植物内质网胁迫应答研究及进展探讨
2018-10-31魏圆圆
魏圆圆
摘 要 本文以内质网胁迫为对象,就其在植物中应用进展作一探讨。另外,本文还剖析了内质网胁迫与膜结合转录因子间所存在的关系,指出了在对内质网胁迫途径进行研究中还没有得到解决的问题,望能为深层化研究内质网胁迫与抗逆之间关系提供参考与依据。
关键词 植物 内质网 胁迫应答
中图分类号:Q503 文献标识码:A
在整个真核生物体系当中,蛋白质有着非常复杂的合成过程,而细胞质当中的核糖体为合成的核心场所。针对那些大分子蛋白,比如在整个细胞总蛋白中约占1/3的分泌蛋白,或者是膜蛋白等,需先进内质网,然后再根据实际需要,进行修饰与折叠,只有蛋白质经过正确、规范化的折叠与修饰,方能向细胞器中转换(如细胞核、线粒体等),并将其生物功能最大化发挥出来。针对蛋白质整个折叠过程而言,不仅精细而且还比较复杂,易受外界影响,造成蛋白出现错误折叠,或者是难以折叠的情况。本文就植物内质网胁迫应答研究及进展作一探讨。
1经典未折叠蛋白的基本应答途径分析
1.1以IREl为介导的XBPmRNA非常规剪接途径分析
在酵母中,IRE1乃是一个比较典型的内质网胁迫感应器,无论是在动物未折叠蛋白应答中,还是在植物应答中,均发挥着重要作用与地位。对于IRE1而言,其实为一个内质网驻留蛋白质,具有单次跨膜的特点,其不仅拥有内切核酸酶RNase活性,而且还有胞质激酶活性。在整个内质网当中,当未折叠蛋白质出现持续、不间断累积时,对于此时的IRE1蛋白而言,其便会形成比较典型的多聚体,将IRE1所持有的蛋白激酶活性激活,且出现磷酸化,并使其内切核酸酶活性得到进一步激活;还需要指出的是,无论是动物XBP1,还是酵母HAC1,针对与之处于对应状态的mRNA,实施非常规剪切处理,将一些核苷酸切掉,并对原有的蛋白形式进行重新编码。针对此形式而言,其不仅拥有典型的转录激活活性,而且还拥有核定位信号,还可以进入细胞核,对蛋白折叠相应UPR基因進行调节,最终达到缓解内质网胁迫的目的。
1.2 ATF6-S2P水解的基本途径
针对ATF6而言,其在整个哺乳动物体系中,实为一个bZIP家族跨膜转录因子(内质网II型),对于其N端来讲,其多处于细胞质当中,在整个架构当中,其囊括有一个呈碱性状态的亮氨酸拉链结构域,而对于C端来讲,其多处于内质网腔。通常情况下,处于全长状态的ATF6,会被BiP滞留,并且始终维持在内质网当中;还需要指出的是,基于内质网的影响及持续胁迫下,COPII会转移ATF6,使其经膜泡,而持续运至高尔基体当中,然后由2个蛋白酶(S1P与S2P),实施分步酶切操作,完成酶切后,其形式会发生改变,其中不存在跨膜域,此时,经核定位信号,便会持续进入到细胞核中,将下游UPR相应基因表达予以激发;针对此种酶切方式来讲,也业内又被称作蛋白质水解方式。
1.3 PERK/ATF4-CHOP选择翻译性途径分析
针对PERK来讲,其实为一个能够在内质网中定位,并且还含有跨膜域的一种激酶,针对C末端来讲,其所处对象为胞质,而对于N末端来讲,其方向所指的是内质网腔,从根本上来讲,其拥有比较典型且具有独特性的丝/苏氨酸蛋白激酶活性,现阶段,仅能在动物当中被发现。针对翻译起始因子eIF2来讲,其内部所含有的 亚基(eIF2 ),便会以一种独特方式与GTP相结合,然后可以与tRNA融合在一起,对起始复合物进行翻译。如果内质网处于应激状态,针对此时的PERK磷酸,其在化真核起始因子eIF2 位置上,在丝氨酸排位上,处于第51位。针对eIF2 来讲,当其已经被磷酸化之后,便会对翻译起始复合物当中的GTP与GDP的交换进行有效抑制,在此过程中,其会对蛋白质相应翻译施加抑制,还会对其合成进行相应抑制,因而能够较大程度减少进入到内质网当中的蛋白。
2植物膜结合转录因子与内质网胁迫应答
2.1 AtbZIP28途径分析
当处于正常状态下,针对拟南芥膜结合转录因子(bZIP28)来讲,经跨膜域,实现在ER当中的定位,当感应到胁迫后(内质网胁迫、高温等),对于此时的bZIP28来讲,其便会进入高尔基体中,并且还会分别被丝氨酸蛋白酶当中的S1P、S2P实施分步酶切处理,将跨膜域去掉;在实际操作中,通过对位信号进行核定,并进入到指定的细胞核中,并且还会对诸多与UPR之间存在关联的基因进行上调,以此来更好的帮助蛋白折叠。在整个哺乳动物体系当中,对于ATF6而言,其会被BiP长期滞留于内质网中,基于内质网的影响、作用与胁迫下,COPII会借助于膜泡运输,把ATF6持续向高尔基体传送。在植物当中,大多经过预测明确是停靠于移动高尔基体(内质网出口位点),无需中间囊泡,便可以把内质网蛋白以一种合理方式向高尔基体转运;虽然是这样,许多报道指出,从内质网至高尔基体,在其整个转运过程相关于COPII装置。
2.2 AtbZIP60/OsbZIP74途径分析
针对拟南芥bZIP60(水稻bZIP74)来讲,其在具体的活化方式上,不同于AtbZIP28。对于AtbZIP60/OsbZIP74所持有的mRNA来讲,其可以根据实际需要,形成二级发夹结构,并且还会被IRE1识别出来,于mRNA水平上,开展非常规剪切操作。在整个内质网当中,随着未折叠蛋白质的持续、不间断积累,IRE1蛋白便会根据实际情况,形成多聚体,将IRE1所对应的蛋白激酶活性激活,加速自体磷的持续酸化,从中推动内切核酸酶活性的不断激活,还需要指出的是,通过对bZIP60mRNA中所存在的双茎环结构激活,并将其中的23个核苷酸去除掉,势必会造成阅读框移码,并且还会出现异常化的终止密码子,受此影响,其便会被重新编码,成为一个并没有跨膜域的单纯性的蛋白形式。针对形式来讲,其不仅拥有转录激活活性,而且还有核定位信号,可以根据实际需要,进入到细胞核当中,并对UPR基因表达实施上调处理,实现细胞的更好生存。针对植物当中的IRE1蛋白来讲,其与酵母与动物当中的IRE1蛋白序列向比较,存在着比较高的同源性,但需要指出的是,针对与IRE1蛋白相对应的剪接底物来讲,其所持有的核苷酸序列,相比于酵母与动物的IRE1蛋白所持有的剪接底物核苷酸序列,存在着比较低的相似性。
2.3 NAC062途径分析
针对真核的分泌系统来讲,其主要由疏水区域、囊泡、内质网、高尔基体与质膜构成。针对NAC062来讲,其在整个植物特异转录因子NAC家族当中,乃是其核心成员,针对其C-末端而言,其存在着比较典型的疏水跨膜域。针对内质网胁迫诱导剂TM来讲,其能够对NAC062实施诱导,使其表达上调,而针对此种上调而言,其在整个bzip60突变体当中,已经被全部抑制,但需要指出的是,如若其在bzip28突变体当中,则受到的影响较小;经酵母單杂交试验以及EMSA实验得知,针对bZIP60而言,其能够与NAC062启动子直接结合。当处于正常状态下,NAC062能够在质膜上实现定位,并且在内质网的作用与胁迫下,会被一种未知方式进行活化处理,从质膜向细胞核转移,而针对已经活化的NAC062,其能够与UPR基因所对应的启动子相结合,对促细胞生存基因实施调控。
3植物细胞死亡因子与内质网胁迫应答
3.1异三聚体G蛋白
针对拟南芥异源三聚体G蛋白来讲,当其持续被胁迫信号进行诱导时,其在整个程序性细胞死亡当中发挥着重要作用。针对异三聚体G蛋白来讲,其主要由3中亚基组成,分别为 、 与 ,针对G 来讲吗,其拥有GTPase活性。有研究指出,在与内质网胁存在关联的程序性细胞死亡中,异三聚体G蛋白均有一定参与。在整个拟南芥当中,当将G 敲除之后,如果培养基中含有内质网胁迫诱导剂,那么其相比于对照野生型和G ,有更好的生长价值,由此表明,在植物中,暗示G (AGB1)能够一定程度加速细胞死亡,但在报道其作用机制方面却并不多。现实当中,有报道指出,当敲除G 后,针对突变体而言,其相比于野生型对照,在具体的内质网胁迫诱导剂上,会变得更为的敏感,AGB1具有稳定与促进细胞生存的作用,但针对其作用机制而言,仍需开展深入研究。
3.2 Metacaspase
在整个哺乳动物体系当中,caspase在细胞凋亡发挥着关键作用。而在植物细胞当中,并无细胞凋亡情况出现。针对植物当中的Metacaspase而言,其尽管无caspase活性,但是,其被当作与动物细胞凋亡当中的caspase同源。在拟南芥当中,其共有metacaspase9个,其中,针对metacaspase-8而言,有研究指出,其受UVC、过氧化氢影响,已经出现大幅度上调,并将细胞死亡途径激活。除此之外,无论是在植物木质部形成方面,还是在重金属胁迫上,均能检测到相关于PCD类的caspase活性。
4结语
综上,针对蛋白折叠而言,其乃是真核细胞基础生物学的整个过程表现。对于内质网而言,其实为真核细胞的核心细胞器,全部分泌蛋白以及诸多膜蛋白,均需基于内质网中来加工,只有这样方能向其他细胞器转运,然后分泌至细胞外,实现生物学功能的最大化发挥。随着膜结合转录因子bZIP28、bZIP60的被发现,其为植物内质网胁迫领域的深入研究,开辟了新思路、新途径。
参考文献
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