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肺炎克雷伯氏菌漆酶基因的克隆及其在毕赤酵母中的高效表达

2019-02-23王建玲张妤彤路福平刘逸寒

天津科技大学学报 2019年1期
关键词:氏菌克雷伯底物

王建玲,桂 爽,付 禹,张妤彤,郑 东,路福平,刘逸寒

(工业发酵微生物教育部重点实验室,天津市工业微生物重点实验室,工业酶国家工程实验室,天津科技大学生物工程学院,天津 300457)

漆酶(laccase,EC 1.10.3.2),又称漆酚氧化酶、多铜氧化酶,是一种含铜的多酚氧化酶,属于铜蓝氧化酶蛋白家族的一员[1–2].漆酶的作用底物较为广泛,能够催化包括多酚类、二胺、芳胺类、羧酸类在内的250多种有机物发生氧化、聚合等反应.由于漆酶具有特殊的催化性能和宽泛的作用底物,因此其应用较为广泛,包括纺织业中的染料脱色、造纸工业中的生物漂白、食品行业中食品风味改良、检测酚类污染物生物传感器的构建和生物电子研发等[3–6].部分上述工业过程需要在高温、强酸、强碱等恶劣条件下进行,因此,需要漆酶具有较好的温度和pH稳定性[7].

漆酶主要存在于植物、真菌、少数昆虫和细菌中,其中真菌漆酶来源最为广泛,研究较为深入的真菌漆酶主要来自白腐真菌(C.thermophilium)[8]、射脉菌(Phlebia radiata)[9]、云芝栓孔菌(Trametes versicolor)[10]、鲜红密孔菌(Pycnoporus cinnabarinus)[11]、糙皮侧耳(P.ostreatus)[12]、毛木耳(Auricularia polytricha)[13]和黑木耳(Auricularia auricula)[14]等.目前,关于真菌漆酶的研究众多,但其存在碱性条件下活性较低、热稳定性较差和丝状真菌生长周期长等缺点.细菌漆酶来源较少,目前已在生脂固氮螺菌(Azospirillum lipoferum)[15]、链霉菌(Streptomycetes)[16]、球形芽胞杆菌(Bacillus sphaericus)[17]、枯草芽胞杆菌(Bacillus subtilis)[18]、嗜热栖热菌(Thermus thermophilus)[19]及肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)[20]等细菌中发现过漆酶活性.与真菌来源漆酶相比,细菌漆酶在碱性条件下具有较好的催化活性和稳定性及存在 Cu2+抗性等优点[21–23].以 2,6-DMP 为底物时,细菌漆酶的最适温度一般在 60~65℃,最适 pH 一般为 7.0~8.0,在 25~60℃和 pH 6.0~9.0范围内稳定性较好[24–27].另外,黄俊等[20]筛选获得一株产漆酶菌 Klebsiella sp.601,以 2,6-DMP为底物时,该漆酶在 pH 5.0~8.0条件下较稳定,在 pH 3.0~4.0、pH 9.0~10.0条件下,几乎没有残余酶活力.本实验室前期从中国西双版纳土壤中筛选获得一株含漆酶基因(lac)的肺炎克雷伯氏菌[28],lac基因与上述Klebsiella sp.601来源漆酶基因相比,共有18个不同氨基酸,该漆酶以2,6-DMP 为底物时,在pH 5.0~9.0条件下较稳定,在 pH 3.0~4.0、pH 10.0~11.0条件下,其残余酶活力在 20%以上,在 30~70℃条件下较稳定,其残余酶活力在40%以上,表明该漆酶具有良好的 pH和温度稳定性,但由于是在大肠杆菌中表达,难以实现高效合成.

本研究旨在通过构建前期筛选获得的具有良好酶学特性的 lac毕赤酵母重组菌株,实现该重组漆酶的高效分泌表达,为其应用奠定基础.

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 菌种与质粒

肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)TCCC111142、质粒 pUC57-lacm(根据毕赤酵母的密码子偏爱性优化的漆酶基因lacm克隆入pUC57中,由北京六合华大基因科技有限公司合成)、大肠杆菌(Escherichia coli)DH5α、毕赤酵母(Pichia pastoris)GS115、质粒pPIC9K均为本实验室保存.

1.1.2 主要试剂与工具酶

Taq DNA 聚合酶、限制性内切酶 EcoRⅠ、NotⅠ,Takara公司;质粒快速提取试剂盒和 DNA 纯化回收试剂盒,Omega公司;蛋白胨和酵母浸粉,Oxoid公司;其他试剂均为国产分析纯.

1.1.3 培养基

LB固体培养基(g/L):酵母提取物5.0,胰蛋白胨10.0,NaCl 10.0,琼脂 15.

YPD 固体培养基(g/L):酵母提取物 10,蛋白胨20,葡萄糖 20,琼脂 20.

BMGY 液体培养基(g/L):酵母提取物 10,蛋白胨 20,YNB 13.4,甘油 5,生物素 0.04;1mol/L 磷酸盐缓冲液(pH 6.0)100mL.

BMMY 液体培养基(g/L):酵母提取物 10,蛋白胨20,YNB 13.4,加入生物素0.04;1mol/L磷酸盐缓冲液(pH 6.0)100mL,每日补加甲醇5mL.

MD 培养基(g/L):葡萄糖 20,琼脂 15,YNB 13.4,生物素 0.04.

1.2 方法

1.2.1 肺炎克雷伯氏菌漆酶基因扩增

通过NCBI基因库查找,根据已报道的肺炎克雷伯氏菌漆酶成熟肽基因,分析其保守序列,设计TCCC111142成熟肽编码基因的扩增引物,上游引物A-3′(下划线部分为加入的 EcoRⅠ酶切位点),下游划线部分为加入的 NotⅠ酶切位点,双下划线部分为添加的6个组氨酸标签,方便纯化蛋白).

以肺炎克雷伯氏菌基因组为模板,以 P1和 P2为引物,进行 PCR扩增.扩增条件为:95℃预变性10min;95℃变性 30s,55℃退火 45s,72℃延伸1min 40s,30个循环;72℃延伸 10min.

将 PCR扩增产物进行测序后,获得 lac基因序列,根据毕赤酵母的密码子偏爱性优化该基因,由北京六合华大基因科技有限公司进行合成,得到新型漆酶基因lacm.

1.2.2 重组质粒的构建

重组质粒pUC57-lacm和质粒pPIC9K经EcoRⅠ和NotⅠ双酶切并纯化回收后,用T4 DNA连接酶连接,转化大肠杆菌 DH5α感受态细胞中,经氨苄青霉素(Amp)抗性筛选,挑选阳性转化子;提取质粒,并进行酶切验证.

1.2.3 电转化毕赤酵母

提取重组菌质粒 pPIC9K-lacm,用 SacⅠ酶切线性化并进行纯化回收;制备毕赤酵母 GS115的感受态细胞;然后采用电转化法将线性化的重组质粒pPIC9K-lacm转化到毕赤酵母GS115,将电转液涂布于MD平板,30℃静置培养至转化子出现.

1.2.4 酵母转化子PCR鉴定

从 MD平板上挑选转化子提取基因组,以其基因组为模板,用上述lacm基因特异引物进行PCR反应,凝胶电泳检测 lacm基因是否插入到毕赤酵母GS115的染色体上.

1.2.5 漆酶在毕赤酵母中的诱导表达

选择 PCR鉴定为阳性的菌落 GS115/pPIC9K-lacm和转有空质粒的对照菌株 GS115/pPIC9K接种至 YPD 液体培养基中,30℃、220r/min培养 24h.以 3%的接种量转接到新鲜 BMGY培养基中,继续以 30℃、220r/min培养 24h,然后以 6000r/min离心 10min收集菌体,将菌体转接到 BMMY培养基中.再以 30℃、220r/min培养,并每隔 12h补加一次甲醇,使其终体积分数保持在0.5%,培养120h后可得到重组漆酶(rLACM)的粗酶液.

1.2.6 纯化rLACM

采用镍柱纯化亲和层析法纯化 rLACM,步骤如下:将含有 Ni树脂装入合适的纯化柱中,树脂体积为 2mL;用预冷的 Lysis Buffer缓冲溶液平衡树脂2~5个床体积;将平衡后的树脂与经过膜(0.22µm)过滤的粗酶液混合,在4℃条件下通过磁力搅拌器使二者结合 40~60min;将树脂与粗酶液的结合液过柱;加入预冷的 Wash Buffer缓冲溶液 20mL,进行清洗杂蛋白;用500mmol/L咪唑的Elution Buffer缓冲溶液5mL进行洗脱,用于SDS-PAGE检测目标蛋白的相对分子质量和纯度.

1.2.7 表达产物的SDS-PAGE分析

重组菌株 GS115/pPIC9K-lacm 和对照菌GS115/pPIC9K 在30℃诱导培养结束后,取1mL发酵液离心去除菌体,取上清液和纯化后 rLACM 各40μL进行SDS-PAGE分析.

1.2.8 漆酶活力测定及酶学性质考察

取 200µL的含 4mmol/L Cu2+的 0.1mol/L的柠檬酸–磷酸氢二钠缓冲液(pH 2~8)或者含 4mmol/L Cu2+的 0.05mol/L的甘氨酸–氢氧化钠缓冲液(pH 8.5~11),于96孔板中,70℃保温1min.加入10µL的稀释适当倍数的纯酶液,混匀,70℃保温1min.再加入30µL的底物(8mmol/L的2,6-DMP),混匀,记录反应初始吸光度和反应3min时吸光度.在一定的条件下,每分钟氧化1µmol的2,6-DMP所需要的酶量定义为一个酶活力单位(U).

用pH 8.0的磷酸缓冲溶液配制漆酶的2,6-DMP底物,分别在20~100℃测定其酶活力,确定rLACM的最适温度.将酶液置于 pH 8.0缓冲液,在 30~80℃温浴,每隔 1h取样,在最适反应条件下测定其酶活力,考察其温度稳定性.

分别用pH为2.0~11.0的磷酸缓冲溶液配制漆酶底物 2,6-DMP,在 70℃反应下,确定 rLACM 的最适pH.将酶液置于pH 3.0~10.0缓冲液,于70℃保温35h,每隔5h测定rLACM酶活力,考察其pH稳定性.

2 结果与分析

2.1 重组质粒pPIC9K-lacm的构建

以肺炎克雷伯氏细菌的基因组为模板,以引物P1和P2扩增目的基因lac.在lac基因序列基础上,基于毕赤酵母密码子偏爱性,优化合成获得 lacm基因,与 lac相比,共改变 406个碱基,GC含量由61.3%变为 48.4%.重组质粒 pUC57-lacm与质粒pPIC9K均经 EcoRⅠ和 NotⅠ双酶切后连接,转化大肠杆菌 DH5α感受态细胞中,经 Amp抗性筛选,挑选阳性转化子,提取质粒并进行酶切验证.如图 1所示,经过 EcoRⅠ和 NotⅠ双切,重组质粒产生约1600bp和 9300bp的两条带,与预计大小相符,证明重组质粒构建成功.

图1 重组质粒的酶切鉴定Fig. 1 Enzyme digestion idenfication of recombinant plasmid

2.2 重组质粒电转及转化子鉴定

将重组质粒 pPIC9K-lacm线性化后电转毕赤酵母GS115感受态,将电转液涂布于MD平板.从MD平板上挑选转化子,提取基因组,进行 PCR验证.如图2所示,得到一条约1600bp的条带,证明lacm插入到毕赤酵母染色体中,成功构建重组菌株GS115/pPIC9K-lacm.

图2 GS115/pPIC9K-lacm的PCR扩增结果Fig. 2 PCR amplification results of GS115/pPIC9K-lacm

2.3 rLACM的诱导表达及纯化

对照菌株 GS115/pPIC9K和重组菌 GS115/pPIC9K-lacm经甲醇诱导发酵 120h后,离心得到发酵上清液.以2,6-DMP为漆酶底物时,测得rLACM的酶活力达到 0.37U/mL,而嗜热栖热菌来源的热稳定性好的漆酶酶活力约为 0.022U/mL,嗜盐菌Chromohalobacter salexigens来源的漆酶活力达到0.14U/mL[25,29].

对 rLACM 进行 SDS-PAGE分析,如图 3(a)所示,GS115/pPIC9K-lacm 与 GS115/pPIC9K 相比,在相对分子质量 5.8×104左右多出一条带,与预期rLACM 大小一致,以上说明 GS115/pPIC9K-lacm成功高效分泌表达rLACM.

如图 3(b)所示,使用镍柱亲和层析法纯化rLACM,并进行 SDS-PAGE分析,有一条单一条带,其相对分子质量约为 5.8×104,可用于后续的酶学性质研究.

图3 rLACM的SDS-PAGE分析Fig. 3 SDS-PAGE analysis of the rLACM

2.4 rLACM的酶学性质

2.4.1 rLACM的最适温度和温度稳定性

rLACM 的最适温度和温度稳定性如图 4所示.rLACM 的最适反应温度为 70℃,在 30~90℃范围内具有酶活性.对 rLACM 的热稳定性进行分析,其在30℃和40℃条件下保温5h,酶活力可维持在 95%左右;在 50℃和 60℃条件下保温 5h,酶活力仍在 50%以上;在 80℃条件下保温 1h,残余活力为25%左右.

图4 rLACM的最适温度和温度稳定性Fig. 4 Optimum temperature and thermostability for rLACM

由此可见,rLACM 的热稳定性能比真菌中的米曲霉(Aspergillus oryzae)以及细菌中的嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)的漆酶热稳定性能更加稳定[30-31].另外,黄俊等[20]报道的肺炎克雷伯氏菌 601(Klebsiella sp.601)来源漆酶在 80℃处理 30min,则完全失活;而 rLACM 在 80℃条件下保温 1h,残余活力为 25%左右.这表明 rLACM 具有较好的热稳定性.

2.4.2 rLACM的最适pH和pH稳定性

rLACM的最适 pH和 pH稳定性如图 5所示.rLACM的最适pH为8.0,在pH 7.0~9.0的范围内具有酶活性.对 rLACM 的 pH稳定性进行分析,其在pH 7.0和pH 8.0的条件下保温35h,其残余活力在70%以上.在pH 5.0和pH 6.0以及pH 8.0和pH 9.0的条件下保温20h,其残余活力在60%以上,而黄俊等[20]报道 Klebsiella sp.601来源漆酶在 pH 8.0和 pH 9.0条件下保温 24h残余酶活力分别为55%和10%左右.此外,在pH 4.0、pH 10.0的条件下保温20h,其残余活力仍分别保持在41%和35%.该结果表明,rLACM具有较宽的pH稳定范围.

图5 rLACM的最适pH和pH稳定性Fig. 5 Optimum pH and pH stability for rLACM

由上述研究表明,rLACM 与目前报道的细菌来源漆酶相比,兼具较好的热稳定性及较宽的 pH稳定范围;同时,经在毕赤酵母中表达 lacm基因获得的rLACM,其酶学性质与在大肠杆菌中表达的重组漆酶[24]相似,说明表达宿主的改变并未影响漆酶的特性,从而可以通过毕赤酵母表达系统制备该性能优良的rLACM.

3 结 语

本研究以肺炎克雷伯氏菌的基因组为模板,通过PCR扩增得到其漆酶基因 lac,基于毕赤酵母密码子偏爱性优化后得到新型漆酶基因 lacm,并成功构建重组菌株 GS115/pPIC9K-lacm,以 2,6-DMP为底物,发酵液中的酶活力达到 0.37U/mL,实现肺炎克雷伯氏菌漆酶的高效分泌表达.经酶学性质分析表明,以 2,6-DMP为底物时,rLACM 的最适温度为70℃,最适pH为8;在30~70℃、pH 5.0~9.0活力稳定.该rLACM表现出的良好的酶学特性为漆酶的应用奠定了基础.

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