微小RNA-23b-3p通过靶向TGFBR3促进人心房肌成纤维细胞纤维化相关基因表达*
2019-01-25杨真祯朱文思朱杰宁符永恒林秋雄谭虹虹单志新吴书林
杨真祯, 朱文思, 肖 珍, 朱杰宁, 符永恒, 林秋雄, 谭虹虹, 单志新, 吴书林△
[1华南理工大学医学院, 广东 广州 510632; 2广东省心血管病研究所, 广东省人民医院(广东省医学科学院), 广东 广州 510080; 3广东省妇幼保健院, 广东 广州 511400]
心房颤动(atrial fibrillation, AF)又称房颤,是临床常见的心律失常之一。现有的房颤治疗策略还存在局限,不良反应风险发生率较高,疗效不确切,远期复发率较高[1-2]。持续的房颤可导致电重构和结构重构,而心肌纤维化是结构重构的重要特征,现有的实验及临床数据表明,多种因素参与心肌纤维化及房颤的发生过程,包括氧化应激、钙超载、炎症以及肌成纤维细胞的激活等[3]。心房纤维化对心律失常的维持起到关键作用[2, 4]。房颤患者心脏纤维化组织的含量及分布与房颤发生的机制、并发症风险及治疗效果相关[4-5]。心肌纤维化是房颤重要的病理特征,导致细胞外基质的过度沉积,引起心肌重构甚至心力衰竭[6]。目前对于房颤及心肌纤维化的研究尚不深入,相关的病理生理机制仍不清楚。
微小RNA(microRNA,miRNA, miR)是在植物、动物和一些病毒中发现的非编码RNA,含有约22个核苷酸,通过影响靶基因mRNA稳定性和翻译来参与多细胞生物体中基因表达的转录后调控[7-8]。miRNA在多种基因调控途径中发挥关键作用,包括机体发育,造血干细胞分化,细胞凋亡,细胞增殖及器官发育等[9]。miRNA参与调控多种心血管疾病,包括冠状动脉粥样硬化、心肌纤维化、心力衰竭及心律失常等。例如,miR-21通过激活ERK信号通路从而促进纤维化的进展以及房颤的易感性[10];miR-29在犬房颤心房组织以及血浆中表达降低,而胶原基质同步增加,纤维化水平增高,而其机制主要是miR-29能阻断转化生长因子β1(transforming growth factor β1,TGF-β1)对胶原纤维以及细胞外基质蛋白分泌的促进作用;此外,miR-30和miR-590均能通过纤维化参与房颤的发展[11-12]。
我们前期miRNA表达谱芯片检测发现,miR-23b-3p在风湿性心脏病伴房颤患者心耳组织中表达显著增强,但其对心肌纤维化的作用尚不明确。本文将初步研究miR-23b-3p在人心肌成纤维细胞中对纤维化相关基因表达的调控作用,明确miR-23b-3p的作用靶基因。
材 料 和 方 法
1 主要试剂
限制性内切酶XhoI和EcoR I、转染试剂Lipofectamine 2000、TRIzol、逆转录试剂盒、4×SDS protein loading buffer、2×SYBR Green Mix和RNAase-free water(TaKaRa);miR-23b-3p mimic和TGFBR3 siRNA(广州锐博);BCA蛋白定量试剂盒和蛋白Marker(Thermo);SDS-PAGE凝胶配制试剂盒(Bio-Rad);抗GAPDH和COL3A1抗体(Protein Technology);抗COL1A1抗体(Thermo);抗ACTA2抗体(Abcam);抗TGFBR3 抗体(Affinity);PVDF膜和ECL发光液(Millipore);DMEM/F12细胞培养液、特级澳洲胎牛血清和0.25% EDTA-胰蛋白酶(Gibco);其它生化试剂均为进口分装或国产分析纯。
2 主要方法
2.1人心房肌成纤维细胞(human atrial fibroblasts,HAFs)原代分离培养和处理 将经患者知情同意的废弃的手术切除的新鲜心耳组织(本研究经广东省人民医院伦理委员会批准,手术标本来源:广东省心血管病研究所)置于预冷的PBS缓冲液中,只剪取近心房组织,去除淤血。用0.25% EDTA-胰蛋白酶消化法分离心房肌成纤维细胞。离心弃上清,沉淀用完全培养液(含10 %胎牛血清、1×105U/L 青霉素和100 mg/L 链霉素的DMEM/F12培养液)重悬,接种于25 cm2细胞培养瓶中,再置于37 ℃、5% CO2培养箱中培养。培养24 h后,更换一次完全培养液。待细胞密度达90%时,消化传代。取第3~7代细胞消化后铺于孔板内,分别将100 nmol/L scrambled对照、 miR-23b-3p mimic和TGFBR3 siRNA转染到HAFs中,24 h后结束实验。
2.2细胞免疫荧光鉴定HAFs中ACTA2表达 第3代的HAFs稳定生长后,用预热的PBS清洗3遍后,4%多聚甲醛室温固定30 min,用0.2% Triton X-100透化5 min,5% BSA室温封闭2 h,加ACTA2 Ⅰ抗(1∶500),4 ℃孵育过夜,加荧光Ⅱ抗室温避光孵育1 h,加入含核染料DAPI的封片剂覆盖细胞,室温孵育5 min后激光共聚焦显微镜下观察拍照。
2.3CCK-8、EdU和Transwell实验检测HAFs活力、增殖和迁移能力 在96孔板中接种密度合适的HAFs,稳定生长24 h后,分别转染scrambled对照和miR-23b-3p mimic。24 h后每孔加入培养液总体积10%的CCK solution,混匀培养4 h后检测450 nm处的吸光度(A)值。接种合适密度的HAFs于confocal皿中,稳定生长后按上述分组转染细胞,24 h后加入EdU工作液,使其终浓度为50 μmol/L,继续培养12 h,PBS清洗并用4%多聚甲醛固定后按说明书方法染色(Apollo®567染增殖细胞核),在激光共聚焦显微镜下观察并拍照。在Transwell小室内接种合适密度的HAFs,稳定生长后按上述分组转染细胞,24 h后更换不同浓度血清的培养液,小室外面血清浓度高于小室内,过夜后用PBS清洗细胞并用4%多聚甲醛室温固定30 min,用棉签擦除小室内底部细胞,结晶紫染色液染小室外底部细胞20 min,显微镜下观察并拍照。
2.4RT-qPCR检测TGFBR3和纤维化标志物mRNA及miR-23b-3p的表达情况 用TRIzol法提取HAFs中总RNA。取1 μg总RNA,加入5×逆转录试剂4 μL(逆转录试剂盒),用Oligo (dT)15和random primers逆转录出cDNA用于检测TGFBR3及纤维化标志物的 mRNA水平,以GAPDH为内参照。取1.0 μg总RNA,用miR-23b-3p特异的RT引物逆转录出cDNA用于检测miR-23b-3p水平,以U6为内参照。在ViiA 7 Quantitative PCR System(Applied Biosystems)进行PCR和结果分析。以2-ΔΔCt法计算TGFBR3、纤维化标志物和miR-23b-3p的相对表达水平。引物序列见表1。
表1 RT-qPCR引物序列
2.5Western blot法检测蛋白水平 处理后的HAFs中加入RIPA蛋白裂解液,冰上裂解,收集裂解液于4 ℃、12 000 r/min离心10 min,取上清,蛋白质定量后分装,加入4×上样缓冲液,99 ℃加热10 min使蛋白质变性,然后进行SDS-PAGE。用PVDF膜转膜,5%脱脂奶粉封闭1 h,分别用相应的抗体[anti-COL1A1(1∶2 000)、anti-COL3A1(1∶2 000)、anti-ACTA2(1∶2 000)和anti-TGFBR3(1∶1 000)]4 ℃孵育过夜。TBST洗膜后,加入Ⅱ抗(1∶5 000)室温孵育1 h。ECL发光试剂盒显影,以GAPDH(1∶5 000)为内参照,扫描灰度值并分析蛋白表达相对含量。
2.6双萤光素酶报告基因实验验证 miR-23b-3p与TGFBR3 3’-UTR的结合作用 参照我们已报道方法[13]分别构建包含miR-23b-3p潜在结合序列的TGFBR3 3’UTR重组萤光素酶报告质粒pGL3-TGFBR3-285-292。将HEK293细胞(细胞密度约为每孔1×105)转染1 μg重组萤光素酶报告质粒、100 nmol/L miR-23b-3p mimic或miR-23b-3p-Mut以及20 ng pRL-TK(表达海肾萤光素酶的内参照质粒)。转染后24 h,测定萤火虫萤光素酶(firefly luciferase, FL)及海肾萤光素酶(Renillaluciferase, RL)催化底物的发光强度。FL/RL的变化可反映miR-23b-3p与TGFBR3 3’UTR结合的能力。
3 统计学处理
用SPSS 21.0统计软件进行分析。数据均采用均数±标准误(mean±SEM)表示,两组间比较采用t检验;多组间比较采用单因素方差分析(one-way ANOVA),并用Bonferroni校正的t检验进行组间两两比较。以P<0.05为差异有统计学意义。
结 果
1 人心房肌成纤维细胞的分离及鉴定
原代分离的HAFs第2天观察细胞因杂质较多,只可见少量细胞,呈圆形,单个存在。3天后观察,细胞伸展,细胞呈长梭形,胞核明显。约1周后,细胞融合度达到90%,按1∶2比例传代培养。本研究所用HAFs为第3~7代细胞,其成纤维细胞表型在细胞因子刺激下逐步向肌成纤维细胞表型转化,大量分泌细胞外基质,ACTA2表达增多,利用细胞免疫荧光染色实验对HAFs表达的ACTA2进行鉴定,见图1。
2 miR-23b-3p对HAFs活力、增殖及迁移能力的影响
我们将100 nmol/L miR-23b-3p mimic转染入HAFs中,RT-qPCR结果显示,转染miR-23b-3p mi-mic的HAFs中miR-23b-3p水平显著升高(P<0.01),见图2A。CCK-8及EdU检测显示,与对照组相比,HAFs过表达miR-23b-3p后,细胞活力和增殖能力无显著差异,见图2B、C。同样地,Transwell检测显示,过表达miR-23b-3p对细胞迁移能力无明显影响,见图2D。
Figure 1.The morphology and identification of HAFs. A: cultured HAFs under light microscope (the scale bar=100 μm); B: expression of ACTA2 in HAFs detected by immunofluorescence staining assay (the scale bar=50 μm).
图1人心房肌成纤维细胞的分离及ACTA2表达鉴定
Figure 2.miR-23b-3p had no significant effect on the viability, proliferation and migration of HAFs. A: the expression level of miR-23b-3p in HAFs transfected with miR-23b-3p mimic was detected by RT-qPCR; B~D: the effects of miR-23b-3p on the viability, proliferation and migration of HAFs were detected by CCK-8, EdU and Transwell assays. Scale bar=100 μm. Mean±SEM.n=3.**P<0.01vsscrambled group.
图2miR-23b-3p对人心房肌成纤维细胞活力、增殖及迁移能力的影响
3 miR-23b-3p促进HAFs中纤维化相关基因的表达
RT-qPCR和Western blot检测结果显示,HAFs过表达miR-23b-3p后,纤维化相关基因COL1A1、COL3A1和ACTA2的mRNA和蛋白表达均显著升高(P<0.05,P<0.01),提示miR-23b-3p可在转录水平促进纤维化相关基因的表达,见图3。
4 TGFBR3介导miR-23b-3p促进HAFs中纤维化相关基因表达
利用miRDB(www.mirdb.org)和TargetScan (www.targetscan.org)数据库对TGFBR3及miR-23b-3p进行序列分析显示,TGFBR3 3’UTR的285~292碱基可能是miR-23b-3p的结合位点。双萤光素酶报告基因实验证实,miR-23b-3p可与TGFBR3 3’UTR的285~292位点特异性结合,而将miR-23b-3p序列突变后,miR-23b-3p-Mut不能与TGFBR3 3’UTR结合,见图4A。RT-qPCR和Western blot检测发现,过表达miR-23b-3p的HAFs中,TGFBR3的mRNA和蛋白表达水平均显著降低,提示miR-23b-3p可在转录水平调控TGFBR3的表达(P<0.05或P<0.01),见图4B。在HAFs中,利用TGFBR3 siRNA沉默靶基因TGFBR3的表达以及过表达miR-23b-3p后,Western blot检测显示,TGFBR3 的表达均显著降低,同时p-Smad3水平以及纤维化相关蛋白COL1A1、COL3A1和ACTA2的表达水平均一致性升高(P<0.05或P<0.01),见图4C。
讨 论
近期研究表明,miR-23b在脓毒症引起的心功能障碍中表达上调,miR-23b靶向抑制TGIF1,激活TGF-β1/Smad2/3信号通路,进而促进心肌成纤维细胞的分化,miR-23b还可靶向抑制PTEN,激活AKT/N-cadherin信号通路,从而导致细胞外基质的沉积[14]。另有研究表明,miR-23b-3p在充血性心力衰竭患者外周血中表达上调,提示miRNA可能在心力衰竭的病理过程中起作用,因为它们可能涉及与疾病进展有关的途径,包括纤维化[15]。miR-23b-3p在心脏疾病中的发挥重要作用,但其心肌纤维中的作用机制尚未完全阐明。
在本文中,我们成功从房颤患者心耳组织中分离并培养HAFs,通过ACTA2免疫荧光染色证实,分离得到的细胞为表达ACTA2表型的肌成纤维细胞,适合用于纤维化表型相关的研究。鉴于心肌成纤维细胞的增殖和迁移也是心肌纤维化的重要特征[16]。我们分别通过CCK-8、EdU染色和Transwell实验检测HAFs的活力、增殖和迁移能力,结果显示miR-23b-3p对HAFs的活力、增殖及迁移能力无明显影响。进一步,通过将miR-23b-3p mimic转染入HAFs,证实miR-23b-3p可显著增强纤维化相关基因COL1A1、COL3A1和ACTA2表达,从而明确miR-23b-3p主要通过增强纤维化相关基因表达来发挥促进心肌纤维化的作用。
Figure 3.miR-23b-3p enhanced the expression of fibrosis-related genes in HAFs. A: the mRNA expression of COL1A1, COL3A1 and ACTA2 was determined by RT-qPCR assay; B: the fibrosis-related protein expression was determined by Western blot. Mean±SEM.n=3.*P<0.05,**P<0.01 scrambled group.
图3miR-23b-3p促进人心房肌成纤维细胞中纤维化相关基因表达
已有的研究报道,多种microRNA参与调控心肌纤维化过程,如miR-29a可靶向VEGF-A/MAPK信号通路,抑制心肌成纤维细胞纤维化水平及增殖[17];miR-199a-5p靶向Sirt1促进心肌成纤维细胞中心肌纤维化相关基因表达[18];miR-24可抑制心肌成纤维细胞中纤维化相关基因表达,并且降低心肌成纤维细胞的增殖及迁移能力[19];我们通过序列分析提示TGFBR3可能是miR-23b-3p的靶基因,通过双萤光素酶报告基因实验证实miR-23b-3p与TGFBR3 3’UTR有特异性结合作用;进一步,我们证实miR-23b-3p可在mRNA和蛋白水平抑制HAFs中TGFBR3的表达,说明miR-23b-3p在转录水平抑制TGFBR3表达。功能实验结果表明,miR-23b-3p和TGFBR3 siRNA可一致性地促进HAFs中纤维化相关基因表达。因此,上述结果证实TGFBR3是miR-23b-3p的靶基因,并介导了miR-23b-3p发挥促进HAFs中纤维化相关基因表达的作用。
TGFBR3是TGF-β超家族的共受体,介导TGF-β信号转导,但抑制TGF-β与TGFBR1及TGFBR2的结合作用,发挥抑制TGF-β/Smad3信号通路的作用[20],并已被证实与多种疾病的发生相关[21-22]。研究显示,miR-21可靶向抑制TGFBR3的表达,从而促进心肌纤维化,而过表达TGFBR3后可抑制miR-21和心肌纤维化水平[23]。在小鼠肺成纤维细胞中抑制TGFBR3的表达可加剧肺纤维化的过程[24]。本文结果表明,miR-23b-3p可抑制HAFs中TGFBR3的表达,激活Smad3信号并增强纤维化相关基因表达。本文结果与以往关于TGFBR3具有抑制心肌纤维化作用的报道一致[23, 25-26]。
Figure 4.TGFBR3 mediated the effect of miR-23b-3p on upregulation of fibrosis-related genes in HAFs. A: dual-luciferase reporter assay; B: the mRNA and protein expression of TGFBR3 in HAFs transfected with miR-23b-3p mimic; C: the protein expression of COL1A1, COL3A1, ACTA2, TGFBR3, p-Smad3 and Smad3 in HAFs after transfection with miR-23b-3p mimic orTGFBR3 siRNA (si-TGFBR3). Mean±SEM.n=3.##P<0.01vspGL3-promoter+scrambled group;*P<0.05,**P<0.01vsscrambled group.
图4TGFBR3介导miR-23b-3p促进人心房肌成纤维细胞中纤维化相关基因表达
综上所述,本文证实TGFBR3是miR-23b-3p的作用靶基因,介导miR-23b-3p激活HAFs中Smad3信号,发挥促进纤维化相关基因表达的作用。在后续研究中,我们将在整体动物水平进一步明确miR-23b-3p对TGFBR3表达和心肌纤维化的调控作用。