FTIR显微成像表征碱处理后玉米秸秆木质素含量及分布
2019-05-24杨增玲杜书荣梅佳琪李骏宝刘二伟韩鲁佳
杨增玲,杜书荣,梅佳琪,李骏宝,刘二伟,韩鲁佳
FTIR显微成像表征碱处理后玉米秸秆木质素含量及分布
杨增玲,杜书荣,梅佳琪,李骏宝,刘二伟,韩鲁佳※
(中国农业大学工学院,北京 100083)
探究木质素原位表征方法,能为研究农作物秸秆去木质化过程中木质素变化规律提供帮助。该研究以玉米秸秆为原料,碱处理玉米秸秆横切片后进行傅里叶变换红外(Fourier transform infrared,FTIR)显微成像,并结合快速非负最小二乘(fast non-negativity-constrained least squares,fast NNLS)拟合算法计算组织中木质素的分布。结果显示:1)FTIR显微图像结合fast NNLS算法可对组织中的木质素进行定位及定量分析。如拟合计算得到,原样组织薄壁细胞中木质素质量分数为7.7%,碱处理5、30、60 min后下降至6.0%、4.8%、3.5%;2)基于fast NNLS拟合计算的组织中木质素变化趋势同试验测定的木质素变化趋势一致。研究结果表明,基于FTIR显微成像的表征方法可用于原位分析碱处理过程中秸秆组织的木质素分布及含量变化,实现介观尺度研究秸秆木质素降解规律。
秸秆;木质素;图像处理;FTIR显微成像;碱处理;
0 引 言
木质素是一种非线性芳香族聚合物,是由羟基或甲氧基取代的苯丙烷单体无序聚合而成的三维复杂结构,储量仅次于纤维素。木质素是植物细胞壁的主要组成成分之一,为植物提供足够的强度和硬度,同时避免生物侵害和水的侵蚀。农作物秸秆等生物质资源的木质素含量及分布直接影响其转化利用效率。因此,探究木质素原位表征方法,对研究农作物秸秆去木质化过程中木质素的分布及变化规律有重要意义[1-5]。
近年来对植物组织的木质化过程和去木质化反应的研究受到学者们广泛关注,目前已有大量研究采用传统的湿化学分析法对反应后木质素的去除进行了测定[6-8]。在木质素定位研究中,使用的方法主要包括组织染色法[9-10]、荧光显微技术[11]和共聚焦拉曼显微技术[12]等。也有学者利用光谱[5,13-14]、电镜结合能谱[15-16]等技术对木质素进行半定量分析。随着现代分析仪器的发展,已经有学者探索开发了植物不同部位组分分布原位表征手段[17-18],傅里叶变换红外(FTIR)显微成像技术[19-20]便是其中之一。
FTIR显微成像技术将基于红外光谱的秸秆组分原位分析与基于显微镜技术的直观成像相结合,不仅能提供具有丰富空间和化学信息的图像,而且还能提供精确到微米级微区的具有指纹特性的红外光谱信息。Dokken等[21]使用FTIR显微成像研究了向日葵和玉米根不同部位脂质、蛋白质、纤维素、木质素和碳水化合物的空间分布信息。Gorzsás等[22]以欧洲山杨树和拟南芥木质部为研究对象,利用FTIR显微红外结合隐变量正交投影判别法对植物器官进行了化学表征。Yang等[23]使用FTIR显微成像结合快速非负最小二乘(fast NNLS)算法探究了表征小麦不同生长期秸秆组分分布及变化规律的可行性。以上研究均取得了较理想的效果。但尚未检索到对预处理过程中秸秆不同组织的木质素变化进行表征的研究。秸秆组分复杂且各组织具有不同的生物特性,使得木质素在不同组织中的含量不均匀,预处理过程中各个组织的木质素降解率可能也会存在差异,但传统湿化学分析方法仅能测定木质素的平均去除率,如文献[24]指出,碱处理可以去除85%的木质素,是一种有效去除木质素的化学预处理方式。研究预处理过程中表皮、维管束及薄壁细胞等不同组织木质素去除过程的差异可以为秸秆转化利用和预处理作用机理探究提供帮助。本文以碱处理为例,拟探究碱处理过程中秸秆不同组织中木质素变化的表征方法。
本研究以玉米秸秆为对象,探索FTIR显微成像技术表征玉米秸秆碱处理过程中不同组织木质素分布和含量变化的可行性。
1 材料与方法
1.1 样品采集与制备
本试验中使用的玉米秸秆为拔节期新鲜玉米秸秆,于2018年7月底取自中国农业大学上庄试验站。在每根新鲜秸秆地面以上第6节间中部位置连续取厚度约为0.5 cm的2个茎段,共取4个茎段置于福尔马林-乙酸-乙醇(formalin-aceto-alcohol,FAA)固定剂中固定24 h以上。其中1个茎段直接采用石蜡包埋[25]作为碱处理前的对照组样品;另外3个使用去离子水清洗后于100 ℃预热,然后加入约3倍样品体积已预热的2% NaOH溶液,在100 ℃反应5、30、60 min时取出对应样品,用去离子水清洗,最后进行石蜡包埋。包埋后的样品用切片机(ESM-150S,ERMA,日本)切取厚度约为18m的切片,置于ZnS玻片上,用于FTIR显微成像分析。取整株新鲜玉米秸秆地面以上至穗以下部分,切成1~2 mm薄片,混合均匀并同样固定24 h以上。清洗干燥后分成4份,取1份原样作为对照组,将另3份进行与茎段一样的碱处理。然后按照石蜡包埋中脱水透明过程对4份样品分别进行脱水透明和逆脱水透明,清洗干燥后粉碎过0.069 mm筛,按照NREL/TP-510-42618[26]标准测定木质纤维成分。
此外,为后续数据分析,需获得玉米秸秆中纤维素、半纤维素和木质素的纯组分红外光谱作为参考光谱。将新鲜玉米秸秆自然风干后粉碎并过0.069 mm筛,取筛下样品按照参考文献[27-28]中的方法,提取玉米秸秆中的纤维素和磨木木质素。半纤维素主要成分为木聚糖,以购买于Sigma-Aldrich(美国)的木聚糖代替半纤维素获取纯组分光谱。
1.2 数据获取
采用傅里叶变换红外显微成像系统(Spotlight 400,PerkinElmer,英国)采集置于ZnS玻片上的样品的FTIR显微图像。该系统采用液氮冷却的碲镉汞(MCT)阵列检测器,图像采集参数为:图像空间分辨率6.25m× 6.25m、波长范围4 000~750 cm–1、光谱分辨率4 cm–1、扫描次数8。
提取的玉米秸秆纤维素、磨木木质素及木聚糖采用傅里叶变换红外光谱仪(Spectrum 400,PerkinElmer,英国)在透射模式下获取光谱。将提取的纤维素、木质素和木聚糖按质量比1:100分别与KBr混合,取大约1 mg制作KBr压片。红外光谱获取参数为:光谱范围4 000~750 cm–1、光谱分辨率4 cm–1、扫描次数32。
1.3 数据分析与处理
1.3.1 数据预处理
对FTIR显微图像,首先利用局部阈值法进行二值化,将前景(样品图像)信息赋值为1,背景信息赋值为0,从而消除背景对后续数据处理的影响;然后,选取1 800~800 cm–1光谱范围的矩阵数据进行分析,并对选取的光谱数据进行Savizky−Golay卷积5点平滑、标准正态变换(SNV)和Whittaker自动滤波基线校正等光谱预处理,从而消除光谱的基线漂移现象。
相同的,对玉米秸秆纤维素、木质素及木聚糖的红外光谱,也是在1 800~800 cm–1光谱范围内进行与FTIR显微图像光谱相同的光谱预处理。
1.3.2 快速非负最小二乘拟合
考虑到各组分光谱有重叠,通过单一特征峰峰高或峰面积成像很可能受到其他组分的干扰,因此本研究采用快速非负最小二乘(fast NNLS)拟合算法,获取木质素的分布信息。
NNLS算法是一种基于朗伯-比尔定律的多变量计算方法。FTIR原始图像数据可以视为的立方体,其中和为空间坐标,为波长,如图1所示。其中每个像素点的光谱被记录为一个行向量,依像素点顺序展开后的FTIR图像数据被记作:
式中为原始图像数据矩阵,是组分个数,为系数矩阵,S是阶纯组分光谱矩阵,是误差矩阵。
注:和为空间坐标,为波长。
Note:andare spatial positions,is wavelength.
图1 FTIR数据结构示意图[23]
Fig.1 Data structure of FTIR microspectroscopic image[23]
在NNLS算法基础上,Bro等[29]于1997年提出了基于三线性平行因子分解模型(three-way PARAFAC model)的快速非负最小二乘算法(fast NNLS),以解决NNLS因计算量大故而耗时的缺陷。其算法公式如下:
式中x表示矩阵的第行,第列,第层元素。载荷矩阵的第行,第列记为a。同理,第2和第3载荷矩阵、的元素被记作b和c。e是矩阵第个元素的残差。在上式分解中,须令待分析组分个数等于。计算中,载荷矩阵、和的计算参照条件最小二乘问题,迭代而得。
目标组分在每个像素点的浓度占比a%由公式(3)计算得到
为使碱处理不同时间后的样品间具有可比性,对a%进行校正。是样品纤维素、半纤维素和木质素3种组分的化学校正值总和(等于试验测定的样品3种组分总和与对应碱处理固体回收率的乘积)。按公式(4)计算
1.3.3 组织提取
为表征碱处理前后各组织中木质素的变化,本研究结合可见光图像及其RGB/HSV/Lab多空间分量与光谱预处理后的显微红外平均吸光度图像,利用均值聚类算法提取表皮、维管束和薄壁细胞等组织。
1.3.4 数据处理软件
2 结果与讨论
2.1 样品可见光图像和FTIR显微图像
由傅里叶变换红外(FTIR)显微成像系统获取的碱处理前后样品的可见光图像和FTIR平均吸光度显微图像(原始图像)如表1所示。为防止扫样位置影响试验结果,扫样前选取位置相似的切片,并在切片上选取相近位置和相同面积(表皮1 325m×525m、维管束2 475m×975m、薄壁细胞1 525m×775m)的区域采集红外显微图像。受样品中杂质的影响,样品显微图像中存在异常点,当有些异常点红外响应值较大时,局部阈值法提取的前景中会包括异常点,需手动去除非样品部分或样品因受污染而出现的异常点。选取的扫描区域中样品结构应清晰可辨,以保证提取前景时完整保留所有结构信息。
表1 样品可见光图像及FTIR平均吸光度显微图像
Table 1 Visible images and FTIR average absorbance microspectroscopic images
注:样品可见光图像从左到右依次为含表皮区域、维管束区域和薄壁细胞区域,平均吸光度显微图像与可见光图像对应;由上至下依次为玉米秸秆原样、碱处理5 min、碱处理30 min和碱处理60 min. Abs.为吸光度。
Note: The visible images of the samples contain the epidermis area, vascular bundle and parenchyma cell from left to right. The average absorbance microscopic images correspond to the visible image. From top to bottom, they are raw samples of corn stover, alkali pretreated by 5 min, alkali pretreated by 30 min and alkali pretreated by 60 min. Abs. is absorbance.
2.2 3组分傅里叶变换红外光谱图
图2是截取的纤维素、木聚糖代表的半纤维素和木质素3种组分在1 800~800 cm–1范围的傅里叶变换红外光谱图,3种组分在此范围内的红外光谱主要吸收峰如图2所示。表2所示是纤维素、半纤维素和木质素红外光谱图中不同位置的吸收峰对应的官能团归属。由图2可知,纤维素、半纤维素和木质素很多谱带相互重叠,仅1 432和1 514 cm–1处的吸收峰受其他物质吸收峰的干扰较小,可分别作为纤维素和木质素的特征峰,而半纤维素不存在不受干扰的特征峰,本文采用快速非负最小二乘(fast NNLS)拟合算法避免了各组分光谱特征峰相互影响的 问题。
图2 纤维素、半纤维素和木质素傅里叶变换红外光谱图
2.3 组织提取结果
由均值聚类算法提取的原样及碱处理样品的表皮、维管束和薄壁细胞等组织如图3所示。表皮、维管束和薄壁细胞3种组织分别由表1中3列样品可见光图像及其对应的FTIR平均吸光度显微图像从左至右依次对应提取得到。组织提取时先将可见光图像分解成RGB/HSV/ Lab多空间分量,选取组织结构明晰、冗杂信息少的分量与可见光图像和光谱预处理后的FTIR显微图像进行融合,从而突显不同组织的结构特征,继而利用均值聚类算法提取图像中的表皮、维管束和薄壁细胞3种组织。从图3中可以看出,随预处理时间增加,样品组织形态的完整度逐渐减小,碱处理60 min的样品最不完整,且薄壁细胞完整度减小最明显。
2.4 FTIR显微成像及fast NNLS拟合计算结果
基于试验分析的木质素含量(化学校正值)和基于fast NNLS拟合的3个组织(表皮、维管束和薄壁细胞)中木质素含量随碱处理时间的变化,如图4所示。化学校正值是试验测定的木质素含量与对应碱处理固体回收率的乘积。将试验测定的木质素含量转化为木质素绝对含量,使试验测定的碱处理不同时间的样品木质素含量具有可比性。化学校正值随碱处理时间增加不断下降,且反应初始阶段,木质素降解速率最大,随后木质素降解速率逐渐减小。这可能是由样品中木质素含量减少,反应困难程度增大而引起的。
由图4中基于fast NNLS拟合计算的3个组织(表皮、维管束和薄壁细胞)中木质素含量可知,玉米秸秆表皮中的木质素含量高于维管束中的含量,而薄壁细胞中木质素含量最少。这一计算结果与植物学研究结果一致,表皮和维管束中木质素大量沉积有利于巩固和支持植物体、保护植物体及物质输导。拟合计算得到,原样组织薄壁细胞中木质素质量分数为7.7%,碱处理5、30、60 min后下降至6.0%、4.8%、3.5%,图中结果显示,除原样(图中第1个点)外,碱处理样的表皮、维管束和薄壁细胞3个组织中木质素含量均呈现随着碱处理时间增加而不断减少的趋势;并且3个组织中木质素变化趋势均与化学校正值的变化趋势一致。表皮中木质素降解速率快于其他3个组织,这可能与表皮中木质素含量较高有关,另外2个组织中木质素降解速率则相当;组织中木质素降解速率逐渐减小,与化学校正值速率的变化一致。
图5是基于fast NNLS拟合计算的表皮、维管束和薄壁细胞等3个组织中木质素分布的FTIR显微图像。FTIR显微图像可以直观看到图5中的计算结果:表皮中木质素含量大于维管束和薄壁细胞中的,随着碱处理时间增加,各个组织中木质素含量逐渐减少。同时,各组织形态也出现了不同程度的破坏,维管束和薄壁细胞的破坏程度比较明显。
图5中薄壁细胞的FTIR显微图像显示细胞形状随碱处理时间的增加愈加不完整,一方面是由于所选区域的薄壁细胞经碱处理原有形态被严重破坏;另一方面,由于薄壁细胞细胞壁较表皮部分和维管束薄,导致红外吸收光程短,所以薄壁细胞的红外响应值较低,引起细胞形态部分缺失。
a. 原样 a. Raw sampleb. 碱处理5 minb. Alkali pretreated by 5 min c. 碱处理30 min c. Alkali pretreated by 30 mind.碱处理60 mind. Alkali pretreated by 60 min
2.5 讨论
图4中原样的(第1个点)基于fast NNLS拟合计算值与整体趋势不符,推测是拟合计算值出现偏差。NNLS拟合计算时须令待分析组分等于,本试验中取3,即假定每个像素点仅由纤维素、半纤维素和木质素3种组分组成,组分占比总和越接近1,拟合值越准确。但实际上,如表3所示,玉米秸秆原样中纤维素、半纤维素和木质素三者总和仅为83.36%,原样中还存在淀粉、果胶、灰分等多种成分,因而拟合值出现偏差。而碱处理不同时间的样品中,纤维素、半纤维素和木质素三者总和均在90%以上,所以拟合值更准确。为解决原样拟合值出现偏差的问题,在后续研究中可以通过增加参与fast NNLS计算的组分数,使组分总和尽量接近于1。
图4 木质素含量随预处理时间的变化
注:每个小标题对应的3个小图分别为表皮、维管束和薄壁细胞组织。组织越接近红色表明木质素含量越高,越接近蓝色,表明木质素含量越低.
表3 样品中木质纤维成分的含量
3 结 论
本研究采用傅里叶变换红外(FTIR)显微成像系统获取玉米秸秆原样切片和碱处理不同时间的切片的显微图像,然后基于快速非负最小二乘(fast NNLS)拟合算法计算样品各个组织(表皮、维管束和薄壁细胞)中木质素含量并在FTIR显微图像中直观表达木质素含量的变化。对比基于fast NNLS拟合所得的3个组织(表皮、维管束和薄壁细胞)中木质素含量和基于试验分析的木质素含量(化学校正值)随碱处理时间的变化发现,各个组织中木质素含量逐渐下降,且与化学校正值变化趋势一致;木质素降解速率呈现先快后慢;表皮中木质素含量高于其他2个组织,降解速率也大于其他2个组织;受算法原理的限制,原样各组织中木质素拟合计算含量存在偏差,需进一步研究。由本文研究结果可知,FTIR显微成像结合fast NNLS算法可以实现木质素的定位和定量分析,能用于表征玉米秸秆碱处理过程中不同组织的木质素分布和含量变化。
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Lignin content and distribution in alkali pretreated corn straw based on Fourier transform infrared microspectroscopic imaging
Yang Zengling, Du Shurong, Mei Jiaqi, Li Junbao, Liu Erwei, Han Lujia※
(100083,)
Lignin is one of the major components of plant cell wall, and it can provide sufficient strength and hardness to plant cells while avoiding biological damage and water erosion. In recent years, studies on the lignification process and delignification of plant tissues have received extensive attention from scholars. A large number of studies have been carried out to determine the removal of lignin after pretreatment by conventional wet chemical analysis. The lignin content and distribution of biomass resources such as crop straw directly affect its conversion and utilization efficiency. It’s meaningful to develop multi-scale and in situ analysis to identify lignin distribution and quantification on delignified plant cell wall for bio-resource commercial utilization. In this paper, we studied an in situ analysis method to visualize changing of lignin distribution in the alkali pretreated corn straw internodal transverse section based on Fourier transform infrared (FTIR) microspectroscopic imaging, with a fast non-negativity-constrained least squares (fast NNLS) fitting. We collected the middle of the 6th node of fresh jointing stage corn straw. Corn straws were pretreated for series of times (0 , 5 , 30, 60 min) by 2% NaOH solution at 100℃. A paraffin embedding method was used to produce 18m-thick transverse sections for each sample. Then, the sections were transferred onto ZnS windows for FTIR microspectroscopic imaging. We acquired FTIR spectra of major components of corn straw for fast NNLS fitting. We also milled whole straws to 0.069 mm and pretreated in the same condition as sections to determine structure carbohydrate. The data of FTIR microspectroscopic images and FTIR spectra were processed by Savizky−Golay smoothing within 5 points, SNV, and automatic Whittaker filter baseline to correct baseline and offset.-means cluster algorithm was used to distinguish various tissues including epidermis, vascular bundles and parenchyma cells. Fast NNLS fitting was carried out to calculate the lignin concentrations in pixels. For comparison between different pretreated times, lignin concentration in pixels was calibrated according to the sum of content of all components based on laboratory analysis. The lignin content by laboratory analysis decreased with the increasing of the pretreated time, and the lignin degradation rate was larger at the initial stage of the reaction. The lignin content in the epidermis, vascular bundle and parenchyma cells of the samples showed a decreasing trend with the increasing of pretreatment time, and the trends of lignin changing in the three tissues were consistent with the trend of laboratory analysis. By comparing laboratory analysis with fast NNLS fitting results, the results show that the FTIR microspectroscopic imaging combined with fast NNLS could locate and quantify the distribution of lignin in various tissues, and the trend of lignin changing calculated by fast NNLS fitting is the same as the laboratory chemical analysis results. The study demonstrated that FTIR microspectroscopic imaging combined with fast NNLS fitting could be successfully applied to in situ visualize lignin distribution within corn straw pretreatment. The characterization method provides reference for the lignin research of corn stover pretreatment and the study of lignin degradation during straw pretreatment.
straw; lignin; image processing; FTIR microspectroscopic imaging; alkali pretreatment
2019-01-09
2019-04-08
国家自然科学基金(31471407);教育部创新团队计划(IRT_17R105)
杨增玲,教授,博士生导师,教育部新世纪优秀人才,主要从事光谱、显微光谱和光谱成像技术在农业中的应用研究。 Email:yangzengling@cau.edu.cn
韩鲁佳,教授,博士生导师,长江学者特聘教授,主要从事农业生物质工程研究资源开发与利用和农产品加工工程方向的研究。 Email:hanlj@cau.edu.cn
10.11975/j.issn.1002-6819.2019.08.033
S216.2
A
1002-6819(2019)-08-0280-07
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