亲子鉴定中STR基因座可疑多步突变2例
2017-04-04张陈明
张陈明,陶 胜
(安徽百友司法鉴定中心,安徽 合肥230031)
亲子鉴定中STR基因座可疑多步突变2例
张陈明,陶 胜
(安徽百友司法鉴定中心,安徽 合肥230031)
法医遗传学;亲子关系;短串联重复序列;DNA突变分析;多步突变
1 案 例
两位母亲(胡某与杨某)均因为自己女儿(刘某与李某)办理出生医学证明所需,委托我中心进行亲子关系鉴定。本中心采集四位被鉴定人指尖血备检。用Chelex-100法提取基因组DNA,分别采用AGCU EX22、AGCU 21+1试剂盒(无锡中德美联生物技术有限公司)对常染色体上39个STR基因座进行复合扩增,并用PowerPlex®16 HS试剂盒(美国Promega公司)对常染色体上15个STR基因座进行复合扩增,对上述检验结果进行复核验证。同时,采用AGCU X12试剂盒(无锡中德美联生物技术有限公司)对X染色体上12个STR基因座进行复合扩增。以上扩增均在9700型PCR仪(美国AB公司)上完成,扩增体系和扩增条件均依照试剂盒使用说明书,PCR产物在3130xl基因分析仪(美国Thermo Fisher Scientific公司)上进行毛细管电泳,用GeneMapper®ID v3.2软件进行STR分型。
先用AGCU EX22试剂盒对常染色体21个STR基因座进行检验,发现两对母女(胡某-刘某、杨某-李某)均在FGA基因座存在多步突变的可能。在第一对母女的FGA基因座,母亲胡某的表型为“22”,女儿刘某的表型为“27”;在第二对母女的FGA基因座,母亲杨某的表型为“21”,女儿李某的表型为“24”。采用PowerPlex®16 HS试剂盒进行复核验证,发现FGA基因座的分型与上述结果一致,且这两种STR试剂盒检出的FGA基因座的等位基因峰(胡某女儿的“27”、杨某的“21”以及杨某女儿的“24”)在信号强度、峰高与峰面积等方面均比其他基因座的杂合子高。
采用AGCU 21+1试剂盒进一步检测18个多态性STR基因座,第一对母女又出现一个STR基因座不符合遗传规律:在D4S2408基因座,母亲胡某的表型为“9”,女儿刘某的表型为“10”;在第二对母女中,母亲杨某均能提供女儿李某必需的等位基因。对12个X-STR基因座进行分型检验,发现两对母女在每个X-STR基因座均有一个相同的等位基因。按照SF/Z JD0105001—2016《亲权鉴定技术规范》,在考虑第一对母女FGA和D4S2408基因座存在突变可能、第二对母女FGA基因座存在突变可能的前提下,累积亲权指数分别为1.020 1×104、1.525 1×105。
2 讨 论
在亲子鉴定实践中,STR基因座发生突变的现象是普遍存在的,且其发生突变的主要机制是复制滑动突变,只涉及一个基序的加或减称为一步突变,约占STR基因座的90%,少数突变基因会涉及几个基序,称多步突变[1]。多步突变是通过逐步突变形成的,突变的步数越多,其发生的机会越小,最多突变步数为四步[2]。通常STR基因座核心序列重复次数越多,基因突变率越高,FGA基因座等位基因范围在12.2~51.2,目前观察到的等位基因数目多达80个,共有69种变异,在常见突变的基因座中,FGA基因座的突变率最高(0.29%)[3,4]。
在本文的两个案例中,FGA基因座的可疑突变分别达到了五步及三步,这在日常鉴定实践中极为罕见,甚至第一对母女还同时有另一个STR基因座(D4S2408)存在一步突变的可能。查阅文献发现,亲子鉴定中同时存在2个及以上STR基因座突变的现象已有报道[5-7]。
关于亲子鉴定实践中遇到这种突变的应对策略,笔者认为,若只有1个或2个STR基因座不符合孟德尔遗传规律,为了避免因STR基因座发生突变而错判,应增加突变率低、稳定性好的STR基因座进行复核验证,以便能更有效地排除近亲关系。在二联体亲子鉴定中,遇到突变时若能使双亲的另一方也参与检验,更有利于结果的准确判断。有文献[8]报道,FGA基因座存在等位基因丢失导致假突变现象,因此,若发生突变的基因座检测为纯合子,最好换用其他厂家生产、引物序列不同的试剂盒或重新设计引物进行验证,以防出现等位基因漏检,即杂合子扩增丢失现象。如出现类似突变,也可以考虑应用高通量二代测序仪分型检测判断,有条件的还可进一步增加红细胞血型、SNP等遗传标记系统、性染色体STR分型、mtDNA测序、插入缺失(InDel)位点检验等技术,以确保鉴定意见的准确性与严谨性。
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[5]常云峰,蔡继峰,杨立,等.2个STR基因座变异亲子鉴定1例[J].法医学杂志,2011,27(3):192.
[6]任贺,郭剑章,陈星,等.3个STR基因座变异亲子鉴定1例[J].法医学杂志,2010,26(6):479-480.
[7]李海霞,孙宏钰,张何,等.3个STR基因座同时突变的亲子鉴定案1例[J].法医学杂志,2009,25(4):319-320.
[8]蔡金洪,汤美云,黄健.亲子鉴定中常用10个STR基因座突变的观察和分析[J].湖南中医药大学学报,2013,33(4):8-9.
DF795.2
B
10.3969/j.issn.1004-5619.2017.04.035
1004-5619(2017)04-0451-02
2016-04-05)
(本文编辑:李 莉)
张陈明(1985—),男,硕士研究生,助理研究员,主要从事法医物证学鉴定;E-mail:448531970@qq.com