进口蜂蜜中幼虫芽孢杆菌的分离鉴定及调查
2019-01-22李如松王建峰倪健波黄素文赵秀玲陈先锋黄绍棠
李如松,王建峰*,倪健波,黄素文,郑 剑,赵秀玲,陈先锋,黄绍棠
(1.宁波检验检疫科学技术研究院,浙江 宁波 315100;2.湖北检验检疫科学技术研究院,湖北 武汉430050)
幼虫芽孢杆菌(Paenibacillus larvae)是一种革兰氏阳性类芽孢杆菌,具有极强的生命力,可在蜂蜜[1]、蜂王浆、蜂胶和蜂花粉中存活,可引起美洲幼虫腐臭病(American foulbrood,AFB)。AFB是一种主要侵害蜜蜂幼虫和蜂蛹的急性毁灭性传染病,一旦发生极易造成蜂群衰弱及死亡,很难彻底清除,给养蜂业造成重大经济损失[2]。在曾经暴发过该病的养蜂区域能存活长达35年,因此该病被OIE列入OIE疫病名录(OIE-listed iseases),为必须通报的动物疫病[3]。通过对国内外蜂蜜的标准进行综合分析,发现目前蜂蜜标准主要关注质量、安全、真实性等相关的指标,而忽略了蜂蜜可以传播美洲幼虫腐臭病的风险[4],因此本研究对进口蜂蜜进行调查,并对分离株的16S rRNA基因进行生物信息学分析,为进口蜂蜜风险控制提供依据。
1 材料与方法
1.1 样品及主要试剂2017年度宁波地区进口蜂蜜样品71份,分别来自加拿大、澳大利亚、西班牙等10个国家和地区。MYPGP培养基(Mueller-Hinton broth、酵母抽提物、K2HPO4、丙酮酸盐、葡萄糖)由本实验室配置并添加吡哌酸和萘啶酮酸;细菌基因组DNA提取试剂盒购自天根生化科技(北京)有限公司;2×EasyTaqPCR SuperMix(+dye)购自北京全式金生物技术有限公司。
1.2 细菌的分离培养及鉴定按照OIE《陆生动物诊断实验和疫苗手册》2017版2.02.02的方法进行分离,蜂蜜样品加热至45℃~50℃,PBS或生理盐水稀释,80℃处理10 min。离心弃上清液,留下约 3 mL液体,混匀后,取悬液 200 μL涂布于MYPGP平板,37℃培养7 d~8 d,挑选可疑菌落进行纯化、观察菌落形态、镜检和生化鉴定,生化鉴定参照国家行业标准SN/T 1681-2011[5]。
1.3 16S rRNA基因扩增和序列分析按照细菌基因组DNA提取试剂盒的说明书,提取细菌DNA作为模板,参照文献[6]报道合成引物,并进行PCR扩增其16S rRNA,PCR产物经1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测后由上海派森诺生物科技有限公司测序,利用Blast和DNAStar对测序结果进行分析,并构建系统发育树。
2 结果与讨论
2.1 细菌的分离鉴定对采集的蜂蜜样品进行分离培养,在71份蜂蜜样品中共分离到菌株31株,详见表 1,阳性率达到 43.6%(31/71)。分离菌在MYPGP平板上观察到整齐、粗糙、扁平或突起的灰白色小菌落(图1A),镜检结果为革兰氏阳性杆菌(图1B)。生化反应结果与国家行业标准[5]结果一致(表1)。表明分离得到的细菌为幼虫芽孢杆菌。
图1 分离株培养性状观察Fig.1 The characters of the isolates
2.2 16S rRNA基因鉴定和序列分析细菌16S rRNA基因序列具有相对稳定和易变异的双重特点,常用于细菌的分类鉴定,Dirk Gevers等的研究结果表明菌株之间16S rRNA的序列同源性≥97%的才有可能是同种细菌[7]。31株分离细菌的PCR产物约为1 400 bp(图略),经测序及比对分析结果显示所有菌株的16S rRNA基因序列与P.larvae(ATCC9545)等标准菌株同源性大于97%,可以判定这些菌株均为幼虫芽孢杆菌。
16S rRNA序列变化是微生物的系统发育和进化的重要的指示之一,本研究利用DNAStar软件中MegAlign对包括 31株分离株(分别来自于澳大利亚、法国,韩国、加拿大、罗马尼亚、台湾、西班牙、希腊、新西兰、匈牙利)、3株ATCC保藏菌株(ATCC13537、ATCC25368、ATCC9545),1 株 DSM保藏菌株(DSM3615)进行核苷酸比对和同源性分析。结果显示31株分离菌的16S rRNA核苷酸序列同源性为99.8%~100%,具有较高的保守性和稳定性,遗传变异较低。基于该基因的系统发育树结果显示,35株分离菌分成2个大分支,ATCC9545单独一支,其原因可能是GenBank中ATCC9545的16S rRNA中存在多个兼并碱基原因。加拿大分离株(4株)、韩国分离株(1株)、台湾分离株(1株)、澳大利亚分离株(1株)在同一分支;法国分离株(1株)和新西兰分离株(1株)在同一分支(图2),由此表明幼虫芽孢杆菌的16S rRNA比较保守,聚类分析发现基因差异较小,不适宜用作区分不同地理来源分离株的分子遗传标记。
表1 31株分离的幼虫芽孢杆菌生化特性Table 1 Detection of the biochemical characters of 31 P.larvae isolates
图2 35株幼虫芽孢杆菌16S rRNA进化树Fig.2 The phylogenetic tree base on 16S rRNA sequences of P.larvae isolates