七个品种燕麦种子发芽指标的主成分分析及良种选择
2018-10-11史威威
史威威
(河南省焦作市中站区畜牧中心,河南 焦作 454191)
燕麦(Acena satica L.)为禾本科燕麦属一年生草本植物,具有单产大、营养价值高、适口性好等优点[1],因地域不同,干草单产水平在4.3-13t·hm-2,全国平均单产水平为8.8 t·hm-2左右[2],燕麦干草粗蛋白能达到9.06%,而燕麦青贮粗蛋白可高达13.01%[3]。燕麦草的适口性好,且优质燕麦草的产奶净能与优质苜蓿草的产奶净能接近[4],是重要的饲料作物之一。
主成分分析(principal components analysis, PCA)是一种简化数据集的技术,在数据分析中,利用单一指标不能综合评判数据的差异性,而多指标又不易得出简明的规律,影响分析效果。主成分分析可以克服这些缺点,对数据进行正交变换转化为较少个数的主成分,从而实现对试验结果的综合评价[5]。本试验通过对燕麦种子萌发指标的主成分分析,为燕麦良种选育提供理论依据。
1 材料与方法
1.1 试验材料
燕麦种子:燕王、牧王、爱沃、枪手、魅力、领袖和贝勒共7个品种。试验所用燕麦种子均由北京正道生态科技有限公司提供。
1.2 试验方法
采用培养皿纸上发芽法进行发芽试验,每个品种挑选饱满无残缺、大小基本一致的种子50粒,均匀摆放在铺有两层中性滤纸的培养皿中,加入蒸馏水4ml,盖上培养皿盖,3次重复,放入培养箱。培养条件为20 ℃恒温、相对湿度(70±5)%,采用自然光。每日采用称重法添加蒸馏水,补充蒸发水分。
1.3 测定项目
试验期间记录发芽种子数,第4天统计发芽势x2、第8天统计发芽率x1,试验结束时每组随机选取5株幼苗测量其根长。计算发芽指数x3、活力指数x4和平均发芽时间x5。
发芽率(%)=(种子总发芽数/供试种子数)×100%。
发芽势(%)=(规定时间内种子发芽数/供试种子数)×100%。
发芽指数Gi= ΣGt/Dt。Gt:时间t日的发芽数;Dt:发芽日数。
活力指数VI=GI×Sx。其中Sx为根平均长度。
发芽时间=Σ(dn)/ Σn。d:试验天数;n:相应各日正常发芽数。
1.4 数据处理
试验数据采用SAS统计软件进行方差分析和主成分分析。
2 结果与分析
2.1 萌发指标测定结果
表1 燕麦种子的萌发指标
注:同列不同小写字母表示差异显著(p<0.05)
Note: The different small letters are significantly difference (p<0.05) in the same column.
各品种燕麦种子萌发指标见表1。经萌发试验,除贝勒发芽率低于90%以外,其余品种发芽率均大于或接近于95%,且贝勒发芽率显著低于其他品种(p<0.05)。枪手和贝勒发芽势低于90%,其余品种的发芽势均大于90%,且领袖最高,达到99.3%。领袖的发芽指数最高,且显著高于牧王、魅力、枪手和贝勒(p<0.05)。魅力的根长和活力指数最高,显著高于其他品种(p<0.05)。枪手的平均发芽时间显著高于其他品种(p<0.05),达到6.3天。
2.2 主成分分析
表2 燕麦种子萌发指标主成分的方差贡献率和累积方差贡献率
表3 燕麦种子萌发指标相关阵的特征向量
由表2可知:前2个主成分的累积方差贡献率为90.81%,表明前2个主成分已经代表了燕麦种子萌发6个指标90.81%的综合信息,后2个主成分在样本形状分析中所起的作用仅为9.17%。因此,选取前2个主成分为燕麦种子萌发指标的重要主成分。
根据计算样本相关矩阵的特征向量(表3),得出主成分的函数式为:
(1)y1=0.5126x1+0.5457x2+0.5323x3+0.3241x4+0.0898x5-0.2077x6
(2)y2=0.1261x1-0.1326x2-0.2039x3+0.5090x4+0.6369x5+0.5102x6
由以上函数式可以看出:在第一主成分y1中,发芽势x2的系数最大,发芽势是表示种子发芽整齐度的指标,因此,第一主成分反映的是燕麦种子发芽整齐度综合指标。在第二主成分y2中,根长x5的系数最大,根长是表示种子活力的指标,因此,第二主成分反映的是燕麦种子活力的综合指标。总之,由主成分分析表明,不同品种燕麦种子发芽指标的主要差异为发芽整齐度,其次是种子活力。
2.3 应用主成分值选择燕麦品种
对试验结果进行转换,计算每个品种的主成分值(表4),根据需求选择符合目标的优良品种。以第一主成分值为横坐标,第二主成分值为纵坐标作图(见图1)。
由图1可知,魅力的第一和第二主成分值均较高,表明发芽整齐度和种子活力均较高,与试验结果一致;领袖、爱沃和燕王的第一主成分一般,但是,第二主成分值较高,表明这3个品种燕麦种子发芽整齐度较高,而种子活力一般;枪手和牧王的第二主成分一般,但是枪手的第一主成分较高,而牧王的第一主成分较低,表明枪手的种子活力较高,而整齐度一般,牧王的种子活力较低,整齐度一般;贝勒的第一、第二主成分均较低,表明贝勒的整齐度和种子活力均较差。
表4 燕麦种子7个品种的主成分值
图1 燕麦种子7个品种不同主成分值坐标分布图Figure 1 Coordinate diagrams of distinct principal component values in seven oat varieties
3 结论
通过对7个品种燕麦种子的发芽试验,测定了6个主要的种子萌发指标。对该6项主要指标运用主成分分析法分析,得出了2个重要主成分,这2个主成分代表了发芽指标90.81%的信息。这2个主成分反映的是种子发芽的整齐度和种子活力。再通过计算样本相关矩阵的特征向量,得出主成分的函数式,将各品种燕麦种子发芽指标代入函数式,计算每个品种燕麦种子发芽的综合评价指数。经对第一和第二主成分值建坐标图,可以清晰显示各品种燕麦种子萌发的综合性能。
经试验和分析,魅力种子的发芽整齐度和活力较高,是优选品种。领袖、爱沃和燕王种子的整齐度较高,而活力一般。枪手种子发芽整齐度一般,而活力较高;牧王种子发芽整齐度一般,活力较差。贝勒的整齐度和活力均较差。