石蜡包埋组织DNA快速提取法应用于分子病理检测价值评价
2017-09-14杨秀媚
杨秀媚
【摘要】 目的 探讨分析石蜡包埋组织DNA快速提取法应用于分子病理检测的价值。方法 63份经石蜡包埋的组织, 随机分为实验组(32份)和对照组(31份)。实验组采用DNA快速提取法, 对照组采用试剂盒DNA提取法。分别对两组提取出的DNA进行对比分析。结果 实验组在小组织标本中提取DNA的浓度及纯度均低于对照组;实验组在大组织标本中提取DNA的浓度及纯度与对照组比较无显著差异。对照组中提取的DNA扩增后可达到500 bp以上, 实验组扩增产物则在400 bp以上。结论 分子病理检测中应用石蜡包埋组织DNA快速提取法, 可在保证质量的情况下, 大大缩短检测时间, 提高检测安全性, 临床上值得应用。
【关键词】 分子病理检测;石蜡包埋组织;DNA快速提取法;价值
DOI:10.14163/j.cnki.11-5547/r.2017.24.118
近年来, 随着分子病理学的不断发展, 人们对肿瘤疾病的认识与研究不再局限于患者的器官、细胞, 而是延伸到了蛋白质、DNA等水平。分子病理学使病理诊断变得更加准确、客观, 而且在肿瘤的治疗及预后等方面也有着重要价值, 其中免疫检测、基因检测、流式细胞术等技术目前应用较为广范, 全面推动着医疗技术的发展[1]。提取DNA是分子病理检测的重要内容, 本研究通过对石蜡包埋组织进行DNA提取、分析, 旨在评价石蜡包埋组织DNA快速提取法应用于分子病理检测中的价值, 现报告如下。
1 材料与方法
1. 1 材料 选取2016年3~12月经石蜡包埋的组织63份, 将其随机分为实验组(32份)和对照组(31份)。所有标本均使用中性甲醛固定, 其中淋巴结、肿瘤、宫颈组织各21份。
1. 2 方法
1. 2. 1 实验组 采用DNA快速提取法, 对每例标本制作4张蜡片, 首先将蜡片置入离心管中并加入裂解液, 采用金属浴方法将石蜡溶解, 并将温度控制在95℃, 持续时间在10 min左右, 然后以14000 r/min对其进行离心操作, 离心过程持续5 min, 最后将蜡层下出现的清凉溶液置于-20℃环境下保存。
1. 2. 2 對照组 采用试剂盒DNA提取法, 与实验组相同方法制作4张蜡片, 将其置入离心管中并加入二甲苯1 ml, 14000 r/min对其进行离心操作, 3 min后抛除上层清亮液体, 重复操作1次;1 ml无水乙醇加入离心管中, 混匀后重复上述离心操作, 并再次进行乙醇去苯, 完成后开盖蒸发乙醇;将Buffer ALT及蛋白酶K混入离心管, 混匀后进行消化、孵育;使用离心柱9000 r/min对其进行离心, 2 min后将废液丢弃;加500 μl缓冲液AW1, 9000 r/min对其进行离心, 2 min后将废液丢弃;加500 μl缓冲液AW2, 9000 r/min对其进行离心, 2 min后将废液丢弃;加入ATE静置2 min, 再离心处理;处理完毕后管内剩余液体置于-20℃环境下保存[2]。
1. 3 DNA产物评价
1. 3. 1 DNA浓度及纯度 利用紫外分光光度计评价提取物DNA浓度及其纯度。
1. 3. 2 PCR可行性 对提取出的DNA进行PCR扩增(实验组使用DNA原液, 对照组DNA浓度65 ng/μl);反应温度:预变性95℃, 变性95℃, 退火60℃;反应时间:预变性7 min, 变性45 s, 退火45 s;经循环35次后对其进行电泳处理, 并经BIO-RAD系统对两组DNA质量进行分析。
2 结果
2. 1 提取物DNA浓度及纯度评价 实验组在小组织标本中提取DNA的浓度及纯度均低于对照组;实验组在大组织标本中提取DNA的浓度及纯度与对照组比较无显著差异。
2. 2 PCR可行性对比分析 对照组中提取的DNA扩增后可达到500 bP以上,实验组中不同组织提取的DNA扩增产物大小不同,其中宫颈组织可达300 bp,其余组织则在400 bp以上。见图1。
3 讨论
随着科学技术的持续发展及医疗水平的不断进步, 石蜡包埋组织因其具有便于运输储存、交叉污染少等优点, 被广泛应用于临床病理工作中[3-6]。在进行分子病理检测时提取DNA的方法中, 酚-氯仿法应用较早, 但因其操作过程复杂, 且对人体有损害等缺点, 目前已逐渐被离心柱法所代替[3]。离心柱法对操作者要求相对较低, 且得到的DNA质量较高, 但检测过程中因为需要对组织进行消化, 操作步骤较多, 所以检测所需时间较长, 且在操作过程中换管频繁, 增加了标本污染的可能性[4]。如何能够在保证DNA提取质量的情况下缩短操作时间, 成为了研究的热点问题之一。
石蜡包埋组织DNA快速提取法无需应用有毒试剂, 如二甲苯、氯仿等, 能够更好地保障检测人员的身体健康及生命安全[7-11];采用离心管, 不但较通常所应用的PCR管方便许多, 而且可有效降低交叉污染的可能性, 从而提高DNA提取质量;将加热温度设置为95℃, 可有效避免过高的温度所造成的试管爆炸, 大大提高操作安全性[12-14]。石蜡包埋组织在处理过程当中, 会经过甲醛固定以及脱水等步骤, 在进行分子病理检测之前已放置了一定的时间, 所以DNA断裂情况较为常见。有研究结果表明, DNA快速提取法所得到的DNA完全可用于PCR扩增[5]。为进一步探讨分析石蜡包埋组织DNA快速提取法应用于分子病理检测价值, 本实验对石蜡包埋组织进行了分组实验研究。
本实验研究结果显示, 实验组在小组织标本中提取DNA的浓度及纯度均低于对照组;实验组在大组织标本中提取DNA的浓度及纯度与对照组比较无显著差异。对照组中提取的DNA扩增后可达到500 bp以上, 实验组扩增产物则在400 bp以上。endprint
综上所述, 使用石蜡包埋组织DNA快速提取法所提取的DNA, 虽然在小组织中DNA浓度及纯度相对较低, 但完全可满足分子病理检测所需的条件, 而且该方法拥有方便、快速、经济等优点, 具有显著的优势, 可在临床上推荐与应用。
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[收稿日期:2017-06-02]endprint