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新疆部分地区致犊牛腹泻轮状病毒病的调查*

2018-05-23

新疆农垦科技 2018年4期
关键词:琼脂糖牛场轮状病毒

(石河子大学动物科技学院,新疆 石河子 832003)

牛轮状病毒是引起犊牛腹泻的主要病原之一,感染轮状病毒的犊牛表现为消瘦、脱水、排蛋花状水样粪便,病情严重者常并发或继发其他病毒、细菌、寄生虫等感染[1],导致规模化牛场犊牛死亡率升高[2],目前轮状病毒的检测方法主要是病毒的分离鉴定[3-4]、RT-PCR[5-6]、半巢氏 RT-CR[7]、ELISA[8]等。张坤[9]等通过RT-PCR等方法对新疆北疆地区致犊牛腹泻轮状病毒病的调查发现,规模化牛场中犊牛存在感染。轮状病毒结构蛋白中VP6蛋白构成轮状病毒内衣壳[10],具有良好的免疫原性和抗原性[11]。本研究利用VP6设计引物,运用RT-PCR和ELISA方法对新疆规模化牛场致犊牛腹泻病原轮状病毒病进行调查研究,以便为犊牛腹泻采取防控措施提供依据。

1 材料与方法

1.1 试验材料

1.1.1 主要试剂与仪器

ELISA双抗体夹心检测试剂盒购自上海润裕生物技术有限公司,pMD19-T克隆载体、T4 DNA连接酶、DNA Marker均购自宝生物工程大连公司(Takara),RNA提取试剂盒、琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒均购自康为世纪生物科技有限公司,2×Taq PCR MAsterMix溶液、DH5a菌株制备的感受态细胞均购自北京天根生物科技有限公司。试验仪器主要有酶标仪、微量震荡仪器和离心机(Costar公司)。

1.1.2 样本采集

采集石河子地区奶牛场、石河子地区某肉牛场、昌吉奶牛场、奎屯地区奶牛场等地区腹泻犊牛粪便共172份,于-80℃冰箱保存待检。

1.2 试验方法

1.2.1 样品处理

将腹泻犊牛粪便样品与等体积的PBS于冰上充分研磨,进行超声破碎,反复冻融,最后12 000 r离心30 min,取上清液用于PCR模板检测和牛轮状病毒ELISA试剂盒检测。

1.2.2 牛轮状病毒VP6基因的引物设计

根据GenBank公布的BRV基因序列VP6设计引物(见表1)。

1.2.3 总RNA的提取

按照说明书Trizol法,处理后的样品加入适量的Trizol后,用无RNA酶枪头反复吹打混匀,使样品充分裂解,分离蛋白核酸复合物,静置10 min后加入1/5 Trizol量的氯仿,震荡混匀后静置5 min,在预冷的4℃离心机中12 000 r离心15 min,EP管中的液体分为3层,提取的RNA主要在上层的无色液体中,利用特制的带收集管的吸附柱,将无色液体和等量的无水乙醇全部加入吸附柱中,进行离心,用无RNA酶水进行洗脱收集得到的RNA,提取RNA后,进行反转录,具体反应体系如表2。

表1 牛轮状病毒VP6基因PCR扩增引物信息

表2 反转录反应体系

1.2.4 PCR反应

PCR 反应体系 (20 μL):2 × Es Taq Master mix 10.0 μL,上、下游引物各 0.4 μL,模板 2.0 μL,ddH2O 7.2 μL。PCR 反应条件:95℃预变性 5 min,94℃变性 30 s,55℃退火 30 s,72℃延伸 30 s,35 个循环后,72℃延伸10 min。扩增反应结束后,将PCR产物在2%的琼脂糖凝胶上进行电泳检测,同时琼脂糖凝胶试剂盒回收目的片段。

1.2.5 琼脂糖凝胶电泳和目的条带回收

称取琼脂糖1.2 g、1×TBE电泳缓冲液60 mL,配置成2%的琼脂糖凝胶溶液,经微波炉加热,完全溶解,室温静置,滴加EB染液后充分混匀,将其倒入制胶槽中,约30 min后凝固,20 uL点样,180 V、120 mA进行电泳,结束后将胶放入凝胶成像仪器中,进行拍照保存。

目的条带的回收:用切胶刀将目的条带在紫外灯下切除,置于无RNA酶的EP中加入适量的溶胶液,进行50℃水浴溶解,充分溶解后加入特制的吸附柱中,离心后,加入无水乙醇进行洗脱,最后用无RNA酶水进行洗脱,收集得到的洗脱液。

1.2.6 目的基因的连接(表3)

表3 目的基因的连接反应体系

1.2.7 转化及菌液PCR鉴定

转化按照说明书进行操作,采用经特殊工艺制作的DH5α感受态细胞进行DNA的热激转化,将连接产物加入置于冰上缓慢融化的DH5α感受态细胞中,用移液器吹打混匀后,置于冰上30 min,进行42℃水浴热激90 s后迅速置于冰上,加入适量的LB液体后,37℃、170 r摇床上摇4 h,离心取沉淀涂于固体LB平板上。

菌液PCR的鉴定及测序:从转化平皿中挑取单菌落加入氨苄抗性的LB液体培养基,37℃、180 r摇床培养4 h,进行菌液PCR鉴定。将鉴定为阳性的菌,扩大培养后提取质粒送上海生工测序。

1.2.8 牛轮状病毒抗原ELISA检测

按照牛轮状病毒抗原ELISA说明书进行。试剂盒原理是双抗体夹心法,将处理好的样品上清液吸取200 μL加入已经预先包被牛轮状病毒捕获抗体的微孔中,同时设置阴、阳性对照孔和空白孔,除空白孔外,样品孔中加入辣根过氧化物酶(HRP)标记的检测抗体100 μL,微量震荡仪器上震荡混匀,用封板膜封好后置于37℃恒温培养箱中作用1 h,取出弃掉微孔中的液体,每孔用洗涤液洗板5次,每次2 min,加入底物后避光孵育15 min,用终止液进行终止,在450 nm的酶标仪上进行读数。

2 结果与分析

2.1 PCR检测的牛轮状病毒感染情况

表4 新疆部分地区规模化牛场牛轮状病毒检测结果

经PCR方法对新疆部分地区规模化牛场172份腹泻犊牛粪便样品进行检测,检出阳性份数127份,阳性率73.83%(表4)。犊牛粪便中VP6基因检测的结果(图1、图2)运用DNAMAN软件将牛轮状病毒VP6基因测序结果与标准序列进行在线比对,发现两者同源性达到100%(部分图)。

图1 某规模化牛场腹泻犊牛粪便轮状病毒VP6基因检测结果

2.2 ELISA检测结果

表5 ELISA方法检测结果

经ELISA方法对新疆部分地区规模化牛场172份腹泻犊牛粪便样品进行检测,阳性份数100份,阳性率 72%(表5)。

图2 牛轮状病毒VP6基因与标准序列比对结果

3 讨论

牛轮状病毒VP6基因,是诊断牛轮状病毒感染的常用基因,本研究通过设计牛轮状病毒VP6基因引物,通过测序,将测序结果分别与牛轮状病毒VP6基因标准序列通过DNAMAN软件进行在线比对,发现扩增出的牛轮状病毒VP6基因与标准序列的同源性为100%,可以判定被调查牛场犊牛遭受轮状病毒病感染。

ELISA方法是进行大量样本检测的首选,本调查经ELISA方法对新疆部分地区规模化牛场腹泻犊牛粪便样品进行检测,阳性率72%(100/172),经RT-PCR方法检测犊牛粪便样品,阳性率73.83%(127/172),这比张坤[9,12]等应用 RT-PCR 和 ELISA方法检测报道的调查结果略高。综合PCR和ELISA方法各自的优点,可对腹泻犊牛的轮状病毒感染提供较为准确的诊断。

参考文献

[1]李艳婷,孙光野,张露,等.犊牛轮状病毒和大肠杆菌混合感染检测[J].中国畜牧兽医,2017,44(1):248-253.

[2]常继涛,于力.牛轮状病毒引起的犊牛腹泻研究进展[J].中国奶牛,2016(2):22-25.

[3]李凡,周芳,岳华,等.A群牛轮状病毒的分子生物学研究进展[J].动物医学进展,2017,38(6):82-85.

[4]侯美如,高俊峰,周庆民,等.牛轮状病毒诊断方法研究进展[J].中国草食动物科学,2013,33(2):63-66.

[5]李成元,姚美玲,王广伟,等.应用RT-PCR方法检测牛轮状病毒的研究[J].中国动物保健,2015,17(4):65-68.

[6]姜向阳,邓小敏,王晶钰,等.牛轮状病毒的分离及其RTPCR 鉴定[J].西北农业学报,2007(4):191-194.

[7]栾婧婧,杨少华,张维军,等.半巢式RT-PCR快速检测犊牛轮状病毒方法的建立 [J].中国人兽共患病学报,2006(7):671-673.

[8]田风林,魏锁成.应用ELISA法、RT-PCR法检测固原市部分地区肉牛轮状病毒的研究[J].黑龙江畜牧兽医,2017(20):126-128.

[9]张坤,剡根强,王静梅,等.新疆部分地区致犊牛腹泻轮状病毒的检测及VP6基因序列分析 [J].黑龙江畜牧兽医,2016(13):160-162.

[10]Mc Clain B,Settembre E,Temple BRS,et al.X-ray crystal struc-ture of the rotavirus inner capsid particle at 3.8 Aresolution[J].JMol Biol,2010,397(1):587-599.

[11]Kohli E,Muurice L,Bourgeois C,et al.Epitopemapping of themajor inner capaid protein of group A rotavirus using peptide synthesis[J].Virology,1993,194 (1):110-116.

[12]张坤.新疆北疆地区规模化奶牛场犊牛病毒性腹泻相关病原的调查研究[D].石河子:石河子大学,2016.

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