慢性淋巴细胞白血病患者长链非编码RNA RP5-180C18.1的表达及其预后评价作用
2018-04-13邵洋胡延平刘勇
邵洋,胡延平,刘勇
(中国医科大学附属盛京医院 1. 检验科;2. 血液研究室,沈阳 110004)
慢性淋巴细胞白血病 (chronic lymphocytic leukemia,CLL) 是成熟样B淋巴细胞在外周血、骨髓、淋巴结和脾脏大量蓄积为特征的低度恶性肿瘤。CLL在欧美较为常见,而在我国相对少见。目前对CLL的诊断主要依赖于WHO标准[1],依据白细胞计数、血涂片免疫表型等对CLL进行诊断,目前CLL治疗参考NCCN指南[2],需要根据患者年龄、细胞遗传学等分层治疗,预后判断参考RAI和BINET标准[3-4],这两个传统标准主要依赖于体检及血细胞计数来判断预后,并不能充分满足患者需要。近年来一些分子生物学指标 (IGHV、ZAP70、17p-和11q-等) 也参与CLL的诊断治疗及预后判断[5]。为弥补缺陷,CLL-IPI(CLL international prognostic index) 积分系统纳入了TP53缺失/突变、IGHV突变、血清β2-微球蛋白、临床分期和年龄5个指标辅助CLL患者的预后判断[6]。
长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncR-NA) 是一类本身不编码蛋白、转录本长度超过200 nt的长链非编码RNA分子,它可在多层面上 (表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等) 调控基因的表达[7]。非编码RNA的异常表达可以辅助CLL的诊断及预后分层,已有研究证明,多种miRNA及LncRNA在CLL的发生发展中起到重要作用,miR-155提高BCR受体的敏感性,其高表达预示着较差的预后[8],而与之相反,miR-150降低BCR受体的敏感性[9],同时,也有多种lncRNA的下调被认为参与肿瘤的生成,包括HOTAIR、MALAT1和SChLAP1等[10]。本研究前期通过二代测序技术筛选CLL患者中相对于健康人B淋巴细胞中lncRNA的异常表达,结果发现超过20 000种lncRNA存在异常表达,其中RP5-180C18.1存在显著上调 (P< 0.001) ,提示RP5-180C18.1可能在CLL的发生发展中起一定的作用。本研究分析RP5-180C18.1的表达,探讨其在CLL诊断及预后判断上的作用。
1 材料与方法
1.1 研究对象
收集2006年1月至2017年1月本院血液科就诊的初诊CLL患者,采用样本库中留存的临床废弃骨髓样本60例,其中男性27例,女性33例,中位年龄65岁。并采自30例造血干细胞移植供者骨髓液为健康对照。所有患者经过形态学、免疫分型、细胞遗传学及分子生物学综合确诊,实验室特点见表1,诊断标准参照WHO标准。本实验经过中国医科大学伦理委员会批准 (No. 2016PS352K) 。根据相关分子生物学指标,分别根据IGHV突变、CD38及ZAP70对CLL患者进行分组比较。并对60例CLL患者进行了随访。
表1 CLL患者实验室特征Tab.1 Laboratory features of the chronic lymphocytic leukemia (CLL) and control groups
1.2 方法
1.2.1 试剂及引物:淋巴细胞分离液Lymphoprep(中国达科公司) ,逆转录采用RrimeScript RT reagent Kit 逆转录试剂盒(日本TaKaRa公司) 。实时采用SYBR Green试剂盒(日本TaKaRa公司) 。引物为RP5-180C18.1,F:GCAGCGTCCAGAGGCTGG,R:GGCAGCGAGGATGCTGAACC;TBP,F:CCACGGTG AATCTGTGCT,R:GGAGTCGTCCTCGCTCTT。
1.2.2 qPCR检测:采用淋巴细胞分离液分离骨髓单个核细胞,然后Trizol-氯仿方法提取细胞总RNA,Oligo dT法进行反转录反应,以管家基因TBP为内参,同时进行RP5-180C18.1和TBP的实时反应。实时反应设置3个复孔,得出Ct均值,以正常人为对照,应用ΔΔCt相对定量法分析RP5-180C18.1表达水平的差异。ΔΔCt=ΔCt实验组-ΔCt对照组,ΔCt=Ct RP5-180C18.1-Ct TBP,2-ΔΔCt即为基因表达差异的倍数。
1.3 统计学分析
应用SPSS 17.0进行统计学分析。计量资料采用±s表示。计量资料比较采用独立样本t检验,计数资料比较采用χ2检验,预后分析采用log-rank检验。P< 0.05 (双向) 为差异有统计学意义。
2 结果
2.1 RP5-180C18.1在不同CLL表型中的表达
结果显示,与健康对照组 (1.894±0.62) 比较,RP5-180C18.1在CLL患者 (12.93±2.98) 表达较高 (P=0.013) 。与突变型CLL患者 (0.505±0.07) 比较,IGHV野生型CLL患者 (4.682±1.08) RP5-180C18.1表达高 (P=0.023) ;与 ZAP70 高表达CLL患者 (0.262±0.04) 比较,ZAP70低表达CLL患者 (1.728±0.42) RP5-180C18.1表达较高 (P= 0.002) ;CD38低表达 (1.162±0.31) 与高表达(2.183±0.67) CLL患者RP5-180C18.1表达差异无统计学意义 (P= 0.206) 。
2.2 RP5-180C18.1表达与CLL分型相关分析
将60例CLL样本根据RP5-180C18.1相对表达量的中位数 (2.863) 进行分组[RP5-180C18.1低表达组 (<2.863) 和RP5-180C18.1高表达组 (>2.863)],分析CLL患者临床特征、分型与RP5-180C18.1表达相关性。结果显示,RP5-180C18.1表达与CLL患者性别、年龄、血红蛋白含量及幼稚淋巴细胞比例无关(P分别为 0.604、0.128、0.133、0.058) ;RP5-180C18.1高表达组CLL患者的白细胞计数较低 (P< 0.001) ,血小板含量较高 (P< 0.001) 。根据分子生物学特征分组结果显示,RP5-180C18.1表达与CD38表达无关(P= 0.796) ;RP5-180C18.1高表达组CLL患者ZAP70表达率较高 (P= 0.019) ,野生型IGHV比例较高 (P=0.030) 。见表2。
表2 RP5-180C18.1表达与CLL患者临床特征、分型的相关分析Tab.2 Correlation analysis of RP5-180C18.1 expression and the clinical features and phenotyping of patients with chronic lymphocytic leukemia
2.3 RP5-180C18.1表达与CLL患者预后相关分析
对60例CLL患者随访结果显示,中位总生存期 (overall survival,OS) 93个月,中位无进展生存期(progression-free survival,PFS) 75个月。RP5-180C18.1低表达组中位OS 98个月,RP5-180C18.1高表达组中位OS 39个月,两者具有统计学差异 (P= 0.048) ,见图1A,RP5-180C18.1高表达CLL患者OS更短。如图1B所示,RP5-180C18.1低表达组中位PFS 81个月,RP5-180C18.1高表达组中位PFS 25个月,两者具有统计学差异 (P= 0.041) ,RP5-180C18.1高表达的CLL患者PFS更短。RP5-180C18.1高表达组预后相对于RP5-180C18.1低表达组更差。
3 讨论
图1 根据RP5-180C18.1表达量对CLL患者进行的Kaplan-Meier生存分析结果Fig.1 Kaplan-Meier survival curves of patients with CLL according to RP5-180C18.1 expression
RP5-180C18.1位于1号染色体,编码一段596 bp的转录本,基因 ID为ENST00000413901,本研究发现lncRNA RP5-180C18.1在CLL不同表型中存在差异性表达,并且发现其在CLL诊断及预后判断具有辅助作用。结果显示RP5-180C18.1在CLL患者中相对于健康对照存在高表达,提示RP5-180C18.1有作为检测CLL诊断学标志物的潜力。已有研究证明,lncRNA在肿瘤中存在显著差异性表达,可以作为生物标志物辅助肿瘤检测。有研究[11]证明在患者尿液样本中检测lncRNA PCA3可以比前列腺特异性抗原更敏感更特异诊断前列腺癌。血清中检测rp11-445h22.4发现其在乳腺癌组织中高表达,并且具有92%敏感性和74%特异性,显著优于常规生物标志物 (CEA、CA125、CA153、AFP)[12]。另外,在胃癌患者体液样本中检测lncRNA tincr,ccat2,aoc4p,bancr,linc00857, aa174084和H19发现,这些 lncRNA 可以有效鉴别胃癌患者与健康人,并且可以判断胃癌发展的阶段[13]。需要注意的是,本研究对照组设置相对于实验组在参数 (幼稚细胞比例及血常规) 上存在统计学差异,但这并不违背统计学原理,本研究目的是探索RP5-180C18.1作为CLL生物学标志物的潜力,需要把CLL从健康人中鉴别出来,因此必须采用健康人群作为对照,而幼稚细胞数及血常规指标正是CLL的常见异常。外周血标本来源便捷,临床上最理想的检测标志物采用外周血指标,但是因为标本收集受限,本研究未检测外周血RP5-180C18.1含量,本研究骨髓检测RP5-180C18.1表达可靠,同时期待应用于临床CLL诊断,后续将进一步完善外周血RP5-180C18.1表达检测。
对CLL患者随访分析结果显示,RP5-180C18.1高表达患者具有更差的预后。研究[14]证明lncRNA在肿瘤预后判断起重要作用,lncRNA CCAT2在多种肿瘤 (结肠癌、前列腺癌和甲状腺癌等) 中过表达,并且预示着较差预后。也有研究[15]认为treRNA降低CLL中DNA损伤,其高表达预示着较差预后。本研究发现 RP5-180C18.1在野生型 IGHV和ZAP70高表达CLL患者中表达更高,这是否与RP5-180C18.1高表达CLL患者预后较差有关尚未证实,需进一步研究。研究[16]证明IGHV未突变型或ZAP70高表达CLL患者具有较差预后,这也从另一方面支持本研究结果。
综上所述,lncRNA RP5-180C18.1在CLL中高表达,与CLL侵袭性表型相关,并且其高表达具有较差预后。今后应对RP5-180C18.1表达深入研究,为阐明CLL的发病机制提供科学依据。
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