学1879PLOS ONE225中国畜牧兽医17410PREV VET MED221医学动物防制163
3 讨 论
3.1载文量和文献类型 对期刊发表论文的年代分布进行分析,有利于掌握研究领域的中心和研究热点,指导把握研究脉络和作者投稿。影响因子受到被引频次和发文量的直接制约[4]。ZoonosesandPublicHealth在2007年正式创刊,当年的载文量为581篇,2008年影响因子0.236,2009年升高到1.333,之后影响因子基本在2上下浮动,年载文量相对稳定,每年10期,稿源遍布全球,以美国为主。《中国人兽共患病学报》创刊于1985年,初为双月刊,后于2003年改为月刊,至2007年期刊载文量也达到顶峰为372篇,之后逐渐下降而趋于稳定,稿源多来源于国内。发文量的变化与目前全球疾病谱的变化相对应,疾病谱的变化已从传染性疾病逐渐转移到慢性非传染性疾病,尤其对中文刊物而言,优质稿源的外流会严重影响期刊的载文数量。前者已入选SCI,为全球人兽共患病领域的专家所熟知和认可;而后者是中文科技核心期刊,在国内享有较高声誉,而在国际上的影响力远低于前者。英文期刊研究型文献占58%,综述类占6%;而中文期刊研究型文献占65.9%,综述类占18%,比例相对较大。中文期刊应立足国内,放眼海外,在保证期刊质量的基础上,积极吸纳国内外优质专家和科研工作者审稿和供稿,以提高期刊影响力和国际知名度,为尽早加入国际检索系统奠定基础。
表4ZoonosesandPublicHealth和《中国人兽共患病学报》被引频次居前10的论文
Tab.4 Top 10 highest cited papers inZoonosesandPublicHealthandChineseJournalofZoonoses
期刊排名文题被引频次发表年份第一作者分类文献类型《中国人兽共患病学报》12004-2008年全国包虫病疫情分析942010王立英寄生虫综述2中华绒螯蟹病原维氏气单胞菌的检验942008房 海细菌实验研究3AMOS-PCR对布鲁氏菌种型鉴定的应用852009姜 海细菌论著4胶体金快速诊断技术的研究进展732007何小维方法学综述5一起手足口病暴发的病原学诊断与分析662007杨秀惠病毒论著6用AMOS-PCR对布鲁氏菌种型鉴定的研究612007钟 旗细菌论著7中国大鲵腐皮病病原菌的分离与鉴定592010王 旭细菌实验研究8屠宰生猪沙门氏菌分离株的血清型和药物感受性分析582008李 郁细菌实验研究91996-2006年中国狂犬病流行特征分析572008宋 淼病毒综述10布鲁氏菌病实验室诊断研究进展562010高明华细菌综述Zoonoses and public health1Toxoplasma gondii Infections in Chickens (Gallus domesticus): Prevalence, Clinical Disease, Diagnosis and Public Health Sig-nificance1112010DubeyJPparasiteReview2Review of Influenza A Virus in Swine Worldwide: A Call for Increased Surveil-lance and Research1102014VincentAvirusReview3Pre-harvest interventions to reduce the shed-ding of E-Coli O157 in the faeces of weaned domestic ruminants: A systematic review1042007SargeantJMbacteriaReview4Cats and Toxoplasma: Implications for Pub-lic Health972010DabritzHAparasiteReview5The Zoonotic Flaviviruses of Southern, South-Eastern and Eastern Asia, and Aus-tralasia: The Potential for Emergent Viruses962009MackenzieJSvirusReview6The Role of Swine in the Generation of No-vel Influenza Viruses912009Ma WvirusReview7Chlamydophila psittaci infections in humans during an outbreak of psittacosis from poul-try in Germany842008GaedeWchlamydia Article8A Brief History and Overview of Toxoplasma gondii792010InnesEAparasiteReview9Prevalence and Risk Factors for Bacterial Food-Borne Zoonotic Hazards in Slaughter Pigs: A Review782009FosseJbacteriaReview10Antiviral Immune Responses of Bats: A Re-view762013BakerMLvirusReview
3.2核心作者的挖掘和稿源分布 每一个学科、每一个期刊的发展都离不开一些核心作者的供稿,核心作者的标准可以通过普莱斯定律确定[5],即杰出科学家中最低产的那位科学家所发表的论文数,等于最高产科学家发表论文数的平方根的0.749倍。通过对这一科研群体学术活动的挖掘和分析,可以有效识别不同学科的研究现状与发展脉络。然而,高发文数的作者与被引数量之间不存在必然联系[6]。编委群体的H指数与期刊综合影响因子的相关系数高于其他指标与综合影响因子的相关系数[7]。从文中的数据分析可知,ZoonosesandPublicHealth的高发文作者不是该期刊的编委会成员,但因其所刊文种为通用语言英语,所以稿源遍布全球,以美国为主,影响因子目前为2.688,受众面宽,稿件质量有保证。中文期刊的编委是由该领域的权威专家组成,编委们积极供稿,极大地促进了期刊质量的提高,在提高期刊影响力方面也发挥了较大的作用。从期刊长远发展考虑,编委会应考虑吸纳近期具有较高学术影响力和学术活跃度的专家,使学术期刊始终与科学前沿和热点保持“零距离”[7]。从作者合作来看,团队之间尚未形成深入合作网络,团队之间的联系较少。从发文机构来看,中文期刊的两大发文机构是“中国疾病预防控制中心传染病预防控制所”和“福建省疾病预防控制中心”,2个机构均与该刊的承办单位相关,难免有所偏重;而英文期刊的稿源来源于大学的较多,大学多注重基础类研究,影响力相对较大,所以中文期刊今后的组稿和宣传方向可以向大学等机构倾斜。
3.3关键词 论文关键词是展现一篇文章的核心词汇,是文章中的核心词汇,出现频率较高。关键词是对研究内容、研究视角的高度概括和凝练,关键词共现的频次越高,表示研究主题越接近,关键词共现时区图分析可以揭示某一学术领域研究现状发展过程以及研究趋势。ZoonosesandPublicHealth办刊宗旨是围绕人类和动物健康以及一些公共卫生策略,服务对象是人医和兽医工作者及决策者,并鼓励相关疾病的统计学建模类文章,这与《中国人兽共患病学报》的办刊宗旨是相似的,并且两本杂志的高发文单位都有疾病预防控制中心。刊载的论文都是传染性疾病的流行及实验室研究等,英文刊侧重于公共卫生方面,而中文刊则更注重对人的致病性和一些方法性的研究。两者关键词均与刊名牢牢紧扣。关键词共现分析发现,英文期刊出现频次最高的是“infection”,而中文期刊出现频次最高的是“结核杆菌”,结核病疫情在世界范围急剧恶化,各国结核病发病率呈回升趋势,加之HIV的传播流行以及抗结核药物的不规范使用,导致耐多药菌株尤其是耐多药结核菌的出现使其发病率和病死率不断升高,这与我国是全球结核病和耐药结核高负担国家的情况相一致[8]。
3.4被引期刊 英文期刊的被引期刊的学科分布较为广泛:传染病学、兽医学、检验医学、临床感染等,涵盖了基础医学类的大部分亚学科。说明学科交流广泛,人兽共患病领域的期刊同时被其他领域的作者高度重视。学术期刊之间存在紧密联系。从表3和图5数据看出,ZoonosesandPublicHealth被引期刊最高的是EmergingInfectionDisease,后者主办单位是美国疾病预防控制中心;《中国人兽共患病学报》在每期期刊的封三和封底,都刊登该杂志中有关人兽共患病方面文章的中文摘译,EmergingInfectionDisease间接地在两本人兽共患病学期刊之间起到了桥梁和纽带的作用。从表3数据可计算得知,英文期刊的自引率20.1%,中文期刊为35.8%,编辑部应适当的加以控制和引导,防止作者的偏见,同时期刊本身也应该提高自律性。对于SCI期刊而言,过高的自我引用或者有成为潜在掠夺性期刊的可能性,则随时可能被踢出。
3.5高被引文献 期刊的计量指标中也有无处不在的“二八现象”,例如:某一期刊中20%论文的被引频次可能占期刊总被引的80%[9]。衡量一篇文章影响力,通常是依据该文章的被引次数。但是被引最高的往往并不是质量最好的文献,要看研究的延续性、突破性、发表的难易程度等[10]。过度依赖“高被引”期刊非学术正道,高水平期刊话语权过强,以刊论文和以被引频次对单篇文献的评价是不充分的[11]。表4数据表明ZoonosesandPublicHealth被引频次居前10的文献中有9篇综述,1篇为研究型论文。《中国人兽共患病学报》被引频次居前10的文献中4篇综述,其余6篇为研究型论文。综述类文献在杂志的影响因子中贡献较大。对于某一文献,被引次数多少与刊载的期刊相关性不强,与发文时间相关性较强,一般是发表后的2~3年被引频繁,所以文献的被引也具有一定的机遇性。虽然是被引次数以及基于被引次数的指标或许不应该作为唯一的评价论文的维度,真正有影响力的工作常是创新性的科学成果,可能短时期难以形成学术共识,部分创新性成果无法发表。《中国人兽共患病学报》作为中国科技期刊出版的“核心期刊”,应着力在发表创新性研究成果上下功夫,以提高期刊的影响力。