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基于CiteSpace的结节病可视化研究

2017-06-01刘良楹段江晖杜甲珺陈欣冯小东龙莉艳

中国实用乡村医生杂志 2017年5期
关键词:结节病图谱可视化

刘良楹段江晖杜甲珺陈欣冯小东龙莉艳

特 别 关 注

基于CiteSpace的结节病可视化研究

刘良楹1段江晖2杜甲珺1陈欣1冯小东1龙莉艳1

作者单位:1.100853 北京,解放军总医院医学信息室;2.100029 北京,中日友好医院影像科

目的 探索结节病近10年的研究发展过程与趋势。方法 利用结节病在Web of Science核心集2007—2017年的数据,通过CiteSpace分别生成结节病的5类图谱并进行解读。结果 Marc A Judson、Robert P Baughman、Marjolein Drent、R.P.Baughman和Dominique Valeyre是结节病方面较为重要的作者。美国辛辛那提大学、美国梅奥诊所、美国圣安东尼奥医院、美国克利夫兰诊所和美国南卡莱罗纳医科大学是结节病方面发文量最多的研究机构。美国、日本、法国、德国和英国是研究结节病的中坚力量。Iannuzzi-2007是结节病研究领域最核心的文献。心脏结节病、结节病的诊断、肺结节病这三面均受到了学者们的密切关注。结论 心脏结节病、结节病的诊断、肺结节病是结节病的主要涉及领域。文献作者和合作机构,以及所属的国家多集中于美国、日本、法国、德国和英国。

结节病;CiteSpace;知识图谱;信息可视化

结节病是一种累及多系统原因不明的肉芽肿性疾病,其研究历史可追溯至1899年,该病有不同的地域和种族差异,美国该病的年发病率约为10/10万,亚洲发病率较低[1]。结节病主要见于<40岁的成年人,任何器官均可受累,高达90%的患者累及胸内淋巴结和肺。诊断该病需要结合临床和影像学,并且组织学证实为非干酪坏死性上皮样肉芽肿,并除外其他原因引起的肉芽肿性疾病。

CiteSpace是一款基于JAVA平台的信息可视化应用程序,是由美国德雷克塞尔(Drexel)大学陈超美博士团队开发的一款可识别及可视化科学文献中新趋势与新动态软件[2-3]。利用CiteSpace生成知识图谱,可从中观测到一定时期内某一研究领域的研究热点、研究趋势等内容[4]。本文通过对结节病相关文献进行可视化分析,以窥探近10年来结节病的研究情况。

1 数据和方法

1.1 数据来源和工具 本文所有数据均来自Web of Science核心集,检索策略为主题=(sarcoidosis),时间跨度为2007—2017年,索引数据库包括SCI-EXPANDED、CPCI-S、CCREXPANDED和IC。数据下载日期为2017年3月9日,将检索到的7 568条文献记录以纯文本格式下载并保存,通过基于JAVA 7的CiteSpace 3.7.R8(64-bit)进行处理。

1.2 知识图谱的绘制 运行CiteSpace,进行结节病共被引文献的合并网络图谱参数设置(图1),分别生成结节病的五类图谱:①结节病文献的作者合作网络图谱;②结节病文献的机构合作网络图谱;③结节病文献的国家合作网络图谱;④结节病文献的关键词共现网络图谱;⑤结 节病共被引文献的合并网络图谱及时间线视图。从结节病的合作网络图谱中,可迅速直观地发现学者、机构及国家之间的合作情况;通过关键词的共现网络可窥探结节病的研究前沿与研究热点;借助共被引网络可筛选出结节病的关键文献,并且可对结节病未来的研究方向进行预测。

图1 结节病共被引文献的合并网络图谱及时间线视图的参数设置

2 结节病知识图谱的分析解读

2.1 结节病文献的作者合作网络图谱 在作者的合作网络中(图2),每一引文年代环的厚度代表这一作者发文的数量,引文年代环之间的连线多少代表合作的密切程度,连线的粗细代表合作发表文献的数量,连线的颜色则代表首次合作的时间。2007—2017年,图2显示共有351名研究结节病的学者,Marc A Judson、Robert P Baughman、Marjolein Drent、R.P.Baughman和Domin ique Valey re是发文量最多 的前五位作者。图2显示有两大较为密集的聚类,其中Marc A Judson、 Robert P Baughman、Marjolein Drent和Dominique Valeyre可归 为一个聚类,而R.P.Baughman与其他作者归为另一个聚类。

图2 结节病文献的作者合作网络图谱主要部分

2.2 结节病文献的机构合作网络图谱 机构之间合作的关系亦可通过引文年代环来进行判读。在机构的合作网络中(图3),引文年代环的厚度代表这一机构发表文献的数量,连线多少代表合作的密切程度,连 线粗细代表合作发表文献的数量,颜色则代表首次合作的时间。2007—2017年机构发文量排名前5位的分别是美国辛辛那提大学、美国梅奥诊所、美国圣安东尼奥医院、美国克利夫兰诊所和美国南卡莱罗纳医科大学,其中辛辛那提大学、圣安东尼奥医院和南卡莱罗纳医科大学属于同一聚类,在这一聚类里发生合作的机构数量最多。图3显示了以美国梅奥诊所为代表、美国哈佛大学为代表、以英国皇家布朗登医院和美国范德堡大学为代表的小型聚类。日本京都大学与滋贺成人医学中心、英国皇家布朗登医院与英国伦敦大学帝国理工学院、美国国立犹太人医学研究中心之间相较于其他机构合作较早。

图3 结节病文献的机构合作网络图谱主要部分

2.3 结节病文献的国家合作网络图谱 在结节病的国家合作网络图谱中(图4,封三),每一引文年代环的厚度代表这一国家发文的数量,引文年代环之间的连线多少代表合作的密切程度,粗细代表合作发表文献的数量,颜色则代表首次合作的时间。从图可知,共有85个国家对结节病进行了研究,其中发文量前5位的国家分别是美国、日本、法国、德国和英国,美国以频次1 820位居榜首。澳大利亚与泰国之间存在着深色连线,说明这两个国家在2007年已展开了合作;英国与捷克、美国与丹麦、瑞典与斯洛文尼亚存在着浅色连线,说明这些国家合作时间也比较早。

2.4 结节病关键词共现网络图谱 通过关键词共现网络,可推测十年间结节病的重点研究内容,其中结节病的诊断、肺结节病和结节病治疗的文献数量最多。结节病的诊断、正电子发射计算机断层显像、肺结核的中心性最高,由此可知结节病诊断和肺结节病是结节病最重要的关键词。心脏结节病呈现出引文激增的状态,曾在某一时间段内被频繁出现,说明心脏结节病也是研究的热点之一。见图5(封三)。

2.5 结节病共被引文献的合并网络图谱 在结节病共被引文献的合并网络图谱中(图6,封三),最突出的文章是Iannuzzi-2007[5],通过检索并通读原文得知,此篇文献为新英格兰杂志上关于结节病的一篇综述,这篇文章从结节病的流行病学、环境因素、遗传特征、免疫发病机理、临床特征、诊断、累及的器官、儿童结节病、治疗和未来的发展方向进行了全面总结。其他高被引文献,如Hunninghake-1999(AM J RESP CRIT CARE)、Baughman-2001、Newman-19 97等9篇文献十年间的引用次数皆>200次;图6中右上方和左下方的聚类是最新形成的共被引关系,分别属于呼吸和心脏两个方面的聚类。最主要的聚类为sarcoidosis聚类和cardiac聚类,两者是通过Mehta-2008建立起的连接,Mehta-2008主要探讨了心脏结节病患者的诊断和门诊检查的预后价值[6],文中提及心脏结节病患者的发病率和死亡率非常高,因此,早期诊断和风险分级非常重要,由于这是一篇有关心脏结节病患者门诊检查方面的研究,因此,与两个主要聚类都相关联。

2.6 结节病共被引文献的合并网络时间线视图 在共被引文章的合并网络时间线视图中(图7,封三),可见在1975年之前结节病研究没有重大进展。1976年有学者发表了有关心脏结节病的文献,对致死性心肌结节病的临床病理进行了详细阐述[7],此后,学者们开始了对心脏结节病的进一步研究。1995年前后,有关结节病的研究迅速兴起,近年来心脏结节病已成为研究热门。虽然有关呼吸系统结节病的经典文献较少,但最近两年也有学者开始这方面的研究。针对肝炎方面的结节病研究,文献数量相对较少,且文献间的联系较弱,呈现出孤立状态的节点。至于有关吸入性结节病的相关文献,则相对集中在2004—2011年,并且此后无更多文献报道。

3 讨论

利用CiteSpace生成某一领域的知识图谱[8],可有不同的可视化结果与形式,但不管是哪一种,都能通过相应的调整发现这一领域中的经典文献、研究热点、研究趋势等内容[9-10]。

通过作者的合作网络图谱推测不同的聚类,是由于学者间的研究重点不同而造成的。通过机构的合作网络图谱,可知美国的研究机构占主导地位,整体来说,机构间的合作不够紧密,需加强机构间的联系。通过国家的合作网络图谱,可知美国、日本、法国、德国和英国是研究结节病的主要力量,尤其是美国占据着核心地位,全球间的合作尚未形成,仍需进一步加强国际间的交流。通过关键词共现网络图谱,提示研究前沿为结节病诊断和肺结节病方面,心脏结节病也是研究的热点之一。通过共被引文献的合并网络图谱及时间线视图,说明近期学者们在呼吸和心脏结节病两个方面继续做深入研究,由于有关肺结节病的文献数量较少,但近期又被学者引用,推测呼吸系统结节病可能是未来的一个重要研究方向。

本研究尝试了对结节病的初步探索,还存在很多的不足之处,如数据阈值的设定仅使用了系统默认的设置办法,图谱某些观点解读具有很大的主观性判断,没有充分进行结节病专家的观点调研,也未请专家进行研究结果的判读,在以后的研究中,笔者将针对这些不足进行深入的研究与改进,以期得到更为客观深入的结论。

总体而言,心脏结节病、结节病的诊断、肺结节病是结节病的主要涉及领域。文献作者和合作机构,以及所属的国家多集中于美国、日本、法国、德国和英国。

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R512

A

1672-7185(2017)05-0036-05

10.3969/j.iss n.1672-7185.2017.05.014

2017-04-06)

《中国实用乡村医生杂志》“远程稿件处理系统”运行通知

龙莉艳。1626608485@qq.com

学习需求驱动下的数字出版资源定制投送系统及应用示范(国家科技支撑计划)子课题:机构/个人数字图书馆与出版物投送(课题编号2013BAH47F03)

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