多发性骨髓瘤非编码RNA的研究进展
2018-02-12吴洪坤
纪 伟, 吴洪坤, 周 琳
(第二军医大学长征医院实验诊断科,上海 200003)
多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)是一个复杂的血液恶性肿瘤,其特点是骨髓中浆细胞的异常克隆增殖[1]。MM为第二大常见血液疾病,占血液肿瘤的10%[2]。MM的发病是一个逐步演化的过程,从最初的意义不明的单克隆丙球蛋白病(monoclonal gammopathy of undetermined significance,MGUS)到冒烟型、髓内MM,最后演化为非骨髓MM /浆细胞白血病(plasma cell leukemia,PCL)[3]。骨髓瘤的诊断标准包括骨髓中至少有10%的骨髓瘤细胞,血液和尿液中有单克隆免疫球蛋白,骨髓瘤相关的终末器官和组织损伤(包括高钙血症、肾功能障碍、贫血、免疫缺陷和骨质破坏)[1]。在临床治疗中,尽管免疫调节因子(来那度胺、泊马度胺)或蛋白酶体抑制剂(硼替佐米、卡非佐米)等新兴疗法显著提高了患者的治疗反应率和总体生存率,但MM仍然不可治愈[4]。
人类基因组计划显示,至少90%的人类基因组转录RNA,但是只有不到2%的RNA编码蛋白质[5-6]。非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是一类没有或很少有蛋白质合成能力的RNA,其中包括核糖体RNA(rRNA)、转运RNA(tRNA)、微小RNA(microRNA,miRNA)和长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)等。miRNA是一种短非编码RNA,长度为20~24个核苷酸,可以抑制翻译或降解mRNA[7]。miRNA通过参与基因表达控制多种生物过程如细胞生长、分化、发育和细胞凋亡[8]。在多种疾病中,有些miRNA分子目前被认为是促癌基因或抑癌基因。lncRNA长度超过200个核苷酸[9-10],其功能是作为重要的监管者,参与转录时基因的调控、转录后表观遗传水平的表达[9-11],并参与多种疾病的生物学过程[12]。我们围绕lncRNA在MM的生物学功能、临床参数以及治疗应用等方面进行综述。
1 ncRNA在MM分子发病机制中的作用
miRNA在MM中的浆细胞分化发育、信号通路分子、骨髓微环境调控表观遗传等方面发挥重要的调控作用。一项针对正常人、MGUS和MM患者的研究发现,骨髓浆细胞中部分异常表达的miRNA分子与MM的进展密切相关,特别是在MGUS 和 MM患者中,miRNA-181、miRNA-106b~25原癌簇 (miRNA-93、miRNA-106b和miRNA-25)以及miRNA-21的表达水平明显上调,在MM样本中,只有miRNA-32和miRNA-17~92簇,尤其是miRNA-19a和miRNA-19b的表达明显上调。这些miRNA分子可能通过参与浆细胞的功能调节在MM的疾病进展中发挥调控作用[13]。
此外,miRNA分子通过调控抑癌基因P53肿瘤蛋白(tumor protein P53,TP53)网络在骨髓细胞增殖和分化中起关键作用。miRNA-25和miRNA-30d在MM患者中的表达水平高于健康人群,并且TP53的表达水平与这2个miRNA的表达水平呈显著负相关。当抑制这2个miRNA功能时,可以显著提高TP53表达水平,增强骨髓细胞凋亡。在MM中miRNA-192和miRNA-215通过靶向胰岛素生长因子(insulin-like growth factor,IGF)信号通路防止浆细胞迁移到骨髓中。在MM中,常存在13q14染色体的缺失,miRNA-15a和miRNA-16位于该区域,这2个miRNA分子通过靶向调控蛋白激酶B(protein kinase B,PKB)、核糖体蛋白S6、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、核因子-κB(nuclear factor kappa B,NF-κB)活化因子有丝分裂原激活蛋白3激酶(mitogenactivated protein 3 kinase,MAP3K)和三磷酸肌醇(inositol trisphosphate,IP3)来调控骨髓细胞增殖和生长[14]。进一步的体内外实验表明,其能抑制MM细胞导致的内皮细胞生长和毛细血管的形成,抑制MM细胞在骨髓微环境中的迁移和增殖,对逆转骨髓基质细胞有促进作用,从而发挥抗MM作用。
表观遗传畸变,包括DNA甲基化和/或组蛋白修饰,已成为miRNA异常调节的主要原因[15-17]。以MM患者为研究对象,采用甲基化聚合酶链反应分析4个miRNA分子的甲基化,结果发现在启动子区超甲基化的miRNA-34a和miRNA-124-1在MM的发病机制和疾病进展中并不像在其他疾病中那样发挥作用,相反在复发或进展患者中常常发现抑癌基因miRNA-34b被表观遗传沉默。而miRNA-203的甲基化则出现在骨髓发病早期,通过靶向环磷酸腺芳反应元件结合蛋白-1(cyclic AMP response element-binding protein-1,CREB-1)来抑制细胞增殖[18]。有研究探讨复发或难治性患者中的miRNA的甲基化状态,发现miRNA-152、miRNA-10b-5p和miRNA-34c-3p存在超甲基化调控,且在MM中表达水平下调,当去甲基化或过表达上述miRNA分子时,发现可以诱导细胞凋亡,抑制细胞增殖,并能下调这些miRNA分子的靶基因—DNA甲基转移酶1(DNA methyctransferace 1,DNMT1)、E2F转录因子3(E2F transcription factor 3,E2F3)、β-转导重复相容蛋白(beta-transducin repeat containing,BTRC)和Myc结合蛋白(Myc-binding protein,MYCBP)的表达水平[19]。
除了畸变的DNA甲基化,在MM患者中通过组蛋白修饰调节的miRNA也有报道。有t(4;14)突变的MM患者,miRNA-126的下调是通过MM MSE结合域蛋白(multiple myeloma SET domain,MMSET)的染色修饰来进行的,导致c-Myc上调,加强MM细胞的扩散[20]。
近年来,lncRNA在MM的分子发病机制中的作用逐渐被重视。最近有文献报道,在一项关于20例MGUS患者、33例冒烟型MM患者、170例MM患者、36例髓外MM和9名健康人群的研究中,运用一种新的微阵列方法来检测lncRNA在浆细胞的表达,结果发现相比于正常对照组,有31例MM患者样本中lncRNA异常表达,其中肺腺癌转移相关转录子1(metastasisassociated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1)在MM患者中显著上调,进一步分析发现该分子与多种信号分子途径密切相关,可以调节细胞增殖,涉及细胞周期调控、P53调节的DNA损伤反应和miRNA的成熟过程。短暂的MALAT1过表达还可增强MM细胞的增殖和裸小鼠肿瘤的形成[21-22]。另外,还发现有21个lncRNA的表达在浆细胞恶性阶段逐步下调,提示这些lncRNA可能在疾病的进展中起一定的作用[23],但有关lncRNA在浆细胞恶性疾病中的作用和意义研究则较为少见。
2 ncRNA在 MM患者临床预后中的作用
有研究表明,除了在分子发病机制中的作用外, miRNA还在分析临床参数如危险分层和生存期方面等存在一定的应用价值,miRNA-15a和miRNA-16在国际分期系统(international staging system,ISS) Ⅲ期MM患者中表达水平显著降低,然而在ISS Ⅰ和ISS Ⅱ期的MM患者中表达水平明显升高[24]。与此相反,miRNA-181a和miRNA-181b在ISS Ⅱ和ISS Ⅲ期患者中则表达较高[14]。miRNA-886-5p、miRNA-17和miRNA-18a表达高的MM患者总体生存期更短。因此,miRNA-866-5p、miRNA-17和miRNA-18a可以对预后进行分层,进一步提升基于ISS和荧光标记的原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)的骨髓瘤疾病危险分层的敏感性[25]。最近的研究发现,循环miRNA分子具有作为新型生物标志物的潜力。与健康人的血浆相比,6个miRNA(miRNA-148a、miRNA-181a、miRNA-20a、miRNA-221、miRNA-625和miRNA-99b)在MM患者血浆中的表达水平显著上调。miRNA-1308和miRNA-720对MM和MGUS具有一定的鉴别诊断作用[26]。血清中miRNA-34a和let-7e组合应用可以鉴别诊断正常人群和MM患者,敏感性为80.6%,特异性为86.7%。miRNA-744和let-7e表达低的MM患者总体生存期更短并且有较高的复发率。低水平的miRNA-744、let-7d、let-7e与高ISS分期有关,且低水平的miRNA-744、miRNA-130a、let-7d还与高DS(Durie-Salmon)分期有关[27]。
最近的研究报道,除了miRNA分子外,lncRNA也具有一定的临床预示价值,相比正常健康人群,MALAT1在MM患者中显著高表达[28-29],这表明MALAT1在MM患者中有异常表达。当MM患者治疗后,MALAT1的表达水平显著降低,并与正常健康人的表达水平相近。与治疗后的MM患者相比,MALAT1在进展期以及复发MM患者中的表达显著增加。另外,MALAT1的动态变化与MM的疾病状态相一致,说明MALAT1可以作为早期预测疾病进展的标志,而且lncRNA在初诊MM患者中的异常表达也提示其有作为MM诊断和预后标志物的潜力[30]。
3 ncRNA在MM治疗中的作用
miRNA通过下游靶分子控制多种重要的基因和信号通路,在癌症治疗方面有一定的潜力。如在MM细胞株和MM小鼠动物模型中,miRNA-29b已经被证明可以抑制骨髓瘤细胞的生长,其可以加强硼替佐米的抗肿瘤活性,增强硼替佐米引起的细胞凋亡作用[31]。进一步研究还发现,miRNA-29b抑制骨髓瘤细胞的功能是通过靶向DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase,DNMT),继而去甲基化,激活抑制细胞因子信号1(suppressor of cytokine signalling 1,SOCS1)来抑制白细胞介素6-酪氨酸激酶-信号传导与转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)信号[32]。又如在骨髓微环境中,miRNA-21可以抑制MM细胞的生长,还可以与地塞米松和阿霉素发挥协同作用[13-33],而且STAT3可以直接诱导miRNA-21的上调,从而增强STAT3的致癌潜力。另外, miRNA-21还可以靶向STAT3的蛋白抑制剂(protein inhibitor of activated STAT3,PIAS3),通过形成一个负反馈回路来间接抑制STAT3。
近来有研究发现,miRNA192、miRNA-194和miRNA-125可能通过靶向IGF1和胰岛素样生长因子1受体(insulin-like growth factor 1 receptor,IGF1R)来抑制MM细胞的迁移和侵袭[34]。据报道,miRNA-15a也与骨髓微环境密切相关,miRNA-15a的表达水平在MM患者骨髓微环境中是降低的,下调miRNA-15a能降低骨髓瘤细胞对硼替佐米和美法仑的敏感性[21-35]。在骨髓微环境中,恢复miRNA-15a对蛋白激酶B、NF-κB和血管内皮生长因子的抑制活性,可以发挥抗肿瘤效应[14-24]。
4 总结
总之,miRNA在MM的发病分子机制中作用关键,具有改善MM的诊断和治疗现状的潜力。未来的研究应集中在探讨MM患者中miRNA的特征和在MM诊断治疗预后中的临床应用,从而更好地为MM疾病的分层、预测和治疗服务。在MM的治疗中,miRNA可以说是最有前景的治疗方式之一,可以单独或结合目前治疗策略提高对MM的治疗效果。在MM的发病机制研究中,lncRNA的研究是一个新兴领域,其可以调节关键的生物过程,包括细胞增殖和分化,很多lncRNA的调节在不同形式的浆细胞表达中失调。总之,miRNA的异常表达与MM密切相关。
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