RF-LAMP技术检测肉制品中沙门氏菌的研究
2019-01-08陈发荣王保娟常彦磊时国强
徐 慧,陈发荣,王保娟,王 永,石 磊,陈 洵,常彦磊,时国强,6,张 伟
(1.河北农业大学,河北保定 071001;2.北京艾旗斯德科技有限公司,北京 101102;3.天津市农业质量标准与检测技术研究所,天津 300232;4.暨南大学食品安全与营养研究院,广东广州 510632;5.广州双螺旋基因技术有限公司,广东广州 510320;6.河北三狮生物科技有限公司,河北石家庄 050011)
沙门氏菌(Salmonella) 是一种常见的食源性致病菌,属肠杆菌科、革兰氏阴性肠道杆菌[1],主要寄生于人类和动物肠道中,可致食物中毒、慢性肠炎、肠热症等[2]。因沙门氏菌经常存活于肉制品、蛋类、水产品中,在20℃以上即能大量繁殖,世界各国普遍规定食品中不得检出沙门氏菌[3]。根据数据统计,人摄入含有一定量沙门氏菌(1×106~1×107CFU/g)的动物性产品后易引发细菌性感染,我国每年细菌性食物中毒中70%~80%是由沙门氏菌引起的[4-5]。
目前,常用的沙门氏菌检测方法有传统方法如国家标准、AOAC等,以免疫学为基础的检测方法如酶联免疫法(ELISA)等,以分子生物学为基础的检测方法如聚合酶链式反应(PCR) 等[6]。传统方法培养时间较长,一般需要3~4 d检测时间[7]。ELISA方法从样品的制备到检测结束大概要40~48 h才能完成,且由于使用的多价血清存在不同程度的交叉反应,容易产生假阳性[8]。PCR方法需要昂贵的PCR仪器和繁琐的电泳,故不宜普遍推广。因此,亟需开发一种快速检测食品中沙门氏菌的检测方法,对于保障我国食品安全具有重要意义。
研究在环介导等温扩增法(LAMP)[9]基础上,结合荧光染料SYBR Green I建立的一种实时荧光LAMP(RF-LAMP)技术,为实现沙门氏菌的快速检测提供了新的思路。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 菌株
试验所用菌株包括甲型副伤寒沙门氏菌、乙型副伤寒沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、肠炎沙门氏菌、单增李斯特氏菌、小肠结肠炎耶尔森氏菌、普通变形杆菌、蜡样芽孢杆菌、福氏志贺氏菌、宋内氏志贺氏菌、大肠杆菌O157∶H7、产气荚膜杆菌、阪崎肠杆菌、金黄色葡萄球菌和副溶血性弧菌。
1.1.2 样品
肉制品,购自保定市某超市。
1.1.3 主要培养基和试剂
营养肉汤和营养琼脂,北京陆桥技术股份有限公司提供;Bst DNA聚合酶、MgCl2和dNTPs,大连宝生物工程有限公司提供;荧光试剂,Sigma公司提供;实时荧光LAMP内、外引物,合成于大连宝生物工程有限公司;DNA提取试剂盒,北京全式金生物技术有限公司提供。
1.1.4 主要仪器
WH-861型旋涡混合器,太仓市科教器材厂产品;数显超级恒温水浴锅,金坛市杰瑞尔电器有限公司产品;QYC-200型全温摇床,上海新苗医疗器械制造有限公司产品;实时荧光监测仪,德国ESE Gmbh公司产品;TGL-16G型离心机,上海安亭科学仪器厂产品。
1.2 方法
1.2.1 纯菌的培养
取保藏的菌株接种于灭菌的NB液体培养基中,于37℃条件下振荡培养过夜。
1.2.2 DNA模板的制备
研究采用热裂解法进行DNA模板的提取。取过夜培养的菌悬液1.5 mL于灭菌离心管中,以转速11 000 r/min离心1 min,弃去上清液。加入300 μL无菌蒸馏水洗涤菌体沉淀,重复2次,然后加入100 μL无菌蒸馏水,使菌体充分振荡悬浮;在沸水浴中将菌悬液煮沸10 min,然后以转速11 000 r/min离心1 min,将上清液转移至另一新的灭菌离心管中,于-20℃条件下保存备用。
1.2.3 引物设计
研究选取Genebank中已经公布的沙门氏菌inv基因作为靶基因。
实时荧光LAMP所用引物见表1。
表1 实时荧光LAMP所用引物
1.2.4 RF-LAMP反应体系
总反应体系 (25 μL) 包括 2.5 μL 10×Bst buffer,1 μL镁离子(50 mmol),5 μLdNTPs(2.5 mmol)混合物,1 μLBst酶(8 000 U/mL),1 μL甜菜碱(5 mol),1.5 μL 模板 DNA,0.5 μL SYBR,FIP 和 BIP 引物(10 mmol)各2.5 μL,F3和B3引物(10 mmol)各0.5 μL,无菌双蒸水补足体积至 25 μL。扩增反应条件为61℃条件下反应1 h。
1.2.5 RF-LAMP的特异性
采用热裂解法对表1中15株菌进行基因组DNA提取。阴性对照用无菌蒸馏水代替模板。按照优化好的RF-LAMP反应体系进行扩增来验证该方法的特异性。
1.2.6 RF-LAMP检测纯菌的灵敏度
以编号为CMCC 50041的肠炎沙门氏菌作为试验菌种进行灵敏度和检出限的检测。将过夜培养的新鲜菌液进行平板菌落计数,测得菌液浓度为5.6×109CFU/mL。用无菌生理盐水对其进行10倍梯度稀释,得到连续稀释的肠炎沙门氏菌悬液。取1 mL各稀释梯度的菌悬液提取基因组DNA,并进行RFLAMP方法的灵敏度试验。
1.2.7 RF-LAMP检测人工污染肉制品的检出限
取25 g经国标法检测无沙门氏菌的肉制品加入到225 mL的无菌生理盐水中,制成匀浆液,取9 mL加到离心管(10 mL) 中,分别将10倍梯度稀释的菌悬液(5.1×107~5.1×102CFU/mL) 各1 mL加到上述离心管中,混匀,得到不同浓度的菌液匀浆。用1.2.2中所述热裂解法提取基因组DNA,并用RF-LAMP方法验证人工污染肉制品中沙门氏菌的检出限。
2 结果与分析
2.1 RF-LAMP的特异性
实时荧光LAMP引物特异性的检测结果见表2。
从表2中可以看出,用于RF-LAMP特异性试验的15株试验菌株中,4株沙门氏菌检测结果为阳性;其他11株非沙门氏菌检测结果为阴性,结果表明该研究建立的方法特异性强。
表2 实时荧光LAMP引物特异性的检测结果
2.2 RF-LAMP检测纯菌的灵敏度
实时荧光LAMP检测沙门氏菌的灵敏度见图1。
图1 实时荧光LAMP检测沙门氏菌的灵敏度
由图1可以看出,当沙门氏菌纯培养物浓度为5.6×105CFU/mL~5.6×101CFU/mL时,荧光曲线出现明显的扩增峰,仪器自动判定为阳性;当浓度为5.6×100CFU/mL时,荧光曲线平缓,未出现扩增峰,判定为阴性。因此,研究所建立RF-LAMP检测沙门氏菌的灵敏度为56 CFU/mL。
2.3 RF-LAMP检测人工污染肉制品的检出限
实时荧光LAMP法人工污染肉制品检出限的确定见图2。
从图2中可以看出,当沙门氏菌纯培养物浓度为5.6×107CFU/g~5.6×104CFU/g时,荧光曲线出现明显的扩增峰,仪器自动判定为阳性;当培养物浓度为5.6×103CFU/g时,荧光曲线平缓,未出现扩增峰,判定为阴性。因此,研究所建立RF-LAMP检测人工污染肉制品的检出限为5.6×104CFU/g。
图2 实时荧光LAMP法人工污染肉制品检出限的确定
3 结论
研究建立了一种RF-LAMP方法来快速检测沙门氏菌,检测灵敏度为56 CFU/mL,检测人工污染肉制品中沙门氏菌的检出限为5.6×104CFU/g。该方法是在LAMP技术的基础上,向体系中添加荧光染料,通过观察是否有峰图出现就可知道反应是否发生。与PCR方法相比,RF-LAMP可在等温条件下完成扩增,不需要昂贵的PCR仪;与传统LAMP相比,该方法的灵敏度更高,且避免了传统LAMP产生的气溶胶污染。该方法在结果出现后可直接终止反应,既节省时间又降低了试验成本,同时避免了繁琐的电泳。总之,该研究建立的RF-LAMP检测沙门氏菌方法特异性强、灵敏度高,为沙门氏菌的快速检测开辟了新途径,适合在基层检测机构推广应用。