从土耳其进境番茄种子上首次截获番茄斑萎病毒
2018-11-08辛冯黎霞章柱武目涛李新浩丁
余 辛冯黎霞章 柱武目涛李新浩丁 钿
(1广州机场出入境检验检疫局,广东广州 510000;2广东检验检疫技术中心,广东广州 510000)
番茄(Solanum lycopersicum)是全世界栽培最为普遍的茄果类蔬菜之一,近十年来全世界番茄的消费量以平均每年3%的速度增长。病毒病在世界各国番茄种植区普遍发生,严重威胁番茄的安全生产。目前,危害番茄的病毒有40余种(Hanssen et al.,2010),可通过种子携带的有南芥菜花叶病毒(Arabis mosaic virus,ArMV)、黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)、烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)、番茄花叶病毒(Tomato mosaic virus,ToMV)、番茄斑萎病毒(Tomato spotted wilt virus,TSWV)、番茄环斑病毒(Tomato ringspot virus,ToRSV)、番茄黑环病毒(Tomato black ring virus,TBRV)等。在这些病毒中,TSWV、ArMV、ToRSV、TBRV等是我国禁止进境的检疫性有害生物。
番茄斑萎病毒是布尼亚病毒科(Bunyaviridae)番茄斑萎病毒属(Tospovirus)的代表种,是农业生产上危害非常严重的病毒。Brittlebank(1919)最早在澳大利亚发现TSWV为害番茄,1965年TSWV在大丽菊上被首次分离出来后,研究人员相继从青椒、番茄及多种观赏植物上分离出该病毒。目前TSWV在欧洲、北美洲、南美洲、亚洲和大洋洲等多个国家和地区广泛分布,热带、亚热带、温带地区均有发生,是名副其实的全球性植物病害,被列为世界十大植物病害之一。TSWV的寄主范围十分广泛,能感染超过84科1 090种植物,寄主作物主要有烟草、花生、辣椒、莴苣、茄子等(Parrella et al.,2003)。20世纪80~90年代,TSWV在美国夏威夷、意大利、南非和巴西的流行导致当地的番茄、叶用莴苣(生菜)等作物近乎绝产(Wilson,1998;Pappu et al.,2009;Al-Saleh et al.,2014)。在有些年份,夏威夷莴苣作物因受TSWV破坏,经济损失达50%~90%(Cho et al.,1989)。近些年来,陆续在我国的四川、广州、北京等地多种植物上发现TSWV的危害(许泽永 等,1988;姚革,1992;陈东亮 等,2018)。
近二十年来,基于抗原抗体反应的血清学方法和基于PCR反应的分子生物学方法发展非常迅速,已广泛应用于植物病原菌的检测鉴定中,其中DAS-ELISA和RT-PCR因具有高度的专一性和灵敏度,又可在短时间内得到结果,已成为检测鉴定植物病毒的重要方法(金羽和文景芝,2005)。我国发布的番茄斑萎病毒检疫鉴定国家标准GB/T 31802—2015规定了利用植物叶片进行TSWV检测鉴定的方法和程序,TSWV阳性检出的判定标准为:DAS-ELISA测定为阳性,同时RT-PCR或者实时荧光定量PCR测定为阳性。同时,科研人员也在不断研究并建立快速可靠的TSWV检测方法,Boonham等(2002)运用实时荧光定量PCR技术、吴兴海等(2016)利用恒温扩增技术等建立了TSWV快速检测鉴定技术,刘忠梅等(2017)应用DPO技术建立番茄斑萎病毒检测方法,冯黎霞等(2017)从进境的生菜种子中检测到TSWV。据报道,目前国内外大多是针对番茄感病叶片或果实进行病毒检测,国家标准GB/T 31802—2015中也要求采集叶片用于检测番茄斑萎病毒。直接对番茄种子进行种传病毒的检测鉴定很少(廖富荣 等,2011),也没有直接从番茄种子中检测到TSWV的报道。
本试验以2018年7月自广东口岸进境的土耳其番茄种子为试材,采用研磨的种子进行病毒检测,取样量较大且样品均一性高,利用DASELISA方法初筛鉴定,并进一步进行RT-PCR检测和序列测定,证实该批土耳其进境番茄种子确实携带TSWV,实现了TSWV的快速准确鉴定。
1 材料与方法
1.1 检测样品
检测样品为2018年7月自广州白云国际机场口岸进境的土耳其番茄种子,编号为1-4436751。
1.2 检测试剂
用于双抗体夹心-酶联免疫吸附试验(DASELISA)多克隆抗体及阳性对照样品购自美国Agdia公司,检测的病毒种类包括南芥菜花叶病毒(ArMV)、番茄斑萎病毒(TSWV)、番茄环斑病毒(ToRSV)、番茄黑环病毒(TBRV)。
柱式植物RNA提取试剂盒、RT-PCR两步法反应试剂盒、DNA Marker购自大连TaKaRa生物有限公司。其他试剂均为国产分析纯。
1.3 样品制备
称取0.5 g番茄种子至研磨罐中,在研磨机上研磨1 min,将粉末转移至5 mL离心管中,加入3 mL样品提取缓冲液并混合均匀,然后10 000 r·min-1离心5 min,上清液用于DAS-ELISA检测。另取100 μL上述样品提取液,按照试剂盒说明书提取总RNA,用TSWV特异性引物进行扩增,用于RT-PCR检测。
1.4 DAS-ELISA检测
根据Agdia试剂说明书对番茄种子提取液进行DAS-ELISA检测。每个样品2次重复,取平均值。每孔加入检测样品提取液100 μL,并在阳性和阴性对照明显显色后(约30 min),在酶标仪中读取吸光值OD405。在满足质量控制要求下,如果样品OD405/阴性对照OD405≥2,判定为阳性,样品OD405/阴性对照OD405<2,判定为阴性。
1.5 RT-PCR检测
TSWV特异性引物序列和扩增程序参照国家标准 GB/T 31802—2015,引物序列(5′-3′)为:F-AGGATTGGAGCCACTGAC,R-GCTGGAGCT GAGTATAGCAG,扩增序列片段长度为270 bp。检测时以含TSWV材料的cDNA作为阳性对照,以健康植物材料作为阴性对照,以水代替模板作为空白对照。
cDNA合成:反应体系共20 μL,其中模板RNA 3 μL, 反 向 引 物(20 μmol·L-1)1 μL,5×MMLV 酶缓冲液 5 μL,dNTP(10 mmol·L-1)2 μL,MMLV 反 转 录 酶(5 U·μL-1)1 μL,RNAase抑制剂1 μL,补无RNAase水至20 μL。然后37 ℃ 1 h,94 ℃ 10 min,自然冷却至室温,-20℃冰箱保存。
PCR扩增体系为25 μL,其中DNA模板2 μL, 上 /下 游 引 物(20 μmol·L-1)0.4 μL,10×PCR 缓 冲 液 2 μL,dNTP(10 mmol·L-1)1 μL,Taq酶(5 U·μL-1)0.5 μL,RNAase抑 制剂1 μL,补双蒸水至25 μL。反应程序:94 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s,53 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,35 个循环;72 ℃ 10 min。
PCR反应结束后取5 μL扩增产物进行1.0%琼脂糖凝胶电泳,然后在凝胶成像仪上观测和拍照。
1.6 序列测定和分析
PCR产物回收后进行测序(华大基因技术有限公司)。用Blast进行序列分析,用于比较的GenBank中番茄斑萎病毒序列登录号为:JX452818、JX452817、KP006412、KP006413、JX452816。
2 结果与分析
2.1 DAS-ELISA检测
DAS-ELISA检测结果表明(表1),在检测样品中,TSWV检测项目的OD405/阴性对照OD405>2,TSWV血清学检测结果呈阳性;其余检测项目中样品OD405/阴性对照OD405<2,检测结果呈阴性。根据DAS-ELISA检测结果,初步判断该批番茄种子中携带TSWV。
表1 番茄斑萎病毒DAS-ELISA检测OD值
2.2 TSWV的RT-PCR检测与序列测定
2.2.1 RT-PCR检测 RT-PCR检测结果表明,检测样品扩增出1条与TSWV阳性对照大小一致的条带(270 bp左右),而阴性对照及空白对照没有扩增到该目标条带(图1)。因此,该检测样品TSWV的RT-PCR特异性检测结果呈阳性。
图1 番茄种子中TSWV特异引物的RT-PCR检测结果
2.2.2 序列测定与分析 PCR产物回收纯化后进行测序。结果表明,引物的扩增片段为270 bp,含有上下游引物的相应序列,与预期大小一致。序列Blast比对结果显示,与登录号为KP006413、JX452816的TSWV分离物序列相似度为99%,与登录号为JX452817、JX452818的TSWV分离物相似度达100%。结合DAS-ELISA检测结果,判断该批番茄种子中携带TSWV。
3 结论与讨论
TSWV寄主范围广泛,甚至能侵染一些田间杂草,从而使病源清除困难、传播速度快、防治困难。TSWV在世界范围内的发生与西花蓟马、棕榈蓟马等的广泛分布和携带病毒植物的调运有关(侯海霞 等,2015;卢小雨 等,2016)。其中西花蓟马是TSWV最高效的传播媒介,繁殖速度快、适宜性强、极易产生抗药性,防治难度较大。进境检验检疫数据表明TSWV多次在蓖麻、菜豆、生菜、莴苣、辣椒种子和马蹄莲种球、大丽花种球中被口岸截获。及时在口岸鉴定并销毁,是重要且有效防控TSWV的手段之一。
本试验直接采用研磨的种子进行检测,节省了种子育苗时间,缩短了检测周期和口岸货物通关周期。大量取样处理,在保证样品质量的前提下,样品更具有检测代表性。同时,由于DAS-ELISA可能会产生假阳性,采用了从血清学检测的样品提取液中提取总RNA进行RT-PCR扩增(廖富荣等,2011),保证了两种技术方法采用的为完全一致的样品,而且两种检测方法均为阳性检出,也与TSWV国家标准的判定一致。这是我国首次在进境番茄种子中截获TSWV,为进一步加强TSWV的检疫、防疫工作敲响了警钟,也对TSWV在种间传播的研究具有重要推动意义。