冬凌草甲素生物合成途径及关键酶的研究进展
2018-06-13徐会敏高登风魏闪闪史胜利苏成福
徐会敏, 高登风, 魏闪闪, 史胜利, 苏成福
(1.河南中医药大学 基础医学院,郑州 450008; 2.河南中医药大学 药学院,郑州 450008)
冬凌草是唇形科香茶菜属植物碎米桠[Isodonrubescens(Hemsl.) Hara],为多年生草本或亚灌木植物,也是一种重要的药用植物,主产于河南省,国内其他省份也均有分布[1-2]。
冬凌草全株入药,具有抗癌、抗菌消炎[3-4]、清热解毒、活血止痛等功效。冬凌草含有萜类、黄酮类、生物碱等多种活性成分[5]。其中,甲素是冬凌草的主要药用成分,属于对映-贝壳杉烷类二萜化合物[6-8],具有重要的医药价值和经济价值。
二萜类化合物是植物体内重要的次生代谢物,由4个异戊二烯基单元组成,含有20 个碳原子的一类天然化合物,广泛存在于植物、微生物等生物体内[9-10]。二萜类化合物的化学结构多变、来源丰富决定了其生物活性的多样,也使得其成为药学研究领域的热点[11]。
1 二萜类化合物生物合成途径
目前,已知二萜类化合物的生物体合成途径有两条:甲羟戊酸途径(Mevalonic acid,MVA)和5-磷酸脱氧木酮糖途径(Methyl-D-erythritol phosphate,MEP)[12],如图1所示。在甲羟戊酸途径中,以乙酰CoA为原料合成甲羟戊酸(MVA),再经多步酶促反应合成异戊烯基焦磷酸(IPP)。参与此过程的酶有乙酰CoA酰基转移酶(AACT)、羟甲基戊二酰CoA合酶(HMGS)、羟甲基戊二酰CoA还原酶(HMGR)、甲羟戊酸激酶(MK)、磷酸甲羟戊酸激酶(PMK)、甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶(MDD)等[13]。在MEP途径中,丙酮酸与甘油醛-3-磷酸结合形成1-脱氧木酮糖-5-磷酸,再经多步酶促反应合成异戊烯焦磷酸(IPP)及其异构物二甲基丙烯焦磷酸 (DMAPP)。参与此过程的酶有:1-脱氧-木酮糖-5-磷酸合成酶(DXS)、1-脱氧-木酮糖-5-磷酸还原异构酶(DXR)、4-二磷酸胞苷-2-甲基-赤藓醇合酶(CMS)、4-二磷酸胞苷-2-甲基-赤藓糖激酶(CMK)、2-甲基-赤藓糖醇-2,4-环焦磷酸合成酶(MCS)、1-羟基-2-甲基-2-丁烯基-4-焦磷酸合酶(HDS)、IPP/DMAPP 合酶(IDS)及异戊烯基焦磷酸异构酶(IPI)等[14]。
MVA途径和MEP途径形成的IPP与DMAPP可转化为牻牛儿基焦磷酸(Geranyl pyrophosphate,GPP),进一步形成二萜骨架或贝壳杉烯化合物[15],随后细胞色素 P450等多种修饰酶对其结构进行修饰,最终合成冬凌草甲素等二萜类化合物[16]。此过程需要下列酶的参与:牻牛儿基焦磷酸合酶(GPPS)、法尼基焦磷酸合成酶(FPPS)、牻牛儿牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPPS)、柯巴基焦磷酸合酶(CPS)、 贝壳杉烯合酶(KS),以及细胞色素 P450等多种修饰酶[17]。
植物萜类生物合成分为中间体生成、萜类生成和化学修饰等3个阶段[18]。与之相应,代谢途径中的酶也分为3类。IPP与DMAPP生成前的酶属于I类酶,其中DXS、DXR和 HMGR分别为MEP和MVA途径的关键酶[19](图1)。II类酶主要是各种环化酶,催化IIP和DMAPP生成各种不同分子量大小的形式各异的萜类化合物或中间体,是萜类生物合成的关键酶。III类酶的种类较多,其作用是对环化酶的作用产物进行分子结构修饰,包括异构化、甲基化、脱甲基化、羟基化及加成等过程。目前,萜类合成研究成果主要来自对I类和II类关键酶的研究,对III类酶研究较浅,了解的内容也较少[20]。
2 冬凌草生物合成的关键酶及其编码基因
冬凌草细胞内甲素合成相关酶的表达量低,且有时空差异性,因而其分离纯化较为困难。因此,研究冬凌草二萜类化合物生物合成途径关键酶的编码基因,是揭示甲素生物合成途径的重要方法[21-22]。目前,冬凌草甲素生物合成途径中仅有少数几个I、II类酶的编码基因完成测序及克隆,包括乙酰CoA酰基转移酶(acetyl-CoA acetyltransferase,AACT)、羟甲基戊二酰CoA合酶(HMGS)、1-脱氧-木酮糖-5-磷酸还原异构酶(DXR)和异戊烯基焦磷酸异构酶(IPI)基因等。
2.1 乙酰CoA酰基转移酶(acetyl-CoA acetyltransferase,AACT)
乙酰CoA酰基转移酶属于Ⅱ型硫解酶家族,是植物萜类生物合成 MVA 途径中的首个关键酶,参与细胞中萜类、固醇类等重要代谢过程,不仅参与调节萜类合成代谢,还参与植物逆境胁迫的响应。研究发现,冬凌草AACT基因全长1254 bp,可编码由417 个氨基酸组成的、分子质量约为42 949.6 u的亲水性蛋白质。冬凌草AACT基因片段与丹参AACT的同源性最高,为93%,与番茄、莲、芝麻等双子叶植物AACT的同源性为80%以上,编码硫解酶的4个保守结构域及2个保守位点。该酶蛋白可能主要存在于内质网,也可能分布于过氧化物酶体或微体。冬凌草AACT表达具有组织器官特异性,其转录水平由高到低依次是花、叶片、根、茎、愈伤组织[23]。
图 1 冬凌草甲素的生物合成路径Fig 1 Biosynthesis pathway of oridonin
AACT: Acetyl-CoA acyltransferase; HMGS: Hydroxy methylglutaryl-CoA synthase; HMGR: Hydroxy methylglutaryl-CoA reductase; MK: Mevalonate kinase; PMK: Phosphomevalonate kinase; MDD: Mevalonate disphosphate decarboxylase; DXS: 1-Deoxy-xylulose-5-phosphate synthase; DXR: 1-deoxy-xylulose-5-phosphate reductoisomerase; CMS: 4-Diphosphocytidyl-2-methyl-erythritol synthase; CMK: 4-diphosphocytidyl-2-methyl-erythritol kinase; MCS: 2-methyl-erythritol-2,4-cyclodiphosphate synthase; HDS: 1-Hydroxy-2-methyl-2-butenyl-4-pyrophosphate synthase; IDS: IPP/DMAPP synthase; IPI: Isopentenyl pyrophosphate isomerase; GPPS: Geranyl pyrophosphate synthase; FPPS: Farnesyl pyrophosphate synthase; GGPPS: Geranylgeranyl pyrophosphate synthase; CPS: Copalyl pyrophosphate synthase; KS: Kaurene synthase
2.2 羟甲基戊二酰CoA合酶(Hydroxy methylglutaryl-CoA synthase,HMGS)
羟甲基戊二酰CoA合酶催化乙酰乙酰CoA与乙酰CoA 缩合生成羟甲基戊二酰CoA的作用。研究发现,冬凌草HMGS基因全长为1382 bp,编码由460个氨基组成的,分子质量约为50 571.5 u的亲水性蛋白。冬凌草HMGS基因片段与薰衣草的同源性最高,为96%,与蓖麻、芝麻等双子叶植物同源性为80%以上。HMGS蛋白结构域高度保守,具有一个羟甲基戊二酰CoA 合成酶结构域,以及半胱氨酸活性位点。该蛋白主要存在于细胞质中,也可能分布于液泡、线粒体中。冬凌草HMGS蛋白表达量相对较高,检测发现其在组培苗叶中表达量最高,其次是根,花中最低,可能在冬凌草植株合成累积冬凌草甲素中发挥重要的调节作用[24]。
2.3 1-脱氧-木酮糖-5-磷酸合成酶(1-deoxy-xylulose-5-phosphate synthase,DXS)
1-脱氧-木酮糖-5-磷酸合成酶(DXS)是5-磷酸脱氧木酮糖(MEP)途径的第一个关键酶,催化丙酮酸与3-磷酸-甘油醛缩合生成1-脱氧-木酮糖-5-磷酸,在植物萜类物质的生物合成中发挥重要的作用。冬凌草DXS基因,属于植物DXS II家族,全长2169 bp,编码722个氨基酸,分子质量为77.7 ku。冬凌草DXS蛋白与同科的丹参、薄荷等DXS蛋白序列具有较高的同源性,N端均含一段质体转运肽序列,且均具有一保守焦磷酸硫胺素结构域,以及与吡啶结合相关的DRAG结构域。DXS基因在冬凌草根、叶中表达量较高,而茎、花和愈伤组织中较低[25]。
2.4 1-脱氧-木酮糖-5-磷酸还原异构酶(1-deoxy-xylulose-5-phosphate reductoisomerase,DXR)
1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶(DXR)催化1-脱氧-木酮糖-5-磷酸生成5-磷酸脱氧木酮糖途径(MEP),参与类异戊二烯的合成和积累,是MEP途径中最重要的限速酶,也是萜类代谢工程研究的重点。研究发现,冬凌草DXR基因全长1500 bp,编码为亲水性蛋白。DXR蛋白在游离核糖体上合成完成后,被转运到叶绿体中行使功能,不与膜结合。DXR在愈伤组织中的表达量最低,茎中表达量较高[26]。
2.5 异戊烯基焦磷酸异构酶(Isopentenyl pyrophosphate isomerase,IPI)
异戊烯基焦磷酸异构酶(IPI)催化异戊烯焦磷酸(IPP)异构化形成二甲基丙烯焦磷酸(DMAPP)。IPP和DMAPP是萜类化合物合成的重要前体物质,故IPI与萜类合成密切相关。冬凌草IPI基因全长1050 bp,编码由301个氨基酸组成亲水性的非膜蛋白。该酶蛋白上存在多个磷酸化位点,推测通过磷酸化/去磷酸化以调控其活性,使其成为调控下游代谢途径的总开关,直接影响萜类合成的五碳前体库的代谢流向。该酶蛋白在叶中表达量相对较高,在愈伤组织中表达量最低[27]。
2.6 柯巴基焦磷酸酶(Copalyl diphosphate synthase,CPS)
柯巴基焦磷酸酶催化牻牛儿牻牛儿基焦磷酸(Geranylgeranyl pyrophosphate,GGPP)环化生成柯巴基焦磷酸[28]。研究发现冬凌草有一个柯巴基焦磷酸酶(CPS)基因家族,包括IrCPS1~IrCPS5。IrCPS1、IrCPS2、IrCPS4和IrCPS5均含有CPS典型的(D,E)XDD基序,但IrCPS3中的第二个Asp被Asn替代,其基序转变为(D,E)XND,从而失去催化活性。IrCPS1全长序列与毛萼香茶菜、丹参等物种CPS基因序列的相似性在98%~99%,IrCPS3、IrCPS4和IrCPS5的相似性为99%,而IrCPS2的相似性则小于93%。这些酶催化产物的旋光性不同,IrCPS1、IrCPS2催化生成普通柯巴基焦磷酸,而IrCPS4和IrCPS5则催化生成对映柯巴基焦磷酸。IrCPS1在根部高表达,IrCPS2与IrCPS5在多种组织中均有表达,IrCPS3在所有组织中的表达量都相对较低,而IrCPS4在叶片中高表达,提示IrCPS4在甲素等二萜类化合物的生物合成中可能发挥着更重要的作用[29]。
2.7 类贝壳杉烯合酶(kaurene synthase-like cyclase,KSL)
类贝壳杉烯合酶(KSL)催化柯巴基焦磷酸环化生成贝壳杉烯[30]。冬凌草中发现类贝壳杉烯合酶(KSL)基因家族,包括IrKSL1~ IrKSL6。与毛萼香茶菜、丹参等物种的KSL基因序列比较,IrKSL1和IrKSL3全长序列的相似性在98%~99%,IrKSL6的相似性为99%,而IrKSL2、IrKSL4和IrKSL5的相似性则小于93%。IrKSL1、IrKSL3和IrKSL6为单起源基因,IrKSL3和IrKSL6含γ、β、α 3个结构域,但IrKSL1无N端的γ结构域,仅有β、α结构域。IrKSL1在根部高表达,IrKSL5和IrKSL6在多种组织均有表达,IrKSL2、IrKSL3和IrKSL4在叶片中高表达。IrKSL2、IrKSL4和IrKSL5催化对映柯巴基焦磷酸发生反应,其中IrKSL4可能在甲素合成中起重要作用[29]。
2.8 细胞色素P450 (Cytochrome P450 enzymes,CYP)
细胞色素P450单加氧酶系在二萜类化合物的生物合成中发挥着重要的作用。冬凌草中发现CYP76AH30,其序列与CYP76AH1[31]有80.5%相似性,与CYP76AH22-24的相似性为76.1%~ 77.6%。通过酵母菌转化实验,发现CYP76AH30编码Ferruginol合成酶,催化Miltiradiene生成Ferruginol[29]。
3 总结与展望
当前,对冬凌草甲素生物合成途径的研究主要集中在I类酶上,对II类酶和III类酶研究很少,需要深入研究,将来应深入挖掘与冬凌草甲素合成关键酶及其基因,进一步完善其生物合成途径[32]。通过研究MVA /MEP 途径的相互联系,明确两条途径的调控机制,以及基因时空差异表达调控机制,以实现对合成途径中调控因子,包括正反作用元件的分离、鉴定与合理应用,以及基因的协同转化,通过基因工程技术实现冬凌草甲素的大规模生产[33]。
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